MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 28969

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_021883	TTA	2	6	91011	91016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467482
1003	NC_021883	GAA	2	6	91054	91059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467482
1004	NC_021883	TAT	2	6	91077	91082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467482
1005	NC_021883	TTG	2	6	91853	91858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467483
1006	NC_021883	TAT	2	6	91911	91916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467483
1007	NC_021883	TAT	2	6	91934	91939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467483
1008	NC_021883	GGC	2	6	92073	92078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467483
1009	NC_021883	ACG	2	6	92082	92087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467483
1010	NC_021883	CAT	2	6	92119	92124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467483
1011	NC_021883	TGA	2	6	92160	92165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467483
1012	NC_021883	TCA	2	6	92181	92186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467483
1013	NC_021883	CAG	2	6	92613	92618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467484
1014	NC_021883	TAG	2	6	92627	92632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467484
1015	NC_021883	ATT	2	6	92821	92826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467485
1016	NC_021883	CAA	2	6	92837	92842	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467485
1017	NC_021883	CAT	2	6	93182	93187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467486
1018	NC_021883	AAT	2	6	93240	93245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467486
1019	NC_021883	TCA	2	6	93298	93303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467486
1020	NC_021883	CAC	2	6	93341	93346	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467486
1021	NC_021883	CAC	2	6	93368	93373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467486
1022	NC_021883	GGT	2	6	93474	93479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467486
1023	NC_021883	TGT	2	6	93550	93555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467486
1024	NC_021883	GAC	2	6	93569	93574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467486
1025	NC_021883	CAA	2	6	93716	93721	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467487
1026	NC_021883	GAT	2	6	93741	93746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467487
1027	NC_021883	AAT	3	9	93779	93787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467487
1028	NC_021883	GCT	2	6	93910	93915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467487
1029	NC_021883	TAA	2	6	94221	94226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467487
1030	NC_021883	TAG	2	6	94266	94271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467488
1031	NC_021883	ATA	2	6	94357	94362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467488
1032	NC_021883	GAT	2	6	94408	94413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467488
1033	NC_021883	AGT	2	6	94472	94477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467488
1034	NC_021883	TAG	2	6	94610	94615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467488
1035	NC_021883	TTC	2	6	94853	94858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467488
1036	NC_021883	TTG	2	6	94880	94885	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467488
1037	NC_021883	TAA	2	6	95152	95157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467488
1038	NC_021883	TGT	2	6	95422	95427	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467489
1039	NC_021883	GAA	3	9	95579	95587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467489
1040	NC_021883	ATG	2	6	95744	95749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467489
1041	NC_021883	AGT	2	6	95768	95773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467489
1042	NC_021883	TGA	2	6	95931	95936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467490
1043	NC_021883	CAA	2	6	95950	95955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467490
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1045	NC_021883	TAA	2	6	96118	96123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467491
1046	NC_021883	TAG	2	6	96284	96289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467491
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1049	NC_021883	TGA	2	6	97113	97118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467492
1050	NC_021883	TAT	2	6	97138	97143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	526467492
1051	NC_021883	GTG	2	6	97159	97164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467492
1052	NC_021883	AAG	2	6	97256	97261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467492
1053	NC_021883	GAA	2	6	97309	97314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467492
1054	NC_021883	TGA	2	6	97407	97412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467492
1055	NC_021883	TGG	2	6	97798	97803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467493
1056	NC_021883	TGC	2	6	97826	97831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467493
1057	NC_021883	CAC	2	6	97856	97861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467493
1058	NC_021883	AAC	2	6	97922	97927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467493
1059	NC_021883	TTG	2	6	98311	98316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	526467493
1060	NC_021883	ATA	2	6	98317	98322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467493
1061	NC_021883	CAC	2	6	98378	98383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467493
1062	NC_021883	GCG	2	6	98557	98562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467493
1063	NC_021883	GCA	2	6	98564	98569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	526467493
1064	NC_021883	GAT	2	6	98664	98669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467493
1065	NC_021883	CGG	2	6	98921	98926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467494
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1067	NC_021883	CAA	2	6	99087	99092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467494
1068	NC_021883	ATC	2	6	99094	99099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467494
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1070	NC_021883	CGT	2	6	99331	99336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467495
1071	NC_021883	CCA	2	6	99417	99422	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467495
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1101	NC_021883	GGC	2	6	101883	101888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	526467499
1102	NC_021883	GTG	2	6	101943	101948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467499
1103	NC_021883	TGA	2	6	102047	102052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467499
1104	NC_021883	TGG	2	6	102335	102340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467499
1105	NC_021883	GGT	2	6	102618	102623	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467499
1106	NC_021883	ATG	2	6	102804	102809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467500
1107	NC_021883	TGA	3	9	102989	102997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467500
1108	NC_021883	AAT	2	6	103183	103188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467500
1109	NC_021883	AAC	2	6	103374	103379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467501
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1111	NC_021883	TGC	2	6	103486	103491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467501
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1119	NC_021883	CTA	2	6	103862	103867	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467501
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1121	NC_021883	GAA	2	6	104069	104074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	526467502
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1244	NC_021883	TGG	2	6	114036	114041	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467513
1245	NC_021883	TGG	2	6	114135	114140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467513
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1360	NC_021883	CAT	2	6	125067	125072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467523
1361	NC_021883	TGC	3	9	125347	125355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467524
1362	NC_021883	GCC	2	6	125600	125605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	526467524
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1364	NC_021883	TGG	2	6	125824	125829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	526467524
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1369	NC_021883	GTC	2	6	126369	126374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467525
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1478	NC_021883	GAT	2	6	135510	135515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467532
1479	NC_021883	TTC	2	6	135516	135521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467532
1480	NC_021883	CTT	2	6	135557	135562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467532
1481	NC_021883	TGA	2	6	135623	135628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	526467532
1482	NC_021883	TAA	2	6	135713	135718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467532
1483	NC_021883	ATC	2	6	135753	135758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467532
1484	NC_021883	ATC	2	6	135807	135812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467532
1485	NC_021883	CCA	2	6	135820	135825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467532
1486	NC_021883	ATC	2	6	135834	135839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467532
1487	NC_021883	ACC	2	6	135846	135851	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467532
1488	NC_021883	CGT	2	6	135869	135874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467532
1489	NC_021883	CAC	2	6	135899	135904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	526467532
1490	NC_021883	CAT	2	6	135914	135919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467532
1491	NC_021883	TAC	2	6	135926	135931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467532
1492	NC_021883	TTC	2	6	135966	135971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	526467532
1493	NC_021883	TAA	2	6	135997	136002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467532
1494	NC_021883	CGT	2	6	136230	136235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467532
1495	NC_021883	CAA	2	6	136244	136249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467532
1496	NC_021883	TCA	2	6	136258	136263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	526467532
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1498	NC_021883	AAC	2	6	136347	136352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	526467532
1499	NC_021883	TGC	2	6	136377	136382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	526467532
1500	NC_021883	AAT	2	6	136486	136491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	526467532

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