MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 43837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_015183	GAA	2	6	365343	365348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291808
5502	NC_015183	TGG	2	6	365417	365422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291808
5503	NC_015183	TGG	2	6	365431	365436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291808
5504	NC_015183	ACG	2	6	365455	365460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291808
5505	NC_015183	GCC	2	6	365541	365546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291808
5506	NC_015183	GCC	2	6	365556	365561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291808
5507	NC_015183	CAT	2	6	365565	365570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291808
5508	NC_015183	GCA	2	6	365678	365683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291808
5509	NC_015183	GAT	2	6	365691	365696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291808
5510	NC_015183	TGC	2	6	365710	365715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291808
5511	NC_015183	TCG	2	6	365729	365734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291808
5512	NC_015183	TCG	2	6	365737	365742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291808
5513	NC_015183	TGC	2	6	365765	365770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291808
5514	NC_015183	GAT	2	6	365862	365867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291808
5515	NC_015183	CGT	2	6	365975	365980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291808
5516	NC_015183	GAT	3	9	366000	366008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291808
5517	NC_015183	CCG	2	6	366034	366039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5518	NC_015183	GGA	2	6	366065	366070	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_015183	ATG	2	6	366324	366329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291809
5520	NC_015183	TCC	2	6	366334	366339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291809
5521	NC_015183	ACA	2	6	366342	366347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291809
5522	NC_015183	CGG	2	6	366361	366366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291809
5523	NC_015183	GAC	2	6	366436	366441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291809
5524	NC_015183	CAG	2	6	366473	366478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291809
5525	NC_015183	CTT	2	6	366590	366595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291809
5526	NC_015183	GAA	2	6	366703	366708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5527	NC_015183	AAG	2	6	366731	366736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291810
5528	NC_015183	TCC	2	6	366902	366907	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291810
5529	NC_015183	CCG	2	6	366991	366996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5530	NC_015183	ATC	2	6	367046	367051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291811
5531	NC_015183	CAT	2	6	367163	367168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291811
5532	NC_015183	GCC	2	6	367187	367192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291811
5533	NC_015183	GAC	2	6	367210	367215	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291811
5534	NC_015183	AGC	2	6	367277	367282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291811
5535	NC_015183	GCG	2	6	367407	367412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291811
5536	NC_015183	TTG	2	6	367440	367445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291811
5537	NC_015183	CAG	2	6	367460	367465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291811
5538	NC_015183	GAG	2	6	367639	367644	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_015183	ACT	2	6	367671	367676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_015183	GTC	2	6	367711	367716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_015183	ATG	2	6	367835	367840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291812
5542	NC_015183	AGC	2	6	367865	367870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291812
5543	NC_015183	GGC	2	6	367930	367935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291812
5544	NC_015183	CCG	2	6	368061	368066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291812
5545	NC_015183	ATC	2	6	368222	368227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291812
5546	NC_015183	GTG	2	6	368240	368245	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291812
5547	NC_015183	TCG	2	6	368285	368290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291812
5548	NC_015183	CGG	2	6	368418	368423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291812
5549	NC_015183	GAA	2	6	368483	368488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291813
5550	NC_015183	GAC	3	9	368498	368506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291813
5551	NC_015183	GCG	2	6	368530	368535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291813
5552	NC_015183	ATG	2	6	368642	368647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291813
5553	NC_015183	CAC	2	6	368650	368655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291813
5554	NC_015183	CGC	2	6	368800	368805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291813
5555	NC_015183	GGC	2	6	368884	368889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291813
5556	NC_015183	GGC	2	6	368927	368932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291813
5557	NC_015183	CGG	2	6	369036	369041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291813
5558	NC_015183	GTC	2	6	369076	369081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291813
5559	NC_015183	TCG	2	6	369162	369167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291813
5560	NC_015183	GCG	2	6	369232	369237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291813
5561	NC_015183	GGC	2	6	369328	369333	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291813
5562	NC_015183	CTT	2	6	369391	369396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291813
5563	NC_015183	GTC	2	6	369483	369488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_015183	AGA	2	6	369570	369575	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291814
5565	NC_015183	CAC	2	6	369605	369610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291814
5566	NC_015183	ATC	2	6	369660	369665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291814
5567	NC_015183	AGG	2	6	369774	369779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291814
5568	NC_015183	TGT	2	6	369832	369837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291814
5569	NC_015183	ATC	2	6	369882	369887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291814
5570	NC_015183	CGA	2	6	369928	369933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291814
5571	NC_015183	ACG	2	6	369987	369992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291814
5572	NC_015183	TGA	2	6	370069	370074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291814
5573	NC_015183	CGA	2	6	370078	370083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291814
5574	NC_015183	TTG	2	6	370089	370094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291814
5575	NC_015183	CGA	2	6	370117	370122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291814
5576	NC_015183	CCG	2	6	370215	370220	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291814
5577	NC_015183	ACG	2	6	370224	370229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291814
5578	NC_015183	CAC	2	6	370322	370327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291814
5579	NC_015183	AGC	2	6	370374	370379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291814
5580	NC_015183	GCG	2	6	370627	370632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_015183	CAG	2	6	370697	370702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5582	NC_015183	GGA	2	6	370709	370714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5583	NC_015183	GAG	2	6	370755	370760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_015183	GCA	2	6	371037	371042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291815
5585	NC_015183	CGC	2	6	371047	371052	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291815
5586	NC_015183	GGC	2	6	371088	371093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291815
5587	NC_015183	CCG	2	6	371121	371126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291815
5588	NC_015183	CGA	2	6	371223	371228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291816
5589	NC_015183	GGC	2	6	371250	371255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291816
5590	NC_015183	GCC	2	6	371356	371361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291816
5591	NC_015183	CCT	2	6	371381	371386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291816
5592	NC_015183	CGT	2	6	371387	371392	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291816
5593	NC_015183	CGG	2	6	371547	371552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291816
5594	NC_015183	AGT	2	6	371591	371596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291816
5595	NC_015183	CCA	2	6	371651	371656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291816
5596	NC_015183	TGA	2	6	371663	371668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291816
5597	NC_015183	CGG	2	6	371712	371717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291816
5598	NC_015183	GGC	2	6	371725	371730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291816
5599	NC_015183	CGC	2	6	371750	371755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291816
5600	NC_015183	ATG	2	6	371892	371897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291817
5601	NC_015183	CTG	2	6	371903	371908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291817
5602	NC_015183	GTT	2	6	371924	371929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291817
5603	NC_015183	CGG	2	6	371953	371958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291817
5604	NC_015183	ATC	2	6	372006	372011	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291817
5605	NC_015183	ATC	2	6	372093	372098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291817
5606	NC_015183	CGT	2	6	372112	372117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291817
5607	NC_015183	GAA	2	6	372185	372190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291817
5608	NC_015183	AGA	2	6	372241	372246	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291817
5609	NC_015183	GCA	3	9	372256	372264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291817
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5611	NC_015183	TCT	2	6	372292	372297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291817
5612	NC_015183	CTT	2	6	372298	372303	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291817
5613	NC_015183	CAT	2	6	372314	372319	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291817
5614	NC_015183	CTG	2	6	372323	372328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291817
5615	NC_015183	GAA	2	6	372431	372436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291817
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5617	NC_015183	TGG	2	6	372454	372459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291817
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5619	NC_015183	GAA	3	9	372497	372505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291817
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5976	NC_015183	TCT	2	6	396390	396395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291838
5977	NC_015183	CAG	2	6	396484	396489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291838
5978	NC_015183	GTC	2	6	396526	396531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291838
5979	NC_015183	AGC	2	6	396541	396546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291838
5980	NC_015183	TGC	2	6	396567	396572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291838
5981	NC_015183	TGG	2	6	396597	396602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291838
5982	NC_015183	CTC	2	6	396616	396621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5983	NC_015183	CGC	2	6	396759	396764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291839
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5986	NC_015183	GAC	2	6	396893	396898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291839
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5989	NC_015183	CGA	2	6	397045	397050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291839
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5991	NC_015183	TCG	2	6	397221	397226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291839
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5995	NC_015183	GCC	2	6	397571	397576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291839
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5998	NC_015183	CGT	2	6	397763	397768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291839
5999	NC_015183	CCG	2	6	397770	397775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291839
6000	NC_015183	AGG	2	6	397806	397811	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291839

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