MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 5283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_015138	CGGCG	2	10	1609919	1609928	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1502	NC_015138	CGCGG	2	10	1610840	1610849	0 %	0 %	60 %	40 %	326316269
1503	NC_015138	TGCAC	2	10	1614345	1614354	20 %	20 %	20 %	40 %	326316273
1504	NC_015138	GTCCA	2	10	1615380	1615389	20 %	20 %	20 %	40 %	326316274
1505	NC_015138	GGGCT	2	10	1616180	1616189	0 %	20 %	60 %	20 %	326316275
1506	NC_015138	GCCGG	2	10	1616888	1616897	0 %	0 %	60 %	40 %	326316275
1507	NC_015138	GCCGC	2	10	1617026	1617035	0 %	0 %	40 %	60 %	326316275
1508	NC_015138	CCGAT	2	10	1617048	1617057	20 %	20 %	20 %	40 %	326316275
1509	NC_015138	GCCCG	2	10	1618990	1618999	0 %	0 %	40 %	60 %	326316278
1510	NC_015138	AGGGC	2	10	1623193	1623202	20 %	0 %	60 %	20 %	326316281
1511	NC_015138	GCAAG	2	10	1623931	1623940	40 %	0 %	40 %	20 %	326316282
1512	NC_015138	GCGAC	2	10	1624919	1624928	20 %	0 %	40 %	40 %	326316283
1513	NC_015138	TCCGC	2	10	1628749	1628758	0 %	20 %	20 %	60 %	326316287
1514	NC_015138	GAAGT	2	10	1634266	1634275	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_015138	TCGTG	2	10	1635392	1635401	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_015138	GGGAG	2	10	1636960	1636969	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_015138	ACCAA	2	10	1637362	1637371	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1518	NC_015138	CTCAT	2	10	1638959	1638968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1519	NC_015138	GGCCG	2	10	1641822	1641831	0 %	0 %	60 %	40 %	326316294
1520	NC_015138	AGCGC	2	10	1643665	1643674	20 %	0 %	40 %	40 %	326316296
1521	NC_015138	TGGCC	2	10	1644725	1644734	0 %	20 %	40 %	40 %	326316297
1522	NC_015138	TGTGG	2	10	1645930	1645939	0 %	40 %	60 %	0 %	326316298
1523	NC_015138	GTCGC	2	10	1647475	1647484	0 %	20 %	40 %	40 %	326316300
1524	NC_015138	GCAGA	2	10	1647650	1647659	40 %	0 %	40 %	20 %	326316300
1525	NC_015138	CGGCA	2	10	1648607	1648616	20 %	0 %	40 %	40 %	326316301
1526	NC_015138	CTGCG	2	10	1653637	1653646	0 %	20 %	40 %	40 %	326316306
1527	NC_015138	GCCGG	2	10	1654318	1654327	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1528	NC_015138	CCTTC	2	10	1654363	1654372	0 %	40 %	0 %	60 %	326316307
1529	NC_015138	CGATG	2	10	1654760	1654769	20 %	20 %	40 %	20 %	326316307
1530	NC_015138	GGCGG	2	10	1656193	1656202	0 %	0 %	80 %	20 %	326316308
1531	NC_015138	CAGGC	2	10	1656707	1656716	20 %	0 %	40 %	40 %	326316309
1532	NC_015138	CTGGA	2	10	1657876	1657885	20 %	20 %	40 %	20 %	326316310
1533	NC_015138	CCCGG	2	10	1658075	1658084	0 %	0 %	40 %	60 %	326316310
1534	NC_015138	CGGGG	2	10	1658589	1658598	0 %	0 %	80 %	20 %	326316311
1535	NC_015138	TGGCC	2	10	1665131	1665140	0 %	20 %	40 %	40 %	326316315
1536	NC_015138	CGGCG	2	10	1668802	1668811	0 %	0 %	60 %	40 %	326316317
1537	NC_015138	CTGGC	2	10	1670963	1670972	0 %	20 %	40 %	40 %	326316318
1538	NC_015138	CGGCT	2	10	1671074	1671083	0 %	20 %	40 %	40 %	326316318
1539	NC_015138	GCTGG	2	10	1671661	1671670	0 %	20 %	60 %	20 %	326316318
1540	NC_015138	TTCCC	2	10	1672192	1672201	0 %	40 %	0 %	60 %	326316319
1541	NC_015138	CGGAC	2	10	1672275	1672284	20 %	0 %	40 %	40 %	326316319
1542	NC_015138	GCGAT	2	10	1672380	1672389	20 %	20 %	40 %	20 %	326316319
1543	NC_015138	GGGTG	2	10	1672617	1672626	0 %	20 %	80 %	0 %	326316319
1544	NC_015138	GTCCT	2	10	1672707	1672716	0 %	40 %	20 %	40 %	326316319
1545	NC_015138	GGGCA	2	10	1673482	1673491	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_015138	GGCAG	2	10	1674787	1674796	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1547	NC_015138	ACGGC	2	10	1675176	1675185	20 %	0 %	40 %	40 %	326316322
1548	NC_015138	TGCCG	2	10	1676014	1676023	0 %	20 %	40 %	40 %	326316322
1549	NC_015138	CGCGG	2	10	1676479	1676488	0 %	0 %	60 %	40 %	326316322
1550	NC_015138	TCGCC	2	10	1678110	1678119	0 %	20 %	20 %	60 %	326316324
1551	NC_015138	GTGCC	2	10	1679049	1679058	0 %	20 %	40 %	40 %	326316324
1552	NC_015138	CGGCG	2	10	1679723	1679732	0 %	0 %	60 %	40 %	326316324
1553	NC_015138	GGCCT	2	10	1680055	1680064	0 %	20 %	40 %	40 %	326316325
1554	NC_015138	CGCTG	2	10	1681527	1681536	0 %	20 %	40 %	40 %	326316327
1555	NC_015138	GCACG	2	10	1683697	1683706	20 %	0 %	40 %	40 %	326316328
1556	NC_015138	TCTTT	2	10	1683994	1684003	0 %	80 %	0 %	20 %	326316329
1557	NC_015138	GGCGC	2	10	1685021	1685030	0 %	0 %	60 %	40 %	326316329
1558	NC_015138	GCAGC	2	10	1686257	1686266	20 %	0 %	40 %	40 %	326316329
1559	NC_015138	CCGTG	2	10	1686452	1686461	0 %	20 %	40 %	40 %	326316329
1560	NC_015138	GGCGA	2	10	1688144	1688153	20 %	0 %	60 %	20 %	326316330
1561	NC_015138	GACCT	2	10	1688411	1688420	20 %	20 %	20 %	40 %	326316331
1562	NC_015138	GTGGC	2	10	1691674	1691683	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1563	NC_015138	GCAGG	2	10	1692563	1692572	20 %	0 %	60 %	20 %	326316335
1564	NC_015138	CTGGA	2	10	1692837	1692846	20 %	20 %	40 %	20 %	326316335
1565	NC_015138	GAGCT	2	10	1693183	1693192	20 %	20 %	40 %	20 %	326316336
1566	NC_015138	CCGGA	2	10	1694176	1694185	20 %	0 %	40 %	40 %	326316336
1567	NC_015138	CGTGG	2	10	1694827	1694836	0 %	20 %	60 %	20 %	326316336
1568	NC_015138	GGCGA	2	10	1696780	1696789	20 %	0 %	60 %	20 %	326316338
1569	NC_015138	GATGC	2	10	1698706	1698715	20 %	20 %	40 %	20 %	326316338
1570	NC_015138	TGGGC	2	10	1703968	1703977	0 %	20 %	60 %	20 %	326316342
1571	NC_015138	GCAGA	2	10	1704039	1704048	40 %	0 %	40 %	20 %	326316342
1572	NC_015138	GCCGT	2	10	1704333	1704342	0 %	20 %	40 %	40 %	326316342
1573	NC_015138	CTGGC	2	10	1704578	1704587	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1574	NC_015138	GGTGC	2	10	1704924	1704933	0 %	20 %	60 %	20 %	326316343
1575	NC_015138	GGCCG	2	10	1705554	1705563	0 %	0 %	60 %	40 %	326316344
1576	NC_015138	CGCGC	2	10	1707095	1707104	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1577	NC_015138	GGCCG	2	10	1707153	1707162	0 %	0 %	60 %	40 %	326316345
1578	NC_015138	GGCCG	2	10	1708203	1708212	0 %	0 %	60 %	40 %	326316345
1579	NC_015138	GCCGT	2	10	1711356	1711365	0 %	20 %	40 %	40 %	326316347
1580	NC_015138	GGCGG	3	15	1712142	1712156	0 %	0 %	80 %	20 %	326316347
1581	NC_015138	CGCGG	2	10	1713161	1713170	0 %	0 %	60 %	40 %	326316349
1582	NC_015138	GGCGT	2	10	1713537	1713546	0 %	20 %	60 %	20 %	326316349
1583	NC_015138	GCGCC	2	10	1713893	1713902	0 %	0 %	40 %	60 %	326316349
1584	NC_015138	GCAGC	2	10	1714309	1714318	20 %	0 %	40 %	40 %	326316349
1585	NC_015138	CGGGG	2	10	1715877	1715886	0 %	0 %	80 %	20 %	326316351
1586	NC_015138	TGCCA	2	10	1716592	1716601	20 %	20 %	20 %	40 %	326316351
1587	NC_015138	GGGTG	2	10	1717217	1717226	0 %	20 %	80 %	0 %	326316352
1588	NC_015138	CTGCA	2	10	1718811	1718820	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1589	NC_015138	GCGAG	2	10	1719490	1719499	20 %	0 %	60 %	20 %	326316353
1590	NC_015138	CAGGG	2	10	1719506	1719515	20 %	0 %	60 %	20 %	326316353
1591	NC_015138	TGGAC	2	10	1720716	1720725	20 %	20 %	40 %	20 %	326316355
1592	NC_015138	GGCGA	2	10	1721537	1721546	20 %	0 %	60 %	20 %	326316355
1593	NC_015138	GGCGA	2	10	1721741	1721750	20 %	0 %	60 %	20 %	326316355
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1595	NC_015138	GCGCG	2	10	1727766	1727775	0 %	0 %	60 %	40 %	326316363
1596	NC_015138	TGCGC	2	10	1728113	1728122	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1597	NC_015138	GCCGC	2	10	1728559	1728568	0 %	0 %	40 %	60 %	326316364
1598	NC_015138	GCGCC	2	10	1729429	1729438	0 %	0 %	40 %	60 %	326316365
1599	NC_015138	GGCGA	2	10	1734013	1734022	20 %	0 %	60 %	20 %	326316368
1600	NC_015138	CGCAG	2	10	1734233	1734242	20 %	0 %	40 %	40 %	326316369
1601	NC_015138	CGCGG	2	10	1734482	1734491	0 %	0 %	60 %	40 %	326316369
1602	NC_015138	GCCCG	2	10	1734515	1734524	0 %	0 %	40 %	60 %	326316369
1603	NC_015138	CAGCG	2	10	1735829	1735838	20 %	0 %	40 %	40 %	326316370
1604	NC_015138	CGATC	2	10	1735993	1736002	20 %	20 %	20 %	40 %	326316370
1605	NC_015138	AAGGC	2	10	1737730	1737739	40 %	0 %	40 %	20 %	326316371
1606	NC_015138	GCGAC	2	10	1737808	1737817	20 %	0 %	40 %	40 %	326316371
1607	NC_015138	GGCGG	2	10	1738179	1738188	0 %	0 %	80 %	20 %	326316372
1608	NC_015138	GCAGG	2	10	1739872	1739881	20 %	0 %	60 %	20 %	326316374
1609	NC_015138	GGCCT	2	10	1740702	1740711	0 %	20 %	40 %	40 %	326316375
1610	NC_015138	GCGTG	2	10	1740773	1740782	0 %	20 %	60 %	20 %	326316375
1611	NC_015138	GGCAG	2	10	1743393	1743402	20 %	0 %	60 %	20 %	326316377
1612	NC_015138	GGGCC	2	10	1743462	1743471	0 %	0 %	60 %	40 %	326316377
1613	NC_015138	GGCCG	2	10	1743850	1743859	0 %	0 %	60 %	40 %	326316377
1614	NC_015138	CCTGG	2	10	1743969	1743978	0 %	20 %	40 %	40 %	326316377
1615	NC_015138	CCTGG	2	10	1746558	1746567	0 %	20 %	40 %	40 %	326316381
1616	NC_015138	GCTGG	2	10	1746937	1746946	0 %	20 %	60 %	20 %	326316382
1617	NC_015138	AAATG	2	10	1746967	1746976	60 %	20 %	20 %	0 %	326316382
1618	NC_015138	CATGG	2	10	1747364	1747373	20 %	20 %	40 %	20 %	326316382
1619	NC_015138	CACGA	2	10	1747678	1747687	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1620	NC_015138	CGTCG	2	10	1748992	1749001	0 %	20 %	40 %	40 %	326316383
1621	NC_015138	GCGCA	2	10	1749021	1749030	20 %	0 %	40 %	40 %	326316383
1622	NC_015138	CTGGC	2	10	1749555	1749564	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1623	NC_015138	GGGCG	2	10	1749918	1749927	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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1981	NC_015138	CCCAA	2	10	2117763	2117772	40 %	0 %	0 %	60 %	326316717
1982	NC_015138	AATTT	2	10	2118209	2118218	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1983	NC_015138	GTGCA	2	10	2119283	2119292	20 %	20 %	40 %	20 %	326316718
1984	NC_015138	GTTGG	2	10	2120559	2120568	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1985	NC_015138	TTCCA	2	10	2121077	2121086	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1986	NC_015138	CTGTG	2	10	2121589	2121598	0 %	40 %	40 %	20 %	326316719
1987	NC_015138	TCCGG	2	10	2124502	2124511	0 %	20 %	40 %	40 %	326316722
1988	NC_015138	CGCTG	2	10	2126475	2126484	0 %	20 %	40 %	40 %	326316723
1989	NC_015138	GATGG	2	10	2126681	2126690	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
1990	NC_015138	AAGCG	2	10	2127435	2127444	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1991	NC_015138	CGCTG	2	10	2129177	2129186	0 %	20 %	40 %	40 %	326316725
1992	NC_015138	GGCGT	2	10	2129624	2129633	0 %	20 %	60 %	20 %	326316726
1993	NC_015138	CCGGG	2	10	2131790	2131799	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1994	NC_015138	CGGCG	2	10	2134762	2134771	0 %	0 %	60 %	40 %	326316730
1995	NC_015138	CGGAC	2	10	2135780	2135789	20 %	0 %	40 %	40 %	326316731
1996	NC_015138	GCCTG	2	10	2137129	2137138	0 %	20 %	40 %	40 %	326316733
1997	NC_015138	CCCCG	2	10	2138083	2138092	0 %	0 %	20 %	80 %	326316734
1998	NC_015138	CCTGG	2	10	2139879	2139888	0 %	20 %	40 %	40 %	326316735
1999	NC_015138	AGGGC	2	10	2141443	2141452	20 %	0 %	60 %	20 %	326316736
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