MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium sp. H13-3 chromosome

Total Repeats: 43837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015183	GTC	2	6	135678	135683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2002	NC_015183	GTG	2	6	135717	135722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291574
2003	NC_015183	GGC	2	6	135734	135739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291574
2004	NC_015183	CGA	2	6	135755	135760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2005	NC_015183	TGG	2	6	135823	135828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291574
2006	NC_015183	TTC	2	6	135859	135864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291574
2007	NC_015183	TCG	2	6	135911	135916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2008	NC_015183	TCA	2	6	135952	135957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291574
2009	NC_015183	GCC	2	6	135999	136004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291574
2010	NC_015183	CAG	2	6	136031	136036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291574
2011	NC_015183	CGG	2	6	136061	136066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291574
2012	NC_015183	GAT	2	6	136176	136181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291574
2013	NC_015183	GCC	2	6	136218	136223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291574
2014	NC_015183	ATC	2	6	136253	136258	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291575
2015	NC_015183	CGC	2	6	136259	136264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291575
2016	NC_015183	CGA	2	6	136393	136398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291575
2017	NC_015183	TGG	2	6	136401	136406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291575
2018	NC_015183	CGG	2	6	136489	136494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291575
2019	NC_015183	GCC	2	6	136535	136540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291575
2020	NC_015183	GAT	2	6	136558	136563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291575
2021	NC_015183	CGG	2	6	136588	136593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291575
2022	NC_015183	CCG	2	6	136654	136659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291575
2023	NC_015183	ATC	2	6	136685	136690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291575
2024	NC_015183	AAG	2	6	136796	136801	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291575
2025	NC_015183	GGA	2	6	136870	136875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291575
2026	NC_015183	CGA	2	6	136929	136934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291575
2027	NC_015183	GGT	2	6	137050	137055	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291575
2028	NC_015183	TGC	2	6	137065	137070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291575
2029	NC_015183	GCC	2	6	137132	137137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291575
2030	NC_015183	TCC	2	6	137141	137146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291575
2031	NC_015183	GCA	2	6	137180	137185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291575
2032	NC_015183	ATC	2	6	137211	137216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291575
2033	NC_015183	GGC	3	9	137327	137335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291575
2034	NC_015183	AGA	2	6	137336	137341	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291575
2035	NC_015183	AAG	2	6	137451	137456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291575
2036	NC_015183	GTT	2	6	137588	137593	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291576
2037	NC_015183	CAA	2	6	137609	137614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291576
2038	NC_015183	GCC	2	6	137707	137712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291576
2039	NC_015183	GCC	2	6	137777	137782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291576
2040	NC_015183	GCG	2	6	137863	137868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291576
2041	NC_015183	CCA	2	6	137905	137910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291576
2042	NC_015183	CCA	2	6	137993	137998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291576
2043	NC_015183	CAA	2	6	138057	138062	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	325291576
2044	NC_015183	GTC	2	6	138063	138068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2045	NC_015183	CGC	2	6	138144	138149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2046	NC_015183	TTG	2	6	138150	138155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2047	NC_015183	GAT	2	6	138183	138188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2048	NC_015183	GCT	2	6	138265	138270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291577
2049	NC_015183	TTC	2	6	138366	138371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291577
2050	NC_015183	GGA	2	6	138407	138412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291577
2051	NC_015183	CGA	3	9	138436	138444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291577
2052	NC_015183	CTT	2	6	138614	138619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291577
2053	NC_015183	GCG	2	6	138652	138657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291577
2054	NC_015183	GGC	2	6	138733	138738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291577
2055	NC_015183	CTT	2	6	138761	138766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291577
2056	NC_015183	ATG	2	6	138771	138776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291577
2057	NC_015183	CTT	2	6	138891	138896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_015183	AGC	2	6	138945	138950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2059	NC_015183	AGA	2	6	139075	139080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291578
2060	NC_015183	TCG	2	6	139089	139094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2061	NC_015183	CGA	2	6	139228	139233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2062	NC_015183	GCG	2	6	139236	139241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291578
2063	NC_015183	CGA	2	6	139300	139305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2064	NC_015183	CTC	2	6	139409	139414	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291578
2065	NC_015183	TGC	2	6	139457	139462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2066	NC_015183	GCC	2	6	139470	139475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291578
2067	NC_015183	GAT	2	6	139517	139522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291578
2068	NC_015183	GAT	2	6	139628	139633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291578
2069	NC_015183	CGA	2	6	139831	139836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291578
2070	NC_015183	TGG	2	6	139940	139945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291579
2071	NC_015183	GCC	2	6	140159	140164	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291579
2072	NC_015183	CGA	2	6	140211	140216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291579
2073	NC_015183	TGA	2	6	140301	140306	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291579
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2080	NC_015183	CGG	2	6	140889	140894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291579
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2086	NC_015183	GAA	2	6	141188	141193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2087	NC_015183	GCA	2	6	141273	141278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291580
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2089	NC_015183	GGT	2	6	141339	141344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291580
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2099	NC_015183	GAC	2	6	141940	141945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291580
2100	NC_015183	TGC	2	6	141949	141954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291580
2101	NC_015183	TGC	2	6	142034	142039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_015183	CGA	2	6	142099	142104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2103	NC_015183	CCG	2	6	142153	142158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2104	NC_015183	GCT	2	6	142185	142190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291581
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2106	NC_015183	TGT	2	6	142243	142248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291581
2107	NC_015183	CAG	2	6	142280	142285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291581
2108	NC_015183	CAC	2	6	142286	142291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	325291581
2109	NC_015183	GCC	2	6	142322	142327	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291581
2110	NC_015183	CAG	2	6	142409	142414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291581
2111	NC_015183	CAT	2	6	142525	142530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291581
2112	NC_015183	TGA	2	6	142533	142538	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291581
2113	NC_015183	GTC	2	6	142541	142546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291581
2114	NC_015183	CGT	2	6	142555	142560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291581
2115	NC_015183	TCA	2	6	142582	142587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291581
2116	NC_015183	GCG	2	6	142685	142690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291582
2117	NC_015183	GAA	2	6	142780	142785	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291582
2118	NC_015183	CTT	2	6	142821	142826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291582
2119	NC_015183	CGT	2	6	142906	142911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291582
2120	NC_015183	TCA	2	6	143097	143102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291582
2121	NC_015183	TGG	2	6	143141	143146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291582
2122	NC_015183	AGA	2	6	143160	143165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291582
2123	NC_015183	AGC	2	6	143233	143238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291583
2124	NC_015183	GTA	2	6	143283	143288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
2125	NC_015183	GAT	2	6	143328	143333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
2126	NC_015183	GCC	2	6	143350	143355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291583
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2128	NC_015183	ACG	2	6	143392	143397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291583
2129	NC_015183	TGA	2	6	143408	143413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
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2131	NC_015183	CTT	2	6	143484	143489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291583
2132	NC_015183	CGA	2	6	143556	143561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291583
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2135	NC_015183	GAT	2	6	143916	143921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
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2139	NC_015183	GAA	2	6	144183	144188	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291583
2140	NC_015183	GTG	2	6	144189	144194	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291583
2141	NC_015183	TGA	2	6	144221	144226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
2142	NC_015183	TTG	2	6	144268	144273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291583
2143	NC_015183	GCA	2	6	144314	144319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291583
2144	NC_015183	GCC	2	6	144381	144386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291583
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2146	NC_015183	CAT	2	6	144522	144527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291583
2147	NC_015183	TGA	2	6	144551	144556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
2148	NC_015183	CGT	2	6	144585	144590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291583
2149	NC_015183	TAA	2	6	144622	144627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	325291583
2150	NC_015183	TGA	2	6	144725	144730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
2151	NC_015183	GTT	2	6	144762	144767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	325291583
2152	NC_015183	ACG	2	6	144811	144816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291583
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2154	NC_015183	ATG	2	6	144862	144867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	325291583
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2182	NC_015183	GCT	2	6	146262	146267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291584
2183	NC_015183	TCA	2	6	146292	146297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291584
2184	NC_015183	AGC	3	9	146318	146326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291584
2185	NC_015183	CAT	2	6	146425	146430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2186	NC_015183	AGG	2	6	146665	146670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2187	NC_015183	TGC	2	6	146691	146696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291585
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2189	NC_015183	TCG	2	6	146867	146872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291585
2190	NC_015183	TCT	2	6	146906	146911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291585
2191	NC_015183	TCC	2	6	146951	146956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	325291585
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2202	NC_015183	TTC	2	6	147304	147309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	325291585
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2209	NC_015183	CTG	2	6	147700	147705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291585
2210	NC_015183	CGC	2	6	148038	148043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2211	NC_015183	CAT	2	6	148115	148120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2217	NC_015183	AGC	2	6	148464	148469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291587
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2220	NC_015183	CGG	2	6	148562	148567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291587
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2222	NC_015183	CAT	2	6	148730	148735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291587
2223	NC_015183	GCC	2	6	148815	148820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291587
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2226	NC_015183	CAT	2	6	149225	149230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291587
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2229	NC_015183	GCC	2	6	149333	149338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291587
2230	NC_015183	ACG	2	6	149350	149355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291587
2231	NC_015183	GAG	2	6	149406	149411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	325291587
2232	NC_015183	TCG	2	6	149455	149460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291587
2233	NC_015183	TCG	2	6	149573	149578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291587
2234	NC_015183	CGG	2	6	149594	149599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291587
2235	NC_015183	TAC	2	6	149607	149612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291587
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2238	NC_015183	CCG	2	6	149734	149739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291587
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2241	NC_015183	TCG	2	6	150131	150136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291587
2242	NC_015183	TGC	2	6	150167	150172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291587
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2355	NC_015183	GAC	2	6	156779	156784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	325291590
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2476	NC_015183	TCG	2	6	164876	164881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291600
2477	NC_015183	CGG	2	6	164943	164948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291600
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2479	NC_015183	CTG	2	6	165001	165006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291600
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2489	NC_015183	CGT	2	6	165558	165563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291601
2490	NC_015183	GAA	2	6	165696	165701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	325291601
2491	NC_015183	CGG	2	6	165767	165772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291601
2492	NC_015183	CAT	2	6	165797	165802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	325291601
2493	NC_015183	CCG	2	6	165811	165816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291601
2494	NC_015183	GCT	2	6	165866	165871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	325291601
2495	NC_015183	GCG	2	6	165963	165968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	325291601
2496	NC_015183	CCG	2	6	165983	165988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	325291601
2497	NC_015183	TGG	2	6	166054	166059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	325291601
2498	NC_015183	AGA	2	6	166117	166122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2499	NC_015183	GTC	2	6	166131	166136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2500	NC_015183	ATA	2	6	166147	166152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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