MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 40344

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015183	GCA	2	6	251300	251305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291693
3502	NC_015183	TCG	2	6	251346	251351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291693
3503	NC_015183	GCG	2	6	251481	251486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291693
3504	NC_015183	GCC	2	6	251500	251505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291693
3505	NC_015183	CTT	2	6	251519	251524	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291693
3506	NC_015183	GAC	2	6	251532	251537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291693
3507	NC_015183	AGG	2	6	251572	251577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291693
3508	NC_015183	GCT	2	6	251615	251620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291693
3509	NC_015183	CGC	2	6	251669	251674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291693
3510	NC_015183	CGC	2	6	251701	251706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291693
3511	NC_015183	GAA	2	6	251715	251720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291693
3512	NC_015183	TGA	2	6	251830	251835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291693
3513	NC_015183	CGC	4	12	251931	251942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291694
3514	NC_015183	TGA	2	6	251943	251948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291694
3515	NC_015183	AAG	2	6	251986	251991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291694
3516	NC_015183	GCC	2	6	252136	252141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291694
3517	NC_015183	TCG	2	6	252227	252232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291694
3518	NC_015183	CTT	3	9	252363	252371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291694
3519	NC_015183	TGC	2	6	252401	252406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291694
3520	NC_015183	GCC	2	6	252453	252458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291694
3521	NC_015183	AAG	2	6	252553	252558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291694
3522	NC_015183	CTT	2	6	252606	252611	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291694
3523	NC_015183	TTC	2	6	252649	252654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291694
3524	NC_015183	TGC	2	6	252776	252781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291694
3525	NC_015183	CGG	2	6	252786	252791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291694
3526	NC_015183	TTC	2	6	252883	252888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291694
3527	NC_015183	CGG	2	6	252951	252956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291694
3528	NC_015183	CGA	2	6	253098	253103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3529	NC_015183	GGC	2	6	253107	253112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3530	NC_015183	GTC	2	6	253138	253143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3531	NC_015183	CCG	2	6	253145	253150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
3532	NC_015183	TGG	2	6	253187	253192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291695
3533	NC_015183	GCG	2	6	253226	253231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3534	NC_015183	ATG	2	6	253345	253350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291695
3535	NC_015183	CGA	2	6	253377	253382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3536	NC_015183	ACG	2	6	253385	253390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3537	NC_015183	CAT	2	6	253392	253397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291695
3538	NC_015183	CTT	2	6	253427	253432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291695
3539	NC_015183	CGC	2	6	253530	253535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
3540	NC_015183	GAA	2	6	253671	253676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291695
3541	NC_015183	GCA	2	6	253698	253703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3542	NC_015183	GCC	2	6	253801	253806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
3543	NC_015183	CCG	2	6	253830	253835	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
3544	NC_015183	GTC	2	6	253900	253905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3545	NC_015183	CGA	2	6	253911	253916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3546	NC_015183	CGG	2	6	253935	253940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3547	NC_015183	TGA	2	6	253968	253973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291695
3548	NC_015183	CAT	2	6	254049	254054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291695
3549	NC_015183	GCG	2	6	254081	254086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3550	NC_015183	CAC	2	6	254121	254126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291695
3551	NC_015183	GCG	3	9	254147	254155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3552	NC_015183	GTC	2	6	254173	254178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3553	NC_015183	CGG	2	6	254255	254260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3554	NC_015183	TGG	2	6	254372	254377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291695
3555	NC_015183	ACA	2	6	254405	254410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291695
3556	NC_015183	GAC	2	6	254460	254465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3557	NC_015183	GCA	2	6	254659	254664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3558	NC_015183	CGG	2	6	254760	254765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3559	NC_015183	GCG	2	6	254828	254833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3560	NC_015183	AGA	2	6	255092	255097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291695
3561	NC_015183	CAT	2	6	255195	255200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291695
3562	NC_015183	CAA	2	6	255209	255214	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291695
3563	NC_015183	TCG	2	6	255371	255376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3564	NC_015183	GCG	2	6	255398	255403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
3565	NC_015183	CTT	2	6	255559	255564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291696
3566	NC_015183	GCC	2	6	255588	255593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291696
3567	NC_015183	CGG	2	6	255685	255690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291696
3568	NC_015183	TGA	2	6	255727	255732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291696
3569	NC_015183	CGG	2	6	255780	255785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291696
3570	NC_015183	TCG	2	6	255789	255794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291696
3571	NC_015183	TCC	2	6	255906	255911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291696
3572	NC_015183	GGC	2	6	256168	256173	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291696
3573	NC_015183	CAT	2	6	256187	256192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291696
3574	NC_015183	ACC	2	6	256245	256250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291696
3575	NC_015183	CGA	2	6	256279	256284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291696
3576	NC_015183	GTT	2	6	256292	256297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291696
3577	NC_015183	TCG	2	6	256380	256385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291696
3578	NC_015183	GTT	2	6	256448	256453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291696
3579	NC_015183	GTT	2	6	256571	256576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291697
3580	NC_015183	TAT	2	6	256578	256583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291697
3581	NC_015183	GCC	2	6	256664	256669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291697
3582	NC_015183	CCG	2	6	256689	256694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291697
3583	NC_015183	TCG	2	6	256709	256714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291697
3584	NC_015183	ACC	2	6	256751	256756	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291697
3585	NC_015183	AGG	2	6	256776	256781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291697
3586	NC_015183	GGC	2	6	256785	256790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291697
3587	NC_015183	GCG	2	6	256901	256906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291697
3588	NC_015183	TCG	2	6	256998	257003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291697
3589	NC_015183	GAA	2	6	257117	257122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291697
3590	NC_015183	GCC	2	6	257128	257133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291697
3591	NC_015183	TGG	2	6	257232	257237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291697
3592	NC_015183	GCG	2	6	257288	257293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291697
3593	NC_015183	GAC	3	9	257336	257344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291697
3594	NC_015183	GGA	2	6	257374	257379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291697
3595	NC_015183	TTC	2	6	257462	257467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291697
3596	NC_015183	AGA	2	6	257757	257762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291698
3597	NC_015183	AGC	2	6	257947	257952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291699
3598	NC_015183	TCA	2	6	257954	257959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291699
3599	NC_015183	TGG	2	6	258017	258022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291699
3600	NC_015183	CTT	2	6	258048	258053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291699
3601	NC_015183	TAA	2	6	258241	258246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291699
3602	NC_015183	TGA	2	6	258248	258253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291699
3603	NC_015183	GCA	2	6	258332	258337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291699
3604	NC_015183	TTC	2	6	258358	258363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291699
3605	NC_015183	CCT	2	6	258380	258385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291699
3606	NC_015183	AGC	2	6	258410	258415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291699
3607	NC_015183	TCC	2	6	258469	258474	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291699
3608	NC_015183	TCT	2	6	258587	258592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291699
3609	NC_015183	TCC	2	6	258634	258639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291699
3610	NC_015183	GAT	2	6	258672	258677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291699
3611	NC_015183	CGC	2	6	258689	258694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291699
3612	NC_015183	TCT	2	6	258788	258793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291699
3613	NC_015183	GCC	2	6	258819	258824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291699
3614	NC_015183	CGC	2	6	259048	259053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291700
3615	NC_015183	TCA	2	6	259271	259276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291700
3616	NC_015183	GCA	2	6	259433	259438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291700
3617	NC_015183	TCC	2	6	259486	259491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291700
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3619	NC_015183	GCG	2	6	259656	259661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291700
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3974	NC_015183	TCG	2	6	284350	284355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291727
3975	NC_015183	ATC	2	6	284400	284405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291727
3976	NC_015183	CCG	2	6	284426	284431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291727
3977	NC_015183	CTT	2	6	284455	284460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291727
3978	NC_015183	GCT	2	6	284468	284473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291727
3979	NC_015183	ATC	2	6	284740	284745	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291728
3980	NC_015183	TGC	2	6	284813	284818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291728
3981	NC_015183	CTT	2	6	284899	284904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291728
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3984	NC_015183	TCA	2	6	285032	285037	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291728
3985	NC_015183	CGG	2	6	285087	285092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291728
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3991	NC_015183	TCG	2	6	285419	285424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291728
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3996	NC_015183	GCG	3	9	286319	286327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291730
3997	NC_015183	CCG	3	9	286564	286572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291730
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3999	NC_015183	GTC	2	6	286626	286631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291730
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