MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 26686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_000854	AGG	2	6	206630	206635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_000854	AGA	2	6	206654	206659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_000854	ACT	2	6	206705	206710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_000854	CAG	2	6	206728	206733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_000854	CAG	2	6	206755	206760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3006	NC_000854	TCA	2	6	206800	206805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_000854	GGA	2	6	206853	206858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3008	NC_000854	AAG	3	9	206921	206929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430976
3009	NC_000854	GCA	2	6	206932	206937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430976
3010	NC_000854	GCC	2	6	206953	206958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430976
3011	NC_000854	TAG	2	6	206991	206996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430976
3012	NC_000854	AAG	2	6	207296	207301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430976
3013	NC_000854	GAT	2	6	207376	207381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430976
3014	NC_000854	GAT	2	6	207398	207403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430976
3015	NC_000854	GAC	2	6	207458	207463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430976
3016	NC_000854	GCA	2	6	207484	207489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430976
3017	NC_000854	CGG	2	6	207624	207629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430976
3018	NC_000854	CCT	2	6	207763	207768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430976
3019	NC_000854	CGC	2	6	207774	207779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430976
3020	NC_000854	CTC	2	6	207863	207868	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430976
3021	NC_000854	GGA	2	6	208014	208019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3022	NC_000854	TCG	2	6	208041	208046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430976
3023	NC_000854	CGC	2	6	208084	208089	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430976
3024	NC_000854	GAC	2	6	208112	208117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430976
3025	NC_000854	TCC	2	6	208185	208190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430976
3026	NC_000854	TCA	2	6	208194	208199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430976
3027	NC_000854	CAT	2	6	208261	208266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430976
3028	NC_000854	AGC	2	6	208269	208274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430976
3029	NC_000854	AGG	2	6	208383	208388	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3030	NC_000854	GGA	2	6	208399	208404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3031	NC_000854	GGA	2	6	208458	208463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3032	NC_000854	CTC	2	6	208490	208495	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430976
3033	NC_000854	GAG	2	6	208571	208576	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3034	NC_000854	GGA	2	6	208606	208611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3035	NC_000854	AGG	2	6	208637	208642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3036	NC_000854	GGA	2	6	208651	208656	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3037	NC_000854	GTG	2	6	208667	208672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430976
3038	NC_000854	AGG	2	6	208673	208678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3039	NC_000854	AGG	2	6	208725	208730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3040	NC_000854	GCC	2	6	208748	208753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430976
3041	NC_000854	GAG	2	6	208822	208827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430976
3042	NC_000854	TCG	2	6	208850	208855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_000854	ACC	2	6	208883	208888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_000854	AGG	2	6	209040	209045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3045	NC_000854	GAT	2	6	209071	209076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_000854	AAT	2	6	209132	209137	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3047	NC_000854	AAC	2	6	209147	209152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3048	NC_000854	CGA	2	6	209164	209169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3049	NC_000854	GAG	2	6	209215	209220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_000854	CCT	2	6	209376	209381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430977
3051	NC_000854	CTC	2	6	209386	209391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430977
3052	NC_000854	TAT	2	6	209520	209525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_000854	GAG	2	6	209610	209615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_000854	GAT	2	6	209715	209720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3055	NC_000854	TTC	2	6	209733	209738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3056	NC_000854	CAG	2	6	209791	209796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3057	NC_000854	TCA	2	6	209801	209806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_000854	GGC	2	6	209849	209854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3059	NC_000854	TAT	2	6	209865	209870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_000854	ATC	2	6	209889	209894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_000854	TTC	2	6	209918	209923	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_000854	GTT	2	6	209927	209932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_000854	GTT	2	6	209971	209976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_000854	TCT	2	6	210065	210070	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600601
3065	NC_000854	GAA	2	6	210071	210076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600601
3066	NC_000854	AAG	2	6	210114	210119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600601
3067	NC_000854	CTA	2	6	210200	210205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600601
3068	NC_000854	CAT	2	6	210348	210353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600601
3069	NC_000854	AAG	2	6	210360	210365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600601
3070	NC_000854	AGT	2	6	210521	210526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600601
3071	NC_000854	GAA	2	6	210634	210639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_000854	ACT	2	6	210641	210646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_000854	GAC	2	6	210676	210681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600602
3074	NC_000854	TAT	2	6	210791	210796	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600602
3075	NC_000854	CTC	2	6	210809	210814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600602
3076	NC_000854	ACC	2	6	210818	210823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600602
3077	NC_000854	CAG	2	6	210831	210836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600602
3078	NC_000854	AGC	2	6	210860	210865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600602
3079	NC_000854	CTC	2	6	211063	211068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600602
3080	NC_000854	CTA	2	6	211173	211178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600602
3081	NC_000854	CTG	2	6	211186	211191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600602
3082	NC_000854	GTA	2	6	211670	211675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430978
3083	NC_000854	CAA	2	6	211723	211728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430978
3084	NC_000854	TCA	2	6	211869	211874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430978
3085	NC_000854	CCT	2	6	211888	211893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430978
3086	NC_000854	CCT	2	6	211913	211918	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430978
3087	NC_000854	CGC	2	6	211924	211929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430978
3088	NC_000854	ATA	3	9	211972	211980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_000854	CAG	2	6	212049	212054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_000854	AGG	3	9	212079	212087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430979
3091	NC_000854	CTT	2	6	212127	212132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430979
3092	NC_000854	CGA	2	6	212142	212147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430979
3093	NC_000854	TCC	2	6	212190	212195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430979
3094	NC_000854	CCT	2	6	212333	212338	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600604
3095	NC_000854	TCC	2	6	212341	212346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600604
3096	NC_000854	CTC	2	6	212396	212401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600604
3097	NC_000854	ACA	2	6	212472	212477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600604
3098	NC_000854	TAT	2	6	212605	212610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3099	NC_000854	TGC	2	6	212671	212676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_000854	GCG	2	6	212803	212808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430980
3101	NC_000854	GTA	2	6	212841	212846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430980
3102	NC_000854	GCG	2	6	212884	212889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430980
3103	NC_000854	TCC	2	6	212927	212932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430980
3104	NC_000854	GCC	2	6	212941	212946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430980
3105	NC_000854	GGT	2	6	213145	213150	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600606
3106	NC_000854	AGC	2	6	213219	213224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600606
3107	NC_000854	CTA	2	6	213255	213260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600606
3108	NC_000854	AAG	2	6	213281	213286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600606
3109	NC_000854	GCT	2	6	213336	213341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3110	NC_000854	AGA	2	6	213365	213370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3111	NC_000854	CAG	2	6	213424	213429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_000854	TGG	2	6	213597	213602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430981
3113	NC_000854	GGC	2	6	213659	213664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430981
3114	NC_000854	GAG	2	6	213695	213700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430981
3115	NC_000854	AGT	2	6	213793	213798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430981
3116	NC_000854	GTT	2	6	213806	213811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430981
3117	NC_000854	GAT	2	6	213851	213856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430981
3118	NC_000854	TAA	2	6	213990	213995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430981
3119	NC_000854	ACC	2	6	214009	214014	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430981
3120	NC_000854	GCC	2	6	214161	214166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600608
3121	NC_000854	CTC	2	6	214218	214223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600608
3122	NC_000854	GTA	2	6	214227	214232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600608
3123	NC_000854	CAA	2	6	214502	214507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600608
3124	NC_000854	GGA	2	6	214647	214652	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600608
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3127	NC_000854	TCC	2	6	215005	215010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430982
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3130	NC_000854	TCC	2	6	215134	215139	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430982
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3132	NC_000854	CTA	2	6	215189	215194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600610
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3134	NC_000854	CCT	2	6	215259	215264	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600610
3135	NC_000854	GCC	2	6	215443	215448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600610
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3140	NC_000854	CCG	2	6	215560	215565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3141	NC_000854	CTC	2	6	215719	215724	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430983
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3152	NC_000854	CTG	2	6	216739	216744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430984
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3231	NC_000854	TGA	2	6	223116	223121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3232	NC_000854	TAT	2	6	223199	223204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3233	NC_000854	TGC	2	6	223293	223298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3234	NC_000854	ATA	2	6	223337	223342	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3235	NC_000854	GGC	2	6	223573	223578	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430988
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3245	NC_000854	CTA	2	6	224203	224208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430988
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3484	NC_000854	GCC	2	6	237675	237680	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430998
3485	NC_000854	CCT	3	9	237731	237739	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430998
3486	NC_000854	CTG	2	6	237814	237819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430998
3487	NC_000854	ACC	2	6	237868	237873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3488	NC_000854	AGC	2	6	237885	237890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3489	NC_000854	GGA	2	6	238012	238017	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3490	NC_000854	GTA	2	6	238182	238187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3491	NC_000854	CTT	2	6	238206	238211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430999
3492	NC_000854	TCC	2	6	238319	238324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3493	NC_000854	CTC	3	9	238411	238419	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3494	NC_000854	TCC	2	6	238445	238450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3495	NC_000854	AAC	2	6	238474	238479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430999
3496	NC_000854	CTC	2	6	238517	238522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430999
3497	NC_000854	CTT	2	6	238536	238541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430999
3498	NC_000854	TCT	2	6	238545	238550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430999
3499	NC_000854	GTA	2	6	238606	238611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430999
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