MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus pleuropneumoniae serovar 3 str. JL03 chromosome

Total Repeats: 24549

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_010278	ATT	2	6	45171	45176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975499
502	NC_010278	CGC	2	6	45436	45441	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975499
503	NC_010278	ATT	2	6	45726	45731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975499
504	NC_010278	GAA	2	6	45929	45934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975500
505	NC_010278	GAC	2	6	45987	45992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975500
506	NC_010278	CCG	2	6	46164	46169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975500
507	NC_010278	TAA	2	6	46309	46314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975500
508	NC_010278	AAT	2	6	46390	46395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975500
509	NC_010278	AAC	2	6	46685	46690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975501
510	NC_010278	GAC	2	6	46696	46701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975501
511	NC_010278	CGT	2	6	46798	46803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975501
512	NC_010278	ATT	2	6	46915	46920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975501
513	NC_010278	TAA	2	6	46927	46932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975501
514	NC_010278	TAT	2	6	46974	46979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975501
515	NC_010278	CGG	2	6	47107	47112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975501
516	NC_010278	AAT	2	6	47146	47151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975501
517	NC_010278	CAT	2	6	47451	47456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975501
518	NC_010278	TTG	2	6	47551	47556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975501
519	NC_010278	TTA	2	6	47567	47572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975501
520	NC_010278	ATC	2	6	47599	47604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975501
521	NC_010278	TTG	2	6	47701	47706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975501
522	NC_010278	TCT	2	6	47747	47752	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975501
523	NC_010278	CGA	2	6	47784	47789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975501
524	NC_010278	CTT	2	6	47847	47852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975501
525	NC_010278	CCG	2	6	47973	47978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975501
526	NC_010278	GTT	2	6	48006	48011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975501
527	NC_010278	CAG	2	6	48300	48305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975502
528	NC_010278	TGA	2	6	48412	48417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975502
529	NC_010278	TCA	2	6	48465	48470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975502
530	NC_010278	TTG	2	6	48572	48577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975502
531	NC_010278	CGT	2	6	48586	48591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975502
532	NC_010278	TTC	2	6	48635	48640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975502
533	NC_010278	CTG	2	6	48697	48702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975502
534	NC_010278	ACG	2	6	48773	48778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975502
535	NC_010278	ATA	2	6	48819	48824	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975502
536	NC_010278	ACC	2	6	48876	48881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165975502
537	NC_010278	CTT	2	6	48907	48912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975502
538	NC_010278	TTC	2	6	48971	48976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975502
539	NC_010278	ACG	2	6	49049	49054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975502
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541	NC_010278	TTG	2	6	49270	49275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975502
542	NC_010278	CTA	2	6	49375	49380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975502
543	NC_010278	TCT	2	6	49452	49457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975502
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546	NC_010278	TTC	2	6	49562	49567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975502
547	NC_010278	CCA	2	6	49645	49650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165975502
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551	NC_010278	GTC	2	6	49985	49990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975502
552	NC_010278	CCG	2	6	50028	50033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975502
553	NC_010278	GGT	2	6	50036	50041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165975502
554	NC_010278	ACA	2	6	50196	50201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975502
555	NC_010278	TCA	2	6	50205	50210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975502
556	NC_010278	CCG	2	6	50653	50658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975502
557	NC_010278	CGA	2	6	50683	50688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975502
558	NC_010278	ATA	3	9	50778	50786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975502
559	NC_010278	TTA	2	6	50799	50804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975502
560	NC_010278	GGA	2	6	50841	50846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165975502
561	NC_010278	CGT	2	6	50848	50853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975502
562	NC_010278	ATA	2	6	51372	51377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975503
563	NC_010278	TTA	2	6	51411	51416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975503
564	NC_010278	TAA	2	6	51455	51460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975503
565	NC_010278	ATC	2	6	51479	51484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975503
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568	NC_010278	TCG	2	6	51633	51638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975503
569	NC_010278	TAA	2	6	51674	51679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975503
570	NC_010278	AAC	2	6	51867	51872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975503
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582	NC_010278	TCA	2	6	53238	53243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975504
583	NC_010278	TAC	2	6	53307	53312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975504
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589	NC_010278	AGA	3	9	53589	53597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975504
590	NC_010278	ACG	2	6	53629	53634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975504
591	NC_010278	TAC	2	6	53698	53703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975505
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593	NC_010278	CGC	2	6	53837	53842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165975505
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595	NC_010278	ATT	2	6	53995	54000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975505
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598	NC_010278	CAT	3	9	54207	54215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975505
599	NC_010278	TAA	2	6	54245	54250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165975505
600	NC_010278	ATT	2	6	54304	54309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975505
601	NC_010278	GAT	2	6	54324	54329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975505
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603	NC_010278	ACG	2	6	54898	54903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975506
604	NC_010278	TTA	2	6	55072	55077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975506
605	NC_010278	TCG	2	6	55134	55139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165975506
606	NC_010278	GCG	2	6	55217	55222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165975506
607	NC_010278	AGT	2	6	55229	55234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165975506
608	NC_010278	CAC	2	6	55389	55394	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165975507
609	NC_010278	CAA	2	6	55573	55578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975507
610	NC_010278	GCA	2	6	55730	55735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165975507
611	NC_010278	ATT	2	6	55803	55808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165975507
612	NC_010278	TTC	2	6	55940	55945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165975508
613	NC_010278	ATC	2	6	56105	56110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975508
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615	NC_010278	TCA	2	6	56152	56157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165975508
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620	NC_010278	CAA	2	6	56510	56515	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975509
621	NC_010278	CAA	2	6	56531	56536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165975509
622	NC_010278	GAA	2	6	56597	56602	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165975509
623	NC_010278	TTG	2	6	56607	56612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165975509
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