MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 24235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000854	CTC	2	6	232580	232585	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600627
3002	NC_000854	CTT	2	6	232594	232599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600627
3003	NC_000854	GCC	2	6	232662	232667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600627
3004	NC_000854	GTA	2	6	232700	232705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600627
3005	NC_000854	CTC	2	6	232958	232963	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430995
3006	NC_000854	CTT	2	6	232970	232975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430995
3007	NC_000854	CTC	3	9	232976	232984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430995
3008	NC_000854	TCG	2	6	233139	233144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430995
3009	NC_000854	CGT	2	6	233155	233160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430995
3010	NC_000854	GCT	2	6	233237	233242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430995
3011	NC_000854	GGA	2	6	233442	233447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430996
3012	NC_000854	AGG	2	6	233467	233472	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430996
3013	NC_000854	GGA	2	6	233598	233603	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430996
3014	NC_000854	GGA	2	6	233631	233636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430996
3015	NC_000854	GGA	2	6	233652	233657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430996
3016	NC_000854	AGG	2	6	233740	233745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430996
3017	NC_000854	CTC	2	6	233749	233754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430996
3018	NC_000854	GGA	2	6	233772	233777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430996
3019	NC_000854	GCC	2	6	233799	233804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430996
3020	NC_000854	CCT	2	6	233834	233839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3021	NC_000854	ACA	2	6	233860	233865	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430997
3022	NC_000854	GGT	2	6	233867	233872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430997
3023	NC_000854	CCT	2	6	233888	233893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3024	NC_000854	ATC	2	6	233989	233994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430997
3025	NC_000854	TCA	2	6	234076	234081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430997
3026	NC_000854	CAC	2	6	234102	234107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430997
3027	NC_000854	TCC	2	6	234128	234133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3028	NC_000854	GCC	2	6	234171	234176	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430997
3029	NC_000854	TCT	2	6	234197	234202	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430997
3030	NC_000854	CAA	2	6	234296	234301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430997
3031	NC_000854	AGC	2	6	234352	234357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430997
3032	NC_000854	GAA	2	6	234450	234455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430997
3033	NC_000854	AGG	2	6	234565	234570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430997
3034	NC_000854	GTC	2	6	234681	234686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430997
3035	NC_000854	CCT	2	6	234773	234778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3036	NC_000854	TCC	2	6	234811	234816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3037	NC_000854	GCT	2	6	234851	234856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430997
3038	NC_000854	GAG	2	6	234940	234945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430997
3039	NC_000854	GAG	2	6	235023	235028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430997
3040	NC_000854	GAA	2	6	235167	235172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430997
3041	NC_000854	CTC	2	6	235237	235242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3042	NC_000854	CTC	2	6	235281	235286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3043	NC_000854	CAC	2	6	235440	235445	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430997
3044	NC_000854	AGG	2	6	235504	235509	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430997
3045	NC_000854	CCT	2	6	235584	235589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3046	NC_000854	CCT	2	6	235592	235597	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3047	NC_000854	TCC	2	6	235619	235624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430997
3048	NC_000854	CCG	2	6	235651	235656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430997
3049	NC_000854	TAC	2	6	235876	235881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600632
3050	NC_000854	CTT	2	6	236012	236017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600632
3051	NC_000854	CTC	2	6	236097	236102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600632
3052	NC_000854	AGG	2	6	236129	236134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600632
3053	NC_000854	CAT	2	6	236517	236522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430998
3054	NC_000854	CTA	2	6	236540	236545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430998
3055	NC_000854	CCT	2	6	236585	236590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
3056	NC_000854	ATC	2	6	236638	236643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430998
3057	NC_000854	TAG	2	6	236652	236657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430998
3058	NC_000854	CAG	2	6	236724	236729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430998
3059	NC_000854	CCT	3	9	236732	236740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
3060	NC_000854	TTA	2	6	236798	236803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430998
3061	NC_000854	AGT	2	6	236806	236811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430998
3062	NC_000854	TAG	2	6	236817	236822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430998
3063	NC_000854	CGT	2	6	236969	236974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430998
3064	NC_000854	TCA	2	6	237037	237042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430998
3065	NC_000854	TCT	2	6	237044	237049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430998
3066	NC_000854	AGG	2	6	237094	237099	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430998
3067	NC_000854	AGC	2	6	237120	237125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430998
3068	NC_000854	ACT	2	6	237259	237264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430998
3069	NC_000854	ACC	2	6	237268	237273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430998
3070	NC_000854	CCT	2	6	237306	237311	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
3071	NC_000854	GCT	2	6	237329	237334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430998
3072	NC_000854	TCC	2	6	237431	237436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
3073	NC_000854	TCC	2	6	237595	237600	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
3074	NC_000854	GCC	2	6	237675	237680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430998
3075	NC_000854	CCT	3	9	237731	237739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
3076	NC_000854	CTG	2	6	237814	237819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430998
3077	NC_000854	CTT	2	6	238206	238211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430999
3078	NC_000854	TCC	2	6	238319	238324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3079	NC_000854	CTC	3	9	238411	238419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3080	NC_000854	TCC	2	6	238445	238450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3081	NC_000854	AAC	2	6	238474	238479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430999
3082	NC_000854	CTC	2	6	238517	238522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3083	NC_000854	CTT	2	6	238536	238541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430999
3084	NC_000854	TCT	2	6	238545	238550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430999
3085	NC_000854	GTA	2	6	238606	238611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430999
3086	NC_000854	TCC	3	9	238619	238627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3087	NC_000854	CCT	2	6	238662	238667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3088	NC_000854	TCA	2	6	238674	238679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430999
3089	NC_000854	CGC	2	6	238809	238814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431000
3090	NC_000854	GAA	2	6	238885	238890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431000
3091	NC_000854	CTC	2	6	238979	238984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431000
3092	NC_000854	TCT	2	6	239100	239105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431000
3093	NC_000854	CTC	2	6	239152	239157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431000
3094	NC_000854	CCT	2	6	239386	239391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431000
3095	NC_000854	CGA	2	6	239451	239456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431000
3096	NC_000854	CGC	2	6	239542	239547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431000
3097	NC_000854	AGA	2	6	239636	239641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431000
3098	NC_000854	CTT	2	6	239701	239706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431000
3099	NC_000854	CAC	2	6	239778	239783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431000
3100	NC_000854	CTC	2	6	239997	240002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431001
3101	NC_000854	CGA	2	6	240167	240172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431001
3102	NC_000854	CTC	2	6	240201	240206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431001
3103	NC_000854	GGT	2	6	240341	240346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431001
3104	NC_000854	TAG	2	6	240607	240612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600639
3105	NC_000854	CGA	2	6	240652	240657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600639
3106	NC_000854	GGC	2	6	240719	240724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600639
3107	NC_000854	GCG	2	6	240738	240743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600639
3108	NC_000854	AGT	2	6	240749	240754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600639
3109	NC_000854	ACC	2	6	240815	240820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600639
3110	NC_000854	CAT	2	6	240824	240829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431002
3111	NC_000854	GGC	2	6	240860	240865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431002
3112	NC_000854	CAC	2	6	241035	241040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431002
3113	NC_000854	GCT	2	6	241054	241059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3114	NC_000854	AGG	2	6	241130	241135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3115	NC_000854	GAA	2	6	241195	241200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431002
3116	NC_000854	CTC	2	6	241351	241356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431002
3117	NC_000854	GAG	2	6	241405	241410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3118	NC_000854	GTC	2	6	241429	241434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3119	NC_000854	TCC	2	6	241604	241609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431002
3120	NC_000854	CCG	2	6	241914	241919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431002
3121	NC_000854	GGC	2	6	241943	241948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431002
3122	NC_000854	GCT	2	6	241987	241992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
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3143	NC_000854	TTA	2	6	243746	243751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431003
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3153	NC_000854	GTA	2	6	244431	244436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431003
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3227	NC_000854	AGA	2	6	248549	248554	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431006
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3231	NC_000854	ATC	2	6	248664	248669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431006
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3235	NC_000854	GCC	2	6	248954	248959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431006
3236	NC_000854	CTT	2	6	249147	249152	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431006
3237	NC_000854	AGG	2	6	249235	249240	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431006
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3239	NC_000854	TCA	2	6	249468	249473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431007
3240	NC_000854	GCC	2	6	249537	249542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431007
3241	NC_000854	TCC	2	6	249543	249548	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431007
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3243	NC_000854	CTC	2	6	249571	249576	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431007
3244	NC_000854	ACT	2	6	249718	249723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431007
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3360	NC_000854	ACC	2	6	257169	257174	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600659
3361	NC_000854	CCT	2	6	257177	257182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600659
3362	NC_000854	CTT	2	6	257198	257203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600659
3363	NC_000854	AAC	3	9	257210	257218	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600659
3364	NC_000854	CCT	2	6	257246	257251	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600659
3365	NC_000854	TTA	2	6	257278	257283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600659
3366	NC_000854	CCT	2	6	257290	257295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600659
3367	NC_000854	CTT	4	12	257381	257392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600659
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3372	NC_000854	GTA	2	6	257570	257575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431013
3373	NC_000854	TGC	2	6	257586	257591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431013
3374	NC_000854	TCC	2	6	257602	257607	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431013
3375	NC_000854	CAA	2	6	257623	257628	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431013
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3385	NC_000854	TCC	2	6	258289	258294	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
3386	NC_000854	CTC	2	6	258300	258305	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
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3389	NC_000854	CTT	3	9	258410	258418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600662
3390	NC_000854	CGA	2	6	258521	258526	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600662
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3392	NC_000854	CCT	2	6	258675	258680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600662
3393	NC_000854	GCT	2	6	258755	258760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600662
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3481	NC_000854	CCT	3	9	263975	263983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3482	NC_000854	GGA	2	6	264173	264178	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600670
3483	NC_000854	TGG	2	6	264245	264250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600670
3484	NC_000854	CCT	2	6	264321	264326	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3485	NC_000854	GGC	2	6	264354	264359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600670
3486	NC_000854	TAT	2	6	264360	264365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600670
3487	NC_000854	CCT	2	6	264369	264374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3488	NC_000854	CCT	2	6	264381	264386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3489	NC_000854	TCC	2	6	264454	264459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3490	NC_000854	TCC	2	6	264484	264489	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3491	NC_000854	CTC	2	6	264531	264536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3492	NC_000854	GAG	2	6	264600	264605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600670
3493	NC_000854	CCT	2	6	264665	264670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3494	NC_000854	CTC	2	6	264679	264684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3495	NC_000854	TTA	2	6	264686	264691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600670
3496	NC_000854	ATG	2	6	264721	264726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600670
3497	NC_000854	CGT	2	6	264749	264754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600670
3498	NC_000854	TCC	2	6	264766	264771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
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3500	NC_000854	TCC	2	6	264826	264831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670

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