MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium canettii CIPT 140070008 complete genome

Total Repeats: 3125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019965	CGGCC	2	10	2127395	2127404	0 %	0 %	40 %	60 %	433641993
1502	NC_019965	CACCG	2	10	2128778	2128787	20 %	0 %	20 %	60 %	433641994
1503	NC_019965	CAGCC	2	10	2128933	2128942	20 %	0 %	20 %	60 %	433641994
1504	NC_019965	ACGTC	2	10	2129534	2129543	20 %	20 %	20 %	40 %	433641995
1505	NC_019965	CGCAG	2	10	2131076	2131085	20 %	0 %	40 %	40 %	433641997
1506	NC_019965	GGACA	2	10	2133170	2133179	40 %	0 %	40 %	20 %	433641997
1507	NC_019965	ACCTG	2	10	2137111	2137120	20 %	20 %	20 %	40 %	433641999
1508	NC_019965	CCGGA	2	10	2137328	2137337	20 %	0 %	40 %	40 %	433642000
1509	NC_019965	ACAGC	2	10	2138982	2138991	40 %	0 %	20 %	40 %	433642001
1510	NC_019965	GCCAG	2	10	2140221	2140230	20 %	0 %	40 %	40 %	433642003
1511	NC_019965	GTTGG	2	10	2142680	2142689	0 %	40 %	60 %	0 %	433642007
1512	NC_019965	AGGAG	2	10	2143583	2143592	40 %	0 %	60 %	0 %	433642008
1513	NC_019965	CTGTG	2	10	2144032	2144041	0 %	40 %	40 %	20 %	433642009
1514	NC_019965	GCCGC	2	10	2144509	2144518	0 %	0 %	40 %	60 %	433642009
1515	NC_019965	GTCCT	2	10	2144574	2144583	0 %	40 %	20 %	40 %	433642009
1516	NC_019965	CGTGT	2	10	2149998	2150007	0 %	40 %	40 %	20 %	433642013
1517	NC_019965	TGAGC	2	10	2152751	2152760	20 %	20 %	40 %	20 %	433642018
1518	NC_019965	TGCCG	2	10	2153625	2153634	0 %	20 %	40 %	40 %	433642018
1519	NC_019965	CAGTC	2	10	2158906	2158915	20 %	20 %	20 %	40 %	433642027
1520	NC_019965	CACAA	2	10	2159160	2159169	60 %	0 %	0 %	40 %	433642027
1521	NC_019965	TCATC	2	10	2162360	2162369	20 %	40 %	0 %	40 %	433642030
1522	NC_019965	CCGGG	2	10	2163907	2163916	0 %	0 %	60 %	40 %	433642034
1523	NC_019965	CGGGG	2	10	2164002	2164011	0 %	0 %	80 %	20 %	433642034
1524	NC_019965	TGGTG	2	10	2168105	2168114	0 %	40 %	60 %	0 %	433642037
1525	NC_019965	CGGTG	2	10	2169200	2169209	0 %	20 %	60 %	20 %	433642039
1526	NC_019965	GGCCG	2	10	2173235	2173244	0 %	0 %	60 %	40 %	433642043
1527	NC_019965	CCACA	2	10	2177603	2177612	40 %	0 %	0 %	60 %	433642048
1528	NC_019965	CCCAT	2	10	2178135	2178144	20 %	20 %	0 %	60 %	433642049
1529	NC_019965	GGTGA	2	10	2180974	2180983	20 %	20 %	60 %	0 %	433642051
1530	NC_019965	TCGCC	2	10	2186201	2186210	0 %	20 %	20 %	60 %	433642051
1531	NC_019965	TTGGC	2	10	2186435	2186444	0 %	40 %	40 %	20 %	433642051
1532	NC_019965	CTAAG	2	10	2186799	2186808	40 %	20 %	20 %	20 %	433642051
1533	NC_019965	CCCGC	2	10	2187359	2187368	0 %	0 %	20 %	80 %	433642051
1534	NC_019965	GCCGA	2	10	2189893	2189902	20 %	0 %	40 %	40 %	433642052
1535	NC_019965	CCGAC	2	10	2191542	2191551	20 %	0 %	20 %	60 %	433642053
1536	NC_019965	GCTTG	2	10	2191854	2191863	0 %	40 %	40 %	20 %	433642054
1537	NC_019965	CGGTG	2	10	2194994	2195003	0 %	20 %	60 %	20 %	433642056
1538	NC_019965	CCCCA	2	10	2195795	2195804	20 %	0 %	0 %	80 %	433642056
1539	NC_019965	CGGAC	2	10	2197818	2197827	20 %	0 %	40 %	40 %	433642058
1540	NC_019965	ACGCG	2	10	2198119	2198128	20 %	0 %	40 %	40 %	433642058
1541	NC_019965	CGTGT	2	10	2198162	2198171	0 %	40 %	40 %	20 %	433642058
1542	NC_019965	GGTCG	2	10	2199533	2199542	0 %	20 %	60 %	20 %	433642060
1543	NC_019965	GTGTC	2	10	2199571	2199580	0 %	40 %	40 %	20 %	433642060
1544	NC_019965	GCCGC	2	10	2200264	2200273	0 %	0 %	40 %	60 %	433642060
1545	NC_019965	GGGGT	2	10	2200275	2200284	0 %	20 %	80 %	0 %	433642060
1546	NC_019965	TGGTG	2	10	2201237	2201246	0 %	40 %	60 %	0 %	433642061
1547	NC_019965	CTGAC	2	10	2201359	2201368	20 %	20 %	20 %	40 %	433642061
1548	NC_019965	CGCGG	2	10	2201728	2201737	0 %	0 %	60 %	40 %	433642061
1549	NC_019965	CGGTC	2	10	2202944	2202953	0 %	20 %	40 %	40 %	433642063
1550	NC_019965	CGACG	2	10	2206532	2206541	20 %	0 %	40 %	40 %	433642067
1551	NC_019965	GGTCC	2	10	2208857	2208866	0 %	20 %	40 %	40 %	433642068
1552	NC_019965	CCGTG	2	10	2209528	2209537	0 %	20 %	40 %	40 %	433642069
1553	NC_019965	GCGCA	2	10	2210061	2210070	20 %	0 %	40 %	40 %	433642069
1554	NC_019965	CGGTG	2	10	2210559	2210568	0 %	20 %	60 %	20 %	433642070
1555	NC_019965	CGCTG	2	10	2211081	2211090	0 %	20 %	40 %	40 %	433642070
1556	NC_019965	CGGTC	2	10	2211415	2211424	0 %	20 %	40 %	40 %	433642070
1557	NC_019965	CGGCT	2	10	2211531	2211540	0 %	20 %	40 %	40 %	433642070
1558	NC_019965	ACCGG	2	10	2212219	2212228	20 %	0 %	40 %	40 %	433642070
1559	NC_019965	GCAAG	2	10	2213889	2213898	40 %	0 %	40 %	20 %	433642071
1560	NC_019965	TGTGC	2	10	2215773	2215782	0 %	40 %	40 %	20 %	433642074
1561	NC_019965	GCGCC	2	10	2218299	2218308	0 %	0 %	40 %	60 %	433642078
1562	NC_019965	TGGCC	2	10	2218506	2218515	0 %	20 %	40 %	40 %	433642078
1563	NC_019965	CACCG	2	10	2219155	2219164	20 %	0 %	20 %	60 %	433642078
1564	NC_019965	CCGAC	2	10	2223104	2223113	20 %	0 %	20 %	60 %	433642086
1565	NC_019965	TGCGC	2	10	2224272	2224281	0 %	20 %	40 %	40 %	433642088
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1567	NC_019965	GCGCC	2	10	2229698	2229707	0 %	0 %	40 %	60 %	433642097
1568	NC_019965	GGTCG	2	10	2229735	2229744	0 %	20 %	60 %	20 %	433642098
1569	NC_019965	GGCCG	2	10	2231229	2231238	0 %	0 %	60 %	40 %	433642099
1570	NC_019965	AGGCC	2	10	2231880	2231889	20 %	0 %	40 %	40 %	433642100
1571	NC_019965	GGGGC	2	10	2232263	2232272	0 %	0 %	80 %	20 %	433642100
1572	NC_019965	CGACG	2	10	2232830	2232839	20 %	0 %	40 %	40 %	433642101
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1576	NC_019965	CAACG	2	10	2236400	2236409	40 %	0 %	20 %	40 %	433642104
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1578	NC_019965	TCCGG	2	10	2236968	2236977	0 %	20 %	40 %	40 %	433642104
1579	NC_019965	TGCGG	2	10	2243169	2243178	0 %	20 %	60 %	20 %	433642113
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1587	NC_019965	TGCCT	2	10	2250912	2250921	0 %	40 %	20 %	40 %	433642121
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1591	NC_019965	GCTGA	2	10	2261721	2261730	20 %	20 %	40 %	20 %	433642133
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1593	NC_019965	CATGC	2	10	2266402	2266411	20 %	20 %	20 %	40 %	433642137
1594	NC_019965	CGGGT	2	10	2266519	2266528	0 %	20 %	60 %	20 %	433642137
1595	NC_019965	CCACC	2	10	2266935	2266944	20 %	0 %	0 %	80 %	433642137
1596	NC_019965	CGTCA	2	10	2267634	2267643	20 %	20 %	20 %	40 %	433642139
1597	NC_019965	AGCCC	2	10	2269202	2269211	20 %	0 %	20 %	60 %	433642142
1598	NC_019965	CGGCG	2	10	2269492	2269501	0 %	0 %	60 %	40 %	433642142
1599	NC_019965	CGCGC	2	10	2274977	2274986	0 %	0 %	40 %	60 %	433642150
1600	NC_019965	CAGTC	2	10	2276869	2276878	20 %	20 %	20 %	40 %	433642151
1601	NC_019965	GACGG	2	10	2277204	2277213	20 %	0 %	60 %	20 %	433642151
1602	NC_019965	GTACG	2	10	2278679	2278688	20 %	20 %	40 %	20 %	433642152
1603	NC_019965	CTGGA	2	10	2282257	2282266	20 %	20 %	40 %	20 %	433642154
1604	NC_019965	CCGTC	2	10	2282899	2282908	0 %	20 %	20 %	60 %	433642155
1605	NC_019965	CTGGC	2	10	2284058	2284067	0 %	20 %	40 %	40 %	433642156
1606	NC_019965	TACAA	2	10	2286052	2286061	60 %	20 %	0 %	20 %	433642158
1607	NC_019965	CACCG	2	10	2286208	2286217	20 %	0 %	20 %	60 %	433642158
1608	NC_019965	ACCGA	2	10	2287169	2287178	40 %	0 %	20 %	40 %	433642159
1609	NC_019965	GACCG	2	10	2287708	2287717	20 %	0 %	40 %	40 %	433642160
1610	NC_019965	CGGCC	2	10	2289046	2289055	0 %	0 %	40 %	60 %	433642160
1611	NC_019965	GCGCC	2	10	2295180	2295189	0 %	0 %	40 %	60 %	433642166
1612	NC_019965	CGGCT	2	10	2296522	2296531	0 %	20 %	40 %	40 %	433642168
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1614	NC_019965	TGGAT	2	10	2301952	2301961	20 %	40 %	40 %	0 %	433642173
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1621	NC_019965	TGGCG	2	10	2311568	2311577	0 %	20 %	60 %	20 %	433642178
1622	NC_019965	GCCGG	2	10	2313391	2313400	0 %	0 %	60 %	40 %	433642179
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1989	NC_019965	GGTCC	2	10	2813113	2813122	0 %	20 %	40 %	40 %	433642654
1990	NC_019965	GCGCC	2	10	2815664	2815673	0 %	0 %	40 %	60 %	433642656
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1992	NC_019965	ACGCG	2	10	2820851	2820860	20 %	0 %	40 %	40 %	433642661
1993	NC_019965	CGGGT	2	10	2822422	2822431	0 %	20 %	60 %	20 %	433642662
1994	NC_019965	GCGCC	2	10	2824326	2824335	0 %	0 %	40 %	60 %	433642665
1995	NC_019965	ACGCA	2	10	2827677	2827686	40 %	0 %	20 %	40 %	433642668
1996	NC_019965	TGCGA	2	10	2832997	2833006	20 %	20 %	40 %	20 %	433642675
1997	NC_019965	CACGA	2	10	2836195	2836204	40 %	0 %	20 %	40 %	433642675
1998	NC_019965	GGTCC	2	10	2837880	2837889	0 %	20 %	40 %	40 %	433642676
1999	NC_019965	CGGAC	2	10	2838360	2838369	20 %	0 %	40 %	40 %	433642676
2000	NC_019965	CAGCG	2	10	2838737	2838746	20 %	0 %	40 %	40 %	433642676

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