MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Anaplasma marginale str. Gypsy Plains genome

Total Repeats: 2545

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022784	GTTT	2	8	484149	484156	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_022784	GCGT	2	8	485317	485324	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1003	NC_022784	AGTG	2	8	485516	485523	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_022784	AGCT	2	8	486048	486055	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1005	NC_022784	GTGG	2	8	486389	486396	0 %	25 %	75 %	0 %	557625616
1006	NC_022784	AAGG	2	8	486973	486980	50 %	0 %	50 %	0 %	557625617
1007	NC_022784	CGAA	2	8	487284	487291	50 %	0 %	25 %	25 %	557625617
1008	NC_022784	TGAG	2	8	487699	487706	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_022784	CGAG	2	8	488719	488726	25 %	0 %	50 %	25 %	557625619
1010	NC_022784	GTTT	2	8	488926	488933	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_022784	CTGT	2	8	489188	489195	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1012	NC_022784	TCTT	2	8	489437	489444	0 %	75 %	0 %	25 %	557625620
1013	NC_022784	GCTG	2	8	489523	489530	0 %	25 %	50 %	25 %	557625620
1014	NC_022784	ATGC	2	8	489999	490006	25 %	25 %	25 %	25 %	557625620
1015	NC_022784	CGCC	2	8	490812	490819	0 %	0 %	25 %	75 %	557625621
1016	NC_022784	TCAA	2	8	490882	490889	50 %	25 %	0 %	25 %	557625621
1017	NC_022784	GCAT	2	8	491292	491299	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1018	NC_022784	TCTT	2	8	491361	491368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1019	NC_022784	GGCA	2	8	492875	492882	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1020	NC_022784	ATGA	2	8	493582	493589	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_022784	TGGA	2	8	493745	493752	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_022784	TAGT	2	8	493895	493902	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_022784	AAGC	2	8	496231	496238	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1024	NC_022784	AAAT	2	8	496508	496515	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_022784	GTGG	2	8	497128	497135	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_022784	GCAT	2	8	497186	497193	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1027	NC_022784	GTGA	2	8	497389	497396	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_022784	CAGG	2	8	497988	497995	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1029	NC_022784	AGTG	2	8	498183	498190	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_022784	TGGT	2	8	498506	498513	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_022784	CAGG	2	8	498747	498754	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1032	NC_022784	CGTG	2	8	499086	499093	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_022784	ATGA	2	8	499334	499341	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_022784	TTCG	2	8	500610	500617	0 %	50 %	25 %	25 %	557625622
1035	NC_022784	CTCA	2	8	501022	501029	25 %	25 %	0 %	50 %	557625622
1036	NC_022784	GACG	2	8	504007	504014	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1037	NC_022784	CATT	2	8	504364	504371	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1038	NC_022784	CGGC	2	8	504492	504499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1039	NC_022784	GTTT	2	8	504592	504599	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_022784	GTGG	2	8	504656	504663	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_022784	ATGC	2	8	505231	505238	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1042	NC_022784	GCAA	2	8	505248	505255	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1043	NC_022784	CTAT	2	8	505275	505282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1044	NC_022784	ATGA	2	8	505427	505434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_022784	GCTC	2	8	506090	506097	0 %	25 %	25 %	50 %	557625624
1046	NC_022784	ATGC	2	8	506353	506360	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1047	NC_022784	TATT	2	8	506514	506521	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_022784	CCTT	2	8	506610	506617	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1049	NC_022784	GCAA	2	8	507588	507595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1050	NC_022784	GAGC	2	8	507880	507887	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1051	NC_022784	CGCA	2	8	507975	507982	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_022784	CAGG	2	8	508078	508085	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1053	NC_022784	GACC	2	8	508404	508411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1054	NC_022784	AACT	2	8	508819	508826	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1055	NC_022784	TGAA	2	8	508832	508839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_022784	TGTT	2	8	509683	509690	0 %	75 %	25 %	0 %	557625625
1057	NC_022784	TGAA	2	8	511052	511059	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_022784	ACGT	2	8	511065	511072	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1059	NC_022784	GAGT	2	8	511643	511650	25 %	25 %	50 %	0 %	557625626
1060	NC_022784	TTGC	2	8	512004	512011	0 %	50 %	25 %	25 %	557625626
1061	NC_022784	GATG	2	8	512546	512553	25 %	25 %	50 %	0 %	557625626
1062	NC_022784	TAAG	2	8	512783	512790	50 %	25 %	25 %	0 %	557625626
1063	NC_022784	GTAC	2	8	513108	513115	25 %	25 %	25 %	25 %	557625626
1064	NC_022784	TACA	2	8	513723	513730	50 %	25 %	0 %	25 %	557625627
1065	NC_022784	GTAT	2	8	514151	514158	25 %	50 %	25 %	0 %	557625627
1066	NC_022784	CGGG	2	8	514206	514213	0 %	0 %	75 %	25 %	557625627
1067	NC_022784	TTAA	2	8	514347	514354	50 %	50 %	0 %	0 %	557625627
1068	NC_022784	TCGG	2	8	514437	514444	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_022784	GCGG	2	8	515334	515341	0 %	0 %	75 %	25 %	557625628
1070	NC_022784	CGAT	2	8	515550	515557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1071	NC_022784	CGAG	2	8	516028	516035	25 %	0 %	50 %	25 %	557625629
1072	NC_022784	TATT	2	8	516130	516137	25 %	75 %	0 %	0 %	557625629
1073	NC_022784	TTCA	2	8	517460	517467	25 %	50 %	0 %	25 %	557625630
1074	NC_022784	CGGC	2	8	517593	517600	0 %	0 %	50 %	50 %	557625630
1075	NC_022784	TGCC	2	8	517701	517708	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1076	NC_022784	ACGG	2	8	517798	517805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1077	NC_022784	GCAA	2	8	517822	517829	50 %	0 %	25 %	25 %	557625631
1078	NC_022784	TGTA	2	8	518149	518156	25 %	50 %	25 %	0 %	557625631
1079	NC_022784	TTGC	2	8	519832	519839	0 %	50 %	25 %	25 %	557625633
1080	NC_022784	AGGA	2	8	519874	519881	50 %	0 %	50 %	0 %	557625633
1081	NC_022784	AATG	2	8	519921	519928	50 %	25 %	25 %	0 %	557625633
1082	NC_022784	GTGC	2	8	520258	520265	0 %	25 %	50 %	25 %	557625633
1083	NC_022784	GGTA	2	8	520927	520934	25 %	25 %	50 %	0 %	557625634
1084	NC_022784	AAGG	2	8	521152	521159	50 %	0 %	50 %	0 %	557625634
1085	NC_022784	TCCC	2	8	521375	521382	0 %	25 %	0 %	75 %	557625634
1086	NC_022784	TGCG	2	8	521574	521581	0 %	25 %	50 %	25 %	557625634
1087	NC_022784	GCCC	2	8	522029	522036	0 %	0 %	25 %	75 %	557625635
1088	NC_022784	GGGA	2	8	522687	522694	25 %	0 %	75 %	0 %	557625637
1089	NC_022784	CCGC	2	8	523028	523035	0 %	0 %	25 %	75 %	557625637
1090	NC_022784	TGTT	2	8	523385	523392	0 %	75 %	25 %	0 %	557625637
1091	NC_022784	AGCA	2	8	523572	523579	50 %	0 %	25 %	25 %	557625637
1092	NC_022784	AGAA	2	8	524103	524110	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_022784	CGTG	2	8	524281	524288	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_022784	TGGG	2	8	525836	525843	0 %	25 %	75 %	0 %	557625639
1095	NC_022784	ACGC	2	8	526239	526246	25 %	0 %	25 %	50 %	557625640
1096	NC_022784	TTTC	2	8	526419	526426	0 %	75 %	0 %	25 %	557625640
1097	NC_022784	TACC	2	8	526829	526836	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1098	NC_022784	ATAC	2	8	528871	528878	50 %	25 %	0 %	25 %	557625643
1099	NC_022784	GAGT	2	8	529521	529528	25 %	25 %	50 %	0 %	557625644
1100	NC_022784	CTTG	2	8	529871	529878	0 %	50 %	25 %	25 %	557625644
1101	NC_022784	TGCC	2	8	531122	531129	0 %	25 %	25 %	50 %	557625647
1102	NC_022784	TGCT	2	8	531619	531626	0 %	50 %	25 %	25 %	557625648
1103	NC_022784	GCGT	2	8	532014	532021	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1104	NC_022784	GCCC	2	8	532055	532062	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1105	NC_022784	TCAT	2	8	532158	532165	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1106	NC_022784	GAAA	2	8	532556	532563	75 %	0 %	25 %	0 %	557625649
1107	NC_022784	GATA	2	8	532582	532589	50 %	25 %	25 %	0 %	557625649
1108	NC_022784	TCAG	2	8	533299	533306	25 %	25 %	25 %	25 %	557625649
1109	NC_022784	AGCA	2	8	533316	533323	50 %	0 %	25 %	25 %	557625649
1110	NC_022784	GAAA	2	8	533874	533881	75 %	0 %	25 %	0 %	557625649
1111	NC_022784	GTCA	2	8	534057	534064	25 %	25 %	25 %	25 %	557625649
1112	NC_022784	CTTA	2	8	534129	534136	25 %	50 %	0 %	25 %	557625649
1113	NC_022784	ATCC	2	8	534200	534207	25 %	25 %	0 %	50 %	557625649
1114	NC_022784	TTTG	2	8	535122	535129	0 %	75 %	25 %	0 %	557625649
1115	NC_022784	ATCG	2	8	535970	535977	25 %	25 %	25 %	25 %	557625650
1116	NC_022784	TTTG	2	8	536501	536508	0 %	75 %	25 %	0 %	557625651
1117	NC_022784	CAAG	2	8	537026	537033	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1118	NC_022784	GACA	2	8	537163	537170	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_022784	GGTG	2	8	537453	537460	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022784	CCGT	2	8	537541	537548	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1121	NC_022784	GGCG	2	8	537603	537610	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_022784	GAAG	2	8	537752	537759	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_022784	ATCA	2	8	538361	538368	50 %	25 %	0 %	25 %	557625652
1124	NC_022784	TTTG	2	8	538952	538959	0 %	75 %	25 %	0 %	557625653
1125	NC_022784	CTTG	2	8	539845	539852	0 %	50 %	25 %	25 %	557625654
1126	NC_022784	TAAC	2	8	540007	540014	50 %	25 %	0 %	25 %	557625654
1127	NC_022784	GGGA	2	8	540572	540579	25 %	0 %	75 %	0 %	557625654
1128	NC_022784	CCAC	2	8	540597	540604	25 %	0 %	0 %	75 %	557625654
1129	NC_022784	TGGT	2	8	541855	541862	0 %	50 %	50 %	0 %	557625655
1130	NC_022784	TTCC	2	8	542998	543005	0 %	50 %	0 %	50 %	557625657
1131	NC_022784	CCTG	2	8	543185	543192	0 %	25 %	25 %	50 %	557625657
1132	NC_022784	CATC	2	8	543374	543381	25 %	25 %	0 %	50 %	557625658
1133	NC_022784	GTAG	2	8	544064	544071	25 %	25 %	50 %	0 %	557625660
1134	NC_022784	CTTG	2	8	544444	544451	0 %	50 %	25 %	25 %	557625660
1135	NC_022784	CCAA	2	8	544977	544984	50 %	0 %	0 %	50 %	557625660
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