MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Achromobacter xylosoxidans NH44784-1996 complete genome

Total Repeats: 6589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021285	CACGC	2	10	542360	542369	20 %	0 %	20 %	60 %	528982310
502	NC_021285	GCGCC	2	10	542915	542924	0 %	0 %	40 %	60 %	528982311
503	NC_021285	CGCGC	2	10	543018	543027	0 %	0 %	40 %	60 %	528982311
504	NC_021285	CGCGG	2	10	544092	544101	0 %	0 %	60 %	40 %	528982312
505	NC_021285	GCGAG	2	10	544696	544705	20 %	0 %	60 %	20 %	528982313
506	NC_021285	CGATA	2	10	544729	544738	40 %	20 %	20 %	20 %	528982313
507	NC_021285	CGCGC	3	15	544995	545009	0 %	0 %	40 %	60 %	528982314
508	NC_021285	GCCGT	2	10	545318	545327	0 %	20 %	40 %	40 %	528982314
509	NC_021285	GTGAT	2	10	545877	545886	20 %	40 %	40 %	0 %	528982315
510	NC_021285	TGCAG	2	10	546178	546187	20 %	20 %	40 %	20 %	528982315
511	NC_021285	CCGCG	2	10	547978	547987	0 %	0 %	40 %	60 %	528982317
512	NC_021285	CGGCA	2	10	549284	549293	20 %	0 %	40 %	40 %	528982319
513	NC_021285	CCACG	2	10	550284	550293	20 %	0 %	20 %	60 %	528982320
514	NC_021285	GCGAC	2	10	555095	555104	20 %	0 %	40 %	40 %	528982327
515	NC_021285	CGCAG	2	10	555611	555620	20 %	0 %	40 %	40 %	528982327
516	NC_021285	TGGCC	2	10	555845	555854	0 %	20 %	40 %	40 %	528982327
517	NC_021285	CGGCG	2	10	556046	556055	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
518	NC_021285	GTCGC	2	10	556057	556066	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
519	NC_021285	CGGGA	2	10	556171	556180	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
520	NC_021285	CGGCA	2	10	556682	556691	20 %	0 %	40 %	40 %	528982328
521	NC_021285	CCCCG	2	10	559953	559962	0 %	0 %	20 %	80 %	528982330
522	NC_021285	AGGCC	2	10	560454	560463	20 %	0 %	40 %	40 %	528982330
523	NC_021285	GCCCA	2	10	561181	561190	20 %	0 %	20 %	60 %	528982330
524	NC_021285	ACCAG	2	10	562188	562197	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
525	NC_021285	CGCGG	2	10	564067	564076	0 %	0 %	60 %	40 %	528982333
526	NC_021285	GGCCG	2	10	564982	564991	0 %	0 %	60 %	40 %	528982335
527	NC_021285	GGGCC	2	10	565461	565470	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
528	NC_021285	CGGCG	2	10	565727	565736	0 %	0 %	60 %	40 %	528982336
529	NC_021285	TGGCG	2	10	568677	568686	0 %	20 %	60 %	20 %	528982338
530	NC_021285	CTGGC	2	10	570113	570122	0 %	20 %	40 %	40 %	528982338
531	NC_021285	CCCCA	2	10	571354	571363	20 %	0 %	0 %	80 %	528982339
532	NC_021285	CGCGG	2	10	571506	571515	0 %	0 %	60 %	40 %	528982340
533	NC_021285	GCGCC	2	10	571565	571574	0 %	0 %	40 %	60 %	528982340
534	NC_021285	CATAG	2	10	573737	573746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
535	NC_021285	CGCGC	2	10	574219	574228	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
536	NC_021285	CACGC	2	10	575620	575629	20 %	0 %	20 %	60 %	528982346
537	NC_021285	CCGCA	2	10	578014	578023	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
538	NC_021285	GCGAG	2	10	578274	578283	20 %	0 %	60 %	20 %	528982349
539	NC_021285	CCTGG	2	10	581210	581219	0 %	20 %	40 %	40 %	528982352
540	NC_021285	GCTGG	2	10	583895	583904	0 %	20 %	60 %	20 %	528982354
541	NC_021285	CCGTC	2	10	584977	584986	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
542	NC_021285	CCCGC	2	10	586117	586126	0 %	0 %	20 %	80 %	528982356
543	NC_021285	CCTGG	2	10	587013	587022	0 %	20 %	40 %	40 %	528982356
544	NC_021285	GCCGG	2	10	587336	587345	0 %	0 %	60 %	40 %	528982357
545	NC_021285	CCAGA	2	10	590255	590264	40 %	0 %	20 %	40 %	528982360
546	NC_021285	CCGCC	2	10	593028	593037	0 %	0 %	20 %	80 %	528982362
547	NC_021285	GCGCC	2	10	593040	593049	0 %	0 %	40 %	60 %	528982362
548	NC_021285	CGGCC	2	10	593200	593209	0 %	0 %	40 %	60 %	528982362
549	NC_021285	TGGCG	2	10	593828	593837	0 %	20 %	60 %	20 %	528982363
550	NC_021285	CAGCG	2	10	594023	594032	20 %	0 %	40 %	40 %	528982364
551	NC_021285	GCCGG	2	10	597001	597010	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
552	NC_021285	TGCGC	2	10	597727	597736	0 %	20 %	40 %	40 %	528982369
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554	NC_021285	CAGGC	3	15	599448	599462	20 %	0 %	40 %	40 %	528982370
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557	NC_021285	GTTGC	2	10	601295	601304	0 %	40 %	40 %	20 %	528982371
558	NC_021285	CGCGC	2	10	602809	602818	0 %	0 %	40 %	60 %	528982371
559	NC_021285	CGGCG	2	10	604417	604426	0 %	0 %	60 %	40 %	528982373
560	NC_021285	CGGCT	2	10	608594	608603	0 %	20 %	40 %	40 %	528982377
561	NC_021285	CTGGC	2	10	610270	610279	0 %	20 %	40 %	40 %	528982378
562	NC_021285	CCGCG	2	10	615919	615928	0 %	0 %	40 %	60 %	528982383
563	NC_021285	GCCGC	2	10	616487	616496	0 %	0 %	40 %	60 %	528982383
564	NC_021285	GCTCG	2	10	616504	616513	0 %	20 %	40 %	40 %	528982383
565	NC_021285	CATCG	2	10	619394	619403	20 %	20 %	20 %	40 %	528982385
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571	NC_021285	AGCCC	2	10	628793	628802	20 %	0 %	20 %	60 %	528982394
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577	NC_021285	GCCAG	2	10	640424	640433	20 %	0 %	40 %	40 %	528982406
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583	NC_021285	TGGCG	2	10	647412	647421	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
584	NC_021285	GGCGT	2	10	647712	647721	0 %	20 %	60 %	20 %	528982412
585	NC_021285	AACAA	2	10	648240	648249	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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587	NC_021285	CGGCG	2	10	653556	653565	0 %	0 %	60 %	40 %	528982415
588	NC_021285	CGCGC	2	10	653667	653676	0 %	0 %	40 %	60 %	528982415
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597	NC_021285	CCTGG	2	10	664272	664281	0 %	20 %	40 %	40 %	528982422
598	NC_021285	CGGCG	2	10	668437	668446	0 %	0 %	60 %	40 %	528982424
599	NC_021285	CGCGG	2	10	669316	669325	0 %	0 %	60 %	40 %	528982424
600	NC_021285	CCCGT	2	10	675249	675258	0 %	20 %	20 %	60 %	528982429
601	NC_021285	GCGCC	2	10	676533	676542	0 %	0 %	40 %	60 %	528982429
602	NC_021285	AGGCC	2	10	677305	677314	20 %	0 %	40 %	40 %	528982430
603	NC_021285	TTGGG	2	10	679687	679696	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
604	NC_021285	CGGGC	2	10	679783	679792	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
605	NC_021285	CGCCC	2	10	679902	679911	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
606	NC_021285	GCCCG	2	10	679915	679924	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
607	NC_021285	AAGCG	2	10	679947	679956	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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609	NC_021285	GGCGT	2	10	684253	684262	0 %	20 %	60 %	20 %	528982436
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611	NC_021285	GCGCG	2	10	685313	685322	0 %	0 %	60 %	40 %	528982437
612	NC_021285	CGCGC	2	10	686433	686442	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
613	NC_021285	GGCCG	2	10	688149	688158	0 %	0 %	60 %	40 %	528982440
614	NC_021285	GCCGC	2	10	688572	688581	0 %	0 %	40 %	60 %	528982440
615	NC_021285	CGGGC	2	10	689299	689308	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
616	NC_021285	CGCTG	2	10	689855	689864	0 %	20 %	40 %	40 %	528982442
617	NC_021285	CAGGT	2	10	690743	690752	20 %	20 %	40 %	20 %	528982443
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620	NC_021285	GGATC	2	10	691698	691707	20 %	20 %	40 %	20 %	528982443
621	NC_021285	GGCGG	2	10	695120	695129	0 %	0 %	80 %	20 %	528982447
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624	NC_021285	GGCCT	2	10	701665	701674	0 %	20 %	40 %	40 %	528982450
625	NC_021285	GCGCG	2	10	702691	702700	0 %	0 %	60 %	40 %	528982451
626	NC_021285	CGCGC	2	10	704648	704657	0 %	0 %	40 %	60 %	528982453
627	NC_021285	GTTGC	2	10	705568	705577	0 %	40 %	40 %	20 %	528982454
628	NC_021285	CCAGG	2	10	706153	706162	20 %	0 %	40 %	40 %	528982454
629	NC_021285	CGGGC	2	10	708905	708914	0 %	0 %	60 %	40 %	528982455
630	NC_021285	TGCGC	2	10	710421	710430	0 %	20 %	40 %	40 %	528982457
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632	NC_021285	GGCTC	2	10	714120	714129	0 %	20 %	40 %	40 %	528982461
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