MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 4075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	TGA	2	6	29	34	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021738	TGA	2	6	45	50	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021738	GAA	2	6	96	101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021738	CAC	2	6	110	115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_021738	AAT	2	6	277	282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021738	CCA	2	6	482	487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_021738	CTT	2	6	488	493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_021738	CAG	2	6	548	553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_021738	CAA	2	6	593	598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_021738	TTG	2	6	979	984	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021738	ATA	2	6	998	1003	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021738	AGA	2	6	1060	1065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021738	TCG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_021738	CAC	2	6	1182	1187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_021738	CAG	2	6	1235	1240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021738	ATG	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021738	AAG	2	6	1490	1495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021738	TTC	2	6	1540	1545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_021738	ACC	2	6	1687	1692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_021738	CCA	2	6	1758	1763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_021738	TAA	2	6	2079	2084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021738	TTA	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021738	TAA	2	6	6415	6420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021738	AGT	2	6	6494	6499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021738	ATT	2	6	6511	6516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021738	TCA	2	6	6521	6526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021738	TGA	2	6	6832	6837	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021738	ATG	2	6	6884	6889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021738	AAG	2	6	7069	7074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021738	ATA	2	6	7225	7230	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021738	CAA	2	6	7305	7310	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_021738	AGA	2	6	7401	7406	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021738	TCT	2	6	8590	8595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021738	CAA	2	6	8850	8855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_021738	TTA	2	6	8865	8870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021738	GAT	2	6	8903	8908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021738	GTA	2	6	10749	10754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021738	CCG	2	6	10807	10812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_021738	ACT	2	6	10849	10854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_021738	TAT	2	6	10891	10896	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021738	AAT	2	6	10981	10986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021738	TTA	2	6	11006	11011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021738	TTA	2	6	11051	11056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_021738	TAT	2	6	11072	11077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021738	TTA	2	6	11784	11789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021738	GTT	2	6	16606	16611	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021738	TAC	2	6	16688	16693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_021738	TAG	2	6	16696	16701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021738	TAA	2	6	16727	16732	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021738	ATA	2	6	18529	18534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021738	AGG	2	6	18543	18548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021738	GTT	2	6	18910	18915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021738	TTG	2	6	20943	20948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021738	AAT	2	6	23928	23933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021738	ACT	2	6	26447	26452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021738	ATA	2	6	27675	27680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021738	TTG	2	6	27733	27738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021738	GAA	2	6	27840	27845	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021738	TCT	2	6	30644	30649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021738	AAG	2	6	30696	30701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021738	CTC	2	6	32626	32631	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
62	NC_021738	ATT	2	6	32702	32707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021738	ATT	2	6	34244	34249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021738	ATT	2	6	34309	34314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021738	CAC	2	6	34410	34415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_021738	TGT	2	6	34430	34435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021738	AAT	2	6	35433	35438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021738	ATT	2	6	35523	35528	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021738	ACA	2	6	35535	35540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021738	ACC	2	6	35700	35705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_021738	TGT	2	6	35798	35803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021738	TGA	2	6	35936	35941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021738	GTA	2	6	35986	35991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021738	GTC	2	6	36016	36021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_021738	TGA	2	6	36035	36040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021738	GTG	2	6	36133	36138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021738	AGT	2	6	36458	36463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021738	ATA	2	6	36840	36845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021738	TAT	2	6	38371	38376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021738	ATA	2	6	39208	39213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021738	TTA	2	6	39261	39266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021738	AGA	2	6	39290	39295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021738	CAG	2	6	40018	40023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021738	AAG	2	6	42018	42023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021738	TAC	2	6	43705	43710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021738	AAT	2	6	43734	43739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_021738	GAA	2	6	46875	46880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021738	ATA	2	6	48887	48892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021738	CTT	2	6	48903	48908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_021738	TAA	2	6	48992	48997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021738	GAA	2	6	49015	49020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_021738	TAT	2	6	49078	49083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021738	AAT	2	6	49119	49124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021738	ATT	2	6	49178	49183	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021738	TAT	2	6	51401	51406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021738	AAC	2	6	53998	54003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021738	TAA	2	6	54126	54131	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021738	TTC	2	6	54933	54938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_021738	AGG	2	6	56914	56919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_021738	AAT	2	6	57863	57868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021738	GTA	2	6	61211	61216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021738	TGA	2	6	61439	61444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021738	CAT	2	6	61464	61469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_021738	CAA	2	6	61590	61595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021738	ACC	2	6	61650	61655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021738	TAA	2	6	61779	61784	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021738	CAG	2	6	61787	61792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_021738	CAA	2	6	61814	61819	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021738	AAG	2	6	61827	61832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021738	GTA	2	6	61882	61887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021738	TTG	2	6	66073	66078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021738	ACC	2	6	66140	66145	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_021738	GTA	2	6	67196	67201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021738	TTG	2	6	67964	67969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021738	GAA	2	6	69247	69252	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021738	TAG	2	6	69338	69343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021738	ATT	2	6	69412	69417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021738	TGG	2	6	69533	69538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021738	TTC	2	6	69564	69569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_021738	ACC	2	6	69717	69722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_021738	ATA	2	6	69920	69925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021738	TTC	2	6	69981	69986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021738	ATT	2	6	70062	70067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021738	GTC	2	6	70102	70107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_021738	TTG	2	6	70420	70425	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021738	TGT	2	6	70663	70668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_021738	CAT	2	6	70730	70735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_021738	AGC	2	6	70814	70819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_021738	TGA	2	6	70845	70850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021738	AAC	2	6	70929	70934	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_021738	GTT	2	6	70993	70998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021738	ACC	2	6	71017	71022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_021738	CCT	2	6	74416	74421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_021738	TTC	2	6	75444	75449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_021738	TTG	2	6	76372	76377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_021738	TAA	2	6	76512	76517	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021738	TAA	2	6	77567	77572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021738	AAT	2	6	77587	77592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021738	TTA	2	6	77594	77599	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021738	CAA	2	6	79963	79968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021738	ATG	2	6	80111	80116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NC_021738	GCA	2	6	80118	80123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_021738	GAA	2	6	80170	80175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_021738	GAA	2	6	80379	80384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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