MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021881	GAAAA	2	10	128	137	80 %	0 %	20 %	0 %	526464098
2	NC_021881	ACAGC	2	10	2108	2117	40 %	0 %	20 %	40 %	526464098
3	NC_021881	TATGG	2	10	2192	2201	20 %	40 %	40 %	0 %	526464098
4	NC_021881	AGAGA	2	10	2949	2958	60 %	0 %	40 %	0 %	526464099
5	NC_021881	TGATG	2	10	2999	3008	20 %	40 %	40 %	0 %	526464099
6	NC_021881	ACAGA	2	10	3960	3969	60 %	0 %	20 %	20 %	526464100
7	NC_021881	GTAGT	2	10	4355	4364	20 %	40 %	40 %	0 %	526464100
8	NC_021881	TCGTA	2	10	6909	6918	20 %	40 %	20 %	20 %	526464725
9	NC_021881	GAGTT	2	10	13569	13578	20 %	40 %	40 %	0 %	526464106
10	NC_021881	TGCGA	2	10	14759	14768	20 %	20 %	40 %	20 %	526464106
11	NC_021881	TTGTA	2	10	16249	16258	20 %	60 %	20 %	0 %	526464107
12	NC_021881	AAAGC	2	10	18840	18849	60 %	0 %	20 %	20 %	526464110
13	NC_021881	CTTCT	2	10	20220	20229	0 %	60 %	0 %	40 %	526464111
14	NC_021881	TGTAA	2	10	20354	20363	40 %	40 %	20 %	0 %	526464111
15	NC_021881	ACAAT	2	10	21549	21558	60 %	20 %	0 %	20 %	526464112
16	NC_021881	TTCTT	2	10	22300	22309	0 %	80 %	0 %	20 %	526464113
17	NC_021881	TTATT	2	10	23332	23341	20 %	80 %	0 %	0 %	526464114
18	NC_021881	TGATG	2	10	25621	25630	20 %	40 %	40 %	0 %	526464116
19	NC_021881	GCAAC	2	10	32597	32606	40 %	0 %	20 %	40 %	526464117
20	NC_021881	AAATA	2	10	34338	34347	80 %	20 %	0 %	0 %	526464119
21	NC_021881	AACTC	2	10	35574	35583	40 %	20 %	0 %	40 %	526464120
22	NC_021881	GTTTT	2	10	35604	35613	0 %	80 %	20 %	0 %	526464120
23	NC_021881	CTGAC	2	10	35690	35699	20 %	20 %	20 %	40 %	526464120
24	NC_021881	TAGGT	2	10	37090	37099	20 %	40 %	40 %	0 %	526464122
25	NC_021881	CTGTT	2	10	39436	39445	0 %	60 %	20 %	20 %	526464124
26	NC_021881	AAAGC	2	10	42185	42194	60 %	0 %	20 %	20 %	526464733
27	NC_021881	TTTCC	2	10	42745	42754	0 %	60 %	0 %	40 %	526464733
28	NC_021881	AATAC	2	10	42951	42960	60 %	20 %	0 %	20 %	526464733
29	NC_021881	CTTCA	2	10	43794	43803	20 %	40 %	0 %	40 %	526464733
30	NC_021881	GCTTG	2	10	45453	45462	0 %	40 %	40 %	20 %	526464125
31	NC_021881	TTGCA	2	10	53603	53612	20 %	40 %	20 %	20 %	526464735
32	NC_021881	TTCTA	2	10	55398	55407	20 %	60 %	0 %	20 %	526464735
33	NC_021881	ATCAA	2	10	56855	56864	60 %	20 %	0 %	20 %	526464736
34	NC_021881	ATGGC	2	10	57112	57121	20 %	20 %	40 %	20 %	526464736
35	NC_021881	TACTA	2	10	57205	57214	40 %	40 %	0 %	20 %	526464736
36	NC_021881	ATTAG	2	10	59098	59107	40 %	40 %	20 %	0 %	526464736
37	NC_021881	AACCC	2	10	62558	62567	40 %	0 %	0 %	60 %	526464131
38	NC_021881	CATAC	2	10	63491	63500	40 %	20 %	0 %	40 %	526464131
39	NC_021881	TTCCT	2	10	68863	68872	0 %	60 %	0 %	40 %	526464135
40	NC_021881	GGCGC	2	10	70158	70167	0 %	0 %	60 %	40 %	526464138
41	NC_021881	ACTTC	2	10	72145	72154	20 %	40 %	0 %	40 %	526464140
42	NC_021881	CAGCT	2	10	73123	73132	20 %	20 %	20 %	40 %	526464140
43	NC_021881	GCTGC	2	10	73340	73349	0 %	20 %	40 %	40 %	526464140
44	NC_021881	TTTAG	2	10	75143	75152	20 %	60 %	20 %	0 %	526464741
45	NC_021881	AGGAA	2	10	78674	78683	60 %	0 %	40 %	0 %	526464742
46	NC_021881	GGGTA	2	10	79541	79550	20 %	20 %	60 %	0 %	526464144
47	NC_021881	GGCAG	2	10	80364	80373	20 %	0 %	60 %	20 %	526464144
48	NC_021881	GAAGC	2	10	81105	81114	40 %	0 %	40 %	20 %	526464145
49	NC_021881	TCATT	2	10	82040	82049	20 %	60 %	0 %	20 %	526464145
50	NC_021881	CCGTA	2	10	86437	86446	20 %	20 %	20 %	40 %	526464151
51	NC_021881	TCTCG	2	10	87612	87621	0 %	40 %	20 %	40 %	526464152
52	NC_021881	AACGC	2	10	88882	88891	40 %	0 %	20 %	40 %	526464746
53	NC_021881	GTACT	2	10	94392	94401	20 %	40 %	20 %	20 %	526464153
54	NC_021881	CTTCG	2	10	96782	96791	0 %	40 %	20 %	40 %	526464155
55	NC_021881	AATAA	2	10	97371	97380	80 %	20 %	0 %	0 %	526464747
56	NC_021881	GATGC	2	10	98849	98858	20 %	20 %	40 %	20 %	526464157
57	NC_021881	GAGAG	2	10	99685	99694	40 %	0 %	60 %	0 %	526464159
58	NC_021881	AAATA	2	10	102657	102666	80 %	20 %	0 %	0 %	526464161
59	NC_021881	GAGGC	2	10	103063	103072	20 %	0 %	60 %	20 %	526464162
60	NC_021881	AGTAT	2	10	104845	104854	40 %	40 %	20 %	0 %	526464163
61	NC_021881	CAGAT	2	10	107287	107296	40 %	20 %	20 %	20 %	526464164
62	NC_021881	TGTCA	2	10	107639	107648	20 %	40 %	20 %	20 %	526464751
63	NC_021881	TTTAG	2	10	107935	107944	20 %	60 %	20 %	0 %	526464752
64	NC_021881	GTATT	2	10	109275	109284	20 %	60 %	20 %	0 %	526464165
65	NC_021881	ATGGA	2	10	109461	109470	40 %	20 %	40 %	0 %	526464165
66	NC_021881	GGTGC	2	10	111291	111300	0 %	20 %	60 %	20 %	526464166
67	NC_021881	TTGTT	2	10	112164	112173	0 %	80 %	20 %	0 %	526464166
68	NC_021881	TTTTG	2	10	114697	114706	0 %	80 %	20 %	0 %	526464168
69	NC_021881	TGTGT	2	10	117565	117574	0 %	60 %	40 %	0 %	526464756
70	NC_021881	ATAGT	2	10	126714	126723	40 %	40 %	20 %	0 %	526464760
71	NC_021881	TTGCG	2	10	128394	128403	0 %	40 %	40 %	20 %	526464173
72	NC_021881	CCTAC	2	10	130277	130286	20 %	20 %	0 %	60 %	526464174
73	NC_021881	TACTG	2	10	134685	134694	20 %	40 %	20 %	20 %	526464763
74	NC_021881	CACAG	2	10	137618	137627	40 %	0 %	20 %	40 %	526464766
75	NC_021881	GTATG	2	10	139271	139280	20 %	40 %	40 %	0 %	526464179
76	NC_021881	TCTTT	2	10	139620	139629	0 %	80 %	0 %	20 %	526464179
77	NC_021881	GTTGT	2	10	140155	140164	0 %	60 %	40 %	0 %	526464179
78	NC_021881	ACTAC	2	10	141969	141978	40 %	20 %	0 %	40 %	526464180
79	NC_021881	ATGAG	2	10	145477	145486	40 %	20 %	40 %	0 %	526464769
80	NC_021881	AGCCA	2	10	145662	145671	40 %	0 %	20 %	40 %	526464769
81	NC_021881	GCATT	2	10	152988	152997	20 %	40 %	20 %	20 %	526464185
82	NC_021881	TTGCT	2	10	155043	155052	0 %	60 %	20 %	20 %	526464188
83	NC_021881	TTAGG	2	10	156816	156825	20 %	40 %	40 %	0 %	526464190
84	NC_021881	TTGCT	2	10	157184	157193	0 %	60 %	20 %	20 %	526464774
85	NC_021881	GCATT	2	10	157929	157938	20 %	40 %	20 %	20 %	526464191
86	NC_021881	TGAAG	2	10	161508	161517	40 %	20 %	40 %	0 %	526464192
87	NC_021881	GTTAT	2	10	162546	162555	20 %	60 %	20 %	0 %	526464775
88	NC_021881	TGAAG	2	10	164286	164295	40 %	20 %	40 %	0 %	526464194
89	NC_021881	AGTGT	2	10	167222	167231	20 %	40 %	40 %	0 %	526464197
90	NC_021881	GTTGC	2	10	167680	167689	0 %	40 %	40 %	20 %	526464776
91	NC_021881	GAACA	2	10	179770	179779	60 %	0 %	20 %	20 %	526464205
92	NC_021881	AACAA	2	10	182262	182271	80 %	0 %	0 %	20 %	526464207
93	NC_021881	GCAGA	2	10	182334	182343	40 %	0 %	40 %	20 %	526464207
94	NC_021881	GCAAA	2	10	182387	182396	60 %	0 %	20 %	20 %	526464207
95	NC_021881	ATAGC	2	10	187107	187116	40 %	20 %	20 %	20 %	526464783
96	NC_021881	TGTTT	2	10	191369	191378	0 %	80 %	20 %	0 %	526464211
97	NC_021881	TGCAA	2	10	191521	191530	40 %	20 %	20 %	20 %	526464211
98	NC_021881	GAGGT	2	10	192150	192159	20 %	20 %	60 %	0 %	526464212
99	NC_021881	GGTAC	2	10	192561	192570	20 %	20 %	40 %	20 %	526464212
100	NC_021881	TGAGG	2	10	195081	195090	20 %	20 %	60 %	0 %	526464213
101	NC_021881	ACAAA	2	10	196775	196784	80 %	0 %	0 %	20 %	526464214
102	NC_021881	AATGA	2	10	204096	204105	60 %	20 %	20 %	0 %	526464219
103	NC_021881	AAGCT	2	10	207253	207262	40 %	20 %	20 %	20 %	526464795
104	NC_021881	TATGG	2	10	207265	207274	20 %	40 %	40 %	0 %	526464795
105	NC_021881	AAGCA	2	10	208669	208678	60 %	0 %	20 %	20 %	526464221
106	NC_021881	ATCCC	2	10	211138	211147	20 %	20 %	0 %	60 %	526464222
107	NC_021881	GGTAT	2	10	211973	211982	20 %	40 %	40 %	0 %	526464222
108	NC_021881	GGGTG	2	10	211984	211993	0 %	20 %	80 %	0 %	526464222
109	NC_021881	ACTGA	2	10	214444	214453	40 %	20 %	20 %	20 %	526464797
110	NC_021881	CAAAA	2	10	217215	217224	80 %	0 %	0 %	20 %	526464223
111	NC_021881	CTTCC	2	10	218002	218011	0 %	40 %	0 %	60 %	526464224
112	NC_021881	TTTTC	2	10	221636	221645	0 %	80 %	0 %	20 %	526464226
113	NC_021881	GCGTT	2	10	223772	223781	0 %	40 %	40 %	20 %	526464227
114	NC_021881	TAGAT	2	10	226448	226457	40 %	40 %	20 %	0 %	526464804
115	NC_021881	CTGCT	2	10	229352	229361	0 %	40 %	20 %	40 %	526464229
116	NC_021881	GCACT	2	10	232823	232832	20 %	20 %	20 %	40 %	526464809
117	NC_021881	GGTAG	2	10	236541	236550	20 %	20 %	60 %	0 %	526464231
118	NC_021881	TTTGA	2	10	239030	239039	20 %	60 %	20 %	0 %	526464232
119	NC_021881	ATGGT	2	10	241548	241557	20 %	40 %	40 %	0 %	526464235
120	NC_021881	TAGCT	2	10	243966	243975	20 %	40 %	20 %	20 %	526464237
121	NC_021881	ATGCC	2	10	247331	247340	20 %	20 %	20 %	40 %	526464240
122	NC_021881	GAACG	2	10	247551	247560	40 %	0 %	40 %	20 %	526464240
123	NC_021881	ATCGT	2	10	253769	253778	20 %	40 %	20 %	20 %	526464243
124	NC_021881	AGAGG	2	10	256059	256068	40 %	0 %	60 %	0 %	526464244
125	NC_021881	GAAAG	2	10	256595	256604	60 %	0 %	40 %	0 %	526464244
126	NC_021881	GGAAG	2	10	256632	256641	40 %	0 %	60 %	0 %	526464244
127	NC_021881	GTGCT	2	10	259719	259728	0 %	40 %	40 %	20 %	526464813
128	NC_021881	TTGTT	2	10	260723	260732	0 %	80 %	20 %	0 %	526464246
129	NC_021881	TCCAT	2	10	260963	260972	20 %	40 %	0 %	40 %	526464246
130	NC_021881	AGAAT	2	10	261261	261270	60 %	20 %	20 %	0 %	526464246
131	NC_021881	AAATG	2	10	263456	263465	60 %	20 %	20 %	0 %	526464248
132	NC_021881	GTCAG	2	10	263533	263542	20 %	20 %	40 %	20 %	526464248
133	NC_021881	AAACA	2	10	264604	264613	80 %	0 %	0 %	20 %	526464249
134	NC_021881	CAACT	2	10	270322	270331	40 %	20 %	0 %	40 %	526464252
135	NC_021881	ACCTT	2	10	270952	270961	20 %	40 %	0 %	40 %	526464252
136	NC_021881	CACTA	2	10	271590	271599	40 %	20 %	0 %	40 %	526464252
137	NC_021881	CAGCT	2	10	272271	272280	20 %	20 %	20 %	40 %	526464253
138	NC_021881	TGCCA	2	10	272912	272921	20 %	20 %	20 %	40 %	526464254
139	NC_021881	GATAA	2	10	274305	274314	60 %	20 %	20 %	0 %	526464255
140	NC_021881	ATAGG	2	10	275267	275276	40 %	20 %	40 %	0 %	526464257
141	NC_021881	TTTAC	2	10	278234	278243	20 %	60 %	0 %	20 %	526464262
142	NC_021881	GTGAT	2	10	279942	279951	20 %	40 %	40 %	0 %	526464266
143	NC_021881	AAGGT	2	10	280253	280262	40 %	20 %	40 %	0 %	526464267
144	NC_021881	CAAAG	2	10	281986	281995	60 %	0 %	20 %	20 %	526464271
145	NC_021881	AAAGG	2	10	282281	282290	60 %	0 %	40 %	0 %	526464271
146	NC_021881	AATGA	2	10	284020	284029	60 %	20 %	20 %	0 %	526464275
147	NC_021881	ATAAA	2	10	288847	288856	80 %	20 %	0 %	0 %	526464281
148	NC_021881	TGCAT	2	10	288967	288976	20 %	40 %	20 %	20 %	526464281
149	NC_021881	AAGGT	2	10	290278	290287	40 %	20 %	40 %	0 %	526464281
150	NC_021881	AACTA	2	10	294956	294965	60 %	20 %	0 %	20 %	526464283
151	NC_021881	TAGGT	2	10	296755	296764	20 %	40 %	40 %	0 %	526464285
152	NC_021881	GTCGC	2	10	300893	300902	0 %	20 %	40 %	40 %	526464289
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155	NC_021881	CAAAA	2	10	303914	303923	80 %	0 %	0 %	20 %	526464825
156	NC_021881	CATGC	2	10	304847	304856	20 %	20 %	20 %	40 %	526464292
157	NC_021881	AGCAG	2	10	305758	305767	40 %	0 %	40 %	20 %	526464293
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160	NC_021881	TGTGG	2	10	314211	314220	0 %	40 %	60 %	0 %	526464296
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163	NC_021881	TTGTG	2	10	321406	321415	0 %	60 %	40 %	0 %	526464834
164	NC_021881	GTGAT	2	10	322171	322180	20 %	40 %	40 %	0 %	526464299
165	NC_021881	TTGCA	2	10	322344	322353	20 %	40 %	20 %	20 %	526464299
166	NC_021881	TAGGG	2	10	322865	322874	20 %	20 %	60 %	0 %	526464299
167	NC_021881	AACAG	2	10	323288	323297	60 %	0 %	20 %	20 %	526464299
168	NC_021881	GAATG	2	10	324855	324864	40 %	20 %	40 %	0 %	526464300
169	NC_021881	TTTTG	2	10	325647	325656	0 %	80 %	20 %	0 %	526464301
170	NC_021881	AGATG	2	10	328381	328390	40 %	20 %	40 %	0 %	526464304
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172	NC_021881	CAGTG	2	10	329112	329121	20 %	20 %	40 %	20 %	526464304
173	NC_021881	TGATT	2	10	336712	336721	20 %	60 %	20 %	0 %	526464308
174	NC_021881	TTTAC	2	10	337424	337433	20 %	60 %	0 %	20 %	526464309
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177	NC_021881	CAACT	2	10	342792	342801	40 %	20 %	0 %	40 %	526464311
178	NC_021881	ACTGA	2	10	344064	344073	40 %	20 %	20 %	20 %	526464840
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194	NC_021881	ATGCA	2	10	379810	379819	40 %	20 %	20 %	20 %	526464851
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199	NC_021881	ATATG	2	10	392426	392435	40 %	40 %	20 %	0 %	526464855
200	NC_021881	CTGCA	2	10	393538	393547	20 %	20 %	20 %	40 %	526464855
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214	NC_021881	GGGAA	2	10	440166	440175	40 %	0 %	60 %	0 %	526464877
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249	NC_021881	TCCTT	2	10	530246	530255	0 %	60 %	0 %	40 %	526464382
250	NC_021881	TAGCA	2	10	530410	530419	40 %	20 %	20 %	20 %	526464382
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252	NC_021881	TGTAT	2	10	537283	537292	20 %	60 %	20 %	0 %	526464385
253	NC_021881	CTTTT	2	10	539096	539105	0 %	80 %	0 %	20 %	526464386
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259	NC_021881	ATCTG	2	10	566130	566139	20 %	40 %	20 %	20 %	526464398
260	NC_021881	AAATA	2	10	567445	567454	80 %	20 %	0 %	0 %	526464398
261	NC_021881	ATAGT	2	10	570550	570559	40 %	40 %	20 %	0 %	526464930
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263	NC_021881	CTTAT	2	10	571724	571733	20 %	60 %	0 %	20 %	526464930
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496	NC_021881	TGACA	2	10	1128239	1128248	40 %	20 %	20 %	20 %	526465186
497	NC_021881	TCTCA	2	10	1129304	1129313	20 %	40 %	0 %	40 %	526465187
498	NC_021881	CGCAG	2	10	1133048	1133057	20 %	0 %	40 %	40 %	526464571
499	NC_021881	AGCTG	2	10	1133266	1133275	20 %	20 %	40 %	20 %	526464571
500	NC_021881	GAAGT	2	10	1134244	1134253	40 %	20 %	40 %	0 %	526464571

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