MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica M42548

Total Repeats: 1131

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021082	AATTTG	2	12	1198750	1198761	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482885893
502	NC_021082	GAAGAT	2	12	1204880	1204891	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482885900
503	NC_021082	ATGAAA	2	12	1207096	1207107	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482885903
504	NC_021082	CCAAAC	2	12	1208571	1208582	50 %	0 %	0 %	50 %	482885904
505	NC_021082	AAACTT	2	12	1208726	1208737	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482885904
506	NC_021082	TCACAT	2	12	1213047	1213058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	482885909
507	NC_021082	TCGGTG	2	12	1213100	1213111	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482885909
508	NC_021082	AGCAGA	2	12	1213999	1214010	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482885910
509	NC_021082	AGCGGA	2	12	1214179	1214190	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	482885910
510	NC_021082	AGCGGA	2	12	1214269	1214280	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	482885910
511	NC_021082	AGCGGA	2	12	1214359	1214370	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	482885910
512	NC_021082	ACAGTT	2	12	1214600	1214611	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482885910
513	NC_021082	TCTTTA	2	12	1215174	1215185	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482885911
514	NC_021082	ATCCGT	2	12	1215970	1215981	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	482885911
515	NC_021082	TTGGCA	2	12	1216471	1216482	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482885911
516	NC_021082	TATATT	2	12	1225781	1225792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885919
517	NC_021082	TAATTT	2	12	1226336	1226347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482885919
518	NC_021082	ATGAAA	2	12	1235785	1235796	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	482885927
519	NC_021082	GATTGG	2	12	1238091	1238102	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	482885929
520	NC_021082	GCATTA	2	12	1243715	1243726	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482885934
521	NC_021082	TTTTTA	2	12	1250219	1250230	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_021082	AATTGT	2	12	1250259	1250270	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482885942
523	NC_021082	CTTTTT	2	12	1251938	1251949	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	482885943
524	NC_021082	ACCAAT	2	12	1254897	1254908	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482885946
525	NC_021082	ACCGAT	2	12	1255572	1255583	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482885947
526	NC_021082	TAAGCC	2	12	1256883	1256894	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482885948
527	NC_021082	GTTATC	2	12	1258401	1258412	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482885949
528	NC_021082	TGGCAG	2	12	1258923	1258934	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482885950
529	NC_021082	TCAATA	2	12	1266453	1266464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482885958
530	NC_021082	TCAAAG	2	12	1267068	1267079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
531	NC_021082	GCCAAT	2	12	1268830	1268841	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482885960
532	NC_021082	GCGATT	2	12	1271582	1271593	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482885966
533	NC_021082	AACATC	2	12	1271868	1271879	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482885966
534	NC_021082	TCTTTA	2	12	1280739	1280750	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482885974
535	NC_021082	GAATAT	2	12	1280991	1281002	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482885975
536	NC_021082	TTCAAT	2	12	1282527	1282538	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482885977
537	NC_021082	CTTCAT	2	12	1282871	1282882	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482885977
538	NC_021082	CACTTT	2	12	1283330	1283341	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482885978
539	NC_021082	TTTAGC	2	12	1297046	1297057	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482885991
540	NC_021082	ACGTTT	2	12	1298759	1298770	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482885994
541	NC_021082	ATTTGA	2	12	1304758	1304769	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482886000
542	NC_021082	ATAAAA	2	12	1308791	1308802	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	482886006
543	NC_021082	ACGAAA	2	12	1310023	1310034	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	482886008
544	NC_021082	CAAGTG	2	12	1312641	1312652	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482886010
545	NC_021082	ACCGAT	2	12	1313163	1313174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482886011
546	NC_021082	GCAGAA	2	12	1313440	1313451	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482886011
547	NC_021082	AAGGTA	2	12	1314802	1314813	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482886013
548	NC_021082	AAATCT	2	12	1318489	1318500	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	482886017
549	NC_021082	GGCTTT	2	12	1319364	1319375	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482886017
550	NC_021082	TAAAAT	2	12	1320204	1320215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482886018
551	NC_021082	ATTGCG	2	12	1320433	1320444	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482886018
552	NC_021082	GGCAAT	2	12	1322636	1322647	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482886020
553	NC_021082	ATTGAA	2	12	1326121	1326132	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482886023
554	NC_021082	GCGTGA	2	12	1327924	1327935	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482886025
555	NC_021082	AAGCAC	2	12	1328823	1328834	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482886025
556	NC_021082	AAAAGA	2	12	1331290	1331301	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	482886030
557	NC_021082	TTGGCT	2	12	1335519	1335530	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482886036
558	NC_021082	TAGCGG	2	12	1338887	1338898	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482886039
559	NC_021082	CTTTTG	2	12	1340732	1340743	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482886040
560	NC_021082	GCCTAA	2	12	1341102	1341113	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482886040
561	NC_021082	ACGTGA	2	12	1345808	1345819	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482886046
562	NC_021082	TCCCTC	2	12	1349510	1349521	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
563	NC_021082	GGTAAA	2	12	1353331	1353342	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482886051
564	NC_021082	TGGTAA	2	12	1357980	1357991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	482886057
565	NC_021082	ACGTTT	2	12	1358941	1358952	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482886059
566	NC_021082	TTTCTT	2	12	1363781	1363792	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	482886063
567	NC_021082	TTGATC	2	12	1367795	1367806	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482886064
568	NC_021082	TCAAGT	2	12	1369326	1369337	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482886066
569	NC_021082	AAATTA	2	12	1370657	1370668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	482886068
570	NC_021082	ATTTTC	2	12	1372178	1372189	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482886069
571	NC_021082	GTTCGG	2	12	1378714	1378725	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482886073
572	NC_021082	GGATAA	2	12	1382953	1382964	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_021082	AAACAT	2	12	1382994	1383005	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
574	NC_021082	AAAAAT	2	12	1384090	1384101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	482886078
575	NC_021082	CGGCTT	2	12	1384388	1384399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	482886078
576	NC_021082	GCTCAA	2	12	1385813	1385824	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482886080
577	NC_021082	GTGCCA	2	12	1388905	1388916	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	482886083
578	NC_021082	TGGAAA	2	12	1389608	1389619	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482886084
579	NC_021082	ACGTTT	2	12	1394284	1394295	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482886089
580	NC_021082	GCCTAA	2	12	1395373	1395384	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482886089
581	NC_021082	TTTCGG	2	12	1396765	1396776	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	482886090
582	NC_021082	AACCCA	2	12	1399918	1399929	50 %	0 %	0 %	50 %	482886092
583	NC_021082	TTTGCC	2	12	1403860	1403871	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	482886094
584	NC_021082	GCAGAG	2	12	1410255	1410266	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	482886099
585	NC_021082	GGCAAA	2	12	1411712	1411723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
586	NC_021082	ATTGAA	2	12	1420632	1420643	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482886113
587	NC_021082	GCGATT	2	12	1421610	1421621	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482886114
588	NC_021082	AGAATT	2	12	1423483	1423494	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	482886117
589	NC_021082	CAAGAG	2	12	1424240	1424251	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482886117
590	NC_021082	TTTCGT	2	12	1424934	1424945	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482886118
591	NC_021082	AGGTGC	2	12	1427901	1427912	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482886120
592	NC_021082	CTTGGG	2	12	1433594	1433605	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	482886124
593	NC_021082	ACCGCT	2	12	1433630	1433641	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482886124
594	NC_021082	ACTCAG	2	12	1433978	1433989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482886124
595	NC_021082	ACGAAA	2	12	1440343	1440354	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	482886138
596	NC_021082	GCCAAT	2	12	1444069	1444080	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482886141
597	NC_021082	ATGGAA	2	12	1448560	1448571	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	482886147
598	NC_021082	TTATCG	2	12	1456236	1456247	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482886156
599	NC_021082	GCTTAG	2	12	1456976	1456987	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	482886157
600	NC_021082	GTGCCG	2	12	1458819	1458830	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	482886159
601	NC_021082	AAACGG	2	12	1463870	1463881	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	482886167
602	NC_021082	ACTGAT	2	12	1466640	1466651	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	482886169
603	NC_021082	TGGAAC	2	12	1467510	1467521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	482886170
604	NC_021082	TTAATA	2	12	1467727	1467738	50 %	50 %	0 %	0 %	482886170
605	NC_021082	TTTCGT	2	12	1470002	1470013	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	482886172
606	NC_021082	ACTGAA	2	12	1474427	1474438	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	482886179
607	NC_021082	GATATA	2	12	1477319	1477330	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021082	ATATTT	2	12	1482699	1482710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482886188
609	NC_021082	ATATTT	2	12	1483875	1483886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	482886189
610	NC_021082	CAAAAC	2	12	1486875	1486886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	482886191
611	NC_021082	TATATC	2	12	1488317	1488328	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	482886192
612	NC_021082	CTTTAT	2	12	1489638	1489649	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482886193
613	NC_021082	AAATCG	2	12	1489752	1489763	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	482886193
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720	NC_021082	GTATAT	2	12	1738050	1738061	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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722	NC_021082	ATTTTC	2	12	1741266	1741277	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	482886484
723	NC_021082	CGGTGA	2	12	1742525	1742536	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482886486
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834	NC_021082	GCCTCA	2	12	2032214	2032225	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	482886788
835	NC_021082	ATCTCT	2	12	2034107	2034118	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	482886790
836	NC_021082	TGATCT	2	12	2034239	2034250	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482886790
837	NC_021082	TTTAGC	2	12	2034469	2034480	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	482886791
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840	NC_021082	ATAATT	2	12	2040452	2040463	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
841	NC_021082	GAATTT	2	12	2044233	2044244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	482886801
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938	NC_021082	CAATAA	2	12	2310086	2310097	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	482887053
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942	NC_021082	AATGCC	2	12	2321161	2321172	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	482887068
943	NC_021082	AGCAAC	2	12	2321901	2321912	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	482887070
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946	NC_021082	GGCGGT	2	12	2329869	2329880	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	482887085
947	NC_021082	AAATCC	2	12	2331469	2331480	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	482887087
948	NC_021082	TGGGCG	2	12	2331764	2331775	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	482887087
949	NC_021082	GTTTTT	2	12	2331926	2331937	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
950	NC_021082	GGCGAT	2	12	2333960	2333971	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	482887089
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997	NC_021082	AAATTT	2	12	2452899	2452910	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
998	NC_021082	TTGGTG	2	12	2457624	2457635	0 %	50 %	50 %	0 %	482887236
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