MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 2668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004842	CAAC	2	8	688476	688483	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1502	NC_004842	GACC	2	8	688593	688600	25 %	0 %	25 %	50 %	56416877
1503	NC_004842	TTTC	2	8	689314	689321	0 %	75 %	0 %	25 %	56416878
1504	NC_004842	CATC	2	8	689506	689513	25 %	25 %	0 %	50 %	56416878
1505	NC_004842	CCTA	2	8	689881	689888	25 %	25 %	0 %	50 %	56416878
1506	NC_004842	CCAA	2	8	690134	690141	50 %	0 %	0 %	50 %	56416878
1507	NC_004842	ATTA	2	8	690334	690341	50 %	50 %	0 %	0 %	56416878
1508	NC_004842	CCCT	2	8	690420	690427	0 %	25 %	0 %	75 %	56416878
1509	NC_004842	CGGC	2	8	690542	690549	0 %	0 %	50 %	50 %	56416878
1510	NC_004842	CAAA	2	8	690599	690606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_004842	AACC	2	8	690647	690654	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_004842	AAAG	2	8	690801	690808	75 %	0 %	25 %	0 %	56416879
1513	NC_004842	TGCT	2	8	692078	692085	0 %	50 %	25 %	25 %	56416880
1514	NC_004842	TTGC	2	8	692719	692726	0 %	50 %	25 %	25 %	56416881
1515	NC_004842	TAGA	2	8	693504	693511	50 %	25 %	25 %	0 %	56416882
1516	NC_004842	ATCA	2	8	693637	693644	50 %	25 %	0 %	25 %	56416882
1517	NC_004842	TATC	2	8	694489	694496	25 %	50 %	0 %	25 %	56416883
1518	NC_004842	ACTT	2	8	696063	696070	25 %	50 %	0 %	25 %	161544988
1519	NC_004842	ACAA	2	8	696431	696438	75 %	0 %	0 %	25 %	161544988
1520	NC_004842	GATA	2	8	697914	697921	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_004842	GAGG	2	8	698369	698376	25 %	0 %	75 %	0 %	56416886
1522	NC_004842	CGCA	2	8	698435	698442	25 %	0 %	25 %	50 %	56416886
1523	NC_004842	GACT	2	8	698733	698740	25 %	25 %	25 %	25 %	56416886
1524	NC_004842	CAAG	2	8	699632	699639	50 %	0 %	25 %	25 %	56416887
1525	NC_004842	TCGC	2	8	699879	699886	0 %	25 %	25 %	50 %	56416887
1526	NC_004842	TGTA	2	8	699963	699970	25 %	50 %	25 %	0 %	56416887
1527	NC_004842	CACT	2	8	700008	700015	25 %	25 %	0 %	50 %	56416887
1528	NC_004842	CAGA	2	8	700187	700194	50 %	0 %	25 %	25 %	56416888
1529	NC_004842	CTTT	2	8	700396	700403	0 %	75 %	0 %	25 %	56416888
1530	NC_004842	ATTG	2	8	700849	700856	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1531	NC_004842	AGAA	2	8	701148	701155	75 %	0 %	25 %	0 %	56416889
1532	NC_004842	GTAT	2	8	701382	701389	25 %	50 %	25 %	0 %	56416889
1533	NC_004842	CAGT	2	8	701684	701691	25 %	25 %	25 %	25 %	56416889
1534	NC_004842	CAAA	2	8	702033	702040	75 %	0 %	0 %	25 %	56416889
1535	NC_004842	ACCT	2	8	702096	702103	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1536	NC_004842	AAGG	2	8	702304	702311	50 %	0 %	50 %	0 %	56416890
1537	NC_004842	GTGC	2	8	702330	702337	0 %	25 %	50 %	25 %	56416890
1538	NC_004842	AACA	2	8	703253	703260	75 %	0 %	0 %	25 %	56416890
1539	NC_004842	CAAT	2	8	704082	704089	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1540	NC_004842	TCGC	2	8	704378	704385	0 %	25 %	25 %	50 %	56416891
1541	NC_004842	TACA	2	8	705812	705819	50 %	25 %	0 %	25 %	56416892
1542	NC_004842	CCTG	2	8	706658	706665	0 %	25 %	25 %	50 %	56416893
1543	NC_004842	TTGC	2	8	706949	706956	0 %	50 %	25 %	25 %	56416893
1544	NC_004842	AACA	2	8	707293	707300	75 %	0 %	0 %	25 %	56416893
1545	NC_004842	TTGC	2	8	707315	707322	0 %	50 %	25 %	25 %	56416893
1546	NC_004842	CTCG	2	8	707699	707706	0 %	25 %	25 %	50 %	56416893
1547	NC_004842	CTTT	2	8	707708	707715	0 %	75 %	0 %	25 %	56416893
1548	NC_004842	ATCC	2	8	708277	708284	25 %	25 %	0 %	50 %	56416894
1549	NC_004842	CTAT	2	8	709116	709123	25 %	50 %	0 %	25 %	56416895
1550	NC_004842	ACCC	2	8	710148	710155	25 %	0 %	0 %	75 %	56416895
1551	NC_004842	CGCC	2	8	710299	710306	0 %	0 %	25 %	75 %	56416895
1552	NC_004842	ACAA	2	8	710948	710955	75 %	0 %	0 %	25 %	56416896
1553	NC_004842	CTGA	2	8	711214	711221	25 %	25 %	25 %	25 %	56416896
1554	NC_004842	GACA	2	8	711397	711404	50 %	0 %	25 %	25 %	56416896
1555	NC_004842	TACG	2	8	711667	711674	25 %	25 %	25 %	25 %	56416896
1556	NC_004842	CAAG	2	8	711915	711922	50 %	0 %	25 %	25 %	56416896
1557	NC_004842	ACCA	2	8	711964	711971	50 %	0 %	0 %	50 %	56416896
1558	NC_004842	TGCC	2	8	712148	712155	0 %	25 %	25 %	50 %	56416896
1559	NC_004842	TACC	2	8	712284	712291	25 %	25 %	0 %	50 %	56416896
1560	NC_004842	AGAC	2	8	713418	713425	50 %	0 %	25 %	25 %	56416897
1561	NC_004842	AACA	2	8	713650	713657	75 %	0 %	0 %	25 %	56416897
1562	NC_004842	GCTC	2	8	714305	714312	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_004842	CGGG	2	8	714353	714360	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1564	NC_004842	CAAA	2	8	714420	714427	75 %	0 %	0 %	25 %	56416898
1565	NC_004842	CACC	2	8	714834	714841	25 %	0 %	0 %	75 %	56416898
1566	NC_004842	GCAA	2	8	715097	715104	50 %	0 %	25 %	25 %	56416898
1567	NC_004842	CCAG	2	8	715299	715306	25 %	0 %	25 %	50 %	56416899
1568	NC_004842	AGAT	2	8	716757	716764	50 %	25 %	25 %	0 %	56416900
1569	NC_004842	ACAA	2	8	717017	717024	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_004842	CAGA	2	8	717316	717323	50 %	0 %	25 %	25 %	56416901
1571	NC_004842	ATGA	2	8	717522	717529	50 %	25 %	25 %	0 %	56416901
1572	NC_004842	GCGG	2	8	717705	717712	0 %	0 %	75 %	25 %	56416901
1573	NC_004842	TGCA	2	8	717916	717923	25 %	25 %	25 %	25 %	56416901
1574	NC_004842	AGGC	2	8	718069	718076	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1575	NC_004842	CATT	2	8	718147	718154	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_004842	GATA	2	8	718861	718868	50 %	25 %	25 %	0 %	56416902
1577	NC_004842	CTAT	2	8	719380	719387	25 %	50 %	0 %	25 %	56416903
1578	NC_004842	ATGT	2	8	719829	719836	25 %	50 %	25 %	0 %	56416904
1579	NC_004842	ACCT	2	8	720307	720314	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1580	NC_004842	TCAC	2	8	720531	720538	25 %	25 %	0 %	50 %	161544987
1581	NC_004842	GCCC	2	8	720844	720851	0 %	0 %	25 %	75 %	161544987
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1584	NC_004842	GCAG	2	8	723403	723410	25 %	0 %	50 %	25 %	56416908
1585	NC_004842	AGCA	2	8	723484	723491	50 %	0 %	25 %	25 %	56416908
1586	NC_004842	TGCA	2	8	723658	723665	25 %	25 %	25 %	25 %	56416909
1587	NC_004842	TACC	2	8	723733	723740	25 %	25 %	0 %	50 %	56416909
1588	NC_004842	ATCC	2	8	724006	724013	25 %	25 %	0 %	50 %	56416909
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1591	NC_004842	TCAA	2	8	726120	726127	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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1595	NC_004842	TGGG	2	8	728418	728425	0 %	25 %	75 %	0 %	56416912
1596	NC_004842	CATC	2	8	729251	729258	25 %	25 %	0 %	50 %	56416912
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1598	NC_004842	GCAG	2	8	731939	731946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1599	NC_004842	CCCA	2	8	731979	731986	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
1600	NC_004842	GCAC	2	8	732546	732553	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1601	NC_004842	CGAA	2	8	732650	732657	50 %	0 %	25 %	25 %	56416916
1602	NC_004842	ATAG	2	8	732952	732959	50 %	25 %	25 %	0 %	56416916
1603	NC_004842	CCCT	2	8	733031	733038	0 %	25 %	0 %	75 %	56416916
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1616	NC_004842	TGAG	2	8	741099	741106	25 %	25 %	50 %	0 %	56416919
1617	NC_004842	CCAA	2	8	741645	741652	50 %	0 %	0 %	50 %	56416919
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1623	NC_004842	TCTT	2	8	745497	745504	0 %	75 %	0 %	25 %	56416920
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1629	NC_004842	TTCT	2	8	746684	746691	0 %	75 %	0 %	25 %	56416920
1630	NC_004842	TCAT	2	8	746895	746902	25 %	50 %	0 %	25 %	56416920
1631	NC_004842	CATG	2	8	747540	747547	25 %	25 %	25 %	25 %	56416921
1632	NC_004842	CAGT	2	8	747974	747981	25 %	25 %	25 %	25 %	56416921
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1997	NC_004842	CATC	2	8	902124	902131	25 %	25 %	0 %	50 %	56417063
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