MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 40344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015183	TTC	2	6	242	247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291454
2	NC_015183	GAT	2	6	352	357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291454
3	NC_015183	AGC	2	6	369	374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291454
4	NC_015183	GGT	2	6	382	387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291454
5	NC_015183	CAG	2	6	437	442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291454
6	NC_015183	ATC	2	6	509	514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291454
7	NC_015183	CGG	2	6	551	556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291454
8	NC_015183	GCA	2	6	565	570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291454
9	NC_015183	ATT	2	6	585	590	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291454
10	NC_015183	ATG	2	6	627	632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291454
11	NC_015183	TCA	2	6	672	677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291454
12	NC_015183	GCC	2	6	791	796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291454
13	NC_015183	TCG	2	6	819	824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291454
14	NC_015183	CCA	2	6	912	917	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291454
15	NC_015183	CGC	2	6	986	991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291454
16	NC_015183	CGG	2	6	1162	1167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291455
17	NC_015183	CGA	2	6	1187	1192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291455
18	NC_015183	ATT	2	6	1600	1605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291455
19	NC_015183	ATC	2	6	1744	1749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291456
20	NC_015183	GAA	2	6	1764	1769	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291456
21	NC_015183	TCA	2	6	1829	1834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291456
22	NC_015183	TGG	2	6	1869	1874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291456
23	NC_015183	CGA	2	6	1926	1931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291456
24	NC_015183	GGA	2	6	1938	1943	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291456
25	NC_015183	CCA	2	6	1991	1996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291456
26	NC_015183	GGT	2	6	2067	2072	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291456
27	NC_015183	CGG	2	6	2082	2087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291456
28	NC_015183	CGT	2	6	2100	2105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291456
29	NC_015183	GTT	2	6	2250	2255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291456
30	NC_015183	CGC	2	6	2312	2317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291456
31	NC_015183	TGT	2	6	2331	2336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291456
32	NC_015183	TCC	2	6	2372	2377	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291456
33	NC_015183	TCA	2	6	2430	2435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291456
34	NC_015183	TGA	2	6	2481	2486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291456
35	NC_015183	TCA	2	6	2501	2506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291456
36	NC_015183	TGA	2	6	2527	2532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291456
37	NC_015183	CAG	2	6	2647	2652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291457
38	NC_015183	GAT	2	6	2663	2668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291457
39	NC_015183	GCC	2	6	2673	2678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291457
40	NC_015183	GTT	2	6	2907	2912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291457
41	NC_015183	CGG	2	6	3021	3026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291457
42	NC_015183	ATC	2	6	3036	3041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291457
43	NC_015183	CGG	2	6	3198	3203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291458
44	NC_015183	CAA	2	6	3213	3218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291458
45	NC_015183	CGA	2	6	3309	3314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291458
46	NC_015183	GTC	2	6	3346	3351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291458
47	NC_015183	CGC	2	6	3496	3501	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291458
48	NC_015183	TGG	2	6	3630	3635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291458
49	NC_015183	GAT	3	9	3694	3702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291458
50	NC_015183	GCG	2	6	4044	4049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291459
51	NC_015183	CCA	2	6	4055	4060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291459
52	NC_015183	GAT	2	6	4078	4083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291459
53	NC_015183	CAG	2	6	4102	4107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291459
54	NC_015183	GCA	2	6	4134	4139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291459
55	NC_015183	CGC	2	6	4173	4178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291459
56	NC_015183	GAG	2	6	4335	4340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291459
57	NC_015183	ATC	2	6	4555	4560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291460
58	NC_015183	CTC	2	6	4606	4611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291460
59	NC_015183	TCG	2	6	4613	4618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291460
60	NC_015183	GCC	2	6	4699	4704	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291460
61	NC_015183	ACG	3	9	4736	4744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291460
62	NC_015183	TGA	2	6	4815	4820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291460
63	NC_015183	GAT	2	6	4828	4833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291460
64	NC_015183	CAG	2	6	4834	4839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291460
65	NC_015183	ACG	2	6	4850	4855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291460
66	NC_015183	ACG	2	6	4968	4973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291460
67	NC_015183	CGA	2	6	5019	5024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291460
68	NC_015183	TGA	2	6	5025	5030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291460
69	NC_015183	CAT	2	6	5053	5058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291460
70	NC_015183	TCT	2	6	5091	5096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291460
71	NC_015183	GCC	2	6	5334	5339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291461
72	NC_015183	CGC	2	6	5354	5359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291461
73	NC_015183	GGA	2	6	5427	5432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291461
74	NC_015183	TGA	2	6	5504	5509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291461
75	NC_015183	GAT	2	6	5568	5573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291461
76	NC_015183	GAA	2	6	5610	5615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291461
77	NC_015183	GGC	2	6	5649	5654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291461
78	NC_015183	GGT	2	6	5682	5687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291461
79	NC_015183	TGG	2	6	5816	5821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291461
80	NC_015183	GAC	2	6	5851	5856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291461
81	NC_015183	GAA	2	6	5949	5954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291462
82	NC_015183	AGG	2	6	5983	5988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291462
83	NC_015183	CCG	2	6	6079	6084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291462
84	NC_015183	CCG	2	6	6146	6151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291462
85	NC_015183	CAC	2	6	6187	6192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291462
86	NC_015183	CGG	2	6	6194	6199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291462
87	NC_015183	CGA	2	6	6257	6262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291462
88	NC_015183	CCG	2	6	6284	6289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291462
89	NC_015183	TGG	2	6	6301	6306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291462
90	NC_015183	CGA	3	9	6311	6319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291462
91	NC_015183	CGC	2	6	6396	6401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291462
92	NC_015183	TGC	2	6	6491	6496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291462
93	NC_015183	TCT	2	6	6500	6505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291462
94	NC_015183	GCC	2	6	6540	6545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291462
95	NC_015183	CGC	3	9	6743	6751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291462
96	NC_015183	ACG	2	6	6982	6987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291462
97	NC_015183	TGC	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291462
98	NC_015183	GAA	2	6	7064	7069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291463
99	NC_015183	GGA	2	6	7123	7128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291463
100	NC_015183	CGA	2	6	7141	7146	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291463
101	NC_015183	CGG	2	6	7161	7166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291463
102	NC_015183	GTC	2	6	7172	7177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291463
103	NC_015183	AAG	2	6	7250	7255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291463
104	NC_015183	TCA	2	6	7264	7269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291463
105	NC_015183	TCA	2	6	7425	7430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291463
106	NC_015183	CGG	2	6	7549	7554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291463
107	NC_015183	GCT	2	6	7629	7634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291464
108	NC_015183	TCC	2	6	7745	7750	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291464
109	NC_015183	CAT	2	6	7773	7778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291464
110	NC_015183	GGA	2	6	7791	7796	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291464
111	NC_015183	CTC	2	6	7815	7820	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291464
112	NC_015183	GCC	2	6	7854	7859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291464
113	NC_015183	GGT	2	6	8279	8284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291465
114	NC_015183	CGA	2	6	8297	8302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291465
115	NC_015183	CCG	2	6	8419	8424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291465
116	NC_015183	TCA	2	6	8431	8436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291465
117	NC_015183	CGG	2	6	8489	8494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291465
118	NC_015183	CCG	2	6	8555	8560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291465
119	NC_015183	TGG	2	6	8866	8871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291465
120	NC_015183	TGG	2	6	8928	8933	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291465
121	NC_015183	CAA	2	6	8969	8974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291465
122	NC_015183	CGG	2	6	8990	8995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291465
123	NC_015183	CAT	2	6	9062	9067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291465
124	NC_015183	TTC	2	6	9155	9160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291465
125	NC_015183	GGT	2	6	9281	9286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291465
126	NC_015183	GCC	2	6	9309	9314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291465
127	NC_015183	CGC	2	6	9336	9341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291465
128	NC_015183	TCG	2	6	9424	9429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291465
129	NC_015183	ATC	3	9	9636	9644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291465
130	NC_015183	CTG	2	6	9684	9689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291465
131	NC_015183	CTT	3	9	9695	9703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291465
132	NC_015183	GCC	2	6	9752	9757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291465
133	NC_015183	GAA	2	6	9816	9821	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291465
134	NC_015183	GCC	2	6	9981	9986	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291465
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139	NC_015183	CCG	2	6	10254	10259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291465
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249	NC_015183	GCC	3	9	19565	19573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291474
250	NC_015183	CGG	2	6	19586	19591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291474
251	NC_015183	GCA	2	6	19739	19744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291475
252	NC_015183	CGC	2	6	19767	19772	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291475
253	NC_015183	TCG	2	6	19835	19840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291475
254	NC_015183	TTC	2	6	19888	19893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291475
255	NC_015183	CCA	2	6	19944	19949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291475
256	NC_015183	GGA	2	6	19960	19965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291475
257	NC_015183	GGC	2	6	19990	19995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291475
258	NC_015183	CAT	2	6	20124	20129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291476
259	NC_015183	TGC	2	6	20365	20370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291476
260	NC_015183	GCA	2	6	20576	20581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291476
261	NC_015183	GAG	2	6	20617	20622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291476
262	NC_015183	GCG	2	6	20645	20650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291476
263	NC_015183	TCA	2	6	20677	20682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291476
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265	NC_015183	ATG	2	6	20723	20728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291476
266	NC_015183	AAG	2	6	20748	20753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291476
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274	NC_015183	AAC	2	6	21195	21200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291476
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284	NC_015183	CCA	2	6	21998	22003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291476
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286	NC_015183	TCG	2	6	22210	22215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291476
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500	NC_015183	GCG	2	6	36325	36330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291486

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