MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 18710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_018643	AAC	2	6	396388	396393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406706019
5502	NC_018643	TCA	2	6	396410	396415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706019
5503	NC_018643	GAT	2	6	396452	396457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706019
5504	NC_018643	CAT	2	6	396471	396476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706019
5505	NC_018643	TTC	2	6	396505	396510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706019
5506	NC_018643	CCA	2	6	396590	396595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706020
5507	NC_018643	CAA	2	6	396624	396629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406706020
5508	NC_018643	ATG	2	6	396645	396650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706020
5509	NC_018643	CTT	2	6	396666	396671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706020
5510	NC_018643	AGC	2	6	396775	396780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706020
5511	NC_018643	CCA	2	6	396992	396997	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706020
5512	NC_018643	ACC	2	6	397036	397041	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406706020
5513	NC_018643	TTG	2	6	397107	397112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706020
5514	NC_018643	AGC	2	6	397243	397248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706020
5515	NC_018643	CAG	2	6	397251	397256	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706020
5516	NC_018643	TGT	2	6	397309	397314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706020
5517	NC_018643	TTA	2	6	397588	397593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706021
5518	NC_018643	TGA	2	6	397629	397634	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706021
5519	NC_018643	TTC	2	6	397683	397688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706021
5520	NC_018643	TTC	2	6	397707	397712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706021
5521	NC_018643	ATG	2	6	397765	397770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706021
5522	NC_018643	CTA	2	6	397781	397786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706021
5523	NC_018643	CAA	2	6	397787	397792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406706021
5524	NC_018643	CAG	2	6	397856	397861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706021
5525	NC_018643	TAT	2	6	397866	397871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706021
5526	NC_018643	AGA	2	6	398025	398030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706021
5527	NC_018643	TTA	2	6	398302	398307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706021
5528	NC_018643	CAA	2	6	398312	398317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406706021
5529	NC_018643	ACA	2	6	398464	398469	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406706021
5530	NC_018643	TGA	2	6	398597	398602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706021
5531	NC_018643	AGA	2	6	398696	398701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706022
5532	NC_018643	GCT	2	6	398757	398762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706022
5533	NC_018643	AGA	2	6	398840	398845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706022
5534	NC_018643	AGC	2	6	398873	398878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706022
5535	NC_018643	GAT	2	6	398928	398933	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706022
5536	NC_018643	GAA	2	6	398934	398939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706022
5537	NC_018643	TGA	2	6	398945	398950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706022
5538	NC_018643	GTG	2	6	398986	398991	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406706022
5539	NC_018643	AGA	2	6	399050	399055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706022
5540	NC_018643	AGA	2	6	399107	399112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706022
5541	NC_018643	ATC	2	6	399131	399136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706022
5542	NC_018643	AGA	2	6	399158	399163	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706022
5543	NC_018643	GAA	2	6	399177	399182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706022
5544	NC_018643	TGA	2	6	399191	399196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706022
5545	NC_018643	TAA	2	6	399228	399233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706022
5546	NC_018643	ATG	2	6	399281	399286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706023
5547	NC_018643	GAA	2	6	399416	399421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706023
5548	NC_018643	GGC	2	6	399443	399448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406706023
5549	NC_018643	ATT	2	6	399460	399465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706023
5550	NC_018643	CTA	2	6	399474	399479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706023
5551	NC_018643	ATG	2	6	399501	399506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706023
5552	NC_018643	TGA	3	9	399841	399849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706023
5553	NC_018643	TAT	2	6	399850	399855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706023
5554	NC_018643	GAA	2	6	399881	399886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706023
5555	NC_018643	AGC	2	6	399931	399936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406706023
5556	NC_018643	AAC	2	6	400020	400025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406706023
5557	NC_018643	AAT	2	6	400075	400080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706023
5558	NC_018643	ATT	2	6	400096	400101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706023
5559	NC_018643	TAA	2	6	400210	400215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706023
5560	NC_018643	TTG	2	6	400315	400320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706024
5561	NC_018643	TGG	3	9	400337	400345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406706024
5562	NC_018643	AAT	3	9	400439	400447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706024
5563	NC_018643	TCA	2	6	400475	400480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706024
5564	NC_018643	TGT	2	6	400529	400534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706024
5565	NC_018643	AGT	2	6	400541	400546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706024
5566	NC_018643	TGC	2	6	400562	400567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706024
5567	NC_018643	CTT	3	9	400635	400643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706024
5568	NC_018643	ATA	2	6	400692	400697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706024
5569	NC_018643	AGG	2	6	400739	400744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406706024
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5571	NC_018643	GGA	2	6	400848	400853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406706024
5572	NC_018643	TAA	2	6	401088	401093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706025
5573	NC_018643	GTA	2	6	401267	401272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706025
5574	NC_018643	GAA	2	6	401280	401285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706025
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5579	NC_018643	AGA	2	6	401988	401993	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706026
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5585	NC_018643	AGA	2	6	402363	402368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706026
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5587	NC_018643	AGA	2	6	402415	402420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706026
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5591	NC_018643	AGA	2	6	402535	402540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706026
5592	NC_018643	GAA	2	6	402568	402573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706026
5593	NC_018643	GAG	2	6	402586	402591	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406706026
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5606	NC_018643	TTC	2	6	403954	403959	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406706027
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5977	NC_018643	TAT	2	6	430691	430696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706055
5978	NC_018643	GAT	2	6	430703	430708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406706055
5979	NC_018643	CAT	2	6	430766	430771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706055
5980	NC_018643	ACT	2	6	430818	430823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706055
5981	NC_018643	CAT	2	6	430889	430894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706055
5982	NC_018643	CTA	2	6	430973	430978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706055
5983	NC_018643	AGA	2	6	431032	431037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406706055
5984	NC_018643	AGG	2	6	431265	431270	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406706056
5985	NC_018643	GCT	3	9	431272	431280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706056
5986	NC_018643	AGG	2	6	431298	431303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406706056
5987	NC_018643	ATA	2	6	431413	431418	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706056
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5989	NC_018643	TCA	2	6	431432	431437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406706056
5990	NC_018643	ATT	2	6	431525	431530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406706056
5991	NC_018643	TGT	2	6	431573	431578	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406706056
5992	NC_018643	CTG	2	6	431705	431710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406706056
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6000	NC_018643	ATA	2	6	432301	432306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406706057

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