MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 24549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_010278	CCG	2	6	2237803	2237808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977489
24502	NC_010278	GTT	2	6	2237892	2237897	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977490
24503	NC_010278	GTA	2	6	2237907	2237912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165977490
24504	NC_010278	TTG	2	6	2237955	2237960	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977490
24505	NC_010278	GTT	2	6	2238014	2238019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977490
24506	NC_010278	CAT	2	6	2238053	2238058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977490
24507	NC_010278	GCC	2	6	2238156	2238161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977490
24508	NC_010278	TAA	2	6	2238400	2238405	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165977491
24509	NC_010278	TCA	2	6	2238436	2238441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977491
24510	NC_010278	CGG	2	6	2238552	2238557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165977491
24511	NC_010278	CCG	2	6	2238571	2238576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977491
24512	NC_010278	TGT	2	6	2238645	2238650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977491
24513	NC_010278	CTA	2	6	2238670	2238675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977491
24514	NC_010278	GGT	2	6	2238716	2238721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165977491
24515	NC_010278	CCG	2	6	2238735	2238740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977491
24516	NC_010278	CGA	2	6	2238746	2238751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165977491
24517	NC_010278	CGC	2	6	2238931	2238936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977491
24518	NC_010278	TTC	2	6	2238992	2238997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165977491
24519	NC_010278	CAC	2	6	2239072	2239077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165977491
24520	NC_010278	GTT	2	6	2239153	2239158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977491
24521	NC_010278	CCG	2	6	2239198	2239203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977491
24522	NC_010278	ATC	2	6	2239223	2239228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977491
24523	NC_010278	CTT	2	6	2239243	2239248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165977491
24524	NC_010278	GTC	2	6	2239284	2239289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165977491
24525	NC_010278	ACT	2	6	2239290	2239295	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977491
24526	NC_010278	CCG	2	6	2239708	2239713	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977492
24527	NC_010278	ACC	2	6	2239720	2239725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165977492
24528	NC_010278	TTG	2	6	2239824	2239829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977492
24529	NC_010278	CTT	2	6	2240024	2240029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165977492
24530	NC_010278	TTG	2	6	2240046	2240051	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977492
24531	NC_010278	CCG	2	6	2240170	2240175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977492
24532	NC_010278	ATA	2	6	2240219	2240224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165977492
24533	NC_010278	GGC	2	6	2240232	2240237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165977492
24534	NC_010278	CAA	2	6	2240292	2240297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165977492
24535	NC_010278	CAA	2	6	2240306	2240311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165977492
24536	NC_010278	GTT	2	6	2240387	2240392	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977492
24537	NC_010278	AAT	2	6	2240581	2240586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165977492
24538	NC_010278	ATC	2	6	2240646	2240651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977492
24539	NC_010278	TTG	2	6	2240784	2240789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977492
24540	NC_010278	CGC	2	6	2240816	2240821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977492
24541	NC_010278	GAA	2	6	2240995	2241000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165977493
24542	NC_010278	CAC	2	6	2241009	2241014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165977493
24543	NC_010278	CAT	2	6	2241023	2241028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977493
24544	NC_010278	CCG	2	6	2241099	2241104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165977493
24545	NC_010278	GTT	2	6	2241265	2241270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165977493
24546	NC_010278	ATG	2	6	2241495	2241500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165977493
24547	NC_010278	AGT	2	6	2241608	2241613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165977493
24548	NC_010278	ATC	2	6	2241636	2241641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165977493
24549	NC_010278	TGC	2	6	2241783	2241788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165977493

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.