MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complete genome

Total Repeats: 6589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021285	GCGCC	2	10	239	248	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2	NC_021285	GCCGT	2	10	2387	2396	0 %	20 %	40 %	40 %	528981798
3	NC_021285	GCCAG	2	10	3727	3736	20 %	0 %	40 %	40 %	528981800
4	NC_021285	CGGGC	2	10	4302	4311	0 %	0 %	60 %	40 %	528981801
5	NC_021285	CATGC	2	10	4916	4925	20 %	20 %	20 %	40 %	528981802
6	NC_021285	AAGGA	2	10	9002	9011	60 %	0 %	40 %	0 %	528981807
7	NC_021285	AACTG	2	10	9176	9185	40 %	20 %	20 %	20 %	528981807
8	NC_021285	GGATG	2	10	9697	9706	20 %	20 %	60 %	0 %	528981807
9	NC_021285	GCGGT	2	10	10440	10449	0 %	20 %	60 %	20 %	528981808
10	NC_021285	CCGCG	2	10	11504	11513	0 %	0 %	40 %	60 %	528981810
11	NC_021285	CACCG	2	10	14802	14811	20 %	0 %	20 %	60 %	528981814
12	NC_021285	CGCTG	2	10	17897	17906	0 %	20 %	40 %	40 %	528981819
13	NC_021285	TTTGG	2	10	18189	18198	0 %	60 %	40 %	0 %	528981820
14	NC_021285	GCCTG	2	10	20089	20098	0 %	20 %	40 %	40 %	528981823
15	NC_021285	GTTTC	2	10	20508	20517	0 %	60 %	20 %	20 %	528981823
16	NC_021285	GGTCA	2	10	21153	21162	20 %	20 %	40 %	20 %	528981825
17	NC_021285	GTCGG	2	10	21553	21562	0 %	20 %	60 %	20 %	528981825
18	NC_021285	AGGCC	2	10	22349	22358	20 %	0 %	40 %	40 %	528981825
19	NC_021285	GGCTG	2	10	22917	22926	0 %	20 %	60 %	20 %	528981826
20	NC_021285	TCGTC	2	10	23285	23294	0 %	40 %	20 %	40 %	528981827
21	NC_021285	GCCGT	2	10	26943	26952	0 %	20 %	40 %	40 %	528981830
22	NC_021285	GCCAG	2	10	27321	27330	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_021285	CAGAG	2	10	27516	27525	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_021285	GCGCA	2	10	28244	28253	20 %	0 %	40 %	40 %	528981832
25	NC_021285	CCGCC	2	10	29164	29173	0 %	0 %	20 %	80 %	528981834
26	NC_021285	CGGCG	2	10	30072	30081	0 %	0 %	60 %	40 %	528981835
27	NC_021285	CGGGC	2	10	31225	31234	0 %	0 %	60 %	40 %	528981837
28	NC_021285	GGCTG	2	10	31691	31700	0 %	20 %	60 %	20 %	528981838
29	NC_021285	CACGG	2	10	31870	31879	20 %	0 %	40 %	40 %	528981838
30	NC_021285	CCCTT	2	10	32664	32673	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_021285	CCTTC	2	10	33918	33927	0 %	40 %	0 %	60 %	528981843
32	NC_021285	CGGCG	2	10	34138	34147	0 %	0 %	60 %	40 %	528981844
33	NC_021285	GCGAT	2	10	37468	37477	20 %	20 %	40 %	20 %	528981848
34	NC_021285	CGAAC	2	10	39042	39051	40 %	0 %	20 %	40 %	528981851
35	NC_021285	ATGCT	2	10	45522	45531	20 %	40 %	20 %	20 %	528981863
36	NC_021285	GACGG	2	10	46757	46766	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_021285	GCGCC	2	10	47117	47126	0 %	0 %	40 %	60 %	528981865
38	NC_021285	ATCCG	2	10	48776	48785	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_021285	CAGCG	2	10	49611	49620	20 %	0 %	40 %	40 %	528981867
40	NC_021285	GGCGC	2	10	50779	50788	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_021285	CCGGA	2	10	53553	53562	20 %	0 %	40 %	40 %	528981869
42	NC_021285	CGGGC	2	10	54029	54038	0 %	0 %	60 %	40 %	528981870
43	NC_021285	CCCAG	2	10	55315	55324	20 %	0 %	20 %	60 %	528981872
44	NC_021285	GGCGC	2	10	61792	61801	0 %	0 %	60 %	40 %	528981878
45	NC_021285	CGCGG	2	10	61930	61939	0 %	0 %	60 %	40 %	528981878
46	NC_021285	CGGAT	2	10	62765	62774	20 %	20 %	40 %	20 %	528981878
47	NC_021285	CCCGG	2	10	62826	62835	0 %	0 %	40 %	60 %	528981878
48	NC_021285	CGCGG	2	10	63225	63234	0 %	0 %	60 %	40 %	528981878
49	NC_021285	CGGCC	2	10	63570	63579	0 %	0 %	40 %	60 %	528981878
50	NC_021285	CGCGC	2	10	63733	63742	0 %	0 %	40 %	60 %	528981878
51	NC_021285	CGCGG	2	10	66268	66277	0 %	0 %	60 %	40 %	528981880
52	NC_021285	CCAGC	2	10	67125	67134	20 %	0 %	20 %	60 %	528981881
53	NC_021285	GTCCA	2	10	67195	67204	20 %	20 %	20 %	40 %	528981881
54	NC_021285	CGGGG	2	10	72064	72073	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
55	NC_021285	GCCCC	2	10	73678	73687	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
56	NC_021285	GCACG	2	10	74283	74292	20 %	0 %	40 %	40 %	528981885
57	NC_021285	GCCCT	2	10	75580	75589	0 %	20 %	20 %	60 %	528981885
58	NC_021285	CATTG	2	10	77156	77165	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_021285	CGGCC	2	10	77266	77275	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
60	NC_021285	GACGT	2	10	77730	77739	20 %	20 %	40 %	20 %	528981887
61	NC_021285	GCGCT	2	10	77784	77793	0 %	20 %	40 %	40 %	528981887
62	NC_021285	GCCTG	2	10	78193	78202	0 %	20 %	40 %	40 %	528981888
63	NC_021285	CGATG	2	10	79429	79438	20 %	20 %	40 %	20 %	528981888
64	NC_021285	CCGGT	2	10	79440	79449	0 %	20 %	40 %	40 %	528981888
65	NC_021285	TCGCC	2	10	80365	80374	0 %	20 %	20 %	60 %	528981889
66	NC_021285	GCCTG	2	10	80465	80474	0 %	20 %	40 %	40 %	528981889
67	NC_021285	CGGCG	2	10	80866	80875	0 %	0 %	60 %	40 %	528981889
68	NC_021285	CATTC	2	10	80902	80911	20 %	40 %	0 %	40 %	528981889
69	NC_021285	GCCCG	2	10	84180	84189	0 %	0 %	40 %	60 %	528981893
70	NC_021285	AGCCC	2	10	85604	85613	20 %	0 %	20 %	60 %	528981895
71	NC_021285	GCCCG	2	10	86526	86535	0 %	0 %	40 %	60 %	528981896
72	NC_021285	CCATG	2	10	86725	86734	20 %	20 %	20 %	40 %	528981897
73	NC_021285	GCGCG	2	10	89943	89952	0 %	0 %	60 %	40 %	528981900
74	NC_021285	TGGCC	2	10	93321	93330	0 %	20 %	40 %	40 %	528981902
75	NC_021285	CGGCG	2	10	93737	93746	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
76	NC_021285	TCTGC	2	10	93844	93853	0 %	40 %	20 %	40 %	528981903
77	NC_021285	GGCCT	2	10	94640	94649	0 %	20 %	40 %	40 %	528981904
78	NC_021285	CCCCG	2	10	95688	95697	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
79	NC_021285	AGGTG	2	10	95921	95930	20 %	20 %	60 %	0 %	528981905
80	NC_021285	CGGCA	2	10	96545	96554	20 %	0 %	40 %	40 %	528981906
81	NC_021285	GCGCC	2	10	98169	98178	0 %	0 %	40 %	60 %	528981907
82	NC_021285	GCCGC	2	10	99098	99107	0 %	0 %	40 %	60 %	528981908
83	NC_021285	GGGCC	2	10	99158	99167	0 %	0 %	60 %	40 %	528981908
84	NC_021285	GCGCG	2	10	100620	100629	0 %	0 %	60 %	40 %	528981911
85	NC_021285	CGGCG	2	10	100768	100777	0 %	0 %	60 %	40 %	528981911
86	NC_021285	GCGCC	2	10	100881	100890	0 %	0 %	40 %	60 %	528981911
87	NC_021285	GGCGT	2	10	102045	102054	0 %	20 %	60 %	20 %	528981912
88	NC_021285	GCCCA	2	10	102564	102573	20 %	0 %	20 %	60 %	528981913
89	NC_021285	CCGCC	2	10	103307	103316	0 %	0 %	20 %	80 %	528981913
90	NC_021285	CCCTG	2	10	103402	103411	0 %	20 %	20 %	60 %	528981913
91	NC_021285	GCGCT	2	10	103596	103605	0 %	20 %	40 %	40 %	528981914
92	NC_021285	GGCGT	2	10	104186	104195	0 %	20 %	60 %	20 %	528981914
93	NC_021285	CGTGC	2	10	106670	106679	0 %	20 %	40 %	40 %	528981915
94	NC_021285	GCGCC	2	10	106822	106831	0 %	0 %	40 %	60 %	528981915
95	NC_021285	CGTAG	2	10	107508	107517	20 %	20 %	40 %	20 %	528981916
96	NC_021285	GGGAG	2	10	108261	108270	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
97	NC_021285	ACCGG	2	10	109856	109865	20 %	0 %	40 %	40 %	528981919
98	NC_021285	GGCGC	2	10	110917	110926	0 %	0 %	60 %	40 %	528981920
99	NC_021285	GCCAG	2	10	111336	111345	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
100	NC_021285	CAAGC	2	10	111486	111495	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_021285	GAACG	2	10	111930	111939	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_021285	GTGCC	2	10	112022	112031	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
103	NC_021285	CGAAC	2	10	113728	113737	40 %	0 %	20 %	40 %	528981923
104	NC_021285	GCCGC	2	10	115046	115055	0 %	0 %	40 %	60 %	528981924
105	NC_021285	GGCGC	2	10	115650	115659	0 %	0 %	60 %	40 %	528981925
106	NC_021285	CGCGG	2	10	115768	115777	0 %	0 %	60 %	40 %	528981925
107	NC_021285	ACGGG	2	10	117995	118004	20 %	0 %	60 %	20 %	528981925
108	NC_021285	CCCCA	2	10	118592	118601	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
109	NC_021285	ACGAA	2	10	119365	119374	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_021285	GGCCT	2	10	120318	120327	0 %	20 %	40 %	40 %	528981928
111	NC_021285	CGGCG	2	10	120638	120647	0 %	0 %	60 %	40 %	528981928
112	NC_021285	TGGCC	2	10	121045	121054	0 %	20 %	40 %	40 %	528981928
113	NC_021285	CGCCA	2	10	123859	123868	20 %	0 %	20 %	60 %	528981931
114	NC_021285	GGCAA	2	10	124244	124253	40 %	0 %	40 %	20 %	528981931
115	NC_021285	GCGCC	2	10	124742	124751	0 %	0 %	40 %	60 %	528981931
116	NC_021285	CGGCG	2	10	125389	125398	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
117	NC_021285	CGACC	2	10	125606	125615	20 %	0 %	20 %	60 %	528981932
118	NC_021285	TCGCC	2	10	125971	125980	0 %	20 %	20 %	60 %	528981932
119	NC_021285	CCGGC	2	10	126264	126273	0 %	0 %	40 %	60 %	528981932
120	NC_021285	TGGCC	2	10	126652	126661	0 %	20 %	40 %	40 %	528981932
121	NC_021285	GGCGC	2	10	127385	127394	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
122	NC_021285	CGCCC	2	10	127702	127711	0 %	0 %	20 %	80 %	528981934
123	NC_021285	GCTCG	2	10	127740	127749	0 %	20 %	40 %	40 %	528981934
124	NC_021285	GCCGC	2	10	128717	128726	0 %	0 %	40 %	60 %	528981935
125	NC_021285	AGCCC	2	10	131096	131105	20 %	0 %	20 %	60 %	528981936
126	NC_021285	GCGCG	3	15	131273	131287	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
127	NC_021285	TGGCC	2	10	133065	133074	0 %	20 %	40 %	40 %	528981940
128	NC_021285	GCCGC	2	10	133229	133238	0 %	0 %	40 %	60 %	528981940
129	NC_021285	GCGCC	2	10	133385	133394	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_021285	GCCGC	2	10	134071	134080	0 %	0 %	40 %	60 %	528981941
131	NC_021285	TGCGC	2	10	134221	134230	0 %	20 %	40 %	40 %	528981941
132	NC_021285	GGCGT	2	10	135680	135689	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
133	NC_021285	TGCGC	2	10	136728	136737	0 %	20 %	40 %	40 %	528981943
134	NC_021285	TGCTC	2	10	137115	137124	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
135	NC_021285	TCCGC	2	10	137910	137919	0 %	20 %	20 %	60 %	528981944
136	NC_021285	GATGC	2	10	139664	139673	20 %	20 %	40 %	20 %	528981946
137	NC_021285	CCAGC	2	10	140015	140024	20 %	0 %	20 %	60 %	528981946
138	NC_021285	CGCCA	2	10	140168	140177	20 %	0 %	20 %	60 %	528981946
139	NC_021285	GCCGT	2	10	140540	140549	0 %	20 %	40 %	40 %	528981947
140	NC_021285	GCGCC	2	10	141572	141581	0 %	0 %	40 %	60 %	528981948
141	NC_021285	TCTTT	2	10	143077	143086	0 %	80 %	0 %	20 %	528981951
142	NC_021285	CGGGC	2	10	143862	143871	0 %	0 %	60 %	40 %	528981952
143	NC_021285	AGCCC	2	10	144293	144302	20 %	0 %	20 %	60 %	528981952
144	NC_021285	AGGTC	2	10	145967	145976	20 %	20 %	40 %	20 %	528981954
145	NC_021285	CGCCC	2	10	146277	146286	0 %	0 %	20 %	80 %	528981954
146	NC_021285	GGAAC	2	10	146412	146421	40 %	0 %	40 %	20 %	528981955
147	NC_021285	CCGCG	2	10	147528	147537	0 %	0 %	40 %	60 %	528981955
148	NC_021285	AGGCG	2	10	148645	148654	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
149	NC_021285	AAACG	2	10	148674	148683	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
150	NC_021285	GGGCG	2	10	151979	151988	0 %	0 %	80 %	20 %	528981959
151	NC_021285	CGCTG	2	10	152059	152068	0 %	20 %	40 %	40 %	528981959
152	NC_021285	CCCGC	2	10	153728	153737	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
153	NC_021285	CCCGG	2	10	153755	153764	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
154	NC_021285	ATCGA	2	10	154636	154645	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_021285	CTTGC	2	10	156151	156160	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
156	NC_021285	GCGCG	2	10	156467	156476	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_021285	CGGCC	2	10	156662	156671	0 %	0 %	40 %	60 %	528981965
158	NC_021285	GCGCC	2	10	156818	156827	0 %	0 %	40 %	60 %	528981965
159	NC_021285	AAAAG	2	10	157699	157708	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_021285	GCGCA	2	10	160165	160174	20 %	0 %	40 %	40 %	528981970
161	NC_021285	CGGGT	2	10	160681	160690	0 %	20 %	60 %	20 %	528981971
162	NC_021285	GACGC	2	10	161364	161373	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
163	NC_021285	GCCGT	2	10	161750	161759	0 %	20 %	40 %	40 %	528981972
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168	NC_021285	CAGCG	2	10	171179	171188	20 %	0 %	40 %	40 %	528981981
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172	NC_021285	GCCCC	2	10	178592	178601	0 %	0 %	20 %	80 %	528981986
173	NC_021285	GCATC	2	10	182712	182721	20 %	20 %	20 %	40 %	528981988
174	NC_021285	GTCCC	2	10	183172	183181	0 %	20 %	20 %	60 %	528981989
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180	NC_021285	TGAAG	2	10	190941	190950	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_021285	GGCCC	2	10	196264	196273	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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204	NC_021285	CGCGG	2	10	218093	218102	0 %	0 %	60 %	40 %	528982022
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238	NC_021285	ATGGG	2	10	243523	243532	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
239	NC_021285	AATGA	2	10	244507	244516	60 %	20 %	20 %	0 %	528982055
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250	NC_021285	CCTGG	2	10	251684	251693	0 %	20 %	40 %	40 %	528982063
251	NC_021285	TCGTC	2	10	252172	252181	0 %	40 %	20 %	40 %	528982063
252	NC_021285	CCCAG	2	10	255541	255550	20 %	0 %	20 %	60 %	528982066
253	NC_021285	CGGCG	2	10	256618	256627	0 %	0 %	60 %	40 %	528982067
254	NC_021285	TCAAA	2	10	257244	257253	60 %	20 %	0 %	20 %	528982068
255	NC_021285	GCCAG	2	10	257908	257917	20 %	0 %	40 %	40 %	528982068
256	NC_021285	CCGAT	2	10	260786	260795	20 %	20 %	20 %	40 %	528982070
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258	NC_021285	CGGGC	2	10	262214	262223	0 %	0 %	60 %	40 %	528982072
259	NC_021285	CAGGC	2	10	262834	262843	20 %	0 %	40 %	40 %	528982073
260	NC_021285	GCCCC	2	10	263281	263290	0 %	0 %	20 %	80 %	528982073
261	NC_021285	ATACT	2	10	263661	263670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
262	NC_021285	CGCGC	2	10	263994	264003	0 %	0 %	40 %	60 %	528982074
263	NC_021285	TGATC	2	10	264641	264650	20 %	40 %	20 %	20 %	528982074
264	NC_021285	CCGCG	2	10	264677	264686	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
265	NC_021285	CGGCC	2	10	264730	264739	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
266	NC_021285	GCGTT	2	10	264970	264979	0 %	40 %	40 %	20 %	528982075
267	NC_021285	GACCT	2	10	266677	266686	20 %	20 %	20 %	40 %	528982076
268	NC_021285	CACGC	2	10	269477	269486	20 %	0 %	20 %	60 %	528982077
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398	NC_021285	AACTG	2	10	425364	425373	40 %	20 %	20 %	20 %	528982207
399	NC_021285	CAGGC	2	10	426664	426673	20 %	0 %	40 %	40 %	528982208
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402	NC_021285	GCCGC	2	10	428899	428908	0 %	0 %	40 %	60 %	528982209
403	NC_021285	CGTGG	2	10	429382	429391	0 %	20 %	60 %	20 %	528982209
404	NC_021285	CGCGT	2	10	431052	431061	0 %	20 %	40 %	40 %	528982211
405	NC_021285	GGCCA	2	10	431139	431148	20 %	0 %	40 %	40 %	528982211
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429	NC_021285	GCCGC	2	10	461383	461392	0 %	0 %	40 %	60 %	528982233
430	NC_021285	CGCGC	2	10	461773	461782	0 %	0 %	40 %	60 %	528982233
431	NC_021285	CGTCA	2	10	463822	463831	20 %	20 %	20 %	40 %	528982235
432	NC_021285	CAGGC	2	10	464461	464470	20 %	0 %	40 %	40 %	528982236
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434	NC_021285	ACCGA	2	10	466531	466540	40 %	0 %	20 %	40 %	528982238
435	NC_021285	CAACG	2	10	466641	466650	40 %	0 %	20 %	40 %	528982238
436	NC_021285	GAAAG	2	10	470772	470781	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
437	NC_021285	CGCGC	2	10	472030	472039	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
438	NC_021285	GGCCT	2	10	472170	472179	0 %	20 %	40 %	40 %	528982244
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440	NC_021285	CCGCG	2	10	474920	474929	0 %	0 %	40 %	60 %	528982246
441	NC_021285	CCGGC	2	10	475188	475197	0 %	0 %	40 %	60 %	528982246
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443	NC_021285	GCCGC	2	10	475847	475856	0 %	0 %	40 %	60 %	528982246
444	NC_021285	CATTC	2	10	476445	476454	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
445	NC_021285	GTGCT	2	10	477220	477229	0 %	40 %	40 %	20 %	528982248
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452	NC_021285	GCCGC	2	10	484522	484531	0 %	0 %	40 %	60 %	528982256
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454	NC_021285	CGCGG	2	10	486612	486621	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
455	NC_021285	GCCCG	2	10	488705	488714	0 %	0 %	40 %	60 %	528982260
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483	NC_021285	CGCGC	2	10	522679	522688	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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487	NC_021285	ACCAC	2	10	525932	525941	40 %	0 %	0 %	60 %	528982294
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