MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 26686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000854	CCT	2	6	238662	238667	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3502	NC_000854	TCA	2	6	238674	238679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430999
3503	NC_000854	CGC	2	6	238809	238814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431000
3504	NC_000854	GAA	2	6	238885	238890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431000
3505	NC_000854	CTC	2	6	238979	238984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431000
3506	NC_000854	TCT	2	6	239100	239105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431000
3507	NC_000854	CTC	2	6	239152	239157	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431000
3508	NC_000854	CCT	2	6	239386	239391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431000
3509	NC_000854	CGA	2	6	239451	239456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431000
3510	NC_000854	CGC	2	6	239542	239547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431000
3511	NC_000854	AGA	2	6	239636	239641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431000
3512	NC_000854	CTT	2	6	239701	239706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431000
3513	NC_000854	CAC	2	6	239778	239783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431000
3514	NC_000854	GCG	2	6	239819	239824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_000854	CTC	2	6	239997	240002	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431001
3516	NC_000854	CGA	2	6	240167	240172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431001
3517	NC_000854	CTC	2	6	240201	240206	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431001
3518	NC_000854	GGT	2	6	240341	240346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431001
3519	NC_000854	TAG	2	6	240607	240612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600639
3520	NC_000854	CGA	2	6	240652	240657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600639
3521	NC_000854	GGC	2	6	240719	240724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600639
3522	NC_000854	GCG	2	6	240738	240743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600639
3523	NC_000854	AGT	2	6	240749	240754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600639
3524	NC_000854	ACC	2	6	240815	240820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600639
3525	NC_000854	CAT	2	6	240824	240829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431002
3526	NC_000854	GGC	2	6	240860	240865	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431002
3527	NC_000854	CAC	2	6	241035	241040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431002
3528	NC_000854	GCT	2	6	241054	241059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3529	NC_000854	AGG	2	6	241130	241135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3530	NC_000854	GAA	2	6	241195	241200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431002
3531	NC_000854	CTC	2	6	241351	241356	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431002
3532	NC_000854	GAG	2	6	241405	241410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3533	NC_000854	GTC	2	6	241429	241434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3534	NC_000854	TCC	2	6	241604	241609	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431002
3535	NC_000854	CCG	2	6	241914	241919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431002
3536	NC_000854	GGC	2	6	241943	241948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431002
3537	NC_000854	GCT	2	6	241987	241992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3538	NC_000854	GAG	2	6	242002	242007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3539	NC_000854	ATC	2	6	242018	242023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431002
3540	NC_000854	ACG	2	6	242303	242308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3541	NC_000854	GAC	2	6	242452	242457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3542	NC_000854	GGC	2	6	242470	242475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431002
3543	NC_000854	CTC	2	6	242584	242589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431002
3544	NC_000854	CTC	2	6	242681	242686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431002
3545	NC_000854	GTC	2	6	242752	242757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3546	NC_000854	CAA	2	6	242919	242924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431002
3547	NC_000854	CAA	2	6	242979	242984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431002
3548	NC_000854	GCC	2	6	243005	243010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431002
3549	NC_000854	TCG	3	9	243173	243181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3550	NC_000854	GCC	2	6	243253	243258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431002
3551	NC_000854	GAG	2	6	243280	243285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3552	NC_000854	TGC	2	6	243289	243294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431002
3553	NC_000854	GAG	2	6	243319	243324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3554	NC_000854	GAG	2	6	243334	243339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431002
3555	NC_000854	TAC	2	6	243346	243351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431002
3556	NC_000854	TAG	2	6	243582	243587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431003
3557	NC_000854	GGC	2	6	243622	243627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431003
3558	NC_000854	TTA	2	6	243746	243751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431003
3559	NC_000854	GGC	2	6	243891	243896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431003
3560	NC_000854	GCC	2	6	243952	243957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431003
3561	NC_000854	CGC	2	6	243974	243979	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431003
3562	NC_000854	CCT	2	6	243999	244004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431003
3563	NC_000854	GGA	2	6	244076	244081	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431003
3564	NC_000854	GTA	2	6	244127	244132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431003
3565	NC_000854	ATA	2	6	244224	244229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431003
3566	NC_000854	CAG	2	6	244245	244250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431003
3567	NC_000854	TCC	2	6	244387	244392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431003
3568	NC_000854	GTA	2	6	244431	244436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431003
3569	NC_000854	CCA	2	6	244489	244494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3570	NC_000854	GTG	2	6	244564	244569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3571	NC_000854	GGA	2	6	244796	244801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431004
3572	NC_000854	GAC	2	6	244821	244826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431004
3573	NC_000854	ACC	2	6	244837	244842	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431004
3574	NC_000854	GAG	2	6	245054	245059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431004
3575	NC_000854	TGG	2	6	245101	245106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431004
3576	NC_000854	GAG	2	6	245130	245135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431004
3577	NC_000854	AGG	2	6	245142	245147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431004
3578	NC_000854	CCG	2	6	245257	245262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431004
3579	NC_000854	TGC	2	6	245305	245310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431004
3580	NC_000854	GGC	2	6	245448	245453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431004
3581	NC_000854	CCT	2	6	245477	245482	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431004
3582	NC_000854	CCA	2	6	245509	245514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431004
3583	NC_000854	TCC	2	6	245533	245538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431004
3584	NC_000854	AGG	2	6	245600	245605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431004
3585	NC_000854	TAT	2	6	245664	245669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431004
3586	NC_000854	AAG	2	6	245702	245707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431004
3587	NC_000854	TGG	2	6	245725	245730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431004
3588	NC_000854	GTG	2	6	245817	245822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431004
3589	NC_000854	TAG	2	6	245946	245951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431004
3590	NC_000854	CTC	2	6	245975	245980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
3591	NC_000854	CGA	2	6	246055	246060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431005
3592	NC_000854	CGC	2	6	246067	246072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431005
3593	NC_000854	CTC	2	6	246107	246112	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
3594	NC_000854	ATG	2	6	246129	246134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431005
3595	NC_000854	CGG	2	6	246187	246192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431005
3596	NC_000854	CTG	2	6	246209	246214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431005
3597	NC_000854	GGA	2	6	246232	246237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
3598	NC_000854	ACC	2	6	246251	246256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431005
3599	NC_000854	TCT	2	6	246289	246294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431005
3600	NC_000854	TCC	2	6	246319	246324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
3601	NC_000854	GAG	2	6	246386	246391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
3602	NC_000854	CGT	2	6	246409	246414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431005
3603	NC_000854	GAG	2	6	246431	246436	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
3604	NC_000854	TCA	2	6	246492	246497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431005
3605	NC_000854	CCT	2	6	246517	246522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
3606	NC_000854	GGA	2	6	246584	246589	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
3607	NC_000854	GTA	2	6	246590	246595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431005
3608	NC_000854	CTG	2	6	246729	246734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431005
3609	NC_000854	GGA	2	6	246743	246748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431005
3610	NC_000854	TCC	2	6	246753	246758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431005
3611	NC_000854	GTA	2	6	246797	246802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431005
3612	NC_000854	GAA	2	6	246863	246868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431005
3613	NC_000854	GCC	2	6	246958	246963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431005
3614	NC_000854	CGT	2	6	247154	247159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431006
3615	NC_000854	TTG	2	6	247292	247297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431006
3616	NC_000854	GAA	2	6	247359	247364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431006
3617	NC_000854	GGA	2	6	247405	247410	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431006
3618	NC_000854	CCT	2	6	247415	247420	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431006
3619	NC_000854	AGT	2	6	247472	247477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431006
3620	NC_000854	AGT	2	6	247496	247501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431006
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3622	NC_000854	CTC	2	6	247609	247614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431006
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3657	NC_000854	TTA	2	6	249370	249375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3658	NC_000854	ATA	2	6	249385	249390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3659	NC_000854	TCA	2	6	249468	249473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431007
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3738	NC_000854	TGA	2	6	254313	254318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600654
3739	NC_000854	TAG	2	6	254576	254581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431009
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3741	NC_000854	ACG	2	6	254753	254758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431009
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