MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 4075

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021738	TGA	2	6	585585	585590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_021738	TAT	2	6	585591	585596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_021738	TCT	3	9	585738	585746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_021738	AAT	2	6	585814	585819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1005	NC_021738	TTA	2	6	585821	585826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_021738	CTT	2	6	585883	585888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_021738	CAA	2	6	587247	587252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_021738	GGC	2	6	588257	588262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_021738	CTG	2	6	590558	590563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_021738	GAA	2	6	591446	591451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_021738	AAT	2	6	591466	591471	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_021738	TAC	2	6	591484	591489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_021738	TGT	2	6	591614	591619	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_021738	CAA	2	6	591637	591642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_021738	CTT	2	6	591730	591735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_021738	TAT	2	6	591740	591745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_021738	TAT	2	6	596950	596955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_021738	CAA	2	6	596998	597003	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_021738	CAA	2	6	597040	597045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_021738	GGT	2	6	597386	597391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_021738	TAA	2	6	597484	597489	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_021738	GTT	2	6	597544	597549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021738	TAA	2	6	597669	597674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_021738	AAT	2	6	597687	597692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_021738	AAT	2	6	597729	597734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_021738	CAA	2	6	597829	597834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_021738	ATT	2	6	597883	597888	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_021738	CAA	2	6	597911	597916	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_021738	TTA	2	6	600687	600692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_021738	ATA	2	6	601898	601903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_021738	TTG	2	6	603406	603411	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_021738	TCA	2	6	603426	603431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_021738	ACT	2	6	603571	603576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_021738	AAT	2	6	603638	603643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_021738	ATT	2	6	603777	603782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_021738	GCA	2	6	603784	603789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_021738	TTG	2	6	603801	603806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_021738	TTG	2	6	603831	603836	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_021738	GTT	2	6	603839	603844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021738	ATT	2	6	603915	603920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1041	NC_021738	GGC	2	6	603980	603985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_021738	TTG	2	6	604083	604088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_021738	GCA	2	6	604198	604203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_021738	TCA	2	6	604261	604266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_021738	AAT	2	6	604317	604322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_021738	ATT	2	6	606378	606383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_021738	TCT	2	6	606403	606408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_021738	TGA	2	6	608427	608432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_021738	AAT	2	6	608555	608560	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_021738	GTT	2	6	610346	610351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_021738	ATA	2	6	610529	610534	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1052	NC_021738	AGA	2	6	611781	611786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_021738	TTC	2	6	612002	612007	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_021738	GCA	2	6	612248	612253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_021738	TTG	2	6	612319	612324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_021738	CAC	2	6	612408	612413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1057	NC_021738	TCT	2	6	612425	612430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_021738	GAT	2	6	612531	612536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_021738	CCT	2	6	612560	612565	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_021738	TCA	2	6	612668	612673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_021738	ACC	2	6	612726	612731	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_021738	TTG	2	6	612744	612749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_021738	TTC	2	6	612813	612818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_021738	TAA	2	6	612828	612833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_021738	GTT	2	6	612858	612863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_021738	TCT	2	6	612968	612973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1067	NC_021738	TCA	2	6	613048	613053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_021738	ATT	2	6	613095	613100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_021738	TTA	2	6	613577	613582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_021738	AAT	2	6	618376	618381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1071	NC_021738	ATC	2	6	618411	618416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_021738	ACA	2	6	621763	621768	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_021738	TAT	2	6	621782	621787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_021738	TAT	2	6	623892	623897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_021738	AAT	2	6	629593	629598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_021738	ATT	2	6	629731	629736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_021738	TAA	2	6	629767	629772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_021738	TCA	2	6	629775	629780	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_021738	AAT	2	6	634976	634981	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_021738	TCT	2	6	636338	636343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_021738	ATT	2	6	642076	642081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_021738	CTG	2	6	646157	646162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_021738	ATT	2	6	646210	646215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_021738	TAA	2	6	648624	648629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_021738	ATT	2	6	649507	649512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_021738	ATT	2	6	649624	649629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_021738	AAT	2	6	649633	649638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_021738	TGA	2	6	649676	649681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_021738	AGG	2	6	649720	649725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_021738	CTA	2	6	651332	651337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_021738	TTA	2	6	651382	651387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021738	TTC	2	6	652448	652453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_021738	CAA	2	6	652490	652495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_021738	AGC	2	6	653836	653841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_021738	CAA	2	6	659249	659254	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_021738	CAG	2	6	659268	659273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_021738	TAG	2	6	659285	659290	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_021738	ACA	2	6	659308	659313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_021738	AGC	2	6	659324	659329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_021738	AAT	2	6	659464	659469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021738	GGT	2	6	659493	659498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021738	AAG	2	6	664279	664284	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_021738	ACA	2	6	664297	664302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_021738	CTA	2	6	664315	664320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_021738	TAA	2	6	664329	664334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_021738	AAG	2	6	664343	664348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1107	NC_021738	TAA	2	6	664365	664370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_021738	ATC	2	6	666466	666471	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_021738	ATA	2	6	666552	666557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_021738	GCA	2	6	666612	666617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_021738	GTA	2	6	666749	666754	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_021738	TTC	2	6	666776	666781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_021738	TAA	2	6	666843	666848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021738	ATC	2	6	666993	666998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_021738	CGG	2	6	667051	667056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_021738	CCA	2	6	667072	667077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1117	NC_021738	CTA	2	6	667248	667253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_021738	GCT	2	6	667338	667343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_021738	TAA	2	6	667357	667362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_021738	GTT	2	6	667409	667414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021738	CAA	2	6	667428	667433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_021738	CTT	2	6	667461	667466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_021738	AAT	2	6	667525	667530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_021738	GTC	2	6	670671	670676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_021738	ATT	2	6	670721	670726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_021738	GAA	2	6	671581	671586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_021738	TTA	2	6	673182	673187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021738	GTG	2	6	673193	673198	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_021738	ATC	2	6	674654	674659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_021738	TAT	2	6	674700	674705	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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