MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1020

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021738	AAACGT	2	12	1181564	1181575	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525656752
502	NC_021738	CTTTGT	2	12	1184091	1184102	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525656755
503	NC_021738	TGAAGA	2	12	1185071	1185082	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525656756
504	NC_021738	TGATTT	2	12	1186031	1186042	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	525656757
505	NC_021738	TCGACT	2	12	1187744	1187755	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525656758
506	NC_021738	GTGCAA	2	12	1188791	1188802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525656758
507	NC_021738	CAAAGA	2	12	1189620	1189631	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525656758
508	NC_021738	TTATCT	2	12	1192756	1192767	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525656760
509	NC_021738	AATAAA	2	12	1194232	1194243	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	525656762
510	NC_021738	CGGTGC	2	12	1198681	1198692	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	525656767
511	NC_021738	TTCCAT	2	12	1200523	1200534	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525656768
512	NC_021738	AAATGG	2	12	1203973	1203984	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525656770
513	NC_021738	TAAGAA	2	12	1204024	1204035	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525656770
514	NC_021738	TATAAA	2	12	1204173	1204184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
515	NC_021738	TGGCAT	2	12	1207130	1207141	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525656774
516	NC_021738	ATTTTA	2	12	1207913	1207924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021738	CCGAAA	2	12	1207981	1207992	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_021738	GCGATT	2	12	1208076	1208087	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
519	NC_021738	TCGGTG	2	12	1215130	1215141	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	525656780
520	NC_021738	CAAATC	2	12	1215762	1215773	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525656781
521	NC_021738	CCCAAA	2	12	1218902	1218913	50 %	0 %	0 %	50 %	525656784
522	NC_021738	TTGAAA	2	12	1221115	1221126	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525656786
523	NC_021738	CTTTGC	2	12	1224620	1224631	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	525656790
524	NC_021738	AACGCA	2	12	1230781	1230792	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525656797
525	NC_021738	ATCTCG	2	12	1231223	1231234	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	525656798
526	NC_021738	CAGAGG	2	12	1231260	1231271	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525656798
527	NC_021738	GTTCTT	2	12	1234340	1234351	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525656803
528	NC_021738	TTTTGC	2	12	1236142	1236153	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
529	NC_021738	ATTTCA	2	12	1237363	1237374	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
530	NC_021738	GCCTTC	2	12	1240793	1240804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
531	NC_021738	AATTAA	2	12	1241582	1241593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
532	NC_021738	GCTTTC	2	12	1249949	1249960	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_021738	TCTTAT	2	12	1253663	1253674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
534	NC_021738	CTAATA	2	12	1253757	1253768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
535	NC_021738	CCACTT	2	12	1255615	1255626	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	525656816
536	NC_021738	CGTAAG	2	12	1255791	1255802	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525656816
537	NC_021738	TCTAAA	2	12	1258875	1258886	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525656816
538	NC_021738	CATATA	2	12	1260057	1260068	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525656818
539	NC_021738	GAATAT	2	12	1263733	1263744	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	525656818
540	NC_021738	ATCTTT	2	12	1264147	1264158	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	525656820
541	NC_021738	ATTAAT	2	12	1266452	1266463	50 %	50 %	0 %	0 %	525656824
542	NC_021738	TTAATT	2	12	1268683	1268694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656827
543	NC_021738	TACCCA	2	12	1269558	1269569	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525656828
544	NC_021738	TTCAAC	2	12	1272831	1272842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_021738	TCAAAA	2	12	1273991	1274002	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525656830
546	NC_021738	GTTTTT	2	12	1279698	1279709	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	525656837
547	NC_021738	CCGCTT	2	12	1282398	1282409	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	525656839
548	NC_021738	CCCCTT	2	12	1284903	1284914	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525656842
549	NC_021738	ACCAGA	2	12	1287125	1287136	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525655684
550	NC_021738	AATTCT	2	12	1287655	1287666	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	525656844
551	NC_021738	TATTGA	2	12	1293118	1293129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525656850
552	NC_021738	GAAAGT	2	12	1293253	1293264	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525656850
553	NC_021738	CTAAGC	2	12	1294813	1294824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525656852
554	NC_021738	CTTTCA	2	12	1296118	1296129	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525656853
555	NC_021738	CAAACG	2	12	1297147	1297158	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525656854
556	NC_021738	ACTTTA	2	12	1298618	1298629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
557	NC_021738	CTATAA	2	12	1309672	1309683	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
558	NC_021738	ACGGCT	2	12	1319841	1319852	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_021738	CGTTGC	2	12	1320347	1320358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_021738	GCAGTA	2	12	1323611	1323622	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	525656870
561	NC_021738	GCACCG	2	12	1323646	1323657	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	525656870
562	NC_021738	CGATAC	2	12	1325579	1325590	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525656871
563	NC_021738	ATCACC	2	12	1326497	1326508	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	525656872
564	NC_021738	TTACCT	2	12	1332525	1332536	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	525655686
565	NC_021738	TTCGAT	2	12	1336476	1336487	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
566	NC_021738	ACTTAG	2	12	1340581	1340592	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525656887
567	NC_021738	TGCCGC	2	12	1342120	1342131	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	525656889
568	NC_021738	ATTTCA	2	12	1345985	1345996	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
569	NC_021738	GCCTTC	2	12	1349299	1349310	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
570	NC_021738	AATTAA	2	12	1350088	1350099	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_021738	AAAAAC	2	12	1350298	1350309	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
572	NC_021738	TGCATT	2	12	1353238	1353249	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	525656894
573	NC_021738	GATTTG	2	12	1353711	1353722	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	525656894
574	NC_021738	ACGAAA	2	12	1363504	1363515	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
575	NC_021738	CGCCAT	2	12	1364658	1364669	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
576	NC_021738	AAGCGG	2	12	1372435	1372446	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	525656911
577	NC_021738	AAACGG	2	12	1392172	1392183	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	525656928
578	NC_021738	TGAAAG	2	12	1396677	1396688	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525656931
579	NC_021738	AACCGC	2	12	1396756	1396767	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525656931
580	NC_021738	AGCAAC	2	12	1401793	1401804	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525656935
581	NC_021738	ATTTCA	2	12	1404731	1404742	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
582	NC_021738	GCCTTC	2	12	1408045	1408056	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
583	NC_021738	AATTAA	2	12	1408834	1408845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021738	AAGCTC	2	12	1412844	1412855	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525656940
585	NC_021738	AGCTAA	2	12	1414128	1414139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	525656942
586	NC_021738	CGGTTT	2	12	1414597	1414608	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	525656943
587	NC_021738	TCAAAT	2	12	1417764	1417775	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	525656945
588	NC_021738	AATCCA	2	12	1418727	1418738	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	525656947
589	NC_021738	GCCAAA	2	12	1427482	1427493	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	525656955
590	NC_021738	ATTGCG	2	12	1428369	1428380	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525656956
591	NC_021738	GTGATG	2	12	1430591	1430602	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	525656958
592	NC_021738	TTGTAA	2	12	1431611	1431622	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	525656960
593	NC_021738	ACGAAA	2	12	1434316	1434327	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
594	NC_021738	TTTTGC	2	12	1434784	1434795	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
595	NC_021738	ATTTCA	2	12	1436004	1436015	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
596	NC_021738	GCCTTC	2	12	1439433	1439444	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
597	NC_021738	AATTAA	2	12	1440222	1440233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_021738	TTTAAA	2	12	1443491	1443502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
599	NC_021738	CTATTC	2	12	1448077	1448088	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_021738	CTAAGT	2	12	1448877	1448888	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525656973
601	NC_021738	ATACCG	2	12	1450100	1450111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	525656973
602	NC_021738	AATCGT	2	12	1450120	1450131	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	525656973
603	NC_021738	ACACGC	2	12	1450154	1450165	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	525656973
604	NC_021738	CAAAGA	2	12	1450977	1450988	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	525656975
605	NC_021738	GAAAGT	2	12	1451763	1451774	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	525656976
606	NC_021738	TGCTTT	2	12	1455866	1455877	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	525656978
607	NC_021738	ATTGAA	2	12	1464503	1464514	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021738	ATAAAA	2	12	1464557	1464568	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_021738	ACGTGG	2	12	1464849	1464860	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	525656985
610	NC_021738	AAAATC	2	12	1465079	1465090	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	525656985
611	NC_021738	AAGATA	2	12	1466454	1466465	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	525656986
612	NC_021738	CGGGGC	2	12	1473336	1473347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656994
613	NC_021738	CAAAAA	2	12	1473895	1473906	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
614	NC_021738	CGAAAA	2	12	1479579	1479590	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
615	NC_021738	AGTCGT	2	12	1479966	1479977	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	525656997
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720	NC_021738	TGAATG	2	12	1743283	1743294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525657243
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724	NC_021738	ATTTTA	2	12	1748561	1748572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525657249
725	NC_021738	CTGTGC	2	12	1751900	1751911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525657254
726	NC_021738	TGAAAG	2	12	1757448	1757459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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