MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 3125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019965	TCATC	2	10	902	911	20 %	40 %	0 %	40 %	433640129
2	NC_019965	CGTTT	2	10	2093	2102	0 %	60 %	20 %	20 %	433640130
3	NC_019965	CGGTT	2	10	3242	3251	0 %	40 %	40 %	20 %	433640130
4	NC_019965	CGTCG	2	10	4584	4593	0 %	20 %	40 %	40 %	433640132
5	NC_019965	GCAGC	2	10	7374	7383	20 %	0 %	40 %	40 %	433640134
6	NC_019965	CGGTG	2	10	9282	9291	0 %	20 %	60 %	20 %	433640134
7	NC_019965	CAGAC	2	10	9800	9809	40 %	0 %	20 %	40 %	433640134
8	NC_019965	CGCAA	2	10	10324	10333	40 %	0 %	20 %	40 %	433640135
9	NC_019965	CGGCG	2	10	10450	10459	0 %	0 %	60 %	40 %	433640135
10	NC_019965	AGGCC	2	10	12252	12261	20 %	0 %	40 %	40 %	433640136
11	NC_019965	GGGCC	2	10	14438	14447	0 %	0 %	60 %	40 %	433640140
12	NC_019965	GCGTT	2	10	15183	15192	0 %	40 %	40 %	20 %	433640141
13	NC_019965	CCAGC	2	10	15723	15732	20 %	0 %	20 %	60 %	433640142
14	NC_019965	ACCGA	2	10	16486	16495	40 %	0 %	20 %	40 %	433640142
15	NC_019965	ATCGG	2	10	16878	16887	20 %	20 %	40 %	20 %	433640142
16	NC_019965	CGGCC	2	10	17887	17896	0 %	0 %	40 %	60 %	433640143
17	NC_019965	TTAGC	2	10	19115	19124	20 %	40 %	20 %	20 %	433640144
18	NC_019965	GGTCC	2	10	19187	19196	0 %	20 %	40 %	40 %	433640144
19	NC_019965	GTCGT	2	10	21706	21715	0 %	40 %	40 %	20 %	433640145
20	NC_019965	ATCAC	2	10	23979	23988	40 %	20 %	0 %	40 %	433640148
21	NC_019965	GCCGG	2	10	24666	24675	0 %	0 %	60 %	40 %	433640148
22	NC_019965	GGCAA	2	10	29361	29370	40 %	0 %	40 %	20 %	433640153
23	NC_019965	CGATC	2	10	30187	30196	20 %	20 %	20 %	40 %	433640154
24	NC_019965	CGACG	2	10	32374	32383	20 %	0 %	40 %	40 %	433640158
25	NC_019965	GCGTC	2	10	32429	32438	0 %	20 %	40 %	40 %	433640158
26	NC_019965	GACAC	2	10	32526	32535	40 %	0 %	20 %	40 %	433640158
27	NC_019965	TCCTG	2	10	37524	37533	0 %	40 %	20 %	40 %	433640164
28	NC_019965	CTCGG	2	10	37617	37626	0 %	20 %	40 %	40 %	433640164
29	NC_019965	GGCGC	2	10	38160	38169	0 %	0 %	60 %	40 %	433640164
30	NC_019965	TGGCC	2	10	38308	38317	0 %	20 %	40 %	40 %	433640164
31	NC_019965	CGGCG	2	10	38840	38849	0 %	0 %	60 %	40 %	433640164
32	NC_019965	GTCCA	2	10	39396	39405	20 %	20 %	20 %	40 %	433640165
33	NC_019965	GCACA	2	10	42329	42338	40 %	0 %	20 %	40 %	433640168
34	NC_019965	GGTAC	2	10	44863	44872	20 %	20 %	40 %	20 %	433640170
35	NC_019965	TCGAA	2	10	45095	45104	40 %	20 %	20 %	20 %	433640170
36	NC_019965	GCACC	2	10	46025	46034	20 %	0 %	20 %	60 %	433640170
37	NC_019965	CGGTG	2	10	47059	47068	0 %	20 %	60 %	20 %	433640171
38	NC_019965	TCATG	2	10	47205	47214	20 %	40 %	20 %	20 %	433640171
39	NC_019965	GCAGC	2	10	48599	48608	20 %	0 %	40 %	40 %	433640173
40	NC_019965	CCCGA	2	10	48682	48691	20 %	0 %	20 %	60 %	433640173
41	NC_019965	CAGCG	2	10	49807	49816	20 %	0 %	40 %	40 %	433640174
42	NC_019965	CTCCC	2	10	56247	56256	0 %	20 %	0 %	80 %	433640180
43	NC_019965	CGGCG	2	10	56696	56705	0 %	0 %	60 %	40 %	433640180
44	NC_019965	GACCC	2	10	58229	58238	20 %	0 %	20 %	60 %	433640182
45	NC_019965	CTTCG	2	10	58915	58924	0 %	40 %	20 %	40 %	433640183
46	NC_019965	CGGTG	2	10	59971	59980	0 %	20 %	60 %	20 %	433640186
47	NC_019965	TCAGG	2	10	62418	62427	20 %	20 %	40 %	20 %	433640187
48	NC_019965	CGGCG	2	10	64410	64419	0 %	0 %	60 %	40 %	433640188
49	NC_019965	GGCGA	2	10	64831	64840	20 %	0 %	60 %	20 %	433640188
50	NC_019965	CGGGT	2	10	66234	66243	0 %	20 %	60 %	20 %	433640189
51	NC_019965	CGGCC	2	10	67673	67682	0 %	0 %	40 %	60 %	433640191
52	NC_019965	GGTGT	2	10	68826	68835	0 %	40 %	60 %	0 %	433640194
53	NC_019965	ATCGG	2	10	69463	69472	20 %	20 %	40 %	20 %	433640194
54	NC_019965	CCGCG	2	10	70000	70009	0 %	0 %	40 %	60 %	433640194
55	NC_019965	GGCAA	2	10	70351	70360	40 %	0 %	40 %	20 %	433640194
56	NC_019965	CGACC	2	10	70640	70649	20 %	0 %	20 %	60 %	433640194
57	NC_019965	GGTCG	2	10	71154	71163	0 %	20 %	60 %	20 %	433640194
58	NC_019965	TGCCT	2	10	71895	71904	0 %	40 %	20 %	40 %	433640196
59	NC_019965	GTCCA	2	10	72766	72775	20 %	20 %	20 %	40 %	433640197
60	NC_019965	TGACC	2	10	75390	75399	20 %	20 %	20 %	40 %	433640199
61	NC_019965	GCCAA	2	10	75704	75713	40 %	0 %	20 %	40 %	433640199
62	NC_019965	GTCGC	2	10	75781	75790	0 %	20 %	40 %	40 %	433640199
63	NC_019965	GCGCG	2	10	76869	76878	0 %	0 %	60 %	40 %	433640200
64	NC_019965	CGCCA	2	10	80637	80646	20 %	0 %	20 %	60 %	433640202
65	NC_019965	CGGGC	2	10	80708	80717	0 %	0 %	60 %	40 %	433640202
66	NC_019965	GAGCA	2	10	82544	82553	40 %	0 %	40 %	20 %	433640204
67	NC_019965	GCCGG	2	10	82643	82652	0 %	0 %	60 %	40 %	433640204
68	NC_019965	GCGAC	2	10	82719	82728	20 %	0 %	40 %	40 %	433640204
69	NC_019965	TGCGG	2	10	83366	83375	0 %	20 %	60 %	20 %	433640205
70	NC_019965	ATCCG	2	10	83441	83450	20 %	20 %	20 %	40 %	433640205
71	NC_019965	CACCG	2	10	84221	84230	20 %	0 %	20 %	60 %	433640206
72	NC_019965	TGGTC	2	10	86356	86365	0 %	40 %	40 %	20 %	433640208
73	NC_019965	GCTGG	2	10	86993	87002	0 %	20 %	60 %	20 %	433640209
74	NC_019965	TGGGT	2	10	90031	90040	0 %	40 %	60 %	0 %	433640214
75	NC_019965	TCGCC	2	10	90238	90247	0 %	20 %	20 %	60 %	433640214
76	NC_019965	GGGCC	2	10	91211	91220	0 %	0 %	60 %	40 %	433640215
77	NC_019965	GGCCG	2	10	92530	92539	0 %	0 %	60 %	40 %	433640216
78	NC_019965	GCGCC	2	10	93182	93191	0 %	0 %	40 %	60 %	433640216
79	NC_019965	GCTTG	2	10	95214	95223	0 %	40 %	40 %	20 %	433640218
80	NC_019965	CGTGT	2	10	95646	95655	0 %	40 %	40 %	20 %	433640219
81	NC_019965	AGATC	2	10	95725	95734	40 %	20 %	20 %	20 %	433640219
82	NC_019965	CGGCG	2	10	98752	98761	0 %	0 %	60 %	40 %	433640221
83	NC_019965	ATCGA	2	10	99596	99605	40 %	20 %	20 %	20 %	433640223
84	NC_019965	GCGGT	2	10	99828	99837	0 %	20 %	60 %	20 %	433640223
85	NC_019965	GCGCC	2	10	102660	102669	0 %	0 %	40 %	60 %	433640225
86	NC_019965	GTCGA	2	10	103033	103042	20 %	20 %	40 %	20 %	433640225
87	NC_019965	GGTGG	2	10	103340	103349	0 %	20 %	80 %	0 %	433640226
88	NC_019965	CTGGC	2	10	105112	105121	0 %	20 %	40 %	40 %	433640227
89	NC_019965	GCACA	2	10	106233	106242	40 %	0 %	20 %	40 %	433640227
90	NC_019965	ATCGC	2	10	109058	109067	20 %	20 %	20 %	40 %	433640230
91	NC_019965	CGGTC	2	10	110667	110676	0 %	20 %	40 %	40 %	433640232
92	NC_019965	GACCA	2	10	111805	111814	40 %	0 %	20 %	40 %	433640232
93	NC_019965	GGCTG	2	10	114369	114378	0 %	20 %	60 %	20 %	433640232
94	NC_019965	CCGCG	2	10	118289	118298	0 %	0 %	40 %	60 %	433640233
95	NC_019965	TCGTG	2	10	122242	122251	0 %	40 %	40 %	20 %	433640235
96	NC_019965	CAGCG	2	10	122485	122494	20 %	0 %	40 %	40 %	433640235
97	NC_019965	CCGGA	2	10	124062	124071	20 %	0 %	40 %	40 %	433640237
98	NC_019965	GGCCG	2	10	126422	126431	0 %	0 %	60 %	40 %	433640238
99	NC_019965	TGCGC	2	10	126534	126543	0 %	20 %	40 %	40 %	433640238
100	NC_019965	GCGAG	2	10	127045	127054	20 %	0 %	60 %	20 %	433640238
101	NC_019965	GGGGT	2	10	128054	128063	0 %	20 %	80 %	0 %	433640238
102	NC_019965	CCCAC	2	10	128616	128625	20 %	0 %	0 %	80 %	433640238
103	NC_019965	CCGGC	2	10	129126	129135	0 %	0 %	40 %	60 %	433640238
104	NC_019965	TGCGG	2	10	129536	129545	0 %	20 %	60 %	20 %	433640238
105	NC_019965	ATCGG	2	10	131058	131067	20 %	20 %	40 %	20 %	433640240
106	NC_019965	CGGGC	2	10	132149	132158	0 %	0 %	60 %	40 %	433640240
107	NC_019965	GCGAT	2	10	133954	133963	20 %	20 %	40 %	20 %	433640242
108	NC_019965	GTTCG	2	10	134175	134184	0 %	40 %	40 %	20 %	433640242
109	NC_019965	CCTGG	2	10	134567	134576	0 %	20 %	40 %	40 %	433640242
110	NC_019965	GGCCC	2	10	134673	134682	0 %	0 %	40 %	60 %	433640242
111	NC_019965	CGTTG	2	10	135185	135194	0 %	40 %	40 %	20 %	433640242
112	NC_019965	CGACC	2	10	135257	135266	20 %	0 %	20 %	60 %	433640242
113	NC_019965	GAGAT	2	10	138277	138286	40 %	20 %	40 %	0 %	433640246
114	NC_019965	CGGCG	2	10	140432	140441	0 %	0 %	60 %	40 %	433640248
115	NC_019965	TGCGG	2	10	141065	141074	0 %	20 %	60 %	20 %	433640249
116	NC_019965	CGCTG	2	10	141772	141781	0 %	20 %	40 %	40 %	433640250
117	NC_019965	GTTGC	2	10	142318	142327	0 %	40 %	40 %	20 %	433640250
118	NC_019965	CCGAT	2	10	143066	143075	20 %	20 %	20 %	40 %	433640250
119	NC_019965	AACCG	2	10	144496	144505	40 %	0 %	20 %	40 %	433640251
120	NC_019965	CCGCC	2	10	145083	145092	0 %	0 %	20 %	80 %	433640251
121	NC_019965	CCGCC	2	10	145726	145735	0 %	0 %	20 %	80 %	433640252
122	NC_019965	ATCGG	2	10	149199	149208	20 %	20 %	40 %	20 %	433640256
123	NC_019965	TCGTC	2	10	154390	154399	0 %	40 %	20 %	40 %	433640259
124	NC_019965	CACGC	2	10	154854	154863	20 %	0 %	20 %	60 %	433640259
125	NC_019965	ATTCT	2	10	155698	155707	20 %	60 %	0 %	20 %	433640260
126	NC_019965	AGGCG	2	10	156226	156235	20 %	0 %	60 %	20 %	433640260
127	NC_019965	GTCTG	2	10	158597	158606	0 %	40 %	40 %	20 %	433640263
128	NC_019965	TGACC	2	10	159230	159239	20 %	20 %	20 %	40 %	433640263
129	NC_019965	CGGCG	2	10	159476	159485	0 %	0 %	60 %	40 %	433640263
130	NC_019965	GCACC	2	10	159646	159655	20 %	0 %	20 %	60 %	433640264
131	NC_019965	CCGCA	2	10	160824	160833	20 %	0 %	20 %	60 %	433640265
132	NC_019965	CGCGG	2	10	160903	160912	0 %	0 %	60 %	40 %	433640265
133	NC_019965	CGGTT	2	10	161230	161239	0 %	40 %	40 %	20 %	433640265
134	NC_019965	GCCGG	2	10	161691	161700	0 %	0 %	60 %	40 %	433640266
135	NC_019965	GCGCG	2	10	161813	161822	0 %	0 %	60 %	40 %	433640266
136	NC_019965	CTGGG	2	10	164027	164036	0 %	20 %	60 %	20 %	433640268
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138	NC_019965	GTTGG	2	10	166589	166598	0 %	40 %	60 %	0 %	433640271
139	NC_019965	GCGTG	2	10	167755	167764	0 %	20 %	60 %	20 %	433640274
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149	NC_019965	GGACA	2	10	178147	178156	40 %	0 %	40 %	20 %	433640283
150	NC_019965	GCCGA	2	10	178970	178979	20 %	0 %	40 %	40 %	433640283
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252	NC_019965	CCGGC	2	10	333306	333315	0 %	0 %	40 %	60 %	433640411
253	NC_019965	CCCAC	2	10	336494	336503	20 %	0 %	0 %	80 %	433640413
254	NC_019965	CTCGA	2	10	337236	337245	20 %	20 %	20 %	40 %	433640414
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256	NC_019965	TGCCG	2	10	342322	342331	0 %	20 %	40 %	40 %	433640417
257	NC_019965	CCGGA	2	10	343031	343040	20 %	0 %	40 %	40 %	433640417
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262	NC_019965	CGGTT	2	10	349999	350008	0 %	40 %	40 %	20 %	433640420
263	NC_019965	AGCGC	2	10	350903	350912	20 %	0 %	40 %	40 %	433640421
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