MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 1131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021082	CCTTTA	2	12	2460703	2460714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482887239
1002	NC_021082	TTTCAA	2	12	2462273	2462284	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482887242
1003	NC_021082	GTATTC	2	12	2463600	2463611	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887243
1004	NC_021082	CATTTT	2	12	2463703	2463714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482887243
1005	NC_021082	CGCTAA	2	12	2465717	2465728	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887245
1006	NC_021082	CTAAAA	2	12	2470385	2470396	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	482887247
1007	NC_021082	TTCAAT	2	12	2471648	2471659	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482887248
1008	NC_021082	CAAAGA	2	12	2474457	2474468	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	482887250
1009	NC_021082	CATTGC	2	12	2479575	2479586	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482887254
1010	NC_021082	TTCAAT	2	12	2480360	2480371	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482887255
1011	NC_021082	TTCATT	2	12	2480444	2480455	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482887255
1012	NC_021082	ATCTTG	2	12	2483741	2483752	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887258
1013	NC_021082	CAGCTT	2	12	2485457	2485468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482887260
1014	NC_021082	ACCGAT	2	12	2485620	2485631	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887260
1015	NC_021082	CGCCCT	2	12	2487844	2487855	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	482887263
1016	NC_021082	ACTTCC	2	12	2488638	2488649	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	482887264
1017	NC_021082	CGCAAT	2	12	2488730	2488741	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887264
1018	NC_021082	GTACCA	2	12	2489116	2489127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887264
1019	NC_021082	TTTTCA	2	12	2489854	2489865	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482887265
1020	NC_021082	ATCTAA	2	12	2493214	2493225	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482887269
1021	NC_021082	CTATTT	2	12	2494098	2494109	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482887270
1022	NC_021082	AAATAA	2	12	2499025	2499036	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	482887276
1023	NC_021082	AAATAG	2	12	2503868	2503879	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482887280
1024	NC_021082	TTTACG	2	12	2512054	2512065	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887288
1025	NC_021082	TCAGAT	2	12	2515542	2515553	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482887290
1026	NC_021082	TGCCGG	2	12	2515748	2515759	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482887290
1027	NC_021082	TTTCGT	2	12	2518272	2518283	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482887294
1028	NC_021082	GTTAGT	2	12	2521942	2521953	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	482887301
1029	NC_021082	TTTTGC	2	12	2523339	2523350	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1030	NC_021082	ATTTCA	2	12	2524561	2524572	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1031	NC_021082	GCCTTC	2	12	2527991	2528002	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
1032	NC_021082	AATTAA	2	12	2528780	2528791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_021082	AAAAAC	2	12	2528990	2529001	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1034	NC_021082	CAGCAA	2	12	2531174	2531185	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482887303
1035	NC_021082	TTCAGG	2	12	2534398	2534409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482887305
1036	NC_021082	ATTGAA	2	12	2535533	2535544	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482887305
1037	NC_021082	TTTCGT	2	12	2537619	2537630	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482887307
1038	NC_021082	CTTTGC	2	12	2540063	2540074	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482887311
1039	NC_021082	TGATAA	2	12	2540790	2540801	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482887311
1040	NC_021082	TTTAGC	2	12	2544950	2544961	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887313
1041	NC_021082	TTCCCC	2	12	2547321	2547332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	482887317
1042	NC_021082	CTGCAA	2	12	2547572	2547583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887317
1043	NC_021082	ATAACC	2	12	2548898	2548909	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482887318
1044	NC_021082	GTGTCA	2	12	2551114	2551125	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482887321
1045	NC_021082	CGATTT	2	12	2551460	2551471	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887321
1046	NC_021082	CACAAA	2	12	2554180	2554191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482887323
1047	NC_021082	TATTTT	2	12	2559026	2559037	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	482887328
1048	NC_021082	TGAAAT	2	12	2562385	2562396	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482887332
1049	NC_021082	CTTTGG	2	12	2565392	2565403	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482887336
1050	NC_021082	GCCCCG	2	12	2565871	2565882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	482887337
1051	NC_021082	CAAACG	2	12	2570858	2570869	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482887343
1052	NC_021082	AAAATG	2	12	2571576	2571587	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482887344
1053	NC_021082	TCTATT	2	12	2573896	2573907	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1054	NC_021082	TCGTAT	2	12	2575036	2575047	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887346
1055	NC_021082	CATTGC	2	12	2576593	2576604	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482887348
1056	NC_021082	GATTAG	2	12	2576615	2576626	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482887348
1057	NC_021082	TTTTAT	2	12	2577812	2577823	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	482887349
1058	NC_021082	ATATCA	2	12	2578346	2578357	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482887351
1059	NC_021082	CTCTTC	2	12	2578744	2578755	0 %	50 %	0 %	50 %	482887351
1060	NC_021082	TCAATT	2	12	2579112	2579123	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482887352
1061	NC_021082	GAAATC	2	12	2580060	2580071	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	482887353
1062	NC_021082	CAATCA	2	12	2582745	2582756	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482887356
1063	NC_021082	CTTTAG	2	12	2583051	2583062	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887357
1064	NC_021082	TCTTTC	2	12	2583446	2583457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482887357
1065	NC_021082	CTTCCA	2	12	2585120	2585131	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	482887358
1066	NC_021082	CTTTTA	2	12	2588214	2588225	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482887362
1067	NC_021082	TTTATA	2	12	2589268	2589279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482887362
1068	NC_021082	TCATTA	2	12	2590563	2590574	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482887362
1069	NC_021082	ATATTC	2	12	2593545	2593556	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1070	NC_021082	TCACGA	2	12	2594066	2594077	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887366
1071	NC_021082	AAAATT	2	12	2597434	2597445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482887368
1072	NC_021082	TTTTCT	2	12	2598519	2598530	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	482887372
1073	NC_021082	TGCTAA	2	12	2600450	2600461	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482887373
1074	NC_021082	TACCGT	2	12	2601137	2601148	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482887374
1075	NC_021082	TCCACG	2	12	2602700	2602711	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482887376
1076	NC_021082	GCCTTT	2	12	2605031	2605042	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482887379
1077	NC_021082	TTTTCG	2	12	2605483	2605494	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1078	NC_021082	TGGCGA	2	12	2606779	2606790	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482887381
1079	NC_021082	AAGATA	2	12	2606850	2606861	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482887381
1080	NC_021082	CTGTCT	2	12	2608071	2608082	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482887383
1081	NC_021082	TTTACA	2	12	2608587	2608598	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482887383
1082	NC_021082	CACAAT	2	12	2615993	2616004	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482887391
1083	NC_021082	GATTTA	2	12	2619559	2619570	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482887394
1084	NC_021082	CAATGG	2	12	2622449	2622460	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482887395
1085	NC_021082	AGCCAT	2	12	2627392	2627403	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_021082	AACTCA	2	12	2628964	2628975	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482887400
1087	NC_021082	AGAATG	2	12	2634460	2634471	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482887403
1088	NC_021082	TTTTGA	2	12	2637244	2637255	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	482887404
1089	NC_021082	CTATTC	2	12	2638262	2638273	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482887404
1090	NC_021082	CCGGTA	2	12	2638479	2638490	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482887404
1091	NC_021082	TTGAAA	2	12	2639801	2639812	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482887405
1092	NC_021082	GCCAAA	2	12	2640788	2640799	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482887405
1093	NC_021082	GAATAA	2	12	2642498	2642509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482887406
1094	NC_021082	ATCGGC	2	12	2645003	2645014	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482887409
1095	NC_021082	AAGAGA	2	12	2645550	2645561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	482887410
1096	NC_021082	CCTTTA	2	12	2647994	2648005	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482887414
1097	NC_021082	CCGATT	2	12	2648421	2648432	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482887414
1098	NC_021082	ATTGTT	2	12	2648859	2648870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	482887415
1099	NC_021082	AAATTA	2	12	2648926	2648937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482887415
1100	NC_021082	TTTTAT	2	12	2650129	2650140	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021082	TCCAGC	19	114	2651359	2651472	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482887417
1102	NC_021082	AATGCA	2	12	2658481	2658492	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1103	NC_021082	ATGGTA	2	12	2659056	2659067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482887427
1104	NC_021082	TGAATA	2	12	2659222	2659233	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482887427
1105	NC_021082	TCAAAA	2	12	2661114	2661125	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	482887428
1106	NC_021082	TGGTGT	2	12	2661766	2661777	0 %	50 %	50 %	0 %	482887428
1107	NC_021082	ATTTAA	2	12	2662756	2662767	50 %	50 %	0 %	0 %	482887430
1108	NC_021082	ACGAAA	2	12	2663569	2663580	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	482887430
1109	NC_021082	TACCGT	2	12	2664894	2664905	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482887432
1110	NC_021082	CCTTTT	2	12	2665671	2665682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	482887433
1111	NC_021082	TCGGGT	2	12	2667580	2667591	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482887435
1112	NC_021082	GATTGC	2	12	2668755	2668766	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482887435
1113	NC_021082	GTTTTA	2	12	2671549	2671560	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_021082	ATCAAC	2	12	2674154	2674165	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482887439
1115	NC_021082	GCCGTA	2	12	2680969	2680980	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482887446
1116	NC_021082	ATGAAA	2	12	2687143	2687154	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482887451
1117	NC_021082	GAAAAT	2	12	2693173	2693184	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482887457
1118	NC_021082	TGCGTG	2	12	2694513	2694524	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482887458
1119	NC_021082	AAAAAG	2	12	2708469	2708480	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	482887472
1120	NC_021082	ATGAAT	2	12	2710042	2710053	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482887473
1121	NC_021082	GCGTTT	2	12	2712194	2712205	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482887477
1122	NC_021082	GCCTAA	2	12	2715346	2715357	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887479
1123	NC_021082	CCATTT	2	12	2716453	2716464	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482887480
1124	NC_021082	ATCCAT	2	12	2719610	2719621	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482887485
1125	NC_021082	AAACCC	2	12	2720548	2720559	50 %	0 %	0 %	50 %	482887486
1126	NC_021082	GCTCAA	2	12	2724944	2724955	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887491
1127	NC_021082	GATAAA	2	12	2726116	2726127	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_021082	GAAGTG	2	12	2726924	2726935	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	482887495
1129	NC_021082	TTAGCT	2	12	2727891	2727902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482887495
1130	NC_021082	TGCGTT	2	12	2730277	2730288	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482887497
1131	NC_021082	GATTGC	2	12	2731463	2731474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482887497

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