MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 2668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004842	TTTG	2	8	512	519	0 %	75 %	25 %	0 %	56416371
2	NC_004842	TGAC	2	8	1724	1731	25 %	25 %	25 %	25 %	56416371
3	NC_004842	GCCA	2	8	2496	2503	25 %	0 %	25 %	50 %	56416373
4	NC_004842	ATGA	2	8	2839	2846	50 %	25 %	25 %	0 %	56416373
5	NC_004842	GGTG	2	8	3391	3398	0 %	25 %	75 %	0 %	56416374
6	NC_004842	AAGA	3	12	4428	4439	75 %	0 %	25 %	0 %	56416375
7	NC_004842	GCAA	2	8	4813	4820	50 %	0 %	25 %	25 %	56416376
8	NC_004842	TGCT	2	8	5382	5389	0 %	50 %	25 %	25 %	56416377
9	NC_004842	GGCT	3	12	5509	5520	0 %	25 %	50 %	25 %	56416377
10	NC_004842	CGGA	2	8	6821	6828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_004842	ACGT	2	8	6865	6872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_004842	TCCG	2	8	6901	6908	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004842	GTTG	2	8	7835	7842	0 %	50 %	50 %	0 %	56416380
14	NC_004842	GCGG	2	8	7998	8005	0 %	0 %	75 %	25 %	56416380
15	NC_004842	CCCA	2	8	9305	9312	25 %	0 %	0 %	75 %	56416381
16	NC_004842	GCTC	2	8	9389	9396	0 %	25 %	25 %	50 %	56416382
17	NC_004842	CACG	2	8	9692	9699	25 %	0 %	25 %	50 %	56416382
18	NC_004842	CCAC	2	8	9868	9875	25 %	0 %	0 %	75 %	56416382
19	NC_004842	CTTC	2	8	9906	9913	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004842	ACAA	2	8	10644	10651	75 %	0 %	0 %	25 %	56416383
21	NC_004842	CATG	2	8	10657	10664	25 %	25 %	25 %	25 %	56416383
22	NC_004842	TCCG	2	8	11089	11096	0 %	25 %	25 %	50 %	56416383
23	NC_004842	TTTG	2	8	11164	11171	0 %	75 %	25 %	0 %	56416383
24	NC_004842	TCGT	2	8	11780	11787	0 %	50 %	25 %	25 %	56416384
25	NC_004842	CATA	2	8	12017	12024	50 %	25 %	0 %	25 %	56416384
26	NC_004842	TCCA	2	8	12077	12084	25 %	25 %	0 %	50 %	56416384
27	NC_004842	CCAC	2	8	12166	12173	25 %	0 %	0 %	75 %	56416384
28	NC_004842	ATGC	2	8	12197	12204	25 %	25 %	25 %	25 %	56416384
29	NC_004842	GCAA	2	8	12849	12856	50 %	0 %	25 %	25 %	56416384
30	NC_004842	CCCG	2	8	13118	13125	0 %	0 %	25 %	75 %	56416384
31	NC_004842	CTCA	2	8	13180	13187	25 %	25 %	0 %	50 %	56416385
32	NC_004842	GTGG	2	8	13839	13846	0 %	25 %	75 %	0 %	56416386
33	NC_004842	TTCA	2	8	14752	14759	25 %	50 %	0 %	25 %	56416387
34	NC_004842	CGGT	2	8	15115	15122	0 %	25 %	50 %	25 %	56416388
35	NC_004842	GCGT	2	8	16626	16633	0 %	25 %	50 %	25 %	56416389
36	NC_004842	CTGT	2	8	16809	16816	0 %	50 %	25 %	25 %	56416389
37	NC_004842	GGCG	2	8	17124	17131	0 %	0 %	75 %	25 %	56416389
38	NC_004842	CACC	2	8	17296	17303	25 %	0 %	0 %	75 %	56416389
39	NC_004842	AAAG	2	8	17460	17467	75 %	0 %	25 %	0 %	56416389
40	NC_004842	TCGA	2	8	18725	18732	25 %	25 %	25 %	25 %	56416390
41	NC_004842	CAGG	2	8	19591	19598	25 %	0 %	50 %	25 %	56416390
42	NC_004842	TGCG	2	8	20157	20164	0 %	25 %	50 %	25 %	56416390
43	NC_004842	CAAA	2	8	20654	20661	75 %	0 %	0 %	25 %	56416390
44	NC_004842	AAGG	2	8	20721	20728	50 %	0 %	50 %	0 %	56416390
45	NC_004842	AGAT	2	8	20925	20932	50 %	25 %	25 %	0 %	56416390
46	NC_004842	GTAT	2	8	21097	21104	25 %	50 %	25 %	0 %	56416390
47	NC_004842	ATAG	2	8	21128	21135	50 %	25 %	25 %	0 %	56416390
48	NC_004842	CTTG	2	8	21232	21239	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004842	GTAT	2	8	21318	21325	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004842	GTTC	2	8	21541	21548	0 %	50 %	25 %	25 %	56416391
51	NC_004842	GGTG	2	8	21910	21917	0 %	25 %	75 %	0 %	56416391
52	NC_004842	CAAC	2	8	23630	23637	50 %	0 %	0 %	50 %	56416393
53	NC_004842	GGAT	2	8	24848	24855	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004842	GTTT	2	8	25167	25174	0 %	75 %	25 %	0 %	56416395
55	NC_004842	TTGG	2	8	25518	25525	0 %	50 %	50 %	0 %	56416395
56	NC_004842	TTGC	2	8	25743	25750	0 %	50 %	25 %	25 %	56416395
57	NC_004842	AGCA	2	8	25934	25941	50 %	0 %	25 %	25 %	56416395
58	NC_004842	TATG	2	8	27257	27264	25 %	50 %	25 %	0 %	56416395
59	NC_004842	GTTC	2	8	27284	27291	0 %	50 %	25 %	25 %	56416395
60	NC_004842	TTGT	2	8	27396	27403	0 %	75 %	25 %	0 %	56416395
61	NC_004842	TGGC	2	8	27576	27583	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004842	ACTG	2	8	27584	27591	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_004842	GGCC	2	8	28613	28620	0 %	0 %	50 %	50 %	56416397
64	NC_004842	AGGC	2	8	28993	29000	25 %	0 %	50 %	25 %	56416398
65	NC_004842	CGTG	2	8	29160	29167	0 %	25 %	50 %	25 %	56416398
66	NC_004842	GCTG	2	8	29499	29506	0 %	25 %	50 %	25 %	56416399
67	NC_004842	GGAA	2	8	29584	29591	50 %	0 %	50 %	0 %	56416399
68	NC_004842	TGGC	2	8	29609	29616	0 %	25 %	50 %	25 %	56416399
69	NC_004842	TCGT	2	8	30018	30025	0 %	50 %	25 %	25 %	56416399
70	NC_004842	GCTT	2	8	30072	30079	0 %	50 %	25 %	25 %	56416399
71	NC_004842	GGGT	2	8	30147	30154	0 %	25 %	75 %	0 %	56416399
72	NC_004842	AGCG	2	8	30544	30551	25 %	0 %	50 %	25 %	56416399
73	NC_004842	GTTG	2	8	30963	30970	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004842	TCGC	2	8	31043	31050	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_004842	TGAG	2	8	31745	31752	25 %	25 %	50 %	0 %	56416400
76	NC_004842	CGGC	2	8	32476	32483	0 %	0 %	50 %	50 %	56416401
77	NC_004842	CAGT	2	8	32650	32657	25 %	25 %	25 %	25 %	56416401
78	NC_004842	CAAC	2	8	33277	33284	50 %	0 %	0 %	50 %	56416402
79	NC_004842	GAAG	2	8	34075	34082	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004842	GTAA	2	8	34262	34269	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004842	TAGA	2	8	34731	34738	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004842	GAAA	2	8	35058	35065	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004842	AATT	2	8	35286	35293	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004842	TCAC	2	8	35418	35425	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_004842	CAGC	2	8	35456	35463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004842	ATGG	2	8	36742	36749	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004842	CATC	2	8	37033	37040	25 %	25 %	0 %	50 %	56416404
88	NC_004842	GTGA	2	8	37077	37084	25 %	25 %	50 %	0 %	56416404
89	NC_004842	CTTC	2	8	37240	37247	0 %	50 %	0 %	50 %	56416404
90	NC_004842	TCTT	2	8	37551	37558	0 %	75 %	0 %	25 %	56416404
91	NC_004842	GTAC	2	8	37633	37640	25 %	25 %	25 %	25 %	56416404
92	NC_004842	TGCT	2	8	37801	37808	0 %	50 %	25 %	25 %	56416404
93	NC_004842	CCCT	2	8	38029	38036	0 %	25 %	0 %	75 %	56416404
94	NC_004842	AAGC	2	8	38161	38168	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_004842	TGAG	2	8	39885	39892	25 %	25 %	50 %	0 %	56416408
96	NC_004842	CTGC	2	8	40154	40161	0 %	25 %	25 %	50 %	56416408
97	NC_004842	TGAG	2	8	40227	40234	25 %	25 %	50 %	0 %	56416408
98	NC_004842	CGGC	2	8	40363	40370	0 %	0 %	50 %	50 %	56416408
99	NC_004842	GGGC	2	8	41087	41094	0 %	0 %	75 %	25 %	56416409
100	NC_004842	ACAA	2	8	41479	41486	75 %	0 %	0 %	25 %	56416409
101	NC_004842	AAAG	2	8	42905	42912	75 %	0 %	25 %	0 %	56416410
102	NC_004842	GCAG	2	8	43176	43183	25 %	0 %	50 %	25 %	56416410
103	NC_004842	CCAG	2	8	43449	43456	25 %	0 %	25 %	50 %	56416411
104	NC_004842	TAGG	2	8	43870	43877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004842	AGGC	2	8	44308	44315	25 %	0 %	50 %	25 %	56416412
106	NC_004842	AGGA	2	8	45183	45190	50 %	0 %	50 %	0 %	56416412
107	NC_004842	GACT	2	8	45216	45223	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004842	AGTT	2	8	45405	45412	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004842	AGGA	2	8	45451	45458	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004842	TCAG	2	8	45783	45790	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_004842	AATT	2	8	45956	45963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004842	CTTT	2	8	46183	46190	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004842	CCAC	2	8	47099	47106	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
114	NC_004842	TACT	2	8	47413	47420	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_004842	CTTC	2	8	47599	47606	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_004842	GTTG	2	8	48397	48404	0 %	50 %	50 %	0 %	56416414
117	NC_004842	GTGA	2	8	49045	49052	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004842	GCAG	2	8	49731	49738	25 %	0 %	50 %	25 %	56416415
119	NC_004842	GTTG	2	8	49845	49852	0 %	50 %	50 %	0 %	56416415
120	NC_004842	AGCA	2	8	49965	49972	50 %	0 %	25 %	25 %	56416415
121	NC_004842	GCTG	2	8	50163	50170	0 %	25 %	50 %	25 %	56416415
122	NC_004842	AGGG	2	8	50188	50195	25 %	0 %	75 %	0 %	56416415
123	NC_004842	AGTC	2	8	51474	51481	25 %	25 %	25 %	25 %	56416417
124	NC_004842	CGGG	2	8	52407	52414	0 %	0 %	75 %	25 %	56416417
125	NC_004842	CGTA	2	8	52656	52663	25 %	25 %	25 %	25 %	56416417
126	NC_004842	TCTG	2	8	52675	52682	0 %	50 %	25 %	25 %	56416417
127	NC_004842	ACGC	2	8	53274	53281	25 %	0 %	25 %	50 %	56416417
128	NC_004842	ATGC	2	8	53436	53443	25 %	25 %	25 %	25 %	56416417
129	NC_004842	ACAA	2	8	53888	53895	75 %	0 %	0 %	25 %	56416417
130	NC_004842	CCTT	2	8	54449	54456	0 %	50 %	0 %	50 %	56416417
131	NC_004842	CCGC	2	8	54791	54798	0 %	0 %	25 %	75 %	56416417
132	NC_004842	GTAC	2	8	55334	55341	25 %	25 %	25 %	25 %	56416418
133	NC_004842	CGTG	2	8	55500	55507	0 %	25 %	50 %	25 %	56416418
134	NC_004842	AACC	2	8	55654	55661	50 %	0 %	0 %	50 %	56416418
135	NC_004842	CTGC	2	8	56224	56231	0 %	25 %	25 %	50 %	56416418
136	NC_004842	GCAC	2	8	56880	56887	25 %	0 %	25 %	50 %	56416418
137	NC_004842	CGCA	2	8	57299	57306	25 %	0 %	25 %	50 %	56416418
138	NC_004842	CCAT	2	8	57354	57361	25 %	25 %	0 %	50 %	56416418
139	NC_004842	TGGG	2	8	57671	57678	0 %	25 %	75 %	0 %	56416418
140	NC_004842	CGGT	2	8	58634	58641	0 %	25 %	50 %	25 %	56416418
141	NC_004842	ACAG	2	8	59266	59273	50 %	0 %	25 %	25 %	56416418
142	NC_004842	ATGA	2	8	59467	59474	50 %	25 %	25 %	0 %	56416418
143	NC_004842	AGTG	2	8	62417	62424	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004842	GGTA	2	8	62460	62467	25 %	25 %	50 %	0 %	56416420
145	NC_004842	GTAG	2	8	62883	62890	25 %	25 %	50 %	0 %	56416420
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284	NC_004842	AAGA	2	8	124703	124710	75 %	0 %	25 %	0 %	56416467
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