MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 40344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015183	GGC	2	6	36396	36401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291486
502	NC_015183	CAA	2	6	36460	36465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291486
503	NC_015183	CTT	2	6	36596	36601	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291487
504	NC_015183	GTC	2	6	36635	36640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
505	NC_015183	TCG	2	6	36654	36659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
506	NC_015183	CAC	2	6	36692	36697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291487
507	NC_015183	TGC	2	6	36853	36858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
508	NC_015183	GCT	2	6	36884	36889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
509	NC_015183	CCA	2	6	36919	36924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291487
510	NC_015183	TGA	2	6	36949	36954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291487
511	NC_015183	TCG	2	6	36987	36992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
512	NC_015183	CGC	2	6	37050	37055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291487
513	NC_015183	GCG	2	6	37108	37113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291487
514	NC_015183	GTC	3	9	37217	37225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291487
515	NC_015183	CGG	2	6	37722	37727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
516	NC_015183	TCG	2	6	37785	37790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
517	NC_015183	TGG	2	6	37820	37825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291488
518	NC_015183	ACA	3	9	37827	37835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291488
519	NC_015183	GCT	2	6	37861	37866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
520	NC_015183	CGC	2	6	37888	37893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291488
521	NC_015183	CGG	2	6	37924	37929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
522	NC_015183	GTC	2	6	37961	37966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
523	NC_015183	CAT	2	6	38056	38061	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291488
524	NC_015183	CGG	2	6	38155	38160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
525	NC_015183	CCT	2	6	38163	38168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291488
526	NC_015183	AAG	2	6	38183	38188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291488
527	NC_015183	CTG	2	6	38213	38218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
528	NC_015183	CCG	2	6	38277	38282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291488
529	NC_015183	TTC	2	6	38285	38290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291488
530	NC_015183	CGA	2	6	38350	38355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291488
531	NC_015183	GGC	2	6	38396	38401	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
532	NC_015183	CCG	2	6	38461	38466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291488
533	NC_015183	CGT	2	6	38488	38493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
534	NC_015183	ATC	2	6	38618	38623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291488
535	NC_015183	CGG	2	6	38631	38636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
536	NC_015183	TGC	2	6	38649	38654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
537	NC_015183	CGG	2	6	38802	38807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
538	NC_015183	CTG	2	6	38819	38824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
539	NC_015183	CTG	2	6	38854	38859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
540	NC_015183	CGG	2	6	38881	38886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291488
541	NC_015183	ACG	2	6	39078	39083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291488
542	NC_015183	GAA	2	6	39091	39096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291488
543	NC_015183	GCA	2	6	39164	39169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291488
544	NC_015183	CTG	2	6	39176	39181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291488
545	NC_015183	CGG	2	6	39386	39391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291489
546	NC_015183	CAA	2	6	39410	39415	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291489
547	NC_015183	CGG	2	6	39424	39429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291489
548	NC_015183	AAG	2	6	39520	39525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291489
549	NC_015183	CGC	2	6	39628	39633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291489
550	NC_015183	CCA	2	6	39646	39651	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291489
551	NC_015183	GCC	2	6	39676	39681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291489
552	NC_015183	TCA	2	6	39845	39850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291490
553	NC_015183	AAG	2	6	39862	39867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291490
554	NC_015183	GAT	2	6	39883	39888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291490
555	NC_015183	GGT	2	6	39960	39965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291490
556	NC_015183	AAG	2	6	40123	40128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291490
557	NC_015183	GGC	2	6	40177	40182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291490
558	NC_015183	AAC	2	6	40186	40191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291490
559	NC_015183	ATC	2	6	40192	40197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291490
560	NC_015183	CAA	2	6	40206	40211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291490
561	NC_015183	TAA	2	6	40276	40281	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291490
562	NC_015183	GGT	2	6	40359	40364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291491
563	NC_015183	TTC	2	6	40427	40432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291491
564	NC_015183	GCC	2	6	40472	40477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291491
565	NC_015183	GAA	2	6	40504	40509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291491
566	NC_015183	GAA	2	6	40612	40617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291491
567	NC_015183	GCA	2	6	40668	40673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291491
568	NC_015183	GCA	2	6	40731	40736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291491
569	NC_015183	GCA	2	6	40809	40814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291491
570	NC_015183	CGC	2	6	40868	40873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291491
571	NC_015183	GGT	2	6	40903	40908	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291491
572	NC_015183	TTG	2	6	41024	41029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291491
573	NC_015183	CAG	2	6	41068	41073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291491
574	NC_015183	AGG	2	6	41099	41104	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291491
575	NC_015183	CGC	2	6	41126	41131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291491
576	NC_015183	GTC	2	6	41152	41157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291491
577	NC_015183	TCG	2	6	41180	41185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291491
578	NC_015183	GTG	2	6	41199	41204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291491
579	NC_015183	TTC	2	6	41227	41232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291491
580	NC_015183	GAA	2	6	41239	41244	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291491
581	NC_015183	ATG	2	6	41327	41332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291492
582	NC_015183	ACC	2	6	41428	41433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291492
583	NC_015183	CGG	2	6	41453	41458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291492
584	NC_015183	GGC	2	6	41493	41498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291492
585	NC_015183	CGC	2	6	41535	41540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291492
586	NC_015183	CGC	2	6	41553	41558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291492
587	NC_015183	GGC	3	9	41592	41600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291492
588	NC_015183	CGA	2	6	41609	41614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291492
589	NC_015183	ATC	2	6	41797	41802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291493
590	NC_015183	TGC	2	6	41856	41861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291493
591	NC_015183	GAC	2	6	42058	42063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291493
592	NC_015183	CGG	2	6	42087	42092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291493
593	NC_015183	CGA	2	6	42099	42104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291493
594	NC_015183	AGC	2	6	42161	42166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291493
595	NC_015183	CGC	2	6	42192	42197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291493
596	NC_015183	ACG	2	6	42242	42247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291493
597	NC_015183	CGC	2	6	42313	42318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291493
598	NC_015183	CGC	2	6	42331	42336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291493
599	NC_015183	CGA	2	6	42366	42371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291493
600	NC_015183	GAC	2	6	42385	42390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291493
601	NC_015183	TGA	2	6	42464	42469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291494
602	NC_015183	GCC	2	6	42588	42593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291494
603	NC_015183	GAT	2	6	42690	42695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291494
604	NC_015183	GGC	2	6	42696	42701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291494
605	NC_015183	GCC	2	6	42783	42788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291494
606	NC_015183	GCC	3	9	42936	42944	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291494
607	NC_015183	CGA	2	6	43031	43036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291494
608	NC_015183	TGG	3	9	43308	43316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291495
609	NC_015183	CCG	2	6	43326	43331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291495
610	NC_015183	CGC	2	6	43339	43344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291495
611	NC_015183	GAT	2	6	43347	43352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291495
612	NC_015183	GCG	2	6	43763	43768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291495
613	NC_015183	TGG	2	6	43782	43787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291495
614	NC_015183	GAT	2	6	43816	43821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291495
615	NC_015183	GCG	2	6	43909	43914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291496
616	NC_015183	ACG	2	6	44178	44183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291496
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618	NC_015183	ATG	2	6	44461	44466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291497
619	NC_015183	GTT	2	6	44467	44472	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291497
620	NC_015183	ATC	2	6	44755	44760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291497
621	NC_015183	GGC	2	6	44808	44813	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291497
622	NC_015183	GAT	2	6	44923	44928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291497
623	NC_015183	TGA	2	6	45151	45156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291498
624	NC_015183	ATT	2	6	45162	45167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291498
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628	NC_015183	GCT	2	6	45320	45325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291498
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735	NC_015183	GCG	2	6	53176	53181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291505
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994	NC_015183	ATC	2	6	81201	81206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291524
995	NC_015183	CGG	2	6	81218	81223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291524
996	NC_015183	GCC	2	6	81324	81329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291524
997	NC_015183	CCG	2	6	81375	81380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291524
998	NC_015183	ATC	2	6	81485	81490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291524
999	NC_015183	ATG	2	6	81501	81506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291524
1000	NC_015183	CGA	2	6	81508	81513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291524

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