MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 26686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_000854	ATA	2	6	329581	329586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600738
5002	NC_000854	ACC	2	6	329596	329601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600738
5003	NC_000854	TCC	2	6	329644	329649	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600738
5004	NC_000854	CTC	2	6	329675	329680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431065
5005	NC_000854	AGC	2	6	329742	329747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431065
5006	NC_000854	CAA	2	6	329848	329853	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5007	NC_000854	GAA	2	6	329882	329887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431066
5008	NC_000854	CTA	2	6	329962	329967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431066
5009	NC_000854	AAT	2	6	330017	330022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431066
5010	NC_000854	CGC	2	6	330025	330030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431066
5011	NC_000854	CAC	2	6	330067	330072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_000854	ACC	2	6	330078	330083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_000854	TTG	2	6	330161	330166	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431067
5014	NC_000854	CCG	2	6	330198	330203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431067
5015	NC_000854	GCG	2	6	330211	330216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431067
5016	NC_000854	GAC	2	6	330231	330236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431067
5017	NC_000854	ATT	2	6	330263	330268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431067
5018	NC_000854	TGG	3	9	330271	330279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431067
5019	NC_000854	CTC	2	6	330485	330490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431068
5020	NC_000854	GCC	2	6	330518	330523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431068
5021	NC_000854	AGC	2	6	330614	330619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431068
5022	NC_000854	GAG	2	6	330652	330657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431068
5023	NC_000854	CTG	2	6	330682	330687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431068
5024	NC_000854	CTC	2	6	330740	330745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431068
5025	NC_000854	GGC	2	6	330796	330801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431068
5026	NC_000854	GTC	3	9	330907	330915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431068
5027	NC_000854	CCT	2	6	330999	331004	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431068
5028	NC_000854	GGC	2	6	331081	331086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431068
5029	NC_000854	GCT	2	6	331210	331215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431068
5030	NC_000854	CCT	2	6	331234	331239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431068
5031	NC_000854	CAC	2	6	331242	331247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431068
5032	NC_000854	GCA	2	6	331343	331348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5033	NC_000854	AGG	2	6	331361	331366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_000854	GGA	2	6	331449	331454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5035	NC_000854	CGG	2	6	331463	331468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431069
5036	NC_000854	AGG	2	6	331555	331560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5037	NC_000854	CTC	2	6	331612	331617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431069
5038	NC_000854	GAG	2	6	331665	331670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5039	NC_000854	CAT	2	6	331866	331871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431069
5040	NC_000854	TCC	2	6	331892	331897	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431069
5041	NC_000854	TAG	2	6	331979	331984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431069
5042	NC_000854	TCG	2	6	332006	332011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431069
5043	NC_000854	AGC	2	6	332035	332040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431069
5044	NC_000854	CGC	2	6	332078	332083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431069
5045	NC_000854	GAG	2	6	332113	332118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5046	NC_000854	GCC	2	6	332164	332169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431069
5047	NC_000854	GAG	2	6	332196	332201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5048	NC_000854	CCT	2	6	332211	332216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431069
5049	NC_000854	GAG	3	9	332241	332249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5050	NC_000854	GGA	2	6	332250	332255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5051	NC_000854	AGG	2	6	332263	332268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5052	NC_000854	GGT	2	6	332319	332324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431069
5053	NC_000854	ATG	2	6	332368	332373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431069
5054	NC_000854	GGA	2	6	332376	332381	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5055	NC_000854	GAG	2	6	332466	332471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5056	NC_000854	TAT	2	6	332481	332486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431069
5057	NC_000854	GTG	2	6	332524	332529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431069
5058	NC_000854	GGA	2	6	332604	332609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431069
5059	NC_000854	GAC	2	6	332717	332722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431070
5060	NC_000854	GCT	2	6	332885	332890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431070
5061	NC_000854	AGG	2	6	333087	333092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431070
5062	NC_000854	CTG	2	6	333093	333098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431070
5063	NC_000854	AGG	2	6	333161	333166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431070
5064	NC_000854	GCC	2	6	333265	333270	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431070
5065	NC_000854	GCG	2	6	333272	333277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431071
5066	NC_000854	CCT	2	6	333322	333327	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431071
5067	NC_000854	GAC	2	6	333337	333342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431071
5068	NC_000854	GCG	2	6	333413	333418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431071
5069	NC_000854	CGT	2	6	333721	333726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431072
5070	NC_000854	CCT	2	6	333749	333754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431072
5071	NC_000854	TCC	2	6	333801	333806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431072
5072	NC_000854	TGT	2	6	333988	333993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118431072
5073	NC_000854	GGA	2	6	334025	334030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431072
5074	NC_000854	CTC	2	6	334037	334042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431072
5075	NC_000854	AGC	2	6	334149	334154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431072
5076	NC_000854	CCT	2	6	334265	334270	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431072
5077	NC_000854	TCT	2	6	334276	334281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431072
5078	NC_000854	CCT	2	6	334288	334293	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431072
5079	NC_000854	GCC	2	6	334494	334499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431072
5080	NC_000854	AAT	2	6	334505	334510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431072
5081	NC_000854	AGA	2	6	334591	334596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431072
5082	NC_000854	CCA	2	6	334666	334671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431072
5083	NC_000854	TTA	2	6	334883	334888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_000854	GCC	2	6	334951	334956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5085	NC_000854	CGG	2	6	334963	334968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_000854	CCA	2	6	334996	335001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_000854	TGA	2	6	335036	335041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431073
5088	NC_000854	ACG	2	6	335059	335064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431073
5089	NC_000854	AGG	2	6	335113	335118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431073
5090	NC_000854	CTA	2	6	335168	335173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431073
5091	NC_000854	GCC	2	6	335382	335387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5092	NC_000854	TTG	2	6	335406	335411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600747
5093	NC_000854	CGT	2	6	335486	335491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600747
5094	NC_000854	CGC	2	6	335588	335593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600747
5095	NC_000854	TAT	2	6	335598	335603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600747
5096	NC_000854	CTC	2	6	335701	335706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600747
5097	NC_000854	GCG	2	6	335743	335748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600747
5098	NC_000854	AGC	2	6	335751	335756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600747
5099	NC_000854	AGC	2	6	335874	335879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600747
5100	NC_000854	TGT	2	6	335912	335917	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600747
5101	NC_000854	CAA	2	6	335963	335968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600747
5102	NC_000854	GGC	2	6	336033	336038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600747
5103	NC_000854	CTC	2	6	336039	336044	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600747
5104	NC_000854	ACC	2	6	336112	336117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600747
5105	NC_000854	CTC	2	6	336171	336176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600747
5106	NC_000854	TCC	2	6	336394	336399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600747
5107	NC_000854	TCC	2	6	336449	336454	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600747
5108	NC_000854	TTG	2	6	336496	336501	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600747
5109	NC_000854	GTC	2	6	336556	336561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600747
5110	NC_000854	CTC	2	6	336603	336608	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600747
5111	NC_000854	CGC	2	6	336635	336640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600747
5112	NC_000854	CCT	2	6	336643	336648	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600747
5113	NC_000854	TGC	2	6	336665	336670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600747
5114	NC_000854	ATC	2	6	336673	336678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600747
5115	NC_000854	ATT	2	6	336745	336750	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_000854	CAT	2	6	336804	336809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431074
5117	NC_000854	TCA	2	6	336872	336877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431074
5118	NC_000854	GCG	2	6	336917	336922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431074
5119	NC_000854	TCT	2	6	336929	336934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431074
5120	NC_000854	AAT	2	6	336939	336944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431074
5121	NC_000854	CTG	2	6	336967	336972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431074
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