MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 18462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_019942	GCC	2	6	206	211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432327927
2	NC_019942	GAG	2	6	413	418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327927
3	NC_019942	TGA	2	6	487	492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327927
4	NC_019942	TTG	2	6	537	542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327927
5	NC_019942	GCT	2	6	571	576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327927
6	NC_019942	TCT	2	6	577	582	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327927
7	NC_019942	ATA	2	6	614	619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327927
8	NC_019942	TCT	2	6	649	654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327927
9	NC_019942	AGG	2	6	762	767	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327927
10	NC_019942	GCC	2	6	809	814	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432327927
11	NC_019942	CTG	2	6	848	853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327927
12	NC_019942	GAG	2	6	1013	1018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327927
13	NC_019942	AGA	2	6	1106	1111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327927
14	NC_019942	TTG	2	6	1197	1202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327927
15	NC_019942	GTG	2	6	1217	1222	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327927
16	NC_019942	CAA	2	6	1351	1356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
17	NC_019942	ACA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
18	NC_019942	TAT	2	6	1420	1425	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327928
19	NC_019942	CAA	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
20	NC_019942	CAC	2	6	1673	1678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327928
21	NC_019942	CTT	2	6	1931	1936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327928
22	NC_019942	TGC	2	6	1989	1994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327928
23	NC_019942	CAA	2	6	2068	2073	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327928
24	NC_019942	GAT	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327929
25	NC_019942	TCG	2	6	2352	2357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327929
26	NC_019942	AAT	2	6	2425	2430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327929
27	NC_019942	GAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327929
28	NC_019942	TTC	2	6	2658	2663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327930
29	NC_019942	TTC	2	6	2897	2902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327930
30	NC_019942	AGC	2	6	2952	2957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327930
31	NC_019942	AAT	2	6	2988	2993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327930
32	NC_019942	GAG	2	6	3127	3132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327930
33	NC_019942	ATA	2	6	3343	3348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327930
34	NC_019942	ATA	2	6	3451	3456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327930
35	NC_019942	GCA	2	6	3457	3462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327930
36	NC_019942	GAG	2	6	3531	3536	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327931
37	NC_019942	GGA	2	6	3553	3558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327931
38	NC_019942	TGA	2	6	3590	3595	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327931
39	NC_019942	TAT	2	6	3680	3685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327931
40	NC_019942	GCA	2	6	3704	3709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327931
41	NC_019942	TGG	2	6	3791	3796	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327931
42	NC_019942	ACA	2	6	3844	3849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327931
43	NC_019942	CAG	2	6	4281	4286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327931
44	NC_019942	GGA	2	6	4345	4350	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327931
45	NC_019942	TGA	2	6	4423	4428	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327931
46	NC_019942	TCC	2	6	4544	4549	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327932
47	NC_019942	AAT	2	6	4616	4621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327932
48	NC_019942	GAT	2	6	4745	4750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327932
49	NC_019942	CAG	2	6	4805	4810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327932
50	NC_019942	AAT	2	6	4844	4849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327932
51	NC_019942	TAC	2	6	4851	4856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327932
52	NC_019942	GAT	2	6	5007	5012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327932
53	NC_019942	ACC	2	6	5091	5096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327932
54	NC_019942	ACA	2	6	5139	5144	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
55	NC_019942	AAG	2	6	5165	5170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327932
56	NC_019942	AGG	2	6	5285	5290	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327932
57	NC_019942	AAC	2	6	5414	5419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
58	NC_019942	TGC	2	6	5492	5497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327932
59	NC_019942	ACA	2	6	5586	5591	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
60	NC_019942	ATA	2	6	5616	5621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327932
61	NC_019942	AAC	2	6	5685	5690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327932
62	NC_019942	AGA	2	6	5701	5706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327932
63	NC_019942	AGG	2	6	5733	5738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327932
64	NC_019942	TGG	2	6	5749	5754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327932
65	NC_019942	GAT	2	6	5900	5905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327932
66	NC_019942	GGA	2	6	5906	5911	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327932
67	NC_019942	TGT	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327932
68	NC_019942	TAC	2	6	5997	6002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327932
69	NC_019942	GAA	3	9	6220	6228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327933
70	NC_019942	TAA	2	6	6390	6395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327933
71	NC_019942	CAT	2	6	6474	6479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327933
72	NC_019942	AAG	2	6	6488	6493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327933
73	NC_019942	AGG	2	6	6624	6629	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
74	NC_019942	AGG	2	6	6687	6692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
75	NC_019942	AAG	2	6	6697	6702	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327933
76	NC_019942	AAC	2	6	6745	6750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327933
77	NC_019942	GGA	2	6	6761	6766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
78	NC_019942	CTT	2	6	6778	6783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327933
79	NC_019942	GGA	2	6	6796	6801	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
80	NC_019942	GTG	2	6	6905	6910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327933
81	NC_019942	ATA	2	6	6911	6916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327933
82	NC_019942	AGG	2	6	7041	7046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327933
83	NC_019942	TCA	2	6	7106	7111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327934
84	NC_019942	GCA	2	6	7381	7386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327934
85	NC_019942	AAT	2	6	7464	7469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327934
86	NC_019942	TTC	2	6	7601	7606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327934
87	NC_019942	TTC	2	6	7615	7620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327934
88	NC_019942	AAT	3	9	7635	7643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327934
89	NC_019942	CAA	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327934
90	NC_019942	AGA	2	6	7692	7697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327934
91	NC_019942	GTG	2	6	7736	7741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327934
92	NC_019942	ATA	2	6	7765	7770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327934
93	NC_019942	CAA	2	6	7790	7795	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327934
94	NC_019942	GAG	2	6	7925	7930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327934
95	NC_019942	AAG	2	6	7952	7957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327935
96	NC_019942	TGA	2	6	7989	7994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327935
97	NC_019942	AGA	2	6	8122	8127	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327935
98	NC_019942	GCC	2	6	8194	8199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432327935
99	NC_019942	TAC	2	6	8378	8383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327935
100	NC_019942	ACG	2	6	8430	8435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327935
101	NC_019942	TCC	2	6	8678	8683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327935
102	NC_019942	AAG	2	6	8692	8697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327935
103	NC_019942	GAT	2	6	8758	8763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327935
104	NC_019942	AAC	2	6	8833	8838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327935
105	NC_019942	TCT	2	6	9013	9018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327935
106	NC_019942	GCC	2	6	9023	9028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432327935
107	NC_019942	GAT	2	6	9140	9145	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327935
108	NC_019942	CAA	2	6	9252	9257	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327935
109	NC_019942	AGG	2	6	9263	9268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327935
110	NC_019942	AAT	2	6	9316	9321	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327935
111	NC_019942	AAC	2	6	9326	9331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327935
112	NC_019942	TAC	2	6	9494	9499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327935
113	NC_019942	TAG	2	6	9516	9521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327935
114	NC_019942	CTT	2	6	9618	9623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
115	NC_019942	TAT	2	6	9624	9629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327936
116	NC_019942	CTT	2	6	9630	9635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
117	NC_019942	CAC	2	6	9639	9644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327936
118	NC_019942	CTT	2	6	9717	9722	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
119	NC_019942	CTT	2	6	9728	9733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
120	NC_019942	TTC	2	6	9810	9815	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
121	NC_019942	CTT	2	6	9845	9850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
122	NC_019942	TCC	2	6	9979	9984	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327936
123	NC_019942	CCA	2	6	10032	10037	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327936
124	NC_019942	CTC	2	6	10047	10052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327936
125	NC_019942	GTG	2	6	10054	10059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432327936
126	NC_019942	CTT	2	6	10077	10082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
127	NC_019942	CTT	2	6	10140	10145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
128	NC_019942	TCA	2	6	10207	10212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327936
129	NC_019942	GAA	2	6	10368	10373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327936
130	NC_019942	TGC	2	6	10383	10388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327936
131	NC_019942	TAT	3	9	10398	10406	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327936
132	NC_019942	CCA	2	6	10594	10599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327936
133	NC_019942	TAT	2	6	10671	10676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327936
134	NC_019942	CAC	2	6	10680	10685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327936
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145	NC_019942	ACC	2	6	12117	12122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327936
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147	NC_019942	TGT	2	6	12722	12727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327936
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161	NC_019942	TTC	2	6	13924	13929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327936
162	NC_019942	ACA	2	6	13933	13938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327936
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256	NC_019942	ATC	2	6	21917	21922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327941
257	NC_019942	AAG	2	6	21928	21933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327941
258	NC_019942	CTC	2	6	21943	21948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327941
259	NC_019942	TCA	2	6	21968	21973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327941
260	NC_019942	CCT	2	6	22017	22022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327941
261	NC_019942	GAT	2	6	22055	22060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
262	NC_019942	GCG	2	6	22081	22086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432327942
263	NC_019942	CTG	2	6	22103	22108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327942
264	NC_019942	TTC	2	6	22125	22130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327942
265	NC_019942	GAA	2	6	22159	22164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327942
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267	NC_019942	AAG	2	6	22214	22219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327942
268	NC_019942	CTC	2	6	22239	22244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327942
269	NC_019942	CAA	2	6	22258	22263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327942
270	NC_019942	TAT	2	6	22295	22300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327942
271	NC_019942	TCC	2	6	22334	22339	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327942
272	NC_019942	TGC	2	6	22364	22369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432327942
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274	NC_019942	CTC	2	6	22681	22686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327943
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280	NC_019942	ATG	2	6	23157	23162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
281	NC_019942	GAA	2	6	23180	23185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
282	NC_019942	AGG	2	6	23195	23200	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
283	NC_019942	ATT	2	6	23375	23380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327944
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285	NC_019942	ACA	2	6	23492	23497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327944
286	NC_019942	GAG	2	6	23575	23580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327944
287	NC_019942	AAG	2	6	23596	23601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327944
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289	NC_019942	GCA	2	6	23677	23682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327944
290	NC_019942	ATA	2	6	23740	23745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327944
291	NC_019942	ATA	2	6	23845	23850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327944
292	NC_019942	CAC	2	6	23855	23860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432327944
293	NC_019942	ATA	2	6	24385	24390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432327944
294	NC_019942	CAG	2	6	24431	24436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327944
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298	NC_019942	CTA	2	6	24720	24725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327944
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322	NC_019942	AGG	2	6	26738	26743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
323	NC_019942	GTT	2	6	26944	26949	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327945
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328	NC_019942	TTG	2	6	27042	27047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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353	NC_019942	ATC	2	6	28989	28994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327946
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370	NC_019942	TCA	2	6	30396	30401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327946
371	NC_019942	TTC	2	6	30423	30428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327946
372	NC_019942	AGG	2	6	30472	30477	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327946
373	NC_019942	CTT	2	6	30651	30656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327946
374	NC_019942	TTG	2	6	30669	30674	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327946
375	NC_019942	ATC	2	6	30746	30751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327946
376	NC_019942	TTC	2	6	30879	30884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327946
377	NC_019942	TAT	2	6	30955	30960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327946
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379	NC_019942	TCT	2	6	31012	31017	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327946
380	NC_019942	AGG	2	6	31113	31118	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327946
381	NC_019942	ACC	3	9	31182	31190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
382	NC_019942	ATT	2	6	31257	31262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
383	NC_019942	TGA	2	6	31321	31326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327947
384	NC_019942	CTT	2	6	31512	31517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327947
385	NC_019942	GTT	2	6	31518	31523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432327947
386	NC_019942	GAT	2	6	31745	31750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432327947
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388	NC_019942	GAA	2	6	31907	31912	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327947
389	NC_019942	TCC	2	6	31929	31934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327947
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393	NC_019942	TCA	2	6	32406	32411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432327948
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396	NC_019942	TCC	2	6	32777	32782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327948
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399	NC_019942	CAG	2	6	32887	32892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327948
400	NC_019942	CCT	2	6	32916	32921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327948
401	NC_019942	CCG	2	6	32953	32958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432327948
402	NC_019942	CTC	2	6	33086	33091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327948
403	NC_019942	TCC	2	6	33237	33242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432327948
404	NC_019942	CAA	2	6	33310	33315	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327948
405	NC_019942	GAA	2	6	33484	33489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
406	NC_019942	GAA	3	9	33631	33639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327949
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417	NC_019942	AGG	2	6	34426	34431	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327950
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486	NC_019942	GGA	2	6	39731	39736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432327961
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493	NC_019942	TCT	2	6	40274	40279	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327962
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495	NC_019942	TTC	2	6	40570	40575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432327962
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497	NC_019942	GAC	2	6	40605	40610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432327962
498	NC_019942	AGA	2	6	40673	40678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432327962
499	NC_019942	TAT	2	6	40849	40854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432327963
500	NC_019942	CAA	3	9	40899	40907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432327963

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