MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 18710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_018643	ATG	2	6	216757	216762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705818
3002	NC_018643	ATA	2	6	216811	216816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705818
3003	NC_018643	CCT	2	6	216888	216893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705818
3004	NC_018643	CAA	2	6	216934	216939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705818
3005	NC_018643	CAT	2	6	216981	216986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705818
3006	NC_018643	AAC	2	6	217000	217005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705818
3007	NC_018643	AGA	2	6	217028	217033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3008	NC_018643	TTA	2	6	217050	217055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705818
3009	NC_018643	AGA	2	6	217059	217064	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3010	NC_018643	GAA	2	6	217122	217127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705818
3011	NC_018643	TTG	2	6	217141	217146	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705818
3012	NC_018643	AAT	2	6	217172	217177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705818
3013	NC_018643	ATC	2	6	217231	217236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705818
3014	NC_018643	GCA	2	6	217541	217546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705819
3015	NC_018643	CAA	2	6	217554	217559	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705819
3016	NC_018643	GTT	2	6	217714	217719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705819
3017	NC_018643	ATT	2	6	217746	217751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705819
3018	NC_018643	CAA	2	6	217779	217784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705819
3019	NC_018643	ATT	2	6	217793	217798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705819
3020	NC_018643	ATG	2	6	217818	217823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705819
3021	NC_018643	TGC	2	6	217984	217989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705819
3022	NC_018643	ATG	2	6	218034	218039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705819
3023	NC_018643	ATA	2	6	218085	218090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705819
3024	NC_018643	GAA	2	6	218118	218123	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705819
3025	NC_018643	GGA	2	6	218186	218191	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705819
3026	NC_018643	AAG	2	6	218198	218203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705819
3027	NC_018643	CAA	2	6	218271	218276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705819
3028	NC_018643	AAG	2	6	218346	218351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705819
3029	NC_018643	ATT	2	6	218376	218381	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705819
3030	NC_018643	CAG	2	6	218436	218441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705820
3031	NC_018643	AGA	2	6	218452	218457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705820
3032	NC_018643	TCT	2	6	218464	218469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705820
3033	NC_018643	CAT	2	6	218607	218612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3034	NC_018643	CTG	2	6	218691	218696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705820
3035	NC_018643	TGT	2	6	218715	218720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705820
3036	NC_018643	TAA	2	6	218759	218764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3037	NC_018643	CTT	2	6	218874	218879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705820
3038	NC_018643	ACA	2	6	218924	218929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705820
3039	NC_018643	TGT	2	6	218950	218955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705820
3040	NC_018643	GTT	2	6	219054	219059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705820
3041	NC_018643	CAT	2	6	219120	219125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3042	NC_018643	TCA	2	6	219320	219325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3043	NC_018643	TCA	2	6	219353	219358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3044	NC_018643	TCA	2	6	219402	219407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3045	NC_018643	AAT	2	6	219435	219440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3046	NC_018643	TGA	2	6	219442	219447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705820
3047	NC_018643	CAT	2	6	219459	219464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3048	NC_018643	ATA	2	6	219473	219478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3049	NC_018643	ATA	2	6	219545	219550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3050	NC_018643	CAT	2	6	219555	219560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705820
3051	NC_018643	ACA	2	6	219572	219577	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705820
3052	NC_018643	AAT	2	6	219605	219610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705820
3053	NC_018643	TTC	2	6	219713	219718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705821
3054	NC_018643	AAC	2	6	219797	219802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705821
3055	NC_018643	TCA	2	6	219807	219812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705821
3056	NC_018643	CCA	2	6	219898	219903	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705821
3057	NC_018643	ATA	2	6	219924	219929	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705821
3058	NC_018643	TCT	2	6	219975	219980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705821
3059	NC_018643	GAT	2	6	220272	220277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705822
3060	NC_018643	AGA	2	6	220358	220363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705822
3061	NC_018643	GTT	2	6	220504	220509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705823
3062	NC_018643	CAT	2	6	220669	220674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705823
3063	NC_018643	ATC	2	6	220775	220780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705823
3064	NC_018643	TGA	2	6	220815	220820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705824
3065	NC_018643	TTA	2	6	220856	220861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705824
3066	NC_018643	TTG	2	6	220976	220981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705824
3067	NC_018643	AGG	2	6	220989	220994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705824
3068	NC_018643	AAC	2	6	221010	221015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705824
3069	NC_018643	TGA	2	6	221082	221087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705824
3070	NC_018643	TGA	2	6	221259	221264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705824
3071	NC_018643	ATT	2	6	221364	221369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705824
3072	NC_018643	ATA	2	6	221576	221581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705824
3073	NC_018643	TAT	2	6	221761	221766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3074	NC_018643	AAT	2	6	221826	221831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705825
3075	NC_018643	GAA	2	6	221871	221876	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705825
3076	NC_018643	TGG	2	6	221969	221974	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705825
3077	NC_018643	TGC	2	6	221978	221983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705825
3078	NC_018643	GCA	2	6	222162	222167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705825
3079	NC_018643	TTA	2	6	222204	222209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3080	NC_018643	TTA	2	6	222333	222338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3081	NC_018643	TAA	2	6	222449	222454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705825
3082	NC_018643	ATT	2	6	222480	222485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3083	NC_018643	AGG	2	6	222656	222661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705825
3084	NC_018643	TTA	3	9	222714	222722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3085	NC_018643	GAT	2	6	222723	222728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705825
3086	NC_018643	TTA	2	6	222792	222797	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705825
3087	NC_018643	AGC	2	6	222821	222826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705825
3088	NC_018643	ATA	2	6	222859	222864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705825
3089	NC_018643	GAA	2	6	222874	222879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705825
3090	NC_018643	CTT	2	6	222909	222914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705825
3091	NC_018643	CTA	2	6	223164	223169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705826
3092	NC_018643	GCT	2	6	223214	223219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705826
3093	NC_018643	GAA	2	6	223356	223361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705826
3094	NC_018643	AAC	2	6	223396	223401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705826
3095	NC_018643	GTT	2	6	223415	223420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705826
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3097	NC_018643	GAA	2	6	223514	223519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705826
3098	NC_018643	TTA	2	6	223520	223525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705826
3099	NC_018643	ATG	2	6	223742	223747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705826
3100	NC_018643	GGT	2	6	223811	223816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705826
3101	NC_018643	AGA	2	6	223856	223861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705826
3102	NC_018643	ACA	2	6	223901	223906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705826
3103	NC_018643	GTT	2	6	223916	223921	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705826
3104	NC_018643	CAC	2	6	223935	223940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705826
3105	NC_018643	GTT	2	6	223949	223954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705826
3106	NC_018643	TAG	2	6	224001	224006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705826
3107	NC_018643	ATT	2	6	224027	224032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705826
3108	NC_018643	TGC	2	6	224125	224130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705826
3109	NC_018643	TAC	2	6	224230	224235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705826
3110	NC_018643	AAG	2	6	224241	224246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705826
3111	NC_018643	CAG	2	6	224259	224264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705826
3112	NC_018643	CTA	2	6	224274	224279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705826
3113	NC_018643	TAA	2	6	224397	224402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705827
3114	NC_018643	AAC	2	6	224421	224426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705827
3115	NC_018643	GAA	2	6	224445	224450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705827
3116	NC_018643	AAT	2	6	224488	224493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705827
3117	NC_018643	TGG	2	6	224607	224612	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705827
3118	NC_018643	GAT	2	6	224794	224799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705827
3119	NC_018643	TGA	2	6	224838	224843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705827
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3121	NC_018643	GGT	2	6	224950	224955	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705827
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3236	NC_018643	ATT	2	6	233310	233315	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705835
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3358	NC_018643	ATT	2	6	243460	243465	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705847
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3360	NC_018643	AGA	2	6	243625	243630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705847
3361	NC_018643	ATT	2	6	243781	243786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705847
3362	NC_018643	GAA	2	6	243914	243919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705847
3363	NC_018643	GAA	2	6	244121	244126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705847
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3385	NC_018643	TGA	2	6	245860	245865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705848
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3475	NC_018643	AAC	2	6	252584	252589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705856
3476	NC_018643	GAA	2	6	252657	252662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705856
3477	NC_018643	TTC	2	6	252686	252691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3478	NC_018643	CTT	2	6	252760	252765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3479	NC_018643	TCT	2	6	252848	252853	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3480	NC_018643	TTC	2	6	252913	252918	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3481	NC_018643	TTG	2	6	252925	252930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
3482	NC_018643	TTG	2	6	252958	252963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
3483	NC_018643	TCT	2	6	253089	253094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3484	NC_018643	GAA	2	6	253148	253153	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705856
3485	NC_018643	CAT	2	6	253192	253197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3486	NC_018643	CAT	2	6	253226	253231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3487	NC_018643	AGG	2	6	253271	253276	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705856
3488	NC_018643	TTC	2	6	253300	253305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
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3490	NC_018643	TCT	2	6	253473	253478	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3491	NC_018643	TGC	2	6	253514	253519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705856
3492	NC_018643	TGA	2	6	253632	253637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705856
3493	NC_018643	TTC	2	6	253708	253713	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
3494	NC_018643	CAT	2	6	253991	253996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705856
3495	NC_018643	TTG	2	6	254108	254113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705856
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3497	NC_018643	CAA	2	6	254274	254279	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705856
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3499	NC_018643	TTC	2	6	254333	254338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705856
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