MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_011982	CGT	2	6	178976	178981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080255
2502	NC_011982	CAT	2	6	179031	179036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080255
2503	NC_011982	GGA	2	6	179082	179087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080256
2504	NC_011982	CTC	2	6	179158	179163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080256
2505	NC_011982	CTC	2	6	179182	179187	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080256
2506	NC_011982	CTC	2	6	179345	179350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2507	NC_011982	ATC	2	6	179626	179631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_011982	TGA	2	6	179677	179682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_011982	GCG	2	6	179790	179795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_011982	CGA	2	6	179800	179805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_011982	GGA	2	6	179807	179812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_011982	TCT	2	6	179827	179832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2513	NC_011982	GCT	2	6	179874	179879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_011982	CTT	2	6	179979	179984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2515	NC_011982	GGC	2	6	180029	180034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_011982	GCC	2	6	180167	180172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2517	NC_011982	CTG	2	6	180216	180221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2518	NC_011982	GAA	2	6	180301	180306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_011982	TTG	2	6	180401	180406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_011982	CGC	2	6	180464	180469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2521	NC_011982	GCA	2	6	180677	180682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_011982	CGG	2	6	180992	180997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2523	NC_011982	CGG	2	6	181070	181075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_011982	ACC	2	6	181123	181128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2525	NC_011982	AGG	2	6	181147	181152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_011982	AAG	2	6	181293	181298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_011982	GCG	2	6	181368	181373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_011982	GCT	2	6	181417	181422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_011982	GCT	2	6	181453	181458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2530	NC_011982	GTT	2	6	181604	181609	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_011982	GCG	2	6	181697	181702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2532	NC_011982	ACG	2	6	181706	181711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2533	NC_011982	CGC	2	6	181900	181905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2534	NC_011982	GAG	2	6	181923	181928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_011982	GCG	2	6	182275	182280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080257
2536	NC_011982	GGC	2	6	182292	182297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_011982	GCA	2	6	182444	182449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
2538	NC_011982	TGG	2	6	182469	182474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
2539	NC_011982	GCC	2	6	182651	182656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
2540	NC_011982	GAC	2	6	183187	183192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
2541	NC_011982	TGC	2	6	183249	183254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080258
2542	NC_011982	GAC	2	6	183257	183262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
2543	NC_011982	GCC	2	6	183332	183337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
2544	NC_011982	GGT	2	6	183383	183388	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
2545	NC_011982	GCG	2	6	183420	183425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080258
2546	NC_011982	TGA	2	6	183508	183513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080258
2547	NC_011982	CGC	2	6	183529	183534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
2548	NC_011982	TCG	2	6	183580	183585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080258
2549	NC_011982	TGG	2	6	183615	183620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
2550	NC_011982	TTC	2	6	183626	183631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080258
2551	NC_011982	GAC	2	6	183734	183739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080258
2552	NC_011982	TGG	2	6	183765	183770	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080258
2553	NC_011982	CCG	2	6	183781	183786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
2554	NC_011982	CCG	2	6	183799	183804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
2555	NC_011982	GCC	2	6	183983	183988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080258
2556	NC_011982	TCG	2	6	184023	184028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_011982	CGC	2	6	184100	184105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2558	NC_011982	CGG	2	6	184109	184114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2559	NC_011982	CCG	2	6	184397	184402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080259
2560	NC_011982	CAA	2	6	184430	184435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080259
2561	NC_011982	TGA	2	6	184436	184441	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
2562	NC_011982	ATC	2	6	184603	184608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080259
2563	NC_011982	ACC	2	6	184645	184650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080259
2564	NC_011982	TTC	2	6	184679	184684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080259
2565	NC_011982	GCT	2	6	184715	184720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2566	NC_011982	AGT	2	6	184857	184862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
2567	NC_011982	GAA	2	6	184863	184868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080259
2568	NC_011982	AAG	2	6	184929	184934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080259
2569	NC_011982	CTT	2	6	184996	185001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080259
2570	NC_011982	TCA	2	6	185060	185065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080259
2571	NC_011982	ACG	2	6	185162	185167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2572	NC_011982	TGT	2	6	185208	185213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080259
2573	NC_011982	ATG	2	6	185281	185286	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
2574	NC_011982	CGG	2	6	185314	185319	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080259
2575	NC_011982	TGT	2	6	185369	185374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222080259
2576	NC_011982	GCC	2	6	185391	185396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080259
2577	NC_011982	ACG	2	6	185439	185444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2578	NC_011982	GCC	2	6	185506	185511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080259
2579	NC_011982	CGG	2	6	185541	185546	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080259
2580	NC_011982	AGC	2	6	185648	185653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2581	NC_011982	CTC	2	6	185694	185699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080259
2582	NC_011982	CGT	2	6	185731	185736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2583	NC_011982	GGA	2	6	185752	185757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080259
2584	NC_011982	CTA	2	6	185801	185806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080259
2585	NC_011982	TGA	2	6	185821	185826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
2586	NC_011982	GCG	2	6	185857	185862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080259
2587	NC_011982	ACG	2	6	185879	185884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2588	NC_011982	TGC	3	9	185889	185897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2589	NC_011982	CTT	2	6	185933	185938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080259
2590	NC_011982	GAA	2	6	186036	186041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080259
2591	NC_011982	TTC	2	6	186103	186108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080259
2592	NC_011982	AAT	2	6	186177	186182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080259
2593	NC_011982	AGT	2	6	186484	186489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080259
2594	NC_011982	GCT	2	6	186533	186538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2595	NC_011982	GAA	2	6	186599	186604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080259
2596	NC_011982	GCA	2	6	186635	186640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080259
2597	NC_011982	GGT	2	6	186920	186925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_011982	GGC	2	6	186960	186965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2599	NC_011982	CTT	2	6	187138	187143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080260
2600	NC_011982	CTC	2	6	187391	187396	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080260
2601	NC_011982	CGG	3	9	187399	187407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080260
2602	NC_011982	GAT	2	6	187514	187519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080260
2603	NC_011982	GAA	2	6	187806	187811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222080260
2604	NC_011982	ATC	2	6	187902	187907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080260
2605	NC_011982	CGC	2	6	188014	188019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080260
2606	NC_011982	ACT	2	6	188063	188068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080260
2607	NC_011982	TTG	2	6	188243	188248	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_011982	CAT	2	6	188260	188265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_011982	GGA	2	6	188278	188283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_011982	GGA	2	6	188449	188454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2611	NC_011982	CGG	2	6	188467	188472	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2612	NC_011982	ATT	2	6	188505	188510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_011982	GTG	2	6	188629	188634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222080261
2614	NC_011982	GCC	2	6	188847	188852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080261
2615	NC_011982	CGA	2	6	188901	188906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080261
2616	NC_011982	GCG	2	6	189011	189016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080261
2617	NC_011982	GCT	2	6	189083	189088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080261
2618	NC_011982	TGC	2	6	189122	189127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080261
2619	NC_011982	CGC	2	6	189237	189242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080261
2620	NC_011982	CCA	2	6	189396	189401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080261
2621	NC_011982	GGC	2	6	189476	189481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080261
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2623	NC_011982	CGA	2	6	189979	189984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080262
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2625	NC_011982	ATG	2	6	190194	190199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080262
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2988	NC_011982	TAT	2	6	217657	217662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2989	NC_011982	TTA	2	6	217723	217728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2990	NC_011982	TCT	2	6	217742	217747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2991	NC_011982	TAT	2	6	217771	217776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2992	NC_011982	CGC	2	6	218096	218101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2993	NC_011982	TGA	2	6	218214	218219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2995	NC_011982	ATG	2	6	218376	218381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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