MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 24235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_000854	GAT	2	6	149425	149430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430932
2002	NC_000854	TCT	2	6	149448	149453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430932
2003	NC_000854	GGC	2	6	149470	149475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430932
2004	NC_000854	AGA	2	6	149699	149704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430932
2005	NC_000854	AAG	2	6	149732	149737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430932
2006	NC_000854	CTC	2	6	149820	149825	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430932
2007	NC_000854	CCT	2	6	149866	149871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430932
2008	NC_000854	ACT	2	6	149876	149881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430932
2009	NC_000854	CTA	2	6	149919	149924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430932
2010	NC_000854	CTT	2	6	150522	150527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430933
2011	NC_000854	CCT	2	6	150626	150631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430933
2012	NC_000854	CCT	2	6	150670	150675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430933
2013	NC_000854	CGG	2	6	150698	150703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430933
2014	NC_000854	CTC	2	6	151064	151069	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430933
2015	NC_000854	CTC	2	6	151075	151080	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430933
2016	NC_000854	GTG	2	6	151139	151144	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600529
2017	NC_000854	CGA	2	6	151158	151163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600529
2018	NC_000854	GAA	2	6	151170	151175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600529
2019	NC_000854	ATG	2	6	151189	151194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600529
2020	NC_000854	GAG	2	6	151312	151317	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600529
2021	NC_000854	GGA	2	6	151335	151340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600529
2022	NC_000854	ATA	2	6	151342	151347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600529
2023	NC_000854	GGC	2	6	151365	151370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600529
2024	NC_000854	GAG	2	6	151393	151398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600529
2025	NC_000854	GGC	2	6	151851	151856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600530
2026	NC_000854	GAG	2	6	151887	151892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600530
2027	NC_000854	TCG	2	6	151895	151900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600530
2028	NC_000854	AGG	2	6	151901	151906	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600530
2029	NC_000854	CGT	2	6	152001	152006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600530
2030	NC_000854	ACG	2	6	152063	152068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600530
2031	NC_000854	GAA	3	9	152085	152093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600530
2032	NC_000854	AGG	2	6	152119	152124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600530
2033	NC_000854	TCC	2	6	152171	152176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600530
2034	NC_000854	GCG	2	6	152213	152218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600530
2035	NC_000854	GGA	2	6	152319	152324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600530
2036	NC_000854	GAA	2	6	152419	152424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600530
2037	NC_000854	CAA	2	6	152582	152587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430934
2038	NC_000854	GGC	2	6	152633	152638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430934
2039	NC_000854	AGG	3	9	152652	152660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430934
2040	NC_000854	CCT	2	6	152776	152781	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430934
2041	NC_000854	CTT	2	6	152812	152817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430934
2042	NC_000854	TCC	2	6	152881	152886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430934
2043	NC_000854	TCC	2	6	152892	152897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430934
2044	NC_000854	CGC	2	6	152954	152959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430934
2045	NC_000854	CTC	2	6	152975	152980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430934
2046	NC_000854	GCT	2	6	153121	153126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430934
2047	NC_000854	CGA	2	6	153139	153144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430934
2048	NC_000854	TGC	2	6	153146	153151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430934
2049	NC_000854	CAA	2	6	153211	153216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430934
2050	NC_000854	TCC	2	6	153279	153284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430934
2051	NC_000854	TCC	2	6	153320	153325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430934
2052	NC_000854	AGC	2	6	153371	153376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430934
2053	NC_000854	GTA	2	6	153389	153394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430934
2054	NC_000854	CAT	2	6	153413	153418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430934
2055	NC_000854	ATG	2	6	153507	153512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430934
2056	NC_000854	GCG	2	6	153758	153763	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430935
2057	NC_000854	CCT	2	6	153765	153770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430935
2058	NC_000854	GCC	2	6	153773	153778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430935
2059	NC_000854	AGG	2	6	153784	153789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430935
2060	NC_000854	CGA	2	6	153855	153860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430935
2061	NC_000854	AGG	3	9	153865	153873	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430935
2062	NC_000854	ATG	2	6	153938	153943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430935
2063	NC_000854	CAT	2	6	153975	153980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430935
2064	NC_000854	GTT	2	6	154087	154092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430935
2065	NC_000854	TCC	2	6	154121	154126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430935
2066	NC_000854	ACA	2	6	154280	154285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430935
2067	NC_000854	CCT	2	6	154426	154431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430935
2068	NC_000854	CCT	2	6	154442	154447	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430935
2069	NC_000854	GGA	2	6	154583	154588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430936
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2071	NC_000854	ACC	2	6	154818	154823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430936
2072	NC_000854	AGG	2	6	154908	154913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430936
2073	NC_000854	TGT	2	6	154946	154951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430936
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2080	NC_000854	CGG	2	6	155561	155566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430936
2081	NC_000854	GAG	3	9	155594	155602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430936
2082	NC_000854	AGG	2	6	155622	155627	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430936
2083	NC_000854	GGA	2	6	155702	155707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430936
2084	NC_000854	GAG	2	6	155745	155750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430936
2085	NC_000854	CAT	2	6	155804	155809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430937
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2087	NC_000854	CCT	2	6	155840	155845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430937
2088	NC_000854	CGG	2	6	155870	155875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430937
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2090	NC_000854	CAG	2	6	156091	156096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430937
2091	NC_000854	CGC	2	6	156106	156111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430937
2092	NC_000854	ACC	2	6	156165	156170	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430937
2093	NC_000854	CTC	2	6	156173	156178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430937
2094	NC_000854	TAT	2	6	156233	156238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430937
2095	NC_000854	CCT	2	6	156274	156279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430937
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2099	NC_000854	CGG	2	6	156655	156660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430938
2100	NC_000854	CTC	2	6	156661	156666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430938
2101	NC_000854	TCC	2	6	156668	156673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430938
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2103	NC_000854	ATC	2	6	156764	156769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430938
2104	NC_000854	AGC	2	6	156779	156784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430938
2105	NC_000854	TCG	2	6	156788	156793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430938
2106	NC_000854	AGG	2	6	156848	156853	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430938
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2108	NC_000854	CTC	2	6	156898	156903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430938
2109	NC_000854	TTA	2	6	156920	156925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430938
2110	NC_000854	CTA	2	6	157043	157048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430938
2111	NC_000854	TCT	2	6	157050	157055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430938
2112	NC_000854	GAG	2	6	157179	157184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430939
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2115	NC_000854	GAG	3	9	157488	157496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430939
2116	NC_000854	TCC	3	9	157774	157782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600538
2117	NC_000854	TCC	2	6	157786	157791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600538
2118	NC_000854	GGT	2	6	157885	157890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600538
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2120	NC_000854	GCC	2	6	158135	158140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600538
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2241	NC_000854	CCT	2	6	168605	168610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600550
2242	NC_000854	CCT	2	6	168640	168645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600550
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2361	NC_000854	CAT	2	6	178217	178222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430953
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2481	NC_000854	TGA	2	6	185953	185958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430958
2482	NC_000854	GGC	2	6	185960	185965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430958
2483	NC_000854	TCC	2	6	186012	186017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430958
2484	NC_000854	CAG	2	6	186034	186039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430958
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