MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 28969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021883	CGG	2	6	468	473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467398
2	NC_021883	AAC	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467398
3	NC_021883	AAG	2	6	800	805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467398
4	NC_021883	TGG	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467398
5	NC_021883	AAC	2	6	826	831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467398
6	NC_021883	GGT	2	6	946	951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467398
7	NC_021883	CTG	2	6	965	970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467398
8	NC_021883	CAA	2	6	971	976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467398
9	NC_021883	ACC	2	6	1035	1040	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467398
10	NC_021883	TCT	2	6	1109	1114	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467398
11	NC_021883	TAT	2	6	1233	1238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467398
12	NC_021883	CCA	2	6	1308	1313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467398
13	NC_021883	CCA	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467398
14	NC_021883	CAT	2	6	1437	1442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467398
15	NC_021883	ACT	2	6	1469	1474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467398
16	NC_021883	TGG	2	6	1670	1675	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467398
17	NC_021883	TGC	2	6	1745	1750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467398
18	NC_021883	CCG	2	6	1971	1976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467398
19	NC_021883	GAA	2	6	2289	2294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467398
20	NC_021883	AAT	2	6	2633	2638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467399
21	NC_021883	CAA	2	6	2711	2716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467400
22	NC_021883	ATT	2	6	2743	2748	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467400
23	NC_021883	TGA	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467400
24	NC_021883	TTG	2	6	2829	2834	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467400
25	NC_021883	GTC	2	6	2838	2843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467400
26	NC_021883	CTA	2	6	2936	2941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467400
27	NC_021883	GGA	2	6	3028	3033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	526467400
28	NC_021883	ATG	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467400
29	NC_021883	AAT	2	6	3169	3174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467400
30	NC_021883	AAC	2	6	3183	3188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467400
31	NC_021883	TAG	2	6	3249	3254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467400
32	NC_021883	TGG	2	6	3646	3651	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467401
33	NC_021883	ACT	2	6	3671	3676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467401
34	NC_021883	ACT	2	6	3850	3855	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467401
35	NC_021883	TTC	2	6	3858	3863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467401
36	NC_021883	CAC	2	6	4083	4088	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467401
37	NC_021883	CTG	3	9	4149	4157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467401
38	NC_021883	ATT	2	6	4247	4252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
39	NC_021883	GAA	2	6	4262	4267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467401
40	NC_021883	TTC	2	6	4340	4345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467401
41	NC_021883	TTC	2	6	4367	4372	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467401
42	NC_021883	ATA	2	6	4404	4409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467401
43	NC_021883	TTA	2	6	4442	4447	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
44	NC_021883	ACA	2	6	4627	4632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467401
45	NC_021883	GTT	2	6	4682	4687	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467401
46	NC_021883	TAT	2	6	4726	4731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
47	NC_021883	TAT	2	6	4780	4785	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
48	NC_021883	ATT	2	6	4886	4891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
49	NC_021883	ATT	2	6	4898	4903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467401
50	NC_021883	TGA	2	6	4914	4919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467401
51	NC_021883	AAT	2	6	4983	4988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467401
52	NC_021883	AAC	2	6	6720	6725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467402
53	NC_021883	CAA	2	6	6742	6747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467402
54	NC_021883	ATC	2	6	6810	6815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467402
55	NC_021883	AAC	2	6	6887	6892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467402
56	NC_021883	CTG	2	6	6987	6992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467402
57	NC_021883	TTG	2	6	7023	7028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467402
58	NC_021883	ATG	2	6	7107	7112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467402
59	NC_021883	CGG	2	6	7144	7149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467402
60	NC_021883	TTG	2	6	7196	7201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467402
61	NC_021883	TAT	2	6	7303	7308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467402
62	NC_021883	GAC	2	6	7376	7381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467402
63	NC_021883	GAA	2	6	7469	7474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467402
64	NC_021883	TGA	2	6	7530	7535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467402
65	NC_021883	CAT	2	6	7682	7687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467402
66	NC_021883	ACC	2	6	7848	7853	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
67	NC_021883	GCT	2	6	7978	7983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467403
68	NC_021883	ATC	3	9	7993	8001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467403
69	NC_021883	TGT	2	6	8042	8047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467403
70	NC_021883	AAC	2	6	8116	8121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467403
71	NC_021883	CGG	2	6	8124	8129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467403
72	NC_021883	AAG	2	6	8206	8211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467403
73	NC_021883	CTT	2	6	8249	8254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467403
74	NC_021883	TGT	2	6	8339	8344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467403
75	NC_021883	CCA	2	6	8405	8410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
76	NC_021883	TCA	2	6	8428	8433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467403
77	NC_021883	CGG	2	6	8436	8441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467403
78	NC_021883	CCG	2	6	8584	8589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467403
79	NC_021883	CCA	2	6	8610	8615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
80	NC_021883	CCA	2	6	8619	8624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467403
81	NC_021883	CGG	2	6	8673	8678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467403
82	NC_021883	CGC	2	6	8709	8714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467403
83	NC_021883	ATA	2	6	8845	8850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467403
84	NC_021883	TCA	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467403
85	NC_021883	ATA	2	6	8970	8975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467403
86	NC_021883	CTG	2	6	9043	9048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467403
87	NC_021883	CTG	2	6	9065	9070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467403
88	NC_021883	CAG	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467404
89	NC_021883	CCA	2	6	9515	9520	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467404
90	NC_021883	GTA	2	6	9701	9706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467404
91	NC_021883	CTT	2	6	9920	9925	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467404
92	NC_021883	TCA	2	6	10039	10044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467404
93	NC_021883	CCA	2	6	10055	10060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467404
94	NC_021883	ATA	2	6	10062	10067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467404
95	NC_021883	TTG	2	6	10197	10202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467404
96	NC_021883	CAC	2	6	10256	10261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467404
97	NC_021883	TTG	2	6	10287	10292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467404
98	NC_021883	GCA	2	6	10330	10335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467404
99	NC_021883	TCT	2	6	10447	10452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467405
100	NC_021883	CTT	2	6	10472	10477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467405
101	NC_021883	ACC	3	9	10515	10523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467405
102	NC_021883	ATC	2	6	10525	10530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467405
103	NC_021883	CCG	2	6	10540	10545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467405
104	NC_021883	CTG	2	6	10562	10567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
105	NC_021883	ACT	2	6	10576	10581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467405
106	NC_021883	ACC	2	6	10599	10604	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467405
107	NC_021883	CTG	3	9	10631	10639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
108	NC_021883	CTG	2	6	10643	10648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
109	NC_021883	CTG	2	6	10832	10837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
110	NC_021883	GGT	2	6	10839	10844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467405
111	NC_021883	GTC	2	6	11151	11156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
112	NC_021883	TCA	2	6	11216	11221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467405
113	NC_021883	TGC	2	6	11250	11255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467405
114	NC_021883	TTG	2	6	11277	11282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467405
115	NC_021883	ACC	2	6	11426	11431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467405
116	NC_021883	AAG	2	6	11488	11493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467405
117	NC_021883	GAA	2	6	11769	11774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467405
118	NC_021883	CCG	2	6	11828	11833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467405
119	NC_021883	ACA	2	6	12263	12268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467406
120	NC_021883	TAT	3	9	12287	12295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467406
121	NC_021883	GGT	2	6	12297	12302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467406
122	NC_021883	TTA	3	9	12357	12365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467406
123	NC_021883	TAT	2	6	12530	12535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467406
124	NC_021883	TGA	2	6	12719	12724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
125	NC_021883	GTA	2	6	12756	12761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
126	NC_021883	CGG	2	6	12767	12772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467406
127	NC_021883	ATG	2	6	13015	13020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
128	NC_021883	ACA	2	6	13095	13100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467406
129	NC_021883	CTT	2	6	13120	13125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467406
130	NC_021883	TGA	2	6	13205	13210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467406
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132	NC_021883	AAG	2	6	13276	13281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467406
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162	NC_021883	TTC	2	6	15378	15383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467410
163	NC_021883	CCG	2	6	15457	15462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467410
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254	NC_021883	CAT	2	6	24593	24598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467417
255	NC_021883	GGT	2	6	24749	24754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467417
256	NC_021883	TCA	2	6	24757	24762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467417
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258	NC_021883	ATC	2	6	24828	24833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467417
259	NC_021883	GAA	2	6	24950	24955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467417
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262	NC_021883	TAA	2	6	25190	25195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467418
263	NC_021883	AAC	2	6	25326	25331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467418
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271	NC_021883	TCA	3	9	26563	26571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467420
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