MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Anaplasma phagocytophilum str. Dog2 genome

Total Repeats: 624

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021881	CTCTT	2	10	1135801	1135810	0 %	60 %	0 %	40 %	526464572
502	NC_021881	AAGAT	2	10	1138159	1138168	60 %	20 %	20 %	0 %	526464574
503	NC_021881	CACTG	2	10	1140569	1140578	20 %	20 %	20 %	40 %	526465190
504	NC_021881	ATATC	2	10	1142014	1142023	40 %	40 %	0 %	20 %	526465193
505	NC_021881	TGGTG	2	10	1143163	1143172	0 %	40 %	60 %	0 %	526464576
506	NC_021881	AGAGA	2	10	1143852	1143861	60 %	0 %	40 %	0 %	526464576
507	NC_021881	CAGTG	2	10	1147179	1147188	20 %	20 %	40 %	20 %	526465196
508	NC_021881	CGAAA	2	10	1148018	1148027	60 %	0 %	20 %	20 %	526465197
509	NC_021881	TATTT	2	10	1152708	1152717	20 %	80 %	0 %	0 %	526465199
510	NC_021881	TTGAC	2	10	1157626	1157635	20 %	40 %	20 %	20 %	526465204
511	NC_021881	CAAAC	2	10	1159703	1159712	60 %	0 %	0 %	40 %	526464583
512	NC_021881	GTAAT	2	10	1160385	1160394	40 %	40 %	20 %	0 %	526464584
513	NC_021881	GAGAA	2	10	1165584	1165593	60 %	0 %	40 %	0 %	526465211
514	NC_021881	CCGTA	2	10	1166052	1166061	20 %	20 %	20 %	40 %	526464587
515	NC_021881	AAAGC	2	10	1167161	1167170	60 %	0 %	20 %	20 %	526464589
516	NC_021881	AAAGC	2	10	1167377	1167386	60 %	0 %	20 %	20 %	526464589
517	NC_021881	TCTCT	2	10	1167787	1167796	0 %	60 %	0 %	40 %	526464589
518	NC_021881	TCCCT	2	10	1170632	1170641	0 %	40 %	0 %	60 %	526464590
519	NC_021881	GATAC	2	10	1174137	1174146	40 %	20 %	20 %	20 %	526465215
520	NC_021881	AAAGT	2	10	1177145	1177154	60 %	20 %	20 %	0 %	526464593
521	NC_021881	TTCAC	2	10	1179220	1179229	20 %	40 %	0 %	40 %	526464593
522	NC_021881	CGTAT	2	10	1180268	1180277	20 %	40 %	20 %	20 %	526465217
523	NC_021881	TTCTG	2	10	1182374	1182383	0 %	60 %	20 %	20 %	526464594
524	NC_021881	GTACT	2	10	1189904	1189913	20 %	40 %	20 %	20 %	526465224
525	NC_021881	TACCA	2	10	1193666	1193675	40 %	20 %	0 %	40 %	526464596
526	NC_021881	ATCCT	2	10	1200569	1200578	20 %	40 %	0 %	40 %	526464603
527	NC_021881	GTTTG	2	10	1207885	1207894	0 %	60 %	40 %	0 %	526464608
528	NC_021881	ACAAA	2	10	1210766	1210775	80 %	0 %	0 %	20 %	526464609
529	NC_021881	CAGAG	2	10	1211060	1211069	40 %	0 %	40 %	20 %	526464610
530	NC_021881	CCGCT	2	10	1214531	1214540	0 %	20 %	20 %	60 %	526465237
531	NC_021881	ACATA	2	10	1218379	1218388	60 %	20 %	0 %	20 %	526465237
532	NC_021881	TGCAA	2	10	1223496	1223505	40 %	20 %	20 %	20 %	526465241
533	NC_021881	CAAAA	2	10	1225262	1225271	80 %	0 %	0 %	20 %	526465242
534	NC_021881	ATGAG	2	10	1230518	1230527	40 %	20 %	40 %	0 %	526465244
535	NC_021881	TTTCT	2	10	1232768	1232777	0 %	80 %	0 %	20 %	526464616
536	NC_021881	CTCCA	2	10	1234003	1234012	20 %	20 %	0 %	60 %	526464617
537	NC_021881	CTGCA	2	10	1234564	1234573	20 %	20 %	20 %	40 %	526464617
538	NC_021881	AATGC	2	10	1235928	1235937	40 %	20 %	20 %	20 %	526465245
539	NC_021881	TTTGC	2	10	1240917	1240926	0 %	60 %	20 %	20 %	526464618
540	NC_021881	TGCGG	2	10	1241492	1241501	0 %	20 %	60 %	20 %	526464618
541	NC_021881	GGTGA	2	10	1245475	1245484	20 %	20 %	60 %	0 %	526464621
542	NC_021881	CAGTG	2	10	1247898	1247907	20 %	20 %	40 %	20 %	526465249
543	NC_021881	CGATA	2	10	1249288	1249297	40 %	20 %	20 %	20 %	526464623
544	NC_021881	TGCAA	2	10	1251047	1251056	40 %	20 %	20 %	20 %	526464623
545	NC_021881	ACGAA	2	10	1253006	1253015	60 %	0 %	20 %	20 %	526464624
546	NC_021881	ATAGC	2	10	1253273	1253282	40 %	20 %	20 %	20 %	526464624
547	NC_021881	CTCAT	2	10	1258038	1258047	20 %	40 %	0 %	40 %	526465250
548	NC_021881	CACTG	2	10	1258313	1258322	20 %	20 %	20 %	40 %	526465250
549	NC_021881	TCAAC	2	10	1263396	1263405	40 %	20 %	0 %	40 %	526464628
550	NC_021881	ATTTC	2	10	1264202	1264211	20 %	60 %	0 %	20 %	526464629
551	NC_021881	ACAAG	2	10	1268615	1268624	60 %	0 %	20 %	20 %	526464631
552	NC_021881	TTTCA	2	10	1274348	1274357	20 %	60 %	0 %	20 %	526464634
553	NC_021881	GTAGA	2	10	1274567	1274576	40 %	20 %	40 %	0 %	526464634
554	NC_021881	AGTAC	2	10	1274706	1274715	40 %	20 %	20 %	20 %	526464634
555	NC_021881	TGCCC	2	10	1277051	1277060	0 %	20 %	20 %	60 %	526464636
556	NC_021881	AACCA	2	10	1280376	1280385	60 %	0 %	0 %	40 %	526464639
557	NC_021881	CTATC	2	10	1282300	1282309	20 %	40 %	0 %	40 %	526464640
558	NC_021881	CTCTA	2	10	1283973	1283982	20 %	40 %	0 %	40 %	526465261
559	NC_021881	TTACT	2	10	1288587	1288596	20 %	60 %	0 %	20 %	526464643
560	NC_021881	TACCA	2	10	1288883	1288892	40 %	20 %	0 %	40 %	526464643
561	NC_021881	AAAGC	2	10	1290163	1290172	60 %	0 %	20 %	20 %	526464645
562	NC_021881	TTATG	2	10	1291562	1291571	20 %	60 %	20 %	0 %	526465264
563	NC_021881	CTATA	2	10	1291842	1291851	40 %	40 %	0 %	20 %	526465264
564	NC_021881	ACCCT	2	10	1296144	1296153	20 %	20 %	0 %	60 %	526464646
565	NC_021881	AACCG	2	10	1296840	1296849	40 %	0 %	20 %	40 %	526464646
566	NC_021881	GGGCA	2	10	1302576	1302585	20 %	0 %	60 %	20 %	526465270
567	NC_021881	TTTCC	2	10	1307481	1307490	0 %	60 %	0 %	40 %	526464651
568	NC_021881	GAAAG	2	10	1308448	1308457	60 %	0 %	40 %	0 %	526465272
569	NC_021881	AGGTT	2	10	1308844	1308853	20 %	40 %	40 %	0 %	526465272
570	NC_021881	CAGTG	2	10	1310191	1310200	20 %	20 %	40 %	20 %	526465274
571	NC_021881	ATAGC	2	10	1313151	1313160	40 %	20 %	20 %	20 %	526464652
572	NC_021881	TGTTC	2	10	1314716	1314725	0 %	60 %	20 %	20 %	526465277
573	NC_021881	AGTGG	2	10	1318572	1318581	20 %	20 %	60 %	0 %	526464654
574	NC_021881	TTTTC	2	10	1321526	1321535	0 %	80 %	0 %	20 %	526464656
575	NC_021881	GGTAA	2	10	1321887	1321896	40 %	20 %	40 %	0 %	526464656
576	NC_021881	ATGTA	2	10	1326161	1326170	40 %	40 %	20 %	0 %	526464657
577	NC_021881	CAGGC	2	10	1327201	1327210	20 %	0 %	40 %	40 %	526465283
578	NC_021881	TAGTA	2	10	1332750	1332759	40 %	40 %	20 %	0 %	526464659
579	NC_021881	ACAGT	2	10	1335438	1335447	40 %	20 %	20 %	20 %	526464661
580	NC_021881	CTCTC	2	10	1335525	1335534	0 %	40 %	0 %	60 %	526464661
581	NC_021881	GGTAC	2	10	1336430	1336439	20 %	20 %	40 %	20 %	526464661
582	NC_021881	CGAGA	2	10	1337716	1337725	40 %	0 %	40 %	20 %	526465289
583	NC_021881	CAAAC	2	10	1337849	1337858	60 %	0 %	0 %	40 %	526464662
584	NC_021881	TTTGT	2	10	1340166	1340175	0 %	80 %	20 %	0 %	526465290
585	NC_021881	TTGAG	2	10	1341664	1341673	20 %	40 %	40 %	0 %	526465291
586	NC_021881	TACTC	2	10	1343005	1343014	20 %	40 %	0 %	40 %	526464665
587	NC_021881	CAACA	2	10	1343068	1343077	60 %	0 %	0 %	40 %	526464665
588	NC_021881	TGCGG	2	10	1355494	1355503	0 %	20 %	60 %	20 %	526465297
589	NC_021881	GCAAA	2	10	1360409	1360418	60 %	0 %	20 %	20 %	526464673
590	NC_021881	GAAAT	2	10	1361696	1361705	60 %	20 %	20 %	0 %	526464675
591	NC_021881	GCTCT	2	10	1372590	1372599	0 %	40 %	20 %	40 %	526465304
592	NC_021881	CCTAC	2	10	1373596	1373605	20 %	20 %	0 %	60 %	526464682
593	NC_021881	AACGC	2	10	1374875	1374884	40 %	0 %	20 %	40 %	526464683
594	NC_021881	GAGCA	2	10	1376127	1376136	40 %	0 %	40 %	20 %	526464684
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598	NC_021881	GTTAT	2	10	1396226	1396235	20 %	60 %	20 %	0 %	526465313
599	NC_021881	AACTC	2	10	1397612	1397621	40 %	20 %	0 %	40 %	526465314
600	NC_021881	AACCT	2	10	1400185	1400194	40 %	20 %	0 %	40 %	526464693
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606	NC_021881	TCACA	2	10	1433028	1433037	40 %	20 %	0 %	40 %	526464708
607	NC_021881	AGCCA	2	10	1433323	1433332	40 %	0 %	20 %	40 %	526464708
608	NC_021881	AGGAT	2	10	1433801	1433810	40 %	20 %	40 %	0 %	526464708
609	NC_021881	AGGTA	2	10	1434851	1434860	40 %	20 %	40 %	0 %	526465333
610	NC_021881	CTCAG	2	10	1437024	1437033	20 %	20 %	20 %	40 %	526464709
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612	NC_021881	GTTTG	2	10	1443520	1443529	0 %	60 %	40 %	0 %	526464715
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614	NC_021881	TGCTT	2	10	1443673	1443682	0 %	60 %	20 %	20 %	526464715
615	NC_021881	CTTGA	2	10	1445438	1445447	20 %	40 %	20 %	20 %	526465337
616	NC_021881	AAGTA	2	10	1446846	1446855	60 %	20 %	20 %	0 %	526465339
617	NC_021881	AAAAT	2	10	1458179	1458188	80 %	20 %	0 %	0 %	526464716
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621	NC_021881	TGAGA	2	10	1464431	1464440	40 %	20 %	40 %	0 %	526464719
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623	NC_021881	ATGTA	2	10	1471099	1471108	40 %	40 %	20 %	0 %	526464723
624	NC_021881	TTGCC	2	10	1473010	1473019	0 %	40 %	20 %	40 %	526465355

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