MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 1648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021883	ATCTT	2	10	1594534	1594543	20 %	60 %	0 %	20 %	526468908
1002	NC_021883	CAAAA	2	10	1595069	1595078	80 %	0 %	0 %	20 %	526468908
1003	NC_021883	ATTGT	2	10	1600494	1600503	20 %	60 %	20 %	0 %	526468914
1004	NC_021883	ACCAT	2	10	1602504	1602513	40 %	20 %	0 %	40 %	526468918
1005	NC_021883	CAATC	2	10	1602945	1602954	40 %	20 %	0 %	40 %	526468919
1006	NC_021883	CAGTA	2	10	1604588	1604597	40 %	20 %	20 %	20 %	526468920
1007	NC_021883	AATTG	2	10	1605002	1605011	40 %	40 %	20 %	0 %	526468921
1008	NC_021883	TTGAT	2	10	1606760	1606769	20 %	60 %	20 %	0 %	526468923
1009	NC_021883	ATCTG	2	10	1608364	1608373	20 %	40 %	20 %	20 %	526467356
1010	NC_021883	TGTTT	2	10	1609280	1609289	0 %	80 %	20 %	0 %	526468924
1011	NC_021883	TCAAG	2	10	1609669	1609678	40 %	20 %	20 %	20 %	526468924
1012	NC_021883	AGTTG	2	10	1611866	1611875	20 %	40 %	40 %	0 %	526468925
1013	NC_021883	ATTAA	2	10	1613433	1613442	60 %	40 %	0 %	0 %	526468926
1014	NC_021883	ATTTA	2	10	1614397	1614406	40 %	60 %	0 %	0 %	526468928
1015	NC_021883	AAAAT	2	10	1615607	1615616	80 %	20 %	0 %	0 %	526468929
1016	NC_021883	TTTGT	2	10	1618438	1618447	0 %	80 %	20 %	0 %	526468931
1017	NC_021883	TCTTA	2	10	1621585	1621594	20 %	60 %	0 %	20 %	526468936
1018	NC_021883	CTTTT	2	10	1624957	1624966	0 %	80 %	0 %	20 %	526468939
1019	NC_021883	AGCCA	2	10	1625280	1625289	40 %	0 %	20 %	40 %	526468939
1020	NC_021883	CAAAA	2	10	1626785	1626794	80 %	0 %	0 %	20 %	526468941
1021	NC_021883	CCACA	2	10	1628562	1628571	40 %	0 %	0 %	60 %	526468943
1022	NC_021883	CAAGC	2	10	1628615	1628624	40 %	0 %	20 %	40 %	526468943
1023	NC_021883	AAATA	2	10	1628628	1628637	80 %	20 %	0 %	0 %	526468943
1024	NC_021883	GCAAT	2	10	1633400	1633409	40 %	20 %	20 %	20 %	526468948
1025	NC_021883	TAAAA	2	10	1634264	1634273	80 %	20 %	0 %	0 %	526468949
1026	NC_021883	TTCGT	2	10	1634402	1634411	0 %	60 %	20 %	20 %	526468950
1027	NC_021883	GGAGT	2	10	1639039	1639048	20 %	20 %	60 %	0 %	526468956
1028	NC_021883	CCAAC	2	10	1640689	1640698	40 %	0 %	0 %	60 %	526468958
1029	NC_021883	ATAAC	2	10	1643963	1643972	60 %	20 %	0 %	20 %	526468958
1030	NC_021883	AAAAG	2	10	1643976	1643985	80 %	0 %	20 %	0 %	526468958
1031	NC_021883	GAGAT	2	10	1644796	1644805	40 %	20 %	40 %	0 %	526468959
1032	NC_021883	GCTCG	2	10	1645282	1645291	0 %	20 %	40 %	40 %	526468960
1033	NC_021883	GAGCC	2	10	1646420	1646429	20 %	0 %	40 %	40 %	526468961
1034	NC_021883	AAAAT	2	10	1646836	1646845	80 %	20 %	0 %	0 %	526468961
1035	NC_021883	CCGCC	2	10	1647456	1647465	0 %	0 %	20 %	80 %	526468961
1036	NC_021883	AATCA	2	10	1647732	1647741	60 %	20 %	0 %	20 %	526468961
1037	NC_021883	TTAGT	2	10	1648219	1648228	20 %	60 %	20 %	0 %	526468962
1038	NC_021883	GCAAC	2	10	1649626	1649635	40 %	0 %	20 %	40 %	526468963
1039	NC_021883	TTTGC	2	10	1656454	1656463	0 %	60 %	20 %	20 %	526468967
1040	NC_021883	AAGAA	2	10	1657368	1657377	80 %	0 %	20 %	0 %	526468967
1041	NC_021883	TGCAA	2	10	1659506	1659515	40 %	20 %	20 %	20 %	526468968
1042	NC_021883	CACTA	2	10	1660817	1660826	40 %	20 %	0 %	40 %	526468969
1043	NC_021883	TTAAT	2	10	1662810	1662819	40 %	60 %	0 %	0 %	526468970
1044	NC_021883	TTTCG	2	10	1663749	1663758	0 %	60 %	20 %	20 %	526468971
1045	NC_021883	ATTTT	2	10	1663771	1663780	20 %	80 %	0 %	0 %	526468971
1046	NC_021883	TAAAA	2	10	1663856	1663865	80 %	20 %	0 %	0 %	526468971
1047	NC_021883	TTTCT	2	10	1665069	1665078	0 %	80 %	0 %	20 %	526468971
1048	NC_021883	CATTT	2	10	1665237	1665246	20 %	60 %	0 %	20 %	526468971
1049	NC_021883	TTGCT	2	10	1666722	1666731	0 %	60 %	20 %	20 %	526468972
1050	NC_021883	TGTAT	2	10	1667841	1667850	20 %	60 %	20 %	0 %	526468972
1051	NC_021883	GCTGT	43	215	1668192	1668406	0 %	40 %	40 %	20 %	526468972
1052	NC_021883	ATTCA	2	10	1670153	1670162	40 %	40 %	0 %	20 %	526468975
1053	NC_021883	GCCAA	2	10	1670727	1670736	40 %	0 %	20 %	40 %	526468976
1054	NC_021883	CACTG	2	10	1673707	1673716	20 %	20 %	20 %	40 %	526468978
1055	NC_021883	CTTTT	2	10	1674909	1674918	0 %	80 %	0 %	20 %	526468979
1056	NC_021883	AAATA	2	10	1675392	1675401	80 %	20 %	0 %	0 %	526468979
1057	NC_021883	TGCCT	2	10	1676642	1676651	0 %	40 %	20 %	40 %	526468980
1058	NC_021883	AAAAG	2	10	1682427	1682436	80 %	0 %	20 %	0 %	526468982
1059	NC_021883	GAATG	2	10	1684251	1684260	40 %	20 %	40 %	0 %	526468984
1060	NC_021883	ATTGG	2	10	1687851	1687860	20 %	40 %	40 %	0 %	526468987
1061	NC_021883	GAGTT	2	10	1689171	1689180	20 %	40 %	40 %	0 %	526467360
1062	NC_021883	TGGTT	2	10	1690440	1690449	0 %	60 %	40 %	0 %	526468989
1063	NC_021883	GCATT	2	10	1691835	1691844	20 %	40 %	20 %	20 %	526468990
1064	NC_021883	GGCTA	2	10	1691928	1691937	20 %	20 %	40 %	20 %	526468990
1065	NC_021883	TGTAA	2	10	1693616	1693625	40 %	40 %	20 %	0 %	526468991
1066	NC_021883	CTGCT	2	10	1694802	1694811	0 %	40 %	20 %	40 %	526468993
1067	NC_021883	AAGTA	2	10	1698091	1698100	60 %	20 %	20 %	0 %	526468995
1068	NC_021883	ATCAA	2	10	1701920	1701929	60 %	20 %	0 %	20 %	526468999
1069	NC_021883	CCCTG	2	10	1702691	1702700	0 %	20 %	20 %	60 %	526468999
1070	NC_021883	CCAAA	2	10	1703450	1703459	60 %	0 %	0 %	40 %	526469000
1071	NC_021883	ACGTA	2	10	1704392	1704401	40 %	20 %	20 %	20 %	526469000
1072	NC_021883	AGCGG	2	10	1709464	1709473	20 %	0 %	60 %	20 %	526469004
1073	NC_021883	AGCTG	2	10	1711500	1711509	20 %	20 %	40 %	20 %	526469007
1074	NC_021883	CATTT	2	10	1713208	1713217	20 %	60 %	0 %	20 %	526469011
1075	NC_021883	TCATT	2	10	1718490	1718499	20 %	60 %	0 %	20 %	526469013
1076	NC_021883	ATCAC	2	10	1719351	1719360	40 %	20 %	0 %	40 %	526469014
1077	NC_021883	AAATC	2	10	1719838	1719847	60 %	20 %	0 %	20 %	526469014
1078	NC_021883	AGTGC	2	10	1720863	1720872	20 %	20 %	40 %	20 %	526469015
1079	NC_021883	ACAGC	41	205	1722184	1722388	40 %	0 %	20 %	40 %	526469018
1080	NC_021883	TGCCC	2	10	1723593	1723602	0 %	20 %	20 %	60 %	526469019
1081	NC_021883	GTGCC	2	10	1725570	1725579	0 %	20 %	40 %	40 %	526469021
1082	NC_021883	TGGTG	2	10	1727895	1727904	0 %	40 %	60 %	0 %	526469021
1083	NC_021883	GTGCG	2	10	1728260	1728269	0 %	20 %	60 %	20 %	526469021
1084	NC_021883	GGCTT	2	10	1729018	1729027	0 %	40 %	40 %	20 %	526469022
1085	NC_021883	TTTCA	2	10	1730548	1730557	20 %	60 %	0 %	20 %	526469022
1086	NC_021883	GATTG	2	10	1730564	1730573	20 %	40 %	40 %	0 %	526469022
1087	NC_021883	TTTAT	2	10	1732540	1732549	20 %	80 %	0 %	0 %	526469025
1088	NC_021883	GCAAT	2	10	1733230	1733239	40 %	20 %	20 %	20 %	526469026
1089	NC_021883	TAAAA	2	10	1733540	1733549	80 %	20 %	0 %	0 %	526469026
1090	NC_021883	TAAAA	2	10	1734222	1734231	80 %	20 %	0 %	0 %	526469027
1091	NC_021883	AAAAG	2	10	1735454	1735463	80 %	0 %	20 %	0 %	526469029
1092	NC_021883	AAGCC	2	10	1735897	1735906	40 %	0 %	20 %	40 %	526469030
1093	NC_021883	ACGCC	2	10	1736690	1736699	20 %	0 %	20 %	60 %	526469030
1094	NC_021883	GCGTG	2	10	1738424	1738433	0 %	20 %	60 %	20 %	526469031
1095	NC_021883	AGTAA	2	10	1739052	1739061	60 %	20 %	20 %	0 %	526467362
1096	NC_021883	AAGCA	2	10	1739168	1739177	60 %	0 %	20 %	20 %	526467362
1097	NC_021883	GAAAC	2	10	1745049	1745058	60 %	0 %	20 %	20 %	526469045
1098	NC_021883	CGGCA	2	10	1745869	1745878	20 %	0 %	40 %	40 %	526467364
1099	NC_021883	CAAGG	2	10	1746889	1746898	40 %	0 %	40 %	20 %	526467365
1100	NC_021883	GTATG	2	10	1748810	1748819	20 %	40 %	40 %	0 %	526467366
1101	NC_021883	CCAAA	2	10	1749479	1749488	60 %	0 %	0 %	40 %	526467366
1102	NC_021883	CATTG	2	10	1751881	1751890	20 %	40 %	20 %	20 %	526469051
1103	NC_021883	AGCCA	2	10	1753444	1753453	40 %	0 %	20 %	40 %	526467367
1104	NC_021883	CTTGT	2	10	1754777	1754786	0 %	60 %	20 %	20 %	526469054
1105	NC_021883	CTTGC	2	10	1756170	1756179	0 %	40 %	20 %	40 %	526469056
1106	NC_021883	TCAAC	2	10	1757232	1757241	40 %	20 %	0 %	40 %	526469057
1107	NC_021883	GAGCC	2	10	1758137	1758146	20 %	0 %	40 %	40 %	526469060
1108	NC_021883	TAACT	2	10	1759496	1759505	40 %	40 %	0 %	20 %	526469060
1109	NC_021883	CAAAT	2	10	1760095	1760104	60 %	20 %	0 %	20 %	526469060
1110	NC_021883	TGATG	2	10	1764805	1764814	20 %	40 %	40 %	0 %	526469065
1111	NC_021883	CAAAT	2	10	1767303	1767312	60 %	20 %	0 %	20 %	526469067
1112	NC_021883	AGCCG	2	10	1767562	1767571	20 %	0 %	40 %	40 %	526467368
1113	NC_021883	TATCT	2	10	1775029	1775038	20 %	60 %	0 %	20 %	526469075
1114	NC_021883	AAAAT	2	10	1775784	1775793	80 %	20 %	0 %	0 %	526469076
1115	NC_021883	ATTCC	2	10	1777276	1777285	20 %	40 %	0 %	40 %	526469078
1116	NC_021883	CGCCA	2	10	1777796	1777805	20 %	0 %	20 %	60 %	526469078
1117	NC_021883	TAATG	2	10	1779326	1779335	40 %	40 %	20 %	0 %	526469080
1118	NC_021883	GTTAC	2	10	1781709	1781718	20 %	40 %	20 %	20 %	526469084
1119	NC_021883	CTTTT	2	10	1783828	1783837	0 %	80 %	0 %	20 %	526469086
1120	NC_021883	CCATA	2	10	1786522	1786531	40 %	20 %	0 %	40 %	526469090
1121	NC_021883	TAAAA	2	10	1786625	1786634	80 %	20 %	0 %	0 %	526469090
1122	NC_021883	GCAAG	2	10	1790668	1790677	40 %	0 %	40 %	20 %	526469095
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1124	NC_021883	CGCCT	2	10	1791230	1791239	0 %	20 %	20 %	60 %	526469095
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1495	NC_021883	CAATT	2	10	2401805	2401814	40 %	40 %	0 %	20 %	526469697
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1497	NC_021883	CTGAG	2	10	2402705	2402714	20 %	20 %	40 %	20 %	526469699
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1499	NC_021883	AAATG	2	10	2414313	2414322	60 %	20 %	20 %	0 %	526469713
1500	NC_021883	TATTT	2	10	2416400	2416409	20 %	80 %	0 %	0 %	526469717

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