MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Agrobacterium vitis S4 plasmid pTiS4

Total Repeats: 3570

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_011982	CCG	2	6	254669	254674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080317
3502	NC_011982	GCA	2	6	254712	254717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080317
3503	NC_011982	GCC	2	6	254722	254727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080317
3504	NC_011982	ACA	2	6	254787	254792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222080317
3505	NC_011982	TCG	2	6	254843	254848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080317
3506	NC_011982	CGG	2	6	255107	255112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080317
3507	NC_011982	TCT	2	6	255146	255151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080317
3508	NC_011982	CGA	2	6	255199	255204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080317
3509	NC_011982	CCA	2	6	255234	255239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080317
3510	NC_011982	TCA	2	6	255240	255245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080317
3511	NC_011982	CTG	2	6	255310	255315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080317
3512	NC_011982	CTT	2	6	255319	255324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222080317
3513	NC_011982	TCC	2	6	255353	255358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080317
3514	NC_011982	CGA	2	6	255379	255384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080317
3515	NC_011982	CGA	2	6	255462	255467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080317
3516	NC_011982	GCG	2	6	255492	255497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080317
3517	NC_011982	CCG	2	6	255516	255521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080317
3518	NC_011982	GCC	2	6	255634	255639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080317
3519	NC_011982	TCA	2	6	255660	255665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080317
3520	NC_011982	CGG	2	6	255668	255673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080317
3521	NC_011982	GAG	2	6	255716	255721	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080317
3522	NC_011982	CGG	2	6	255814	255819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080317
3523	NC_011982	ATC	2	6	255983	255988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080317
3524	NC_011982	CAG	2	6	256114	256119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080317
3525	NC_011982	CGA	2	6	256235	256240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080318
3526	NC_011982	CGC	2	6	256287	256292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080318
3527	NC_011982	CAT	2	6	256313	256318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080318
3528	NC_011982	GCG	2	6	256365	256370	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080318
3529	NC_011982	CAC	2	6	256382	256387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080318
3530	NC_011982	CAG	2	6	256418	256423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080318
3531	NC_011982	AAT	2	6	256556	256561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222080319
3532	NC_011982	CGA	2	6	256622	256627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080319
3533	NC_011982	CCG	2	6	256702	256707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080319
3534	NC_011982	CTG	2	6	256779	256784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080319
3535	NC_011982	CTG	2	6	256788	256793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080319
3536	NC_011982	GCC	2	6	256818	256823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080319
3537	NC_011982	TCG	2	6	256922	256927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3538	NC_011982	GAC	2	6	257026	257031	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3539	NC_011982	CCT	2	6	257055	257060	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080320
3540	NC_011982	CCG	2	6	257147	257152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080320
3541	NC_011982	CAG	2	6	257176	257181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3542	NC_011982	GCG	2	6	257189	257194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
3543	NC_011982	ATG	2	6	257216	257221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080320
3544	NC_011982	GAG	2	6	257251	257256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222080320
3545	NC_011982	CGG	2	6	257304	257309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
3546	NC_011982	CGG	2	6	257322	257327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
3547	NC_011982	CGA	2	6	257367	257372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3548	NC_011982	GAT	2	6	257380	257385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080320
3549	NC_011982	CGT	2	6	257398	257403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3550	NC_011982	TCA	2	6	257487	257492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080320
3551	NC_011982	TCG	2	6	257510	257515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3552	NC_011982	GCC	2	6	257599	257604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080320
3553	NC_011982	CGG	3	9	257688	257696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080320
3554	NC_011982	CGA	2	6	257778	257783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080320
3555	NC_011982	TCA	2	6	257792	257797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222080320
3556	NC_011982	GGC	2	6	257891	257896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080321
3557	NC_011982	GTC	2	6	257901	257906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3558	NC_011982	CGG	2	6	257928	257933	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222080321
3559	NC_011982	ACG	2	6	258001	258006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3560	NC_011982	TCG	2	6	258085	258090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3561	NC_011982	GAT	2	6	258114	258119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222080321
3562	NC_011982	CCT	2	6	258157	258162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080321
3563	NC_011982	CTC	2	6	258166	258171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222080321
3564	NC_011982	GTC	2	6	258181	258186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3565	NC_011982	ACC	2	6	258313	258318	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222080321
3566	NC_011982	CGT	2	6	258362	258367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222080321
3567	NC_011982	CGC	2	6	258380	258385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222080321
3568	NC_011982	CAA	3	9	258521	258529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_011982	TGC	2	6	258698	258703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_011982	CTT	2	6	258769	258774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.