MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 2545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022784	TTTG	2	8	722	729	0 %	75 %	25 %	0 %	557625307
2	NC_022784	TGAC	2	8	1934	1941	25 %	25 %	25 %	25 %	557625307
3	NC_022784	GCCA	2	8	2706	2713	25 %	0 %	25 %	50 %	557625309
4	NC_022784	ATGA	2	8	3049	3056	50 %	25 %	25 %	0 %	557625309
5	NC_022784	GGTG	2	8	3601	3608	0 %	25 %	75 %	0 %	557625310
6	NC_022784	AAGA	3	12	4638	4649	75 %	0 %	25 %	0 %	557625311
7	NC_022784	GCAA	2	8	5023	5030	50 %	0 %	25 %	25 %	557626111
8	NC_022784	GGCT	3	12	5717	5728	0 %	25 %	50 %	25 %	557625312
9	NC_022784	CGGA	2	8	7032	7039	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_022784	ACGT	2	8	7076	7083	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_022784	TCCG	2	8	7112	7119	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_022784	GTTG	2	8	8047	8054	0 %	50 %	50 %	0 %	557625314
13	NC_022784	GCGG	2	8	8210	8217	0 %	0 %	75 %	25 %	557625314
14	NC_022784	CCCA	2	8	9517	9524	25 %	0 %	0 %	75 %	557625315
15	NC_022784	GCTC	2	8	9601	9608	0 %	25 %	25 %	50 %	557625316
16	NC_022784	CACG	2	8	9904	9911	25 %	0 %	25 %	50 %	557625316
17	NC_022784	CCAC	2	8	10080	10087	25 %	0 %	0 %	75 %	557625316
18	NC_022784	CTTC	2	8	10118	10125	0 %	50 %	0 %	50 %	557625316
19	NC_022784	ACAA	2	8	10856	10863	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_022784	CATG	2	8	10869	10876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_022784	TCCG	2	8	11301	11308	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
22	NC_022784	TTTG	2	8	11375	11382	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_022784	TCGT	2	8	11991	11998	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_022784	CATA	2	8	12228	12235	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_022784	TCCA	2	8	12288	12295	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_022784	CCAC	2	8	12377	12384	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_022784	GCAA	2	8	13060	13067	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_022784	CCCG	2	8	13329	13336	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
29	NC_022784	CTCA	2	8	13391	13398	25 %	25 %	0 %	50 %	557625317
30	NC_022784	GTGG	2	8	14050	14057	0 %	25 %	75 %	0 %	557625318
31	NC_022784	TTCA	2	8	14963	14970	25 %	50 %	0 %	25 %	557625319
32	NC_022784	CGGT	2	8	15326	15333	0 %	25 %	50 %	25 %	557625320
33	NC_022784	GCGT	2	8	16837	16844	0 %	25 %	50 %	25 %	557625321
34	NC_022784	CTGT	2	8	17020	17027	0 %	50 %	25 %	25 %	557625321
35	NC_022784	GGCG	2	8	17335	17342	0 %	0 %	75 %	25 %	557625321
36	NC_022784	CTGT	2	8	17398	17405	0 %	50 %	25 %	25 %	557625321
37	NC_022784	CACC	2	8	17507	17514	25 %	0 %	0 %	75 %	557625321
38	NC_022784	AAAG	2	8	17671	17678	75 %	0 %	25 %	0 %	557625321
39	NC_022784	TCGA	2	8	18936	18943	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_022784	CAGG	2	8	19802	19809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
41	NC_022784	TGCG	2	8	20368	20375	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_022784	AAAC	2	8	20866	20873	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_022784	GGCA	2	8	20916	20923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_022784	AAGG	2	8	20933	20940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022784	GTAT	2	8	21530	21537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022784	GTTC	2	8	21753	21760	0 %	50 %	25 %	25 %	557625322
47	NC_022784	TTGG	2	8	21862	21869	0 %	50 %	50 %	0 %	557625322
48	NC_022784	GGTG	2	8	22122	22129	0 %	25 %	75 %	0 %	557625322
49	NC_022784	CAAC	2	8	23844	23851	50 %	0 %	0 %	50 %	557625325
50	NC_022784	GGAT	2	8	25069	25076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022784	TTGG	2	8	25739	25746	0 %	50 %	50 %	0 %	557625327
52	NC_022784	TTGC	2	8	25964	25971	0 %	50 %	25 %	25 %	557625327
53	NC_022784	AGCA	2	8	26155	26162	50 %	0 %	25 %	25 %	557625327
54	NC_022784	AAGC	2	8	26698	26705	50 %	0 %	25 %	25 %	557625327
55	NC_022784	TATG	2	8	27478	27485	25 %	50 %	25 %	0 %	557625327
56	NC_022784	GTTC	2	8	27505	27512	0 %	50 %	25 %	25 %	557625327
57	NC_022784	TTGT	2	8	27617	27624	0 %	75 %	25 %	0 %	557625327
58	NC_022784	TGGC	2	8	27797	27804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_022784	ACTG	2	8	27805	27812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_022784	AGGC	2	8	29215	29222	25 %	0 %	50 %	25 %	557625330
61	NC_022784	CGTG	2	8	29382	29389	0 %	25 %	50 %	25 %	557625330
62	NC_022784	GCTG	2	8	29721	29728	0 %	25 %	50 %	25 %	557625331
63	NC_022784	GGAA	2	8	29806	29813	50 %	0 %	50 %	0 %	557625331
64	NC_022784	TGGC	2	8	29831	29838	0 %	25 %	50 %	25 %	557625331
65	NC_022784	TCGT	2	8	30240	30247	0 %	50 %	25 %	25 %	557625331
66	NC_022784	GCTT	2	8	30294	30301	0 %	50 %	25 %	25 %	557625331
67	NC_022784	GGGT	2	8	30369	30376	0 %	25 %	75 %	0 %	557625331
68	NC_022784	AGCG	2	8	30766	30773	25 %	0 %	50 %	25 %	557625331
69	NC_022784	GTTG	2	8	31185	31192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
70	NC_022784	TCGC	2	8	31265	31272	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_022784	TGAG	2	8	31967	31974	25 %	25 %	50 %	0 %	557625332
72	NC_022784	CGGC	2	8	32698	32705	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_022784	CAGT	2	8	32872	32879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_022784	AATT	2	8	35506	35513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_022784	CAGC	2	8	35670	35677	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_022784	CATC	2	8	37244	37251	25 %	25 %	0 %	50 %	557625333
77	NC_022784	GTGA	2	8	37288	37295	25 %	25 %	50 %	0 %	557625333
78	NC_022784	CTTC	2	8	37451	37458	0 %	50 %	0 %	50 %	557625333
79	NC_022784	TCTT	2	8	37762	37769	0 %	75 %	0 %	25 %	557625333
80	NC_022784	TGCT	2	8	38012	38019	0 %	50 %	25 %	25 %	557625333
81	NC_022784	CCCT	2	8	38240	38247	0 %	25 %	0 %	75 %	557625333
82	NC_022784	AAGC	2	8	38372	38379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_022784	TGAG	2	8	40097	40104	25 %	25 %	50 %	0 %	557625336
84	NC_022784	CTGC	2	8	40366	40373	0 %	25 %	25 %	50 %	557625337
85	NC_022784	TGAG	2	8	40439	40446	25 %	25 %	50 %	0 %	557625337
86	NC_022784	CGGC	2	8	40575	40582	0 %	0 %	50 %	50 %	557625337
87	NC_022784	GGGC	2	8	41299	41306	0 %	0 %	75 %	25 %	557625338
88	NC_022784	ACAA	2	8	41691	41698	75 %	0 %	0 %	25 %	557625338
89	NC_022784	AAAG	2	8	43118	43125	75 %	0 %	25 %	0 %	557625339
90	NC_022784	GCAG	2	8	43389	43396	25 %	0 %	50 %	25 %	557625339
91	NC_022784	CCAG	2	8	43662	43669	25 %	0 %	25 %	50 %	557625340
92	NC_022784	TAGG	2	8	44083	44090	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_022784	AGGC	2	8	44521	44528	25 %	0 %	50 %	25 %	557625341
94	NC_022784	AGGA	2	8	45396	45403	50 %	0 %	50 %	0 %	557625341
95	NC_022784	GACT	2	8	45429	45436	25 %	25 %	25 %	25 %	557625341
96	NC_022784	CGCA	2	8	45497	45504	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_022784	TCAG	2	8	45997	46004	25 %	25 %	25 %	25 %	557626112
98	NC_022784	AATT	2	8	46170	46177	50 %	50 %	0 %	0 %	557626112
99	NC_022784	TACT	2	8	47628	47635	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_022784	CTAG	2	8	47784	47791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_022784	CCTA	2	8	47999	48006	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_022784	GTGA	2	8	49247	49254	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_022784	GCAG	2	8	49933	49940	25 %	0 %	50 %	25 %	557625343
104	NC_022784	GTTG	2	8	50047	50054	0 %	50 %	50 %	0 %	557625343
105	NC_022784	AGCA	2	8	50167	50174	50 %	0 %	25 %	25 %	557625343
106	NC_022784	GCTG	2	8	50365	50372	0 %	25 %	50 %	25 %	557625343
107	NC_022784	AGGG	2	8	50390	50397	25 %	0 %	75 %	0 %	557625343
108	NC_022784	AGTC	2	8	51676	51683	25 %	25 %	25 %	25 %	557625345
109	NC_022784	CGGG	2	8	52609	52616	0 %	0 %	75 %	25 %	557625345
110	NC_022784	CGTA	2	8	52858	52865	25 %	25 %	25 %	25 %	557625345
111	NC_022784	TCTG	2	8	52877	52884	0 %	50 %	25 %	25 %	557625345
112	NC_022784	ATTT	2	8	53029	53036	25 %	75 %	0 %	0 %	557625345
113	NC_022784	ACGC	2	8	53476	53483	25 %	0 %	25 %	50 %	557625345
114	NC_022784	ATGC	2	8	53638	53645	25 %	25 %	25 %	25 %	557625345
115	NC_022784	ACAA	2	8	54090	54097	75 %	0 %	0 %	25 %	557625345
116	NC_022784	CCTT	2	8	54651	54658	0 %	50 %	0 %	50 %	557625345
117	NC_022784	CCGC	2	8	54993	55000	0 %	0 %	25 %	75 %	557625345
118	NC_022784	GTAC	2	8	55536	55543	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_022784	AACC	2	8	55857	55864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_022784	ACAG	2	8	56596	56603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_022784	GCAC	2	8	57081	57088	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_022784	CGCA	2	8	57500	57507	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
123	NC_022784	CCAT	2	8	57555	57562	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_022784	TGGG	2	8	57872	57879	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
125	NC_022784	TGGC	2	8	58835	58842	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_022784	ACAG	2	8	59467	59474	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_022784	ATGA	2	8	59668	59675	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_022784	AGTG	2	8	62618	62625	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
129	NC_022784	GGTA	2	8	62661	62668	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_022784	GTAG	2	8	63084	63091	25 %	25 %	50 %	0 %	557625348
131	NC_022784	CTAG	2	8	63171	63178	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_022784	GTTG	2	8	63273	63280	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022784	GACT	2	8	64219	64226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_022784	ACCC	2	8	64476	64483	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
135	NC_022784	CACC	2	8	64755	64762	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
136	NC_022784	CCAA	2	8	64994	65001	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
137	NC_022784	CACT	2	8	65033	65040	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_022784	AATT	2	8	65669	65676	50 %	50 %	0 %	0 %	557626113
139	NC_022784	CTAT	2	8	65839	65846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_022784	TACT	2	8	66986	66993	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_022784	CACT	2	8	67477	67484	25 %	25 %	0 %	50 %	557626114
142	NC_022784	GTGA	2	8	68816	68823	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_022784	AAGA	2	8	69028	69035	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_022784	GAAA	2	8	70186	70193	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_022784	GCAT	2	8	71822	71829	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_022784	CATA	2	8	72246	72253	50 %	25 %	0 %	25 %	557625354
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148	NC_022784	GAAG	2	8	73617	73624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
149	NC_022784	GTAA	2	8	73804	73811	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_022784	AATT	2	8	75248	75255	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_022784	TACG	2	8	76464	76471	25 %	25 %	25 %	25 %	557625355
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163	NC_022784	GAAT	2	8	81372	81379	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
164	NC_022784	AAGA	2	8	81384	81391	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_022784	TGCT	2	8	84191	84198	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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171	NC_022784	GGTG	2	8	84428	84435	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
172	NC_022784	GAAG	2	8	84621	84628	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_022784	CTGT	2	8	97435	97442	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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