MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 1424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017846	CTTGG	2	10	371	380	0 %	40 %	40 %	20 %	387119834
2	NC_017846	ATTTT	2	10	1033	1042	20 %	80 %	0 %	0 %	387119834
3	NC_017846	ATCAC	2	10	5155	5164	40 %	20 %	0 %	40 %	387119841
4	NC_017846	CGGAG	2	10	10748	10757	20 %	0 %	60 %	20 %	387119846
5	NC_017846	TTAAT	2	10	10982	10991	40 %	60 %	0 %	0 %	387119846
6	NC_017846	CGGGG	2	10	11807	11816	0 %	0 %	80 %	20 %	387119847
7	NC_017846	CTGAA	2	10	12046	12055	40 %	20 %	20 %	20 %	387119847
8	NC_017846	CGGTG	2	10	13996	14005	0 %	20 %	60 %	20 %	387119848
9	NC_017846	CTTGC	2	10	14388	14397	0 %	40 %	20 %	40 %	387119849
10	NC_017846	CGAAC	2	10	15216	15225	40 %	0 %	20 %	40 %	387119849
11	NC_017846	TTATT	2	10	16306	16315	20 %	80 %	0 %	0 %	387119850
12	NC_017846	TTTGG	2	10	16422	16431	0 %	60 %	40 %	0 %	387119851
13	NC_017846	CAATT	2	10	16718	16727	40 %	40 %	0 %	20 %	387119851
14	NC_017846	TCCAA	2	10	17155	17164	40 %	20 %	0 %	40 %	387119851
15	NC_017846	AAATT	2	10	20257	20266	60 %	40 %	0 %	0 %	387119854
16	NC_017846	CCAGC	2	10	21181	21190	20 %	0 %	20 %	60 %	387119855
17	NC_017846	AAATT	2	10	22964	22973	60 %	40 %	0 %	0 %	387119856
18	NC_017846	ACGGC	2	10	24083	24092	20 %	0 %	40 %	40 %	387119857
19	NC_017846	CACAA	2	10	24594	24603	60 %	0 %	0 %	40 %	387119858
20	NC_017846	GCCTT	2	10	27878	27887	0 %	40 %	20 %	40 %	387119860
21	NC_017846	ACGTT	2	10	27997	28006	20 %	40 %	20 %	20 %	387119860
22	NC_017846	CCGCC	2	10	29477	29486	0 %	0 %	20 %	80 %	387119861
23	NC_017846	TGTGG	2	10	30350	30359	0 %	40 %	60 %	0 %	387119862
24	NC_017846	TTTAT	2	10	33501	33510	20 %	80 %	0 %	0 %	387119866
25	NC_017846	AAAAC	2	10	34161	34170	80 %	0 %	0 %	20 %	387119867
26	NC_017846	AAAAT	2	10	38080	38089	80 %	20 %	0 %	0 %	387119872
27	NC_017846	CACCG	2	10	38310	38319	20 %	0 %	20 %	60 %	387119873
28	NC_017846	GTTTG	2	10	39561	39570	0 %	60 %	40 %	0 %	387119873
29	NC_017846	ACGCC	2	10	40624	40633	20 %	0 %	20 %	60 %	387119875
30	NC_017846	GCGGG	2	10	48719	48728	0 %	0 %	80 %	20 %	387119882
31	NC_017846	GATAA	2	10	50505	50514	60 %	20 %	20 %	0 %	387119883
32	NC_017846	AATTG	2	10	50569	50578	40 %	40 %	20 %	0 %	387119883
33	NC_017846	ACCGC	2	10	50730	50739	20 %	0 %	20 %	60 %	387119884
34	NC_017846	TGCAC	2	10	51162	51171	20 %	20 %	20 %	40 %	387119884
35	NC_017846	TTCCC	2	10	51777	51786	0 %	40 %	0 %	60 %	387119884
36	NC_017846	GTACC	2	10	53254	53263	20 %	20 %	20 %	40 %	387119884
37	NC_017846	GTTCA	2	10	54334	54343	20 %	40 %	20 %	20 %	387119885
38	NC_017846	GGGTC	2	10	55811	55820	0 %	20 %	60 %	20 %	387119887
39	NC_017846	TTTGG	2	10	57526	57535	0 %	60 %	40 %	0 %	387119888
40	NC_017846	TTGCC	2	10	58972	58981	0 %	40 %	20 %	40 %	387119888
41	NC_017846	TTTGC	2	10	59047	59056	0 %	60 %	20 %	20 %	387119888
42	NC_017846	CAAGG	2	10	59938	59947	40 %	0 %	40 %	20 %	387119889
43	NC_017846	AACTT	2	10	62982	62991	40 %	40 %	0 %	20 %	387119891
44	NC_017846	CTGAA	2	10	65524	65533	40 %	20 %	20 %	20 %	387119893
45	NC_017846	AACGA	2	10	67660	67669	60 %	0 %	20 %	20 %	387119896
46	NC_017846	ACGCA	2	10	70299	70308	40 %	0 %	20 %	40 %	387119898
47	NC_017846	CGCTA	2	10	71582	71591	20 %	20 %	20 %	40 %	387119899
48	NC_017846	CGGCA	2	10	71911	71920	20 %	0 %	40 %	40 %	387119900
49	NC_017846	ACGCA	2	10	72639	72648	40 %	0 %	20 %	40 %	387119900
50	NC_017846	ATTGT	2	10	73059	73068	20 %	60 %	20 %	0 %	387119900
51	NC_017846	AACAC	2	10	76630	76639	60 %	0 %	0 %	40 %	387119901
52	NC_017846	CAAAA	2	10	84965	84974	80 %	0 %	0 %	20 %	387119908
53	NC_017846	GTCCG	2	10	85163	85172	0 %	20 %	40 %	40 %	387119909
54	NC_017846	GCAAT	2	10	86049	86058	40 %	20 %	20 %	20 %	387119909
55	NC_017846	ATACC	2	10	87110	87119	40 %	20 %	0 %	40 %	387119909
56	NC_017846	GTGCG	2	10	88134	88143	0 %	20 %	60 %	20 %	387119910
57	NC_017846	ACCCA	2	10	88786	88795	40 %	0 %	0 %	60 %	387119910
58	NC_017846	AAGGC	2	10	89051	89060	40 %	0 %	40 %	20 %	387119910
59	NC_017846	GGTTA	2	10	90995	91004	20 %	40 %	40 %	0 %	387119912
60	NC_017846	TAAAT	2	10	95344	95353	60 %	40 %	0 %	0 %	387119914
61	NC_017846	ATTTA	2	10	95886	95895	40 %	60 %	0 %	0 %	387119915
62	NC_017846	AAATA	2	10	97189	97198	80 %	20 %	0 %	0 %	387119916
63	NC_017846	GGCAA	2	10	98250	98259	40 %	0 %	40 %	20 %	387119916
64	NC_017846	ATTTT	2	10	99962	99971	20 %	80 %	0 %	0 %	387119917
65	NC_017846	TCGAA	2	10	100613	100622	40 %	20 %	20 %	20 %	387119919
66	NC_017846	TGCAA	2	10	104808	104817	40 %	20 %	20 %	20 %	387119924
67	NC_017846	TGATG	2	10	105092	105101	20 %	40 %	40 %	0 %	387119924
68	NC_017846	AAAAT	2	10	105719	105728	80 %	20 %	0 %	0 %	387119926
69	NC_017846	CTTGT	3	15	106056	106070	0 %	60 %	20 %	20 %	387119926
70	NC_017846	AAAAT	2	10	107891	107900	80 %	20 %	0 %	0 %	387119929
71	NC_017846	CATTT	2	10	109531	109540	20 %	60 %	0 %	20 %	387119930
72	NC_017846	GCCGC	2	10	110656	110665	0 %	0 %	40 %	60 %	387119931
73	NC_017846	CAAAC	2	10	112412	112421	60 %	0 %	0 %	40 %	387119932
74	NC_017846	CAACG	2	10	112673	112682	40 %	0 %	20 %	40 %	387119932
75	NC_017846	CCGGC	2	10	112974	112983	0 %	0 %	40 %	60 %	387119933
76	NC_017846	CGGCG	2	10	113332	113341	0 %	0 %	60 %	40 %	387119933
77	NC_017846	GATTT	2	10	117223	117232	20 %	60 %	20 %	0 %	387119935
78	NC_017846	CGGCG	2	10	122816	122825	0 %	0 %	60 %	40 %	387119942
79	NC_017846	TGCCG	2	10	123811	123820	0 %	20 %	40 %	40 %	387119943
80	NC_017846	AACCA	2	10	124493	124502	60 %	0 %	0 %	40 %	387119943
81	NC_017846	CGCTT	2	10	124636	124645	0 %	40 %	20 %	40 %	387119943
82	NC_017846	TTAAA	2	10	125403	125412	60 %	40 %	0 %	0 %	387119943
83	NC_017846	AATCG	2	10	127109	127118	40 %	20 %	20 %	20 %	387119944
84	NC_017846	AACAG	2	10	127123	127132	60 %	0 %	20 %	20 %	387119944
85	NC_017846	TACGA	2	10	128070	128079	40 %	20 %	20 %	20 %	387119945
86	NC_017846	AAGCG	2	10	128800	128809	40 %	0 %	40 %	20 %	387119946
87	NC_017846	CCCTG	2	10	131824	131833	0 %	20 %	20 %	60 %	387119950
88	NC_017846	GCCAC	2	10	133421	133430	20 %	0 %	20 %	60 %	387119952
89	NC_017846	AATCG	2	10	133583	133592	40 %	20 %	20 %	20 %	387119952
90	NC_017846	GCTAC	2	10	133964	133973	20 %	20 %	20 %	40 %	387119952
91	NC_017846	ACACC	2	10	135316	135325	40 %	0 %	0 %	60 %	387119953
92	NC_017846	AAGGC	2	10	138478	138487	40 %	0 %	40 %	20 %	387119958
93	NC_017846	GAAAA	2	10	144008	144017	80 %	0 %	20 %	0 %	387119962
94	NC_017846	TGATG	2	10	144523	144532	20 %	40 %	40 %	0 %	387119963
95	NC_017846	AAATC	2	10	146379	146388	60 %	20 %	0 %	20 %	387119965
96	NC_017846	TTCGC	2	10	147188	147197	0 %	40 %	20 %	40 %	387119965
97	NC_017846	ATTTT	2	10	149510	149519	20 %	80 %	0 %	0 %	387119967
98	NC_017846	ATTAA	2	10	154533	154542	60 %	40 %	0 %	0 %	387119973
99	NC_017846	TAAAC	2	10	154664	154673	60 %	20 %	0 %	20 %	387119973
100	NC_017846	AAAAT	2	10	155131	155140	80 %	20 %	0 %	0 %	387119973
101	NC_017846	TATAA	2	10	156074	156083	60 %	40 %	0 %	0 %	387119974
102	NC_017846	GGCAT	2	10	158246	158255	20 %	20 %	40 %	20 %	387119976
103	NC_017846	GTTCT	2	10	158503	158512	0 %	60 %	20 %	20 %	387119976
104	NC_017846	ATCAA	2	10	159338	159347	60 %	20 %	0 %	20 %	387119976
105	NC_017846	CTTCA	2	10	159744	159753	20 %	40 %	0 %	40 %	387119977
106	NC_017846	TGCGG	2	10	160718	160727	0 %	20 %	60 %	20 %	387119978
107	NC_017846	CTGCC	2	10	161480	161489	0 %	20 %	20 %	60 %	387119979
108	NC_017846	CAAGC	2	10	161625	161634	40 %	0 %	20 %	40 %	387119979
109	NC_017846	TGGCA	2	10	162656	162665	20 %	20 %	40 %	20 %	387119980
110	NC_017846	AATGT	2	10	164969	164978	40 %	40 %	20 %	0 %	387119982
111	NC_017846	ACCAC	2	10	165258	165267	40 %	0 %	0 %	60 %	387119982
112	NC_017846	AATCC	2	10	166057	166066	40 %	20 %	0 %	40 %	387119982
113	NC_017846	ATTTG	2	10	168445	168454	20 %	60 %	20 %	0 %	387119983
114	NC_017846	TCTGC	2	10	168533	168542	0 %	40 %	20 %	40 %	387119983
115	NC_017846	GTAAA	2	10	168544	168553	60 %	20 %	20 %	0 %	387119983
116	NC_017846	GATTG	2	10	168563	168572	20 %	40 %	40 %	0 %	387119983
117	NC_017846	AAATA	2	10	168649	168658	80 %	20 %	0 %	0 %	387119983
118	NC_017846	GATGG	2	10	170133	170142	20 %	20 %	60 %	0 %	387119985
119	NC_017846	CCAAC	2	10	171579	171588	40 %	0 %	0 %	60 %	387119987
120	NC_017846	CCCGG	2	10	172571	172580	0 %	0 %	40 %	60 %	387119988
121	NC_017846	ACTTT	2	10	175064	175073	20 %	60 %	0 %	20 %	387119990
122	NC_017846	TTTCC	2	10	175957	175966	0 %	60 %	0 %	40 %	387119991
123	NC_017846	ACGCA	2	10	176992	177001	40 %	0 %	20 %	40 %	387119992
124	NC_017846	GATTT	2	10	178558	178567	20 %	60 %	20 %	0 %	387119995
125	NC_017846	ACGGC	2	10	179158	179167	20 %	0 %	40 %	40 %	387119995
126	NC_017846	AACCA	2	10	179340	179349	60 %	0 %	0 %	40 %	387119995
127	NC_017846	CATAA	2	10	180390	180399	60 %	20 %	0 %	20 %	387119996
128	NC_017846	CAAAC	2	10	181939	181948	60 %	0 %	0 %	40 %	387119998
129	NC_017846	ACGCC	2	10	182381	182390	20 %	0 %	20 %	60 %	387119998
130	NC_017846	CTGCT	2	10	184100	184109	0 %	40 %	20 %	40 %	387119999
131	NC_017846	TGATT	2	10	185296	185305	20 %	60 %	20 %	0 %	387119999
132	NC_017846	ACCAA	2	10	185740	185749	60 %	0 %	0 %	40 %	387119999
133	NC_017846	AGCTT	2	10	186108	186117	20 %	40 %	20 %	20 %	387119999
134	NC_017846	CCGGT	2	10	190869	190878	0 %	20 %	40 %	40 %	387120003
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