MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 1648

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021883	CTTGC	2	10	789962	789971	0 %	40 %	20 %	40 %	526468140
502	NC_021883	TAAAA	2	10	794670	794679	80 %	20 %	0 %	0 %	526468147
503	NC_021883	TTTAA	2	10	794851	794860	40 %	60 %	0 %	0 %	526468147
504	NC_021883	ATTGA	2	10	798290	798299	40 %	40 %	20 %	0 %	526468150
505	NC_021883	ATTTT	2	10	800778	800787	20 %	80 %	0 %	0 %	526468154
506	NC_021883	AATTT	2	10	801233	801242	40 %	60 %	0 %	0 %	526468155
507	NC_021883	CTTGT	2	10	801845	801854	0 %	60 %	20 %	20 %	526468156
508	NC_021883	AGTAG	2	10	803280	803289	40 %	20 %	40 %	0 %	526468157
509	NC_021883	AGATA	2	10	807614	807623	60 %	20 %	20 %	0 %	526468159
510	NC_021883	TTTGG	2	10	809115	809124	0 %	60 %	40 %	0 %	526468162
511	NC_021883	CTGAA	2	10	811289	811298	40 %	20 %	20 %	20 %	526468163
512	NC_021883	GGGCA	2	10	813088	813097	20 %	0 %	60 %	20 %	526468165
513	NC_021883	TCGGC	2	10	813160	813169	0 %	20 %	40 %	40 %	526468165
514	NC_021883	GGTGT	2	10	814062	814071	0 %	40 %	60 %	0 %	526468165
515	NC_021883	TTGGT	2	10	814511	814520	0 %	60 %	40 %	0 %	526468166
516	NC_021883	GCCTT	2	10	815105	815114	0 %	40 %	20 %	40 %	526468166
517	NC_021883	GCAGA	2	10	818133	818142	40 %	0 %	40 %	20 %	526468169
518	NC_021883	AGGAC	2	10	819601	819610	40 %	0 %	40 %	20 %	526468169
519	NC_021883	GAGCA	2	10	819755	819764	40 %	0 %	40 %	20 %	526468169
520	NC_021883	TTCCG	2	10	821845	821854	0 %	40 %	20 %	40 %	526468173
521	NC_021883	GTGGA	2	10	823220	823229	20 %	20 %	60 %	0 %	526468174
522	NC_021883	TAAAT	2	10	823241	823250	60 %	40 %	0 %	0 %	526468174
523	NC_021883	ACCGG	2	10	826735	826744	20 %	0 %	40 %	40 %	526468180
524	NC_021883	AAATA	2	10	826956	826965	80 %	20 %	0 %	0 %	526468180
525	NC_021883	ATCCC	2	10	827012	827021	20 %	20 %	0 %	60 %	526468180
526	NC_021883	GCTTT	2	10	831799	831808	0 %	60 %	20 %	20 %	526468183
527	NC_021883	ATTTG	2	10	832151	832160	20 %	60 %	20 %	0 %	526468183
528	NC_021883	CTGAT	2	10	834629	834638	20 %	40 %	20 %	20 %	526468186
529	NC_021883	AGCCA	2	10	836114	836123	40 %	0 %	20 %	40 %	526468187
530	NC_021883	AGCAG	2	10	837691	837700	40 %	0 %	40 %	20 %	526468188
531	NC_021883	CAAAC	2	10	839942	839951	60 %	0 %	0 %	40 %	526468189
532	NC_021883	ATCCA	2	10	843877	843886	40 %	20 %	0 %	40 %	526468193
533	NC_021883	TGATT	2	10	844097	844106	20 %	60 %	20 %	0 %	526468193
534	NC_021883	ACCAA	2	10	844784	844793	60 %	0 %	0 %	40 %	526468193
535	NC_021883	TGAAA	2	10	846011	846020	60 %	20 %	20 %	0 %	526468195
536	NC_021883	ATAAA	2	10	846615	846624	80 %	20 %	0 %	0 %	526468195
537	NC_021883	GGTGG	2	10	847778	847787	0 %	20 %	80 %	0 %	526468198
538	NC_021883	CAAAT	2	10	848836	848845	60 %	20 %	0 %	20 %	526468199
539	NC_021883	AAAAT	2	10	849491	849500	80 %	20 %	0 %	0 %	526468200
540	NC_021883	ATTGG	2	10	852208	852217	20 %	40 %	40 %	0 %	526468203
541	NC_021883	ATGCT	2	10	852460	852469	20 %	40 %	20 %	20 %	526468203
542	NC_021883	AAATT	2	10	854689	854698	60 %	40 %	0 %	0 %	526468204
543	NC_021883	AGCTC	2	10	855138	855147	20 %	20 %	20 %	40 %	526468204
544	NC_021883	TTTAT	2	10	855561	855570	20 %	80 %	0 %	0 %	526468204
545	NC_021883	CGGCT	2	10	856921	856930	0 %	20 %	40 %	40 %	526468205
546	NC_021883	AAAAT	2	10	859175	859184	80 %	20 %	0 %	0 %	526468205
547	NC_021883	ACGCC	2	10	859984	859993	20 %	0 %	20 %	60 %	526468206
548	NC_021883	GATTG	2	10	864082	864091	20 %	40 %	40 %	0 %	526468210
549	NC_021883	CCAAA	2	10	864761	864770	60 %	0 %	0 %	40 %	526468211
550	NC_021883	GTAAT	2	10	868319	868328	40 %	40 %	20 %	0 %	526468212
551	NC_021883	AACTT	2	10	872272	872281	40 %	40 %	0 %	20 %	526468215
552	NC_021883	TAAGT	2	10	872458	872467	40 %	40 %	20 %	0 %	526468215
553	NC_021883	CGAAC	2	10	872836	872845	40 %	0 %	20 %	40 %	526468215
554	NC_021883	GTAAT	2	10	872893	872902	40 %	40 %	20 %	0 %	526468215
555	NC_021883	TGATG	2	10	874496	874505	20 %	40 %	40 %	0 %	526468217
556	NC_021883	ATTTA	2	10	876202	876211	40 %	60 %	0 %	0 %	526468218
557	NC_021883	GATTG	2	10	879716	879725	20 %	40 %	40 %	0 %	526468222
558	NC_021883	AGTTG	2	10	881953	881962	20 %	40 %	40 %	0 %	526468224
559	NC_021883	TTTGG	2	10	882533	882542	0 %	60 %	40 %	0 %	526468225
560	NC_021883	TTGGG	2	10	887251	887260	0 %	40 %	60 %	0 %	526468228
561	NC_021883	TAGCT	2	10	887288	887297	20 %	40 %	20 %	20 %	526468228
562	NC_021883	TGCTT	2	10	887440	887449	0 %	60 %	20 %	20 %	526468228
563	NC_021883	TTAAA	2	10	891955	891964	60 %	40 %	0 %	0 %	526468230
564	NC_021883	TAAGG	2	10	892335	892344	40 %	20 %	40 %	0 %	526468231
565	NC_021883	ATCTT	2	10	894262	894271	20 %	60 %	0 %	20 %	526468232
566	NC_021883	AGATA	2	10	897439	897448	60 %	20 %	20 %	0 %	526468234
567	NC_021883	CATAC	2	10	897920	897929	40 %	20 %	0 %	40 %	526468234
568	NC_021883	ACCAA	2	10	901657	901666	60 %	0 %	0 %	40 %	526468237
569	NC_021883	TAGTT	2	10	904147	904156	20 %	60 %	20 %	0 %	526468241
570	NC_021883	AACCA	2	10	904479	904488	60 %	0 %	0 %	40 %	526468242
571	NC_021883	TTGCT	2	10	905298	905307	0 %	60 %	20 %	20 %	526468243
572	NC_021883	TTTAA	2	10	905975	905984	40 %	60 %	0 %	0 %	526468243
573	NC_021883	AATTA	2	10	906664	906673	60 %	40 %	0 %	0 %	526468244
574	NC_021883	AATAT	2	10	906737	906746	60 %	40 %	0 %	0 %	526468244
575	NC_021883	GGCGA	2	10	910228	910237	20 %	0 %	60 %	20 %	526468248
576	NC_021883	CCGTG	2	10	911223	911232	0 %	20 %	40 %	40 %	526468250
577	NC_021883	GCAAT	2	10	911427	911436	40 %	20 %	20 %	20 %	526468250
578	NC_021883	GAAAT	2	10	911984	911993	60 %	20 %	20 %	0 %	526468251
579	NC_021883	TACAG	2	10	914427	914436	40 %	20 %	20 %	20 %	526468254
580	NC_021883	TGAAT	2	10	914618	914627	40 %	40 %	20 %	0 %	526468254
581	NC_021883	GAACC	2	10	917624	917633	40 %	0 %	20 %	40 %	526468256
582	NC_021883	TATGA	2	10	918749	918758	40 %	40 %	20 %	0 %	526468257
583	NC_021883	CAATT	2	10	918911	918920	40 %	40 %	0 %	20 %	526468257
584	NC_021883	GCAAA	2	10	920358	920367	60 %	0 %	20 %	20 %	526468257
585	NC_021883	AAAAT	2	10	921141	921150	80 %	20 %	0 %	0 %	526468257
586	NC_021883	TCTGC	2	10	921386	921395	0 %	40 %	20 %	40 %	526468257
587	NC_021883	CAACT	2	10	924310	924319	40 %	20 %	0 %	40 %	526468260
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589	NC_021883	TTGTT	2	10	932486	932495	0 %	80 %	20 %	0 %	526467272
590	NC_021883	GGTTA	2	10	932806	932815	20 %	40 %	40 %	0 %	526467272
591	NC_021883	ACCAT	2	10	933798	933807	40 %	20 %	0 %	40 %	526468277
592	NC_021883	TCACT	2	10	934678	934687	20 %	40 %	0 %	40 %	526468277
593	NC_021883	AAATC	2	10	940255	940264	60 %	20 %	0 %	20 %	526468285
594	NC_021883	AATCA	2	10	941329	941338	60 %	20 %	0 %	20 %	526468286
595	NC_021883	GATGA	2	10	943545	943554	40 %	20 %	40 %	0 %	526468289
596	NC_021883	ACATC	2	10	943954	943963	40 %	20 %	0 %	40 %	526468289
597	NC_021883	CCTTG	2	10	946925	946934	0 %	40 %	20 %	40 %	526468293
598	NC_021883	GATGG	2	10	949297	949306	20 %	20 %	60 %	0 %	526468296
599	NC_021883	TTTTG	2	10	951832	951841	0 %	80 %	20 %	0 %	526468301
600	NC_021883	CATTA	2	10	951976	951985	40 %	40 %	0 %	20 %	526468301
601	NC_021883	AAGAT	2	10	952367	952376	60 %	20 %	20 %	0 %	526468301
602	NC_021883	AAAAG	2	10	958786	958795	80 %	0 %	20 %	0 %	526468309
603	NC_021883	TGAAT	2	10	968243	968252	40 %	40 %	20 %	0 %	526468325
604	NC_021883	ATGAT	2	10	970514	970523	40 %	40 %	20 %	0 %	526468326
605	NC_021883	ATGGG	2	10	975753	975762	20 %	20 %	60 %	0 %	526468330
606	NC_021883	TATGA	2	10	975990	975999	40 %	40 %	20 %	0 %	526468330
607	NC_021883	GATTT	2	10	976489	976498	20 %	60 %	20 %	0 %	526468331
608	NC_021883	TGGTT	2	10	978379	978388	0 %	60 %	40 %	0 %	526468332
609	NC_021883	GAATT	2	10	979391	979400	40 %	40 %	20 %	0 %	526468333
610	NC_021883	TGAAG	2	10	979488	979497	40 %	20 %	40 %	0 %	526468333
611	NC_021883	TCGCA	2	10	980994	981003	20 %	20 %	20 %	40 %	526468334
612	NC_021883	GGAAA	2	10	981222	981231	60 %	0 %	40 %	0 %	526468334
613	NC_021883	TGGTT	2	10	982157	982166	0 %	60 %	40 %	0 %	526468335
614	NC_021883	GCTGA	2	10	982846	982855	20 %	20 %	40 %	20 %	526468335
615	NC_021883	TTAGC	2	10	983328	983337	20 %	40 %	20 %	20 %	526468336
616	NC_021883	TACCG	2	10	988404	988413	20 %	20 %	20 %	40 %	526468343
617	NC_021883	TTCAA	2	10	989421	989430	40 %	40 %	0 %	20 %	526468343
618	NC_021883	TATGA	2	10	990570	990579	40 %	40 %	20 %	0 %	526468346
619	NC_021883	TTTTA	2	10	991567	991576	20 %	80 %	0 %	0 %	526468347
620	NC_021883	GGTTT	2	10	992129	992138	0 %	60 %	40 %	0 %	526467274
621	NC_021883	TGCTC	2	10	1000747	1000756	0 %	40 %	20 %	40 %	526468356
622	NC_021883	GGTTG	2	10	1002268	1002277	0 %	40 %	60 %	0 %	526468359
623	NC_021883	GTTGC	2	10	1005710	1005719	0 %	40 %	40 %	20 %	526468361
624	NC_021883	TAAAA	2	10	1008382	1008391	80 %	20 %	0 %	0 %	526468364
625	NC_021883	TAGAA	2	10	1009369	1009378	60 %	20 %	20 %	0 %	526468366
626	NC_021883	TCATT	2	10	1009422	1009431	20 %	60 %	0 %	20 %	526468366
627	NC_021883	AGTTT	2	10	1009442	1009451	20 %	60 %	20 %	0 %	526468366
628	NC_021883	ATTTC	2	10	1010449	1010458	20 %	60 %	0 %	20 %	526468368
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