MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 43837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_015183	TGG	2	6	230689	230694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291668
3502	NC_015183	CGG	2	6	231015	231020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291668
3503	NC_015183	TCA	2	6	231198	231203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291668
3504	NC_015183	GGC	2	6	231215	231220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291668
3505	NC_015183	ATC	2	6	231222	231227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291668
3506	NC_015183	TCT	2	6	231297	231302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291668
3507	NC_015183	GCC	2	6	231373	231378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291668
3508	NC_015183	GTT	2	6	231619	231624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291668
3509	NC_015183	CCG	2	6	231724	231729	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291668
3510	NC_015183	CAC	3	9	231787	231795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291669
3511	NC_015183	ATC	2	6	231809	231814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291669
3512	NC_015183	CCT	2	6	231825	231830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291669
3513	NC_015183	TGC	2	6	231844	231849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291669
3514	NC_015183	GAA	2	6	231862	231867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291669
3515	NC_015183	GCA	2	6	231873	231878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291669
3516	NC_015183	GCC	2	6	231904	231909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291669
3517	NC_015183	AGA	2	6	231930	231935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291669
3518	NC_015183	GCC	2	6	231976	231981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291669
3519	NC_015183	GCA	2	6	232038	232043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291669
3520	NC_015183	GCA	2	6	232109	232114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291669
3521	NC_015183	GCA	2	6	232287	232292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291669
3522	NC_015183	CAA	2	6	232326	232331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291669
3523	NC_015183	ACC	2	6	232394	232399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291669
3524	NC_015183	ATC	2	6	232432	232437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291669
3525	NC_015183	CAC	2	6	232579	232584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291669
3526	NC_015183	GTC	2	6	232613	232618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291669
3527	NC_015183	GTT	2	6	232713	232718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_015183	TGA	2	6	232783	232788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_015183	CGT	2	6	232889	232894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291670
3530	NC_015183	GCG	2	6	233061	233066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291670
3531	NC_015183	GAT	2	6	233343	233348	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291670
3532	NC_015183	CCG	2	6	233524	233529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291670
3533	NC_015183	CTG	2	6	233544	233549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291670
3534	NC_015183	CAT	2	6	233576	233581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291670
3535	NC_015183	GAT	2	6	233586	233591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291670
3536	NC_015183	GGC	2	6	233615	233620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291670
3537	NC_015183	GTC	2	6	233655	233660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291670
3538	NC_015183	TGG	2	6	233771	233776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291670
3539	NC_015183	CGG	3	9	233863	233871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291670
3540	NC_015183	GGC	3	9	233879	233887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291670
3541	NC_015183	GCC	2	6	233950	233955	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291670
3542	NC_015183	CGC	2	6	233972	233977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291670
3543	NC_015183	GGT	2	6	234008	234013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291670
3544	NC_015183	CTC	2	6	234091	234096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291670
3545	NC_015183	GAG	2	6	234164	234169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_015183	TCT	2	6	234200	234205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_015183	AGG	2	6	234216	234221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3548	NC_015183	GCC	2	6	234426	234431	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291671
3549	NC_015183	CAA	2	6	234492	234497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291671
3550	NC_015183	GCA	2	6	234499	234504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291671
3551	NC_015183	CGG	2	6	234522	234527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291671
3552	NC_015183	ATC	2	6	234555	234560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_015183	GCG	2	6	234611	234616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_015183	TCC	2	6	234675	234680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291672
3555	NC_015183	GAG	2	6	234716	234721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291672
3556	NC_015183	GCA	2	6	234756	234761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291672
3557	NC_015183	AGC	2	6	234852	234857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291672
3558	NC_015183	CGA	2	6	234911	234916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291672
3559	NC_015183	CAC	3	9	234956	234964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291672
3560	NC_015183	CGC	2	6	234983	234988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291672
3561	NC_015183	CGC	2	6	235004	235009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291672
3562	NC_015183	GCA	2	6	235042	235047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291672
3563	NC_015183	CAT	2	6	235222	235227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291673
3564	NC_015183	ACG	2	6	235233	235238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291673
3565	NC_015183	TCA	3	9	235239	235247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291673
3566	NC_015183	CGG	2	6	235249	235254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291673
3567	NC_015183	CCG	2	6	235272	235277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291673
3568	NC_015183	TGG	3	9	235311	235319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291673
3569	NC_015183	CAT	2	6	235396	235401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291673
3570	NC_015183	CGC	2	6	235412	235417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291673
3571	NC_015183	TCA	2	6	235494	235499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291673
3572	NC_015183	CGC	2	6	235514	235519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291673
3573	NC_015183	GGC	2	6	235525	235530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291673
3574	NC_015183	CCA	2	6	235687	235692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291673
3575	NC_015183	GCA	2	6	235857	235862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291673
3576	NC_015183	GAA	2	6	235940	235945	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291673
3577	NC_015183	ACA	2	6	235988	235993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291673
3578	NC_015183	CAT	2	6	236243	236248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291674
3579	NC_015183	CGC	2	6	236268	236273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291674
3580	NC_015183	ATG	2	6	236274	236279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291674
3581	NC_015183	CAG	2	6	236396	236401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291674
3582	NC_015183	CGC	2	6	236627	236632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291674
3583	NC_015183	CGG	2	6	236648	236653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291674
3584	NC_015183	TCG	2	6	236682	236687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291674
3585	NC_015183	CAC	2	6	236695	236700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291674
3586	NC_015183	GCA	2	6	236722	236727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291674
3587	NC_015183	TGA	2	6	237023	237028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291675
3588	NC_015183	TCG	2	6	237079	237084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291675
3589	NC_015183	ATC	2	6	237099	237104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291675
3590	NC_015183	GTC	2	6	237165	237170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291675
3591	NC_015183	AGG	2	6	237184	237189	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291675
3592	NC_015183	ATG	2	6	237271	237276	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291675
3593	NC_015183	TCG	2	6	237358	237363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291675
3594	NC_015183	AGC	2	6	237398	237403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291675
3595	NC_015183	CGA	2	6	237452	237457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_015183	TCG	2	6	237474	237479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3597	NC_015183	GCC	2	6	237662	237667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
3598	NC_015183	GCC	2	6	237672	237677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
3599	NC_015183	GCG	2	6	237700	237705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291676
3600	NC_015183	GCC	2	6	237753	237758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
3601	NC_015183	GAT	2	6	237845	237850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291676
3602	NC_015183	ATC	2	6	237942	237947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291676
3603	NC_015183	ACC	2	6	238013	238018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291676
3604	NC_015183	TCG	2	6	238026	238031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3605	NC_015183	TCG	2	6	238042	238047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3606	NC_015183	CCG	2	6	238099	238104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
3607	NC_015183	GAC	2	6	238151	238156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3608	NC_015183	CGA	2	6	238171	238176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3609	NC_015183	GCA	2	6	238225	238230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3610	NC_015183	CGT	2	6	238300	238305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3611	NC_015183	CCG	2	6	238324	238329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
3612	NC_015183	GTC	2	6	238433	238438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3613	NC_015183	TGA	2	6	238489	238494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291676
3614	NC_015183	CAT	2	6	238586	238591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291676
3615	NC_015183	CTG	2	6	238598	238603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3616	NC_015183	CGA	2	6	238675	238680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291676
3617	NC_015183	ATT	2	6	238901	238906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	325291676
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3619	NC_015183	GCC	2	6	239180	239185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291676
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3852	NC_015183	GCG	2	6	253226	253231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
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3856	NC_015183	CAT	2	6	253392	253397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291695
3857	NC_015183	CTT	2	6	253427	253432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291695
3858	NC_015183	CGC	2	6	253530	253535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
3859	NC_015183	GAA	2	6	253671	253676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291695
3860	NC_015183	GCA	2	6	253698	253703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3861	NC_015183	GCC	2	6	253801	253806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291695
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3863	NC_015183	GTC	2	6	253900	253905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291695
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3866	NC_015183	TGA	2	6	253968	253973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291695
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3871	NC_015183	GTC	2	6	254173	254178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291695
3872	NC_015183	CGG	2	6	254255	254260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291695
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3892	NC_015183	CAT	2	6	256187	256192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291696
3893	NC_015183	ACC	2	6	256245	256250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291696
3894	NC_015183	CGA	2	6	256279	256284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291696
3895	NC_015183	GTT	2	6	256292	256297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291696
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3898	NC_015183	TGA	2	6	256516	256521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3899	NC_015183	AAT	2	6	256547	256552	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3900	NC_015183	GTT	2	6	256571	256576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291697
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3904	NC_015183	TCG	2	6	256709	256714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291697
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3960	NC_015183	CGT	3	9	261057	261065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291702
3961	NC_015183	GCG	2	6	261218	261223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291702
3962	NC_015183	CGG	2	6	261363	261368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291702
3963	NC_015183	GCC	2	6	261403	261408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291702
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3965	NC_015183	GTC	2	6	261607	261612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291702
3966	NC_015183	GAA	2	6	261630	261635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291702
3967	NC_015183	GCG	2	6	261664	261669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291702
3968	NC_015183	GCT	2	6	261710	261715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291703
3969	NC_015183	GCC	2	6	261722	261727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291703
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3971	NC_015183	TCG	2	6	261926	261931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291703
3972	NC_015183	GGC	2	6	261960	261965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291703
3973	NC_015183	CAG	2	6	261993	261998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291703
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3976	NC_015183	CGG	2	6	262189	262194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291704
3977	NC_015183	ATG	2	6	262251	262256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291704
3978	NC_015183	GCC	2	6	262323	262328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3979	NC_015183	TCC	2	6	262394	262399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3980	NC_015183	CCG	2	6	262442	262447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3981	NC_015183	GCG	2	6	262624	262629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291705
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