MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 1424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017846	ACGGC	2	10	822344	822353	20 %	0 %	40 %	40 %	387120610
502	NC_017846	ACGCA	2	10	822770	822779	40 %	0 %	20 %	40 %	387120611
503	NC_017846	AAGTG	2	10	822985	822994	40 %	20 %	40 %	0 %	387120611
504	NC_017846	TTGCG	2	10	825258	825267	0 %	40 %	40 %	20 %	387120614
505	NC_017846	GAAAA	2	10	828358	828367	80 %	0 %	20 %	0 %	387120618
506	NC_017846	CTCGC	2	10	831498	831507	0 %	20 %	20 %	60 %	387120620
507	NC_017846	TTGAT	2	10	837304	837313	20 %	60 %	20 %	0 %	387120626
508	NC_017846	CAGTG	2	10	838494	838503	20 %	20 %	40 %	20 %	387120627
509	NC_017846	ACGCC	2	10	838613	838622	20 %	0 %	20 %	60 %	387120627
510	NC_017846	GAGAA	2	10	839348	839357	60 %	0 %	40 %	0 %	387120627
511	NC_017846	CCTTG	2	10	839930	839939	0 %	40 %	20 %	40 %	387120627
512	NC_017846	AATCC	2	10	843094	843103	40 %	20 %	0 %	40 %	387120631
513	NC_017846	TAATT	2	10	844450	844459	40 %	60 %	0 %	0 %	387120632
514	NC_017846	TACAA	2	10	847782	847791	60 %	20 %	0 %	20 %	387120634
515	NC_017846	CCGAT	2	10	848939	848948	20 %	20 %	20 %	40 %	387120636
516	NC_017846	TTTAT	2	10	853748	853757	20 %	80 %	0 %	0 %	387120642
517	NC_017846	AATTT	2	10	854476	854485	40 %	60 %	0 %	0 %	387120643
518	NC_017846	AAAAT	2	10	854951	854960	80 %	20 %	0 %	0 %	387120644
519	NC_017846	ACATC	2	10	856339	856348	40 %	20 %	0 %	40 %	387120645
520	NC_017846	GATTT	2	10	857875	857884	20 %	60 %	20 %	0 %	387120646
521	NC_017846	CGGCA	2	10	858977	858986	20 %	0 %	40 %	40 %	387120647
522	NC_017846	CGCAC	2	10	859521	859530	20 %	0 %	20 %	60 %	387120647
523	NC_017846	GTCAA	2	10	860680	860689	40 %	20 %	20 %	20 %	387120648
524	NC_017846	TTGCC	2	10	861424	861433	0 %	40 %	20 %	40 %	387120649
525	NC_017846	AAAGA	2	10	862217	862226	80 %	0 %	20 %	0 %	387120649
526	NC_017846	TATTT	2	10	862486	862495	20 %	80 %	0 %	0 %	387120650
527	NC_017846	GGATG	2	10	863324	863333	20 %	20 %	60 %	0 %	387120650
528	NC_017846	ATAAA	2	10	864464	864473	80 %	20 %	0 %	0 %	387120651
529	NC_017846	TTTTA	2	10	865235	865244	20 %	80 %	0 %	0 %	387120653
530	NC_017846	AAATC	2	10	865484	865493	60 %	20 %	0 %	20 %	387120653
531	NC_017846	TAAAG	2	10	867655	867664	60 %	20 %	20 %	0 %	387120653
532	NC_017846	TTACC	2	10	868732	868741	20 %	40 %	0 %	40 %	387120655
533	NC_017846	ATTCA	2	10	872255	872264	40 %	40 %	0 %	20 %	387120658
534	NC_017846	CTGAC	2	10	873901	873910	20 %	20 %	20 %	40 %	387120660
535	NC_017846	TAAAA	2	10	875728	875737	80 %	20 %	0 %	0 %	387120662
536	NC_017846	CGCAT	2	10	879058	879067	20 %	20 %	20 %	40 %	387120666
537	NC_017846	TTCAC	2	10	880847	880856	20 %	40 %	0 %	40 %	387120667
538	NC_017846	CTTCG	2	10	881109	881118	0 %	40 %	20 %	40 %	387120668
539	NC_017846	ATTTT	2	10	881626	881635	20 %	80 %	0 %	0 %	387120669
540	NC_017846	TGCCG	2	10	881902	881911	0 %	20 %	40 %	40 %	387120669
541	NC_017846	TTTGA	2	10	885236	885245	20 %	60 %	20 %	0 %	387120671
542	NC_017846	TACAA	2	10	887105	887114	60 %	20 %	0 %	20 %	387120673
543	NC_017846	AAAAT	2	10	888084	888093	80 %	20 %	0 %	0 %	387120674
544	NC_017846	AATTT	2	10	888868	888877	40 %	60 %	0 %	0 %	387120675
545	NC_017846	GTGCG	2	10	889057	889066	0 %	20 %	60 %	20 %	387120675
546	NC_017846	TATTT	2	10	890712	890721	20 %	80 %	0 %	0 %	387120677
547	NC_017846	GATTT	2	10	892432	892441	20 %	60 %	20 %	0 %	387120679
548	NC_017846	AGAAT	2	10	895937	895946	60 %	20 %	20 %	0 %	387120681
549	NC_017846	ATTTA	2	10	898609	898618	40 %	60 %	0 %	0 %	387120681
550	NC_017846	TTTTC	2	10	902816	902825	0 %	80 %	0 %	20 %	387120687
551	NC_017846	ACGCC	2	10	903284	903293	20 %	0 %	20 %	60 %	387120687
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553	NC_017846	TCACC	2	10	905071	905080	20 %	20 %	0 %	60 %	387120690
554	NC_017846	TCGGG	2	10	905697	905706	0 %	20 %	60 %	20 %	387120691
555	NC_017846	TTGCT	2	10	905959	905968	0 %	60 %	20 %	20 %	387120691
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557	NC_017846	AAATA	2	10	913293	913302	80 %	20 %	0 %	0 %	387120699
558	NC_017846	GACCA	2	10	914497	914506	40 %	0 %	20 %	40 %	387120700
559	NC_017846	TCGGT	2	10	915923	915932	0 %	40 %	40 %	20 %	387120701
560	NC_017846	ACCAA	2	10	916888	916897	60 %	0 %	0 %	40 %	387120702
561	NC_017846	CAAAT	2	10	917089	917098	60 %	20 %	0 %	20 %	387120702
562	NC_017846	AATGC	2	10	919075	919084	40 %	20 %	20 %	20 %	387120703
563	NC_017846	TTTGC	2	10	919655	919664	0 %	60 %	20 %	20 %	387120703
564	NC_017846	AAGGC	2	10	921143	921152	40 %	0 %	40 %	20 %	387120706
565	NC_017846	ACAAA	2	10	922231	922240	80 %	0 %	0 %	20 %	387120707
566	NC_017846	AAAGA	2	10	922457	922466	80 %	0 %	20 %	0 %	387120708
567	NC_017846	AAAAT	2	10	923894	923903	80 %	20 %	0 %	0 %	387120709
568	NC_017846	TTTCA	2	10	926129	926138	20 %	60 %	0 %	20 %	387120713
569	NC_017846	TGATT	2	10	926386	926395	20 %	60 %	20 %	0 %	387120713
570	NC_017846	GAAAA	2	10	926581	926590	80 %	0 %	20 %	0 %	387120713
571	NC_017846	TTTCA	2	10	926983	926992	20 %	60 %	0 %	20 %	387120714
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575	NC_017846	TTGCA	2	10	935900	935909	20 %	40 %	20 %	20 %	387120722
576	NC_017846	TGCCG	2	10	939282	939291	0 %	20 %	40 %	40 %	387120723
577	NC_017846	CAGTG	2	10	940815	940824	20 %	20 %	40 %	20 %	387120723
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579	NC_017846	TCGGT	2	10	943662	943671	0 %	40 %	40 %	20 %	387120725
580	NC_017846	GTTAA	2	10	944279	944288	40 %	40 %	20 %	0 %	387120725
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582	NC_017846	CTTTA	2	10	945149	945158	20 %	60 %	0 %	20 %	387120727
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585	NC_017846	AGGTG	2	10	947106	947115	20 %	20 %	60 %	0 %	387120729
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594	NC_017846	GCCGT	2	10	959863	959872	0 %	20 %	40 %	40 %	387120740
595	NC_017846	TTTGT	2	10	961333	961342	0 %	80 %	20 %	0 %	387120742
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599	NC_017846	CGGTT	2	10	970370	970379	0 %	40 %	40 %	20 %	387120751
600	NC_017846	CAAAC	2	10	971870	971879	60 %	0 %	0 %	40 %	387120753
601	NC_017846	GAGCT	2	10	973677	973686	20 %	20 %	40 %	20 %	387120755
602	NC_017846	CTTCA	2	10	973894	973903	20 %	40 %	0 %	40 %	387120756
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609	NC_017846	TTTCA	2	10	983668	983677	20 %	60 %	0 %	20 %	387120767
610	NC_017846	ATTTT	2	10	984455	984464	20 %	80 %	0 %	0 %	387120767
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613	NC_017846	AAGCA	2	10	993820	993829	60 %	0 %	20 %	20 %	387120777
614	NC_017846	CGAAC	2	10	994760	994769	40 %	0 %	20 %	40 %	387120781
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616	NC_017846	TTTTC	2	10	997765	997774	0 %	80 %	0 %	20 %	387120785
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619	NC_017846	TGCCG	2	10	1005704	1005713	0 %	20 %	40 %	40 %	387120793
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622	NC_017846	GCACG	2	10	1012212	1012221	20 %	0 %	40 %	40 %	387120800
623	NC_017846	ACAAA	2	10	1015035	1015044	80 %	0 %	0 %	20 %	387120801
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625	NC_017846	CTTTT	2	10	1016759	1016768	0 %	80 %	0 %	20 %	387120804
626	NC_017846	CGCCA	2	10	1018016	1018025	20 %	0 %	20 %	60 %	387120805
627	NC_017846	CGGCA	2	10	1019417	1019426	20 %	0 %	40 %	40 %	387120805
628	NC_017846	ATTCA	2	10	1019924	1019933	40 %	40 %	0 %	20 %	387120805
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