MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 2668

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_004842	GCTC	2	8	1120330	1120337	0 %	25 %	25 %	50 %	56417247
2502	NC_004842	AGGA	2	8	1120639	1120646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_004842	ATCA	2	8	1120679	1120686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_004842	TTGG	2	8	1120930	1120937	0 %	50 %	50 %	0 %	56417248
2505	NC_004842	TTTC	2	8	1121208	1121215	0 %	75 %	0 %	25 %	56417248
2506	NC_004842	GCCA	2	8	1121392	1121399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2507	NC_004842	TCTG	2	8	1121704	1121711	0 %	50 %	25 %	25 %	56417249
2508	NC_004842	TGAG	2	8	1122006	1122013	25 %	25 %	50 %	0 %	56417249
2509	NC_004842	AGCA	2	8	1122510	1122517	50 %	0 %	25 %	25 %	56417250
2510	NC_004842	GAAC	2	8	1123430	1123437	50 %	0 %	25 %	25 %	56417251
2511	NC_004842	GATG	2	8	1123445	1123452	25 %	25 %	50 %	0 %	56417251
2512	NC_004842	GTAG	2	8	1123638	1123645	25 %	25 %	50 %	0 %	56417251
2513	NC_004842	AAGG	2	8	1123726	1123733	50 %	0 %	50 %	0 %	56417252
2514	NC_004842	ATAG	2	8	1123859	1123866	50 %	25 %	25 %	0 %	56417252
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2520	NC_004842	AGCA	2	8	1127476	1127483	50 %	0 %	25 %	25 %	56417256
2521	NC_004842	ATGG	2	8	1127749	1127756	25 %	25 %	50 %	0 %	56417256
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2523	NC_004842	CTCG	2	8	1129955	1129962	0 %	25 %	25 %	50 %	56417259
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2535	NC_004842	TGAG	2	8	1135224	1135231	25 %	25 %	50 %	0 %	56417264
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2559	NC_004842	ATGT	2	8	1144097	1144104	25 %	50 %	25 %	0 %	56417271
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2598	NC_004842	TAAC	2	8	1161097	1161104	50 %	25 %	0 %	25 %	56417289
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2613	NC_004842	AAGA	2	8	1168064	1168071	75 %	0 %	25 %	0 %	56417296
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2667	NC_004842	AAGT	2	8	1197363	1197370	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2668	NC_004842	ATAC	2	8	1197464	1197471	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.