MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 24549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010278	TAT	2	6	97	102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975458
2	NC_010278	TCT	2	6	146	151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975458
3	NC_010278	TTG	2	6	276	281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975458
4	NC_010278	TCG	2	6	315	320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975458
5	NC_010278	CGG	2	6	384	389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975458
6	NC_010278	AGC	2	6	419	424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975458
7	NC_010278	AGA	2	6	433	438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
8	NC_010278	CAG	2	6	542	547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975458
9	NC_010278	CGG	2	6	595	600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975458
10	NC_010278	TTA	2	6	623	628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975458
11	NC_010278	GTG	2	6	674	679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975458
12	NC_010278	TGA	2	6	777	782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975458
13	NC_010278	AAG	2	6	810	815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
14	NC_010278	AAG	2	6	822	827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
15	NC_010278	TAA	2	6	862	867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975458
16	NC_010278	ATT	2	6	872	877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975458
17	NC_010278	GAA	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
18	NC_010278	TGA	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975458
19	NC_010278	GAA	2	6	1037	1042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
20	NC_010278	ACA	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975458
21	NC_010278	CGG	2	6	1369	1374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975458
22	NC_010278	AAG	2	6	1446	1451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975458
23	NC_010278	ACA	2	6	1544	1549	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975459
24	NC_010278	AGC	2	6	1566	1571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975459
25	NC_010278	TAA	2	6	1592	1597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975459
26	NC_010278	AGC	2	6	1761	1766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975459
27	NC_010278	GAA	2	6	1782	1787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975459
28	NC_010278	GCT	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975459
29	NC_010278	TTA	2	6	2067	2072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975459
30	NC_010278	GTG	2	6	2193	2198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975459
31	NC_010278	AAG	3	9	2401	2409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975459
32	NC_010278	TGG	2	6	2524	2529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975459
33	NC_010278	GCT	2	6	2542	2547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975459
34	NC_010278	TTA	2	6	2584	2589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975459
35	NC_010278	ATC	2	6	2684	2689	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975460
36	NC_010278	AAT	2	6	2690	2695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975460
37	NC_010278	TTG	2	6	2780	2785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975460
38	NC_010278	ATT	2	6	2843	2848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975460
39	NC_010278	AGA	2	6	2860	2865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975460
40	NC_010278	TGA	2	6	2887	2892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975460
41	NC_010278	TTA	2	6	3035	3040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975460
42	NC_010278	GAT	2	6	3569	3574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975460
43	NC_010278	CAA	2	6	3725	3730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975460
44	NC_010278	TGA	2	6	3809	3814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975461
45	NC_010278	CGC	2	6	3815	3820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975461
46	NC_010278	AAT	2	6	3976	3981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975461
47	NC_010278	GTT	2	6	4028	4033	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975461
48	NC_010278	GTT	2	6	4244	4249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975461
49	NC_010278	AAT	2	6	4339	4344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975461
50	NC_010278	TTC	2	6	4658	4663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975462
51	NC_010278	GAA	2	6	4742	4747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975462
52	NC_010278	CGG	2	6	4954	4959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975462
53	NC_010278	CGG	2	6	4993	4998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975462
54	NC_010278	CAT	2	6	5142	5147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975462
55	NC_010278	ATT	2	6	5257	5262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975462
56	NC_010278	AGA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975462
57	NC_010278	CAA	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975462
58	NC_010278	ATT	2	6	5444	5449	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975462
59	NC_010278	GCG	2	6	5450	5455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975462
60	NC_010278	ATT	2	6	5614	5619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975462
61	NC_010278	AAT	2	6	5667	5672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975462
62	NC_010278	CGC	2	6	5851	5856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975463
63	NC_010278	CCA	2	6	5959	5964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165975463
64	NC_010278	TTA	2	6	5985	5990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975463
65	NC_010278	ATC	2	6	6053	6058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975463
66	NC_010278	CTT	2	6	6088	6093	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975463
67	NC_010278	ACG	2	6	6137	6142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975464
68	NC_010278	CGT	2	6	6283	6288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975464
69	NC_010278	CCG	2	6	6378	6383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975464
70	NC_010278	TAA	2	6	6455	6460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975464
71	NC_010278	TGA	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975464
72	NC_010278	GTT	2	6	6688	6693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975464
73	NC_010278	CCG	2	6	6757	6762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975464
74	NC_010278	AAT	2	6	6858	6863	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975464
75	NC_010278	ATG	2	6	7077	7082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975465
76	NC_010278	AAG	2	6	7087	7092	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975465
77	NC_010278	CGT	2	6	7308	7313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975465
78	NC_010278	GAA	2	6	7395	7400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975465
79	NC_010278	GCG	2	6	7719	7724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975465
80	NC_010278	ACA	2	6	7736	7741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975465
81	NC_010278	GAT	2	6	7868	7873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975465
82	NC_010278	GCG	2	6	7875	7880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975465
83	NC_010278	CGG	2	6	7906	7911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975465
84	NC_010278	TTA	2	6	8025	8030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975465
85	NC_010278	ATT	2	6	8104	8109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975465
86	NC_010278	GAT	2	6	8115	8120	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975465
87	NC_010278	AAC	2	6	8152	8157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975465
88	NC_010278	GTT	2	6	8341	8346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975466
89	NC_010278	TTG	2	6	8352	8357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975466
90	NC_010278	GGT	3	9	8359	8367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975466
91	NC_010278	CAA	2	6	8447	8452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975466
92	NC_010278	GAA	2	6	8480	8485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975466
93	NC_010278	GCG	2	6	8519	8524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975466
94	NC_010278	GAA	2	6	8579	8584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975466
95	NC_010278	ACG	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975466
96	NC_010278	TTA	2	6	8705	8710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975466
97	NC_010278	GTA	2	6	8732	8737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975466
98	NC_010278	GGC	2	6	8818	8823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975466
99	NC_010278	GCG	2	6	8826	8831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975466
100	NC_010278	ATG	2	6	8837	8842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975466
101	NC_010278	TCG	2	6	8862	8867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975466
102	NC_010278	TGA	2	6	8961	8966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975466
103	NC_010278	CCG	2	6	8967	8972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975466
104	NC_010278	CAA	2	6	9035	9040	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975466
105	NC_010278	GAA	2	6	9047	9052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975466
106	NC_010278	ATT	2	6	9061	9066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975466
107	NC_010278	TGA	2	6	9166	9171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975466
108	NC_010278	GAT	2	6	9185	9190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975466
109	NC_010278	AGA	2	6	9243	9248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975466
110	NC_010278	ATG	2	6	9335	9340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975466
111	NC_010278	ATA	2	6	9609	9614	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975467
112	NC_010278	AAC	2	6	9660	9665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975467
113	NC_010278	ACT	2	6	9754	9759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975467
114	NC_010278	CGT	2	6	9788	9793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975467
115	NC_010278	TGC	2	6	9838	9843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975467
116	NC_010278	CAA	2	6	9893	9898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975467
117	NC_010278	CGG	2	6	9990	9995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975467
118	NC_010278	AAT	2	6	10058	10063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975468
119	NC_010278	CGC	2	6	10381	10386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975468
120	NC_010278	TGA	2	6	10391	10396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975468
121	NC_010278	GAA	2	6	10533	10538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975468
122	NC_010278	ATT	2	6	10626	10631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975468
123	NC_010278	TTA	2	6	10702	10707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975468
124	NC_010278	AGA	2	6	10802	10807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975468
125	NC_010278	GAA	2	6	10829	10834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975468
126	NC_010278	ATT	2	6	11049	11054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975469
127	NC_010278	GAT	2	6	11058	11063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975469
128	NC_010278	ATA	2	6	11074	11079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975469
129	NC_010278	ATT	2	6	11097	11102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975469
130	NC_010278	CGT	2	6	11105	11110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975469
131	NC_010278	TCA	2	6	11141	11146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975469
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