MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 chromosome

Total Repeats: 5283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015138	AGTGC	2	10	508928	508937	20 %	20 %	40 %	20 %	326315287
502	NC_015138	GGCCG	2	10	509379	509388	0 %	0 %	60 %	40 %	326315287
503	NC_015138	CCGGG	2	10	510383	510392	0 %	0 %	60 %	40 %	326315287
504	NC_015138	TGGTG	2	10	510605	510614	0 %	40 %	60 %	0 %	326315287
505	NC_015138	CGGCA	2	10	511448	511457	20 %	0 %	40 %	40 %	326315288
506	NC_015138	GCGCC	2	10	511849	511858	0 %	0 %	40 %	60 %	326315288
507	NC_015138	TGCTG	2	10	512902	512911	0 %	40 %	40 %	20 %	326315290
508	NC_015138	CCTGC	2	10	514897	514906	0 %	20 %	20 %	60 %	326315290
509	NC_015138	GGGCG	2	10	515322	515331	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
510	NC_015138	CATGC	2	10	515842	515851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
511	NC_015138	CAGGC	2	10	515918	515927	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
512	NC_015138	GCGAT	2	10	516963	516972	20 %	20 %	40 %	20 %	326315293
513	NC_015138	TGGCC	2	10	518302	518311	0 %	20 %	40 %	40 %	326315293
514	NC_015138	GCTGG	2	10	518850	518859	0 %	20 %	60 %	20 %	326315294
515	NC_015138	TTTCC	2	10	519795	519804	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
516	NC_015138	CTGCG	2	10	520467	520476	0 %	20 %	40 %	40 %	326315296
517	NC_015138	GCGCT	2	10	521835	521844	0 %	20 %	40 %	40 %	326315298
518	NC_015138	CCAGG	2	10	522984	522993	20 %	0 %	40 %	40 %	326315299
519	NC_015138	TGCTC	2	10	523744	523753	0 %	40 %	20 %	40 %	326315300
520	NC_015138	GCCGT	2	10	525033	525042	0 %	20 %	40 %	40 %	326315300
521	NC_015138	TGCCC	2	10	526785	526794	0 %	20 %	20 %	60 %	326315301
522	NC_015138	TGCGC	2	10	528258	528267	0 %	20 %	40 %	40 %	326315302
523	NC_015138	CCGGC	2	10	528432	528441	0 %	0 %	40 %	60 %	326315302
524	NC_015138	TCGCG	2	10	528679	528688	0 %	20 %	40 %	40 %	326315302
525	NC_015138	CGCGC	2	10	529126	529135	0 %	0 %	40 %	60 %	326315303
526	NC_015138	AGGCG	2	10	531486	531495	20 %	0 %	60 %	20 %	326315305
527	NC_015138	CGCGC	2	10	532619	532628	0 %	0 %	40 %	60 %	326315306
528	NC_015138	GCGCG	2	10	532857	532866	0 %	0 %	60 %	40 %	326315306
529	NC_015138	GCCGC	2	10	532984	532993	0 %	0 %	40 %	60 %	326315306
530	NC_015138	CGGTG	2	10	533573	533582	0 %	20 %	60 %	20 %	326315307
531	NC_015138	GGCTG	2	10	533782	533791	0 %	20 %	60 %	20 %	326315307
532	NC_015138	GCGCT	2	10	535318	535327	0 %	20 %	40 %	40 %	326315308
533	NC_015138	TGCGC	2	10	538720	538729	0 %	20 %	40 %	40 %	326315311
534	NC_015138	GGCCT	2	10	540893	540902	0 %	20 %	40 %	40 %	326315313
535	NC_015138	GGGCG	2	10	541321	541330	0 %	0 %	80 %	20 %	326315313
536	NC_015138	CGCCT	2	10	545540	545549	0 %	20 %	20 %	60 %	326315316
537	NC_015138	CGTGG	2	10	547852	547861	0 %	20 %	60 %	20 %	326315318
538	NC_015138	GTGCA	2	10	551035	551044	20 %	20 %	40 %	20 %	326315320
539	NC_015138	GCGCG	2	10	551937	551946	0 %	0 %	60 %	40 %	326315320
540	NC_015138	CAGGC	2	10	552109	552118	20 %	0 %	40 %	40 %	326315320
541	NC_015138	CCGGC	2	10	553448	553457	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
542	NC_015138	GCGCC	2	10	554521	554530	0 %	0 %	40 %	60 %	326315324
543	NC_015138	GCCGC	2	10	554997	555006	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
544	NC_015138	GTCGA	2	10	555324	555333	20 %	20 %	40 %	20 %	326315325
545	NC_015138	ACGCC	2	10	555514	555523	20 %	0 %	20 %	60 %	326315325
546	NC_015138	CGGCC	2	10	556289	556298	0 %	0 %	40 %	60 %	326315326
547	NC_015138	TGGAA	2	10	557364	557373	40 %	20 %	40 %	0 %	326315326
548	NC_015138	CGGGC	2	10	557817	557826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
549	NC_015138	GCGGG	2	10	558867	558876	0 %	0 %	80 %	20 %	326315328
550	NC_015138	TCGCG	2	10	559101	559110	0 %	20 %	40 %	40 %	326315328
551	NC_015138	TGCGG	2	10	563345	563354	0 %	20 %	60 %	20 %	326315334
552	NC_015138	ATGCG	2	10	564326	564335	20 %	20 %	40 %	20 %	326315335
553	NC_015138	GTCCG	2	10	564672	564681	0 %	20 %	40 %	40 %	326315335
554	NC_015138	GAACG	2	10	566141	566150	40 %	0 %	40 %	20 %	326315336
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556	NC_015138	AGCGC	2	10	567339	567348	20 %	0 %	40 %	40 %	326315337
557	NC_015138	CGTGC	2	10	567949	567958	0 %	20 %	40 %	40 %	326315337
558	NC_015138	CGTGG	2	10	569128	569137	0 %	20 %	60 %	20 %	326315339
559	NC_015138	GGCCC	2	10	571869	571878	0 %	0 %	40 %	60 %	326315340
560	NC_015138	ATCGC	2	10	576013	576022	20 %	20 %	20 %	40 %	326315344
561	NC_015138	GCCCC	2	10	576066	576075	0 %	0 %	20 %	80 %	326315344
562	NC_015138	CGGCC	2	10	576641	576650	0 %	0 %	40 %	60 %	326315345
563	NC_015138	TGCCG	2	10	577290	577299	0 %	20 %	40 %	40 %	326315346
564	NC_015138	GTACG	2	10	577836	577845	20 %	20 %	40 %	20 %	326315346
565	NC_015138	ATGCC	2	10	578806	578815	20 %	20 %	20 %	40 %	326315347
566	NC_015138	CCTTC	2	10	579058	579067	0 %	40 %	0 %	60 %	326315347
567	NC_015138	CGGGG	2	10	579181	579190	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
568	NC_015138	GCGCG	2	10	580803	580812	0 %	0 %	60 %	40 %	326315349
569	NC_015138	TGCCT	2	10	581192	581201	0 %	40 %	20 %	40 %	326315349
570	NC_015138	CATGG	2	10	582899	582908	20 %	20 %	40 %	20 %	326315352
571	NC_015138	GCTGG	2	10	583157	583166	0 %	20 %	60 %	20 %	326315352
572	NC_015138	GCGCC	2	10	584270	584279	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
573	NC_015138	GGCCC	2	10	584954	584963	0 %	0 %	40 %	60 %	326315358
574	NC_015138	CAGGC	2	10	585967	585976	20 %	0 %	40 %	40 %	326315360
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577	NC_015138	GCCGC	2	10	590011	590020	0 %	0 %	40 %	60 %	326315362
578	NC_015138	CCGCG	2	10	590379	590388	0 %	0 %	40 %	60 %	326315362
579	NC_015138	GCGCG	2	10	590883	590892	0 %	0 %	60 %	40 %	326315363
580	NC_015138	GCCGT	2	10	591799	591808	0 %	20 %	40 %	40 %	326315364
581	NC_015138	GCCGG	2	10	592098	592107	0 %	0 %	60 %	40 %	326315364
582	NC_015138	GCCAG	2	10	592411	592420	20 %	0 %	40 %	40 %	326315365
583	NC_015138	TGGGA	2	10	593110	593119	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_015138	TTCCC	2	10	594826	594835	0 %	40 %	0 %	60 %	326315367
586	NC_015138	TTCCC	2	10	595088	595097	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
587	NC_015138	GCGCC	2	10	595201	595210	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
588	NC_015138	GCCCG	2	10	595445	595454	0 %	0 %	40 %	60 %	326315368
589	NC_015138	CGGCC	2	10	597059	597068	0 %	0 %	40 %	60 %	326315370
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591	NC_015138	CCGCC	2	10	599154	599163	0 %	0 %	20 %	80 %	326315374
592	NC_015138	GCTGC	2	10	599941	599950	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
593	NC_015138	CGCGC	2	10	600189	600198	0 %	0 %	40 %	60 %	326315375
594	NC_015138	GCACG	2	10	601230	601239	20 %	0 %	40 %	40 %	326315375
595	NC_015138	CCCAT	2	10	601381	601390	20 %	20 %	0 %	60 %	326315375
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598	NC_015138	CGTGG	2	10	603783	603792	0 %	20 %	60 %	20 %	326315376
599	NC_015138	GCGCC	2	10	603992	604001	0 %	0 %	40 %	60 %	326315377
600	NC_015138	GCGCT	2	10	604998	605007	0 %	20 %	40 %	40 %	326315377
601	NC_015138	TGCGG	2	10	608288	608297	0 %	20 %	60 %	20 %	326315381
602	NC_015138	TTGCC	2	10	609986	609995	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
603	NC_015138	GCCGT	2	10	610439	610448	0 %	20 %	40 %	40 %	326315383
604	NC_015138	GCTGC	2	10	610783	610792	0 %	20 %	40 %	40 %	326315383
605	NC_015138	AGCGC	2	10	612375	612384	20 %	0 %	40 %	40 %	326315384
606	NC_015138	CCTGG	2	10	613096	613105	0 %	20 %	40 %	40 %	326315384
607	NC_015138	GCACC	3	15	613890	613904	20 %	0 %	20 %	60 %	326315386
608	NC_015138	TGGCA	2	10	614646	614655	20 %	20 %	40 %	20 %	326315386
609	NC_015138	GCACC	2	10	614671	614680	20 %	0 %	20 %	60 %	326315386
610	NC_015138	CGCTG	2	10	614760	614769	0 %	20 %	40 %	40 %	326315386
611	NC_015138	CCGGC	2	10	614772	614781	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
612	NC_015138	CCGCA	2	10	618800	618809	20 %	0 %	20 %	60 %	326315391
613	NC_015138	GGCCC	2	10	619408	619417	0 %	0 %	40 %	60 %	326315391
614	NC_015138	AGGGA	2	10	620391	620400	40 %	0 %	60 %	0 %	326315392
615	NC_015138	CCCGG	2	10	622162	622171	0 %	0 %	40 %	60 %	326315393
616	NC_015138	GCCGT	2	10	623109	623118	0 %	20 %	40 %	40 %	326315394
617	NC_015138	CCATG	2	10	628584	628593	20 %	20 %	20 %	40 %	326315399
618	NC_015138	AGGCC	2	10	630499	630508	20 %	0 %	40 %	40 %	326315402
619	NC_015138	GAAGT	2	10	631277	631286	40 %	20 %	40 %	0 %	326315404
620	NC_015138	GCCTG	2	10	633623	633632	0 %	20 %	40 %	40 %	326315409
621	NC_015138	CGCAG	2	10	635668	635677	20 %	0 %	40 %	40 %	326315413
622	NC_015138	CGCGG	2	10	641226	641235	0 %	0 %	60 %	40 %	326315419
623	NC_015138	GCGGT	2	10	643684	643693	0 %	20 %	60 %	20 %	326315422
624	NC_015138	GGCGC	2	10	643769	643778	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
625	NC_015138	CCGCG	2	10	646446	646455	0 %	0 %	40 %	60 %	326315425
626	NC_015138	CGGGC	2	10	646828	646837	0 %	0 %	60 %	40 %	326315426
627	NC_015138	CCGTG	2	10	648013	648022	0 %	20 %	40 %	40 %	326315427
628	NC_015138	TTTTG	2	10	651971	651980	0 %	80 %	20 %	0 %	326315430
629	NC_015138	GCGTG	2	10	652020	652029	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
630	NC_015138	AAGGG	2	10	652675	652684	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
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