MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 5283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015138	ACAAG	2	10	1770	1779	60 %	0 %	20 %	20 %	326314825
2	NC_015138	CCACG	2	10	3814	3823	20 %	0 %	20 %	60 %	326314826
3	NC_015138	CCGAG	2	10	7739	7748	20 %	0 %	40 %	40 %	326314828
4	NC_015138	CCAAC	2	10	9470	9479	40 %	0 %	0 %	60 %	326314830
5	NC_015138	TCGGC	2	10	10860	10869	0 %	20 %	40 %	40 %	326314831
6	NC_015138	CAGAC	2	10	12498	12507	40 %	0 %	20 %	40 %	326314832
7	NC_015138	CACGC	2	10	16299	16308	20 %	0 %	20 %	60 %	326314834
8	NC_015138	GCTTG	2	10	17157	17166	0 %	40 %	40 %	20 %	326314835
9	NC_015138	CCCAA	2	10	19150	19159	40 %	0 %	0 %	60 %	326314836
10	NC_015138	GCACG	2	10	19628	19637	20 %	0 %	40 %	40 %	326314836
11	NC_015138	GCGGG	2	10	20358	20367	0 %	0 %	80 %	20 %	326314836
12	NC_015138	ACGCA	2	10	20970	20979	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_015138	CGTTC	2	10	21665	21674	0 %	40 %	20 %	40 %	326314837
14	NC_015138	CGTGG	2	10	23624	23633	0 %	20 %	60 %	20 %	326314838
15	NC_015138	GATGC	2	10	24336	24345	20 %	20 %	40 %	20 %	326314839
16	NC_015138	CCCGG	2	10	25374	25383	0 %	0 %	40 %	60 %	326314840
17	NC_015138	GCTGG	2	10	25784	25793	0 %	20 %	60 %	20 %	326314840
18	NC_015138	CCGCC	2	10	26213	26222	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
19	NC_015138	GGCGC	2	10	26474	26483	0 %	0 %	60 %	40 %	326314841
20	NC_015138	TGAAC	2	10	26682	26691	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_015138	TCCCA	2	10	26770	26779	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
22	NC_015138	CGGGG	2	10	28799	28808	0 %	0 %	80 %	20 %	326314844
23	NC_015138	CTGGC	2	10	29707	29716	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_015138	CCGCG	2	10	30234	30243	0 %	0 %	40 %	60 %	326314846
25	NC_015138	GCGCT	2	10	30964	30973	0 %	20 %	40 %	40 %	326314846
26	NC_015138	CGCGC	2	10	31041	31050	0 %	0 %	40 %	60 %	326314846
27	NC_015138	GGCAC	2	10	31581	31590	20 %	0 %	40 %	40 %	326314846
28	NC_015138	AGCGC	2	10	34003	34012	20 %	0 %	40 %	40 %	326314850
29	NC_015138	TGGCG	2	10	35166	35175	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_015138	TGCCG	2	10	35709	35718	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
31	NC_015138	GGCAG	2	10	36642	36651	20 %	0 %	60 %	20 %	326314852
32	NC_015138	TTGAT	2	10	36977	36986	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015138	CCGGC	2	10	37032	37041	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_015138	ACGCC	2	10	37716	37725	20 %	0 %	20 %	60 %	326314853
35	NC_015138	GCCGC	2	10	38263	38272	0 %	0 %	40 %	60 %	326314853
36	NC_015138	GGGCA	2	10	38438	38447	20 %	0 %	60 %	20 %	326314853
37	NC_015138	CGACG	2	10	38512	38521	20 %	0 %	40 %	40 %	326314853
38	NC_015138	GCCAT	2	10	38881	38890	20 %	20 %	20 %	40 %	326314854
39	NC_015138	CCGCG	2	10	39495	39504	0 %	0 %	40 %	60 %	326314855
40	NC_015138	GCCGC	2	10	39638	39647	0 %	0 %	40 %	60 %	326314855
41	NC_015138	GGCCA	2	10	39721	39730	20 %	0 %	40 %	40 %	326314855
42	NC_015138	CGCGG	2	10	40282	40291	0 %	0 %	60 %	40 %	326314855
43	NC_015138	GGCCG	2	10	40695	40704	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
44	NC_015138	TCCCA	2	10	40743	40752	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
45	NC_015138	CGGAG	2	10	43086	43095	20 %	0 %	60 %	20 %	326314856
46	NC_015138	CGCGG	2	10	43614	43623	0 %	0 %	60 %	40 %	326314856
47	NC_015138	TGGGG	2	10	45018	45027	0 %	20 %	80 %	0 %	326314856
48	NC_015138	GGCCG	2	10	45661	45670	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
49	NC_015138	CTTGC	2	10	45712	45721	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_015138	GTGGC	2	10	46736	46745	0 %	20 %	60 %	20 %	326314857
51	NC_015138	TGCGG	2	10	47561	47570	0 %	20 %	60 %	20 %	326314858
52	NC_015138	CGGTG	2	10	47751	47760	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
53	NC_015138	GGGCC	2	10	48366	48375	0 %	0 %	60 %	40 %	326314859
54	NC_015138	CGGCG	2	10	49723	49732	0 %	0 %	60 %	40 %	326314860
55	NC_015138	CTTGC	2	10	50732	50741	0 %	40 %	20 %	40 %	326314862
56	NC_015138	GGCGC	2	10	52984	52993	0 %	0 %	60 %	40 %	326314864
57	NC_015138	TGCGC	2	10	53776	53785	0 %	20 %	40 %	40 %	326314866
58	NC_015138	GGCGG	2	10	54043	54052	0 %	0 %	80 %	20 %	326314866
59	NC_015138	CGGGG	2	10	54241	54250	0 %	0 %	80 %	20 %	326314866
60	NC_015138	CGGAC	2	10	54397	54406	20 %	0 %	40 %	40 %	326314866
61	NC_015138	GCTGC	2	10	55067	55076	0 %	20 %	40 %	40 %	326314866
62	NC_015138	GCCGG	2	10	55600	55609	0 %	0 %	60 %	40 %	326314866
63	NC_015138	ATTCG	2	10	56061	56070	20 %	40 %	20 %	20 %	326314867
64	NC_015138	CGCAG	2	10	57281	57290	20 %	0 %	40 %	40 %	326314867
65	NC_015138	GGCGG	2	10	57730	57739	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
66	NC_015138	GGCGT	2	10	61971	61980	0 %	20 %	60 %	20 %	326314870
67	NC_015138	GGTCG	2	10	62851	62860	0 %	20 %	60 %	20 %	326314871
68	NC_015138	CCGGA	2	10	62877	62886	20 %	0 %	40 %	40 %	326314871
69	NC_015138	CTGCC	2	10	63136	63145	0 %	20 %	20 %	60 %	326314871
70	NC_015138	GTGGC	2	10	63623	63632	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_015138	GCCCG	2	10	64669	64678	0 %	0 %	40 %	60 %	326314872
72	NC_015138	CGGCC	2	10	64933	64942	0 %	0 %	40 %	60 %	326314872
73	NC_015138	GCAGC	2	10	65229	65238	20 %	0 %	40 %	40 %	326314873
74	NC_015138	TGGCC	2	10	66695	66704	0 %	20 %	40 %	40 %	326314874
75	NC_015138	GAAGG	2	10	67486	67495	40 %	0 %	60 %	0 %	326314875
76	NC_015138	CGGGC	2	10	67759	67768	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
77	NC_015138	AGGCC	2	10	68188	68197	20 %	0 %	40 %	40 %	326314876
78	NC_015138	AGGCC	2	10	72664	72673	20 %	0 %	40 %	40 %	326314880
79	NC_015138	CGCTG	2	10	75187	75196	0 %	20 %	40 %	40 %	326314883
80	NC_015138	GCCGC	2	10	75223	75232	0 %	0 %	40 %	60 %	326314883
81	NC_015138	CCCGG	2	10	76779	76788	0 %	0 %	40 %	60 %	326314885
82	NC_015138	GGCCC	2	10	76997	77006	0 %	0 %	40 %	60 %	326314885
83	NC_015138	CCGCG	2	10	79820	79829	0 %	0 %	40 %	60 %	326314889
84	NC_015138	TCCGG	2	10	80210	80219	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
85	NC_015138	GCCGG	2	10	80864	80873	0 %	0 %	60 %	40 %	326314890
86	NC_015138	CACGC	2	10	81635	81644	20 %	0 %	20 %	60 %	326314890
87	NC_015138	CCAGG	2	10	82187	82196	20 %	0 %	40 %	40 %	326314891
88	NC_015138	GCCGC	2	10	83438	83447	0 %	0 %	40 %	60 %	326314891
89	NC_015138	CGCGG	2	10	83960	83969	0 %	0 %	60 %	40 %	326314892
90	NC_015138	CGGCG	2	10	84581	84590	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
91	NC_015138	CGCGG	2	10	87074	87083	0 %	0 %	60 %	40 %	326314894
92	NC_015138	TGCGC	2	10	87305	87314	0 %	20 %	40 %	40 %	326314894
93	NC_015138	GCCGT	2	10	88229	88238	0 %	20 %	40 %	40 %	326314895
94	NC_015138	GAACG	2	10	90295	90304	40 %	0 %	40 %	20 %	326314897
95	NC_015138	GGCCC	2	10	90381	90390	0 %	0 %	40 %	60 %	326314897
96	NC_015138	GGGGC	2	10	91805	91814	0 %	0 %	80 %	20 %	326314898
97	NC_015138	CGGCA	2	10	92185	92194	20 %	0 %	40 %	40 %	326314899
98	NC_015138	TGCGT	2	10	95446	95455	0 %	40 %	40 %	20 %	326314902
99	NC_015138	CGCGC	3	15	96424	96438	0 %	0 %	40 %	60 %	326314903
100	NC_015138	CGCGG	2	10	97029	97038	0 %	0 %	60 %	40 %	326314903
101	NC_015138	CCAGG	2	10	97101	97110	20 %	0 %	40 %	40 %	326314903
102	NC_015138	GCCGC	2	10	98008	98017	0 %	0 %	40 %	60 %	326314904
103	NC_015138	GCGGA	2	10	98445	98454	20 %	0 %	60 %	20 %	326314905
104	NC_015138	GCCCG	2	10	98880	98889	0 %	0 %	40 %	60 %	326314905
105	NC_015138	CCGGG	2	10	99019	99028	0 %	0 %	60 %	40 %	326314905
106	NC_015138	CGGCC	2	10	99182	99191	0 %	0 %	40 %	60 %	326314905
107	NC_015138	CCATG	2	10	99601	99610	20 %	20 %	20 %	40 %	326314905
108	NC_015138	ACGCC	2	10	99981	99990	20 %	0 %	20 %	60 %	326314906
109	NC_015138	GCTGC	2	10	100630	100639	0 %	20 %	40 %	40 %	326314906
110	NC_015138	CCTGG	2	10	101417	101426	0 %	20 %	40 %	40 %	326314907
111	NC_015138	CGCTG	2	10	101848	101857	0 %	20 %	40 %	40 %	326314907
112	NC_015138	CGGGC	2	10	103316	103325	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
113	NC_015138	CGGCG	2	10	104476	104485	0 %	0 %	60 %	40 %	326314909
114	NC_015138	GTGCG	2	10	105164	105173	0 %	20 %	60 %	20 %	326314909
115	NC_015138	CAGGC	2	10	105547	105556	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
116	NC_015138	GCCGC	2	10	105635	105644	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
117	NC_015138	CTCAC	2	10	107060	107069	20 %	20 %	0 %	60 %	326314911
118	NC_015138	GGCCA	2	10	107835	107844	20 %	0 %	40 %	40 %	326314912
119	NC_015138	CGGCC	2	10	108864	108873	0 %	0 %	40 %	60 %	326314913
120	NC_015138	GCGCC	2	10	110097	110106	0 %	0 %	40 %	60 %	326314914
121	NC_015138	CGCTG	2	10	112935	112944	0 %	20 %	40 %	40 %	326314917
122	NC_015138	CGGCC	2	10	114765	114774	0 %	0 %	40 %	60 %	326314919
123	NC_015138	CCGGC	2	10	115582	115591	0 %	0 %	40 %	60 %	326314921
124	NC_015138	CGGCC	2	10	116189	116198	0 %	0 %	40 %	60 %	326314921
125	NC_015138	GGGCG	2	10	116667	116676	0 %	0 %	80 %	20 %	326314922
126	NC_015138	GCGCC	2	10	116787	116796	0 %	0 %	40 %	60 %	326314922
127	NC_015138	GCCCG	2	10	117616	117625	0 %	0 %	40 %	60 %	326314923
128	NC_015138	CGGCG	2	10	118351	118360	0 %	0 %	60 %	40 %	326314925
129	NC_015138	GCGGT	2	10	120467	120476	0 %	20 %	60 %	20 %	326314928
130	NC_015138	CACGC	2	10	120623	120632	20 %	0 %	20 %	60 %	326314929
131	NC_015138	CTGGG	2	10	121052	121061	0 %	20 %	60 %	20 %	326314929
132	NC_015138	CTGCG	2	10	122346	122355	0 %	20 %	40 %	40 %	326314930
133	NC_015138	GCGCC	2	10	122716	122725	0 %	0 %	40 %	60 %	326314930
134	NC_015138	GGCAG	2	10	125139	125148	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
135	NC_015138	TAGAA	2	10	128942	128951	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015138	TTGCA	2	10	128959	128968	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_015138	CAACA	2	10	129337	129346	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_015138	CCAAG	2	10	129665	129674	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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261	NC_015138	CCTGC	2	10	231371	231380	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
262	NC_015138	CCGTG	2	10	235312	235321	0 %	20 %	40 %	40 %	326315036
263	NC_015138	GGCCC	2	10	236204	236213	0 %	0 %	40 %	60 %	326315037
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269	NC_015138	GTCGC	2	10	243730	243739	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
270	NC_015138	GCCTG	2	10	244161	244170	0 %	20 %	40 %	40 %	326315044
271	NC_015138	GGCCT	2	10	244221	244230	0 %	20 %	40 %	40 %	326315044
272	NC_015138	CGGCC	2	10	244383	244392	0 %	0 %	40 %	60 %	326315044
273	NC_015138	GGGCA	2	10	244414	244423	20 %	0 %	60 %	20 %	326315044
274	NC_015138	TGCCT	2	10	247564	247573	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
275	NC_015138	GCCGC	2	10	249067	249076	0 %	0 %	40 %	60 %	326315048
276	NC_015138	GGCGC	2	10	251673	251682	0 %	0 %	60 %	40 %	326315049
277	NC_015138	TGGAA	2	10	253853	253862	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
278	NC_015138	ACCAC	2	10	254022	254031	40 %	0 %	0 %	60 %	326315052
279	NC_015138	GCGCA	2	10	258401	258410	20 %	0 %	40 %	40 %	326315055
280	NC_015138	GCCCG	2	10	259105	259114	0 %	0 %	40 %	60 %	326315055
281	NC_015138	CGCGC	2	10	259582	259591	0 %	0 %	40 %	60 %	326315055
282	NC_015138	GCCCA	2	10	260253	260262	20 %	0 %	20 %	60 %	326315056
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284	NC_015138	CCCGG	2	10	264871	264880	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
285	NC_015138	AGCCC	2	10	266558	266567	20 %	0 %	20 %	60 %	326315061
286	NC_015138	TGCGC	2	10	266990	266999	0 %	20 %	40 %	40 %	326315062
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288	NC_015138	CCGAG	2	10	267450	267459	20 %	0 %	40 %	40 %	326315063
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291	NC_015138	CGGTG	2	10	269877	269886	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
292	NC_015138	CGTTC	2	10	271423	271432	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
293	NC_015138	CGGCC	2	10	271877	271886	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
294	NC_015138	ACCAC	2	10	273316	273325	40 %	0 %	0 %	60 %	326315068
295	NC_015138	GCGAT	2	10	274188	274197	20 %	20 %	40 %	20 %	326315069
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297	NC_015138	GGCGG	2	10	274756	274765	0 %	0 %	80 %	20 %	326315069
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301	NC_015138	GCACC	2	10	277328	277337	20 %	0 %	20 %	60 %	326315071
302	NC_015138	AGGGT	2	10	277712	277721	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
303	NC_015138	CGCAG	2	10	277908	277917	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
304	NC_015138	GATGG	2	10	278227	278236	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
305	NC_015138	CTTGG	2	10	278291	278300	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
306	NC_015138	GCCGT	2	10	278531	278540	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
307	NC_015138	CTGGA	2	10	278951	278960	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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320	NC_015138	CCACG	2	10	292405	292414	20 %	0 %	20 %	60 %	326315083
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323	NC_015138	GCTGG	2	10	295895	295904	0 %	20 %	60 %	20 %	326315085
324	NC_015138	AGTTC	2	10	301186	301195	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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326	NC_015138	GCTGG	2	10	310797	310806	0 %	20 %	60 %	20 %	326315093
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339	NC_015138	GGCCT	2	10	327663	327672	0 %	20 %	40 %	40 %	326315107
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341	NC_015138	GGCCT	2	10	329201	329210	0 %	20 %	40 %	40 %	326315108
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350	NC_015138	TGGGC	2	10	336156	336165	0 %	20 %	60 %	20 %	326315116
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379	NC_015138	GGGCT	2	10	370689	370698	0 %	20 %	60 %	20 %	326315148
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381	NC_015138	ATGGC	2	10	371187	371196	20 %	20 %	40 %	20 %	326315148
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383	NC_015138	GCGCG	2	10	373993	374002	0 %	0 %	60 %	40 %	326315151
384	NC_015138	GCCGA	2	10	374258	374267	20 %	0 %	40 %	40 %	326315151
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393	NC_015138	GGCTT	2	10	379134	379143	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
394	NC_015138	GGTGG	2	10	384294	384303	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
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397	NC_015138	TGGCC	2	10	388946	388955	0 %	20 %	40 %	40 %	326315167
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399	NC_015138	GCATG	2	10	390961	390970	20 %	20 %	40 %	20 %	326315168
400	NC_015138	CGGCG	2	10	391711	391720	0 %	0 %	60 %	40 %	326315169
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402	NC_015138	GTGGC	2	10	396386	396395	0 %	20 %	60 %	20 %	326315173
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