MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_011982	CAT	2	6	140178	140183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2002	NC_011982	TGT	2	6	140197	140202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_011982	CGA	2	6	140257	140262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2004	NC_011982	CGA	2	6	140455	140460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2005	NC_011982	GTC	2	6	140510	140515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2006	NC_011982	ACC	2	6	140531	140536	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2007	NC_011982	CAC	2	6	140596	140601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2008	NC_011982	AGC	2	6	140784	140789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2009	NC_011982	AGC	2	6	140820	140825	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2010	NC_011982	CGC	2	6	140869	140874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2011	NC_011982	CTT	2	6	140944	140949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2012	NC_011982	CGC	2	6	141050	141055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2013	NC_011982	CCT	2	6	141090	141095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2014	NC_011982	GGT	2	6	141114	141119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2015	NC_011982	CCG	2	6	141167	141172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2016	NC_011982	CCG	2	6	141245	141250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2017	NC_011982	ATG	2	6	141348	141353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_011982	CCG	2	6	141387	141392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2019	NC_011982	TGA	3	9	141485	141493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2020	NC_011982	AAG	2	6	141500	141505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2021	NC_011982	TTC	2	6	141615	141620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2022	NC_011982	CGT	2	6	141718	141723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2023	NC_011982	CAG	2	6	141744	141749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2024	NC_011982	ATC	2	6	141767	141772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080227
2025	NC_011982	GGC	2	6	141773	141778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080227
2026	NC_011982	TTG	2	6	141801	141806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080227
2027	NC_011982	AGC	2	6	141851	141856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2028	NC_011982	TGC	2	6	141895	141900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2029	NC_011982	CGA	2	6	141978	141983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2030	NC_011982	CGC	2	6	142065	142070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080227
2031	NC_011982	ACG	2	6	142131	142136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2032	NC_011982	ATT	2	6	142156	142161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080227
2033	NC_011982	TCA	2	6	142459	142464	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080227
2034	NC_011982	CTT	2	6	142557	142562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080227
2035	NC_011982	GAT	2	6	142580	142585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080227
2036	NC_011982	GGC	2	6	142653	142658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080227
2037	NC_011982	ACG	2	6	142708	142713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2038	NC_011982	GTC	2	6	142728	142733	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080227
2039	NC_011982	TTG	2	6	142737	142742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080227
2040	NC_011982	AGA	2	6	142757	142762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080227
2041	NC_011982	ACC	2	6	142788	142793	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080227
2042	NC_011982	GAT	2	6	142939	142944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080227
2043	NC_011982	CAG	2	6	142967	142972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2044	NC_011982	TCG	2	6	143021	143026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2045	NC_011982	CGG	2	6	143064	143069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
2046	NC_011982	TCA	2	6	143141	143146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080228
2047	NC_011982	TAA	2	6	143194	143199	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080228
2048	NC_011982	TCG	2	6	143238	143243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2049	NC_011982	CGA	2	6	143395	143400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2050	NC_011982	GTT	2	6	143408	143413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080228
2051	NC_011982	CGC	2	6	143619	143624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080228
2052	NC_011982	TAA	2	6	143668	143673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080228
2053	NC_011982	CGG	2	6	143690	143695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
2054	NC_011982	CGG	2	6	143753	143758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080228
2055	NC_011982	CTA	2	6	143790	143795	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080228
2056	NC_011982	TAT	2	6	143836	143841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080228
2057	NC_011982	GCT	2	6	143917	143922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080228
2058	NC_011982	GCA	2	6	144208	144213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2059	NC_011982	TGC	2	6	144272	144277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2060	NC_011982	GCT	2	6	144335	144340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2061	NC_011982	GAA	2	6	144344	144349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080229
2062	NC_011982	CTT	2	6	144402	144407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080229
2063	NC_011982	GTC	2	6	144442	144447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2064	NC_011982	CAA	2	6	144684	144689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080229
2065	NC_011982	TAA	2	6	144977	144982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080229
2066	NC_011982	CTC	2	6	145161	145166	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080229
2067	NC_011982	GAT	2	6	145193	145198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080229
2068	NC_011982	CAG	2	6	145203	145208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080229
2069	NC_011982	GAT	2	6	145256	145261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080229
2070	NC_011982	AGA	2	6	145294	145299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080229
2071	NC_011982	GGC	2	6	145383	145388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080229
2072	NC_011982	CGG	2	6	145552	145557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
2073	NC_011982	CGG	2	6	145630	145635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
2074	NC_011982	ACC	2	6	145684	145689	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080230
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2078	NC_011982	GCT	2	6	145978	145983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2079	NC_011982	GCT	2	6	146014	146019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2080	NC_011982	GAT	2	6	146198	146203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080230
2081	NC_011982	GTG	2	6	146268	146273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080230
2082	NC_011982	CGA	2	6	146287	146292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2083	NC_011982	TCG	2	6	146343	146348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2084	NC_011982	GCG	2	6	146381	146386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080230
2085	NC_011982	TCG	2	6	146541	146546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080230
2086	NC_011982	ACA	2	6	146601	146606	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2087	NC_011982	CGG	2	6	146810	146815	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2088	NC_011982	CAA	2	6	146872	146877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2089	NC_011982	TTC	2	6	146972	146977	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_011982	GTG	2	6	147035	147040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2091	NC_011982	GCA	2	6	147056	147061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_011982	GGC	2	6	147106	147111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2093	NC_011982	CGC	2	6	147243	147248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2094	NC_011982	AAG	2	6	147294	147299	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2095	NC_011982	TCC	2	6	147466	147471	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2096	NC_011982	TCG	2	6	147473	147478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2097	NC_011982	CGC	2	6	147483	147488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2098	NC_011982	GCG	2	6	147589	147594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2099	NC_011982	CGA	2	6	147848	147853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2100	NC_011982	GCT	2	6	147872	147877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2101	NC_011982	GGC	2	6	147996	148001	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_011982	GCC	2	6	148014	148019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2103	NC_011982	CGT	2	6	148254	148259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2104	NC_011982	CTT	2	6	148382	148387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080231
2105	NC_011982	GCA	2	6	148510	148515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2106	NC_011982	CGT	2	6	148639	148644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2107	NC_011982	TGG	2	6	148902	148907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080231
2108	NC_011982	GCT	2	6	149109	149114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2109	NC_011982	CGT	2	6	149161	149166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2110	NC_011982	ACT	2	6	149174	149179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080231
2111	NC_011982	TGC	2	6	149291	149296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2112	NC_011982	GTT	2	6	149329	149334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080231
2113	NC_011982	AGA	2	6	149379	149384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080231
2114	NC_011982	GCT	2	6	149497	149502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2115	NC_011982	GTC	2	6	149574	149579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2116	NC_011982	TCA	2	6	149739	149744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080231
2117	NC_011982	CAA	2	6	149851	149856	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080231
2118	NC_011982	ATT	2	6	150012	150017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080231
2119	NC_011982	CTG	2	6	150179	150184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080231
2120	NC_011982	GAA	2	6	150210	150215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080231
2121	NC_011982	GCG	2	6	150216	150221	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080231
2122	NC_011982	GTT	2	6	150253	150258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080231
2123	NC_011982	TTC	2	6	150287	150292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080231
2124	NC_011982	CCA	2	6	150313	150318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080231
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2126	NC_011982	CGG	2	6	150472	150477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080231
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2128	NC_011982	GTT	2	6	150705	150710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2129	NC_011982	CAA	2	6	150744	150749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2227	NC_011982	AAC	2	6	157417	157422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2240	NC_011982	GGA	2	6	158101	158106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080236
2241	NC_011982	TGC	2	6	158202	158207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080237
2242	NC_011982	CCT	2	6	158263	158268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080237
2243	NC_011982	CCG	2	6	158312	158317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080237
2244	NC_011982	CGG	2	6	158357	158362	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080237
2245	NC_011982	GCC	2	6	158418	158423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080237
2246	NC_011982	GAT	2	6	158490	158495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080237
2247	NC_011982	GTC	2	6	158581	158586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080237
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2250	NC_011982	TGG	2	6	158780	158785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2251	NC_011982	TGA	2	6	158786	158791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2252	NC_011982	GGC	2	6	158812	158817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2253	NC_011982	CAA	2	6	158824	158829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2254	NC_011982	CGT	2	6	158875	158880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2255	NC_011982	GCC	2	6	158889	158894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080238
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2267	NC_011982	AGA	2	6	159854	159859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080239
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2325	NC_011982	TCG	2	6	165130	165135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080244
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2342	NC_011982	GTT	2	6	166491	166496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080245
2343	NC_011982	CGT	2	6	166537	166542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080245
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2345	NC_011982	ATC	2	6	166826	166831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080245
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2347	NC_011982	TCT	2	6	166893	166898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080245
2348	NC_011982	CGG	2	6	167176	167181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080245
2349	NC_011982	AAC	2	6	167198	167203	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080245
2350	NC_011982	CGA	2	6	167295	167300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080245
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2352	NC_011982	GTG	2	6	167397	167402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080245
2353	NC_011982	GAG	2	6	167434	167439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080245
2354	NC_011982	GCT	2	6	167494	167499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080245
2355	NC_011982	CGG	2	6	167549	167554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080245
2356	NC_011982	ATC	2	6	167603	167608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080245
2357	NC_011982	TCC	2	6	167721	167726	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080245
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2481	NC_011982	CGT	2	6	177282	177287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080254
2482	NC_011982	TTG	2	6	177296	177301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080254
2483	NC_011982	CGG	2	6	177426	177431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080255
2484	NC_011982	TGC	2	6	177435	177440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2485	NC_011982	GTC	2	6	177501	177506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2486	NC_011982	TCA	3	9	177515	177523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080255
2487	NC_011982	GTT	2	6	177611	177616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080255
2488	NC_011982	CAA	2	6	177668	177673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080255
2489	NC_011982	TCA	2	6	177761	177766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080255
2490	NC_011982	GTC	2	6	177943	177948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2491	NC_011982	TGC	2	6	178130	178135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2492	NC_011982	TTA	2	6	178177	178182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080255
2493	NC_011982	GCA	2	6	178253	178258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2494	NC_011982	TAT	2	6	178352	178357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222080255
2495	NC_011982	TAG	2	6	178555	178560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080255
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