MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans D7S-1 chromosome

Total Repeats: 1424

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_017846	AATAA	2	10	1605561	1605570	80 %	20 %	0 %	0 %	387121401
1002	NC_017846	ATTTT	2	10	1605862	1605871	20 %	80 %	0 %	0 %	387121402
1003	NC_017846	ATAAA	2	10	1609043	1609052	80 %	20 %	0 %	0 %	387121404
1004	NC_017846	TTTGC	2	10	1610506	1610515	0 %	60 %	20 %	20 %	387121407
1005	NC_017846	TACGA	2	10	1610623	1610632	40 %	20 %	20 %	20 %	387121407
1006	NC_017846	GCGCG	2	10	1611754	1611763	0 %	0 %	60 %	40 %	387121408
1007	NC_017846	GAAAA	2	10	1612594	1612603	80 %	0 %	20 %	0 %	387121408
1008	NC_017846	AGGGC	2	10	1612672	1612681	20 %	0 %	60 %	20 %	387121408
1009	NC_017846	GCGGT	2	10	1614503	1614512	0 %	20 %	60 %	20 %	387121412
1010	NC_017846	GCGGT	2	10	1616900	1616909	0 %	20 %	60 %	20 %	387121413
1011	NC_017846	TGCAG	2	10	1616994	1617003	20 %	20 %	40 %	20 %	387121413
1012	NC_017846	GCTTA	2	10	1617801	1617810	20 %	40 %	20 %	20 %	387121414
1013	NC_017846	CAAAA	2	10	1618160	1618169	80 %	0 %	0 %	20 %	387121414
1014	NC_017846	CGCAC	2	10	1620179	1620188	20 %	0 %	20 %	60 %	387121415
1015	NC_017846	GCAAG	2	10	1620853	1620862	40 %	0 %	40 %	20 %	387121416
1016	NC_017846	CGGTG	2	10	1621355	1621364	0 %	20 %	60 %	20 %	387121418
1017	NC_017846	CAGAA	2	10	1621377	1621386	60 %	0 %	20 %	20 %	387121418
1018	NC_017846	TTATC	2	10	1621959	1621968	20 %	60 %	0 %	20 %	387121418
1019	NC_017846	CGGCA	2	10	1623112	1623121	20 %	0 %	40 %	40 %	387121419
1020	NC_017846	TTCAC	2	10	1627873	1627882	20 %	40 %	0 %	40 %	387121424
1021	NC_017846	CCATA	2	10	1628533	1628542	40 %	20 %	0 %	40 %	387121424
1022	NC_017846	AGGTG	2	10	1628555	1628564	20 %	20 %	60 %	0 %	387121424
1023	NC_017846	GCACC	2	10	1629655	1629664	20 %	0 %	20 %	60 %	387121425
1024	NC_017846	TGCCG	2	10	1630477	1630486	0 %	20 %	40 %	40 %	387121426
1025	NC_017846	CCCCG	2	10	1631572	1631581	0 %	0 %	20 %	80 %	387121427
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1028	NC_017846	TATCT	2	10	1633173	1633182	20 %	60 %	0 %	20 %	387121429
1029	NC_017846	TGTAA	2	10	1633902	1633911	40 %	40 %	20 %	0 %	387121429
1030	NC_017846	TGATT	2	10	1634612	1634621	20 %	60 %	20 %	0 %	387121429
1031	NC_017846	TCTTT	2	10	1636652	1636661	0 %	80 %	0 %	20 %	387121430
1032	NC_017846	TGGCT	2	10	1639193	1639202	0 %	40 %	40 %	20 %	387121434
1033	NC_017846	TGTTT	2	10	1639862	1639871	0 %	80 %	20 %	0 %	387121434
1034	NC_017846	AGGTG	2	10	1640487	1640496	20 %	20 %	60 %	0 %	387121435
1035	NC_017846	CCACC	2	10	1641747	1641756	20 %	0 %	0 %	80 %	387121437
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1039	NC_017846	TAAAA	2	10	1655120	1655129	80 %	20 %	0 %	0 %	387121448
1040	NC_017846	ATTTT	2	10	1657209	1657218	20 %	80 %	0 %	0 %	387121451
1041	NC_017846	TGGAA	2	10	1657864	1657873	40 %	20 %	40 %	0 %	387121452
1042	NC_017846	CGTTT	2	10	1658986	1658995	0 %	60 %	20 %	20 %	387121453
1043	NC_017846	TTTCA	2	10	1662026	1662035	20 %	60 %	0 %	20 %	387121456
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1046	NC_017846	TGGCT	2	10	1665449	1665458	0 %	40 %	40 %	20 %	387121459
1047	NC_017846	ATCAA	2	10	1666156	1666165	60 %	20 %	0 %	20 %	387121459
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1049	NC_017846	GTTCA	2	10	1668352	1668361	20 %	40 %	20 %	20 %	387121461
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1051	NC_017846	TGATT	2	10	1669199	1669208	20 %	60 %	20 %	0 %	387121462
1052	NC_017846	CGCTG	2	10	1676464	1676473	0 %	20 %	40 %	40 %	387121464
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1054	NC_017846	GTGCG	2	10	1677863	1677872	0 %	20 %	60 %	20 %	387121464
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1057	NC_017846	GTTTT	2	10	1683798	1683807	0 %	80 %	20 %	0 %	387121471
1058	NC_017846	CTTTG	2	10	1683814	1683823	0 %	60 %	20 %	20 %	387121471
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1107	NC_017846	TCATT	2	10	1772204	1772213	20 %	60 %	0 %	20 %	387121568
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