MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021738	ACGAAT	2	12	2458760	2458771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525657912
1002	NC_021738	ACACGT	2	12	2460600	2460611	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525657912
1003	NC_021738	TAATTC	2	12	2461100	2461111	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525657912
1004	NC_021738	GGTTAG	2	12	2462628	2462639	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525657913
1005	NC_021738	TAAAAA	2	12	2467018	2467029	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525657918
1006	NC_021738	GGCATT	2	12	2471844	2471855	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525657925
1007	NC_021738	ATCGGA	2	12	2474016	2474027	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525657927
1008	NC_021738	TGATTT	2	12	2474701	2474712	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525657928
1009	NC_021738	AACTTT	2	12	2482660	2482671	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525657938
1010	NC_021738	TTGTTT	2	12	2482786	2482797	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525657938
1011	NC_021738	AGAAAT	2	12	2483828	2483839	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525657940
1012	NC_021738	TTTCGC	2	12	2484124	2484135	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525657940
1013	NC_021738	GCGTTT	2	12	2484945	2484956	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1014	NC_021738	ATTCTG	2	12	2487917	2487928	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525657943
1015	NC_021738	AAAGCA	2	12	2488999	2489010	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525657943
1016	NC_021738	GAAATG	2	12	2491164	2491175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021738	TCAGAC	2	12	2494278	2494289	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525655723
1018	NC_021738	CTGAGT	2	12	2500582	2500593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525657952
1019	NC_021738	AGCGGT	2	12	2500930	2500941	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525657952
1020	NC_021738	GCCCAA	2	12	2500965	2500976	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525657952

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.