MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aciduliprofundum sp. MAR08-339

Total Repeats: 18462

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_019942	AAT	2	6	1403499	1403504	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329419
18002	NC_019942	GAT	2	6	1403529	1403534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329419
18003	NC_019942	TTC	2	6	1403545	1403550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329419
18004	NC_019942	ATG	2	6	1403665	1403670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329419
18005	NC_019942	ACT	2	6	1403675	1403680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329419
18006	NC_019942	GAA	2	6	1403819	1403824	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329419
18007	NC_019942	GAA	2	6	1403833	1403838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329419
18008	NC_019942	GGA	2	6	1403872	1403877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329419
18009	NC_019942	TCC	2	6	1403936	1403941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329419
18010	NC_019942	TGA	2	6	1404129	1404134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329419
18011	NC_019942	CCT	2	6	1404186	1404191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329419
18012	NC_019942	AGG	2	6	1404272	1404277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329419
18013	NC_019942	GCA	2	6	1404353	1404358	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329420
18014	NC_019942	CTT	2	6	1404556	1404561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329420
18015	NC_019942	ATT	2	6	1404763	1404768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329420
18016	NC_019942	CAA	2	6	1404826	1404831	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329421
18017	NC_019942	CTC	2	6	1404893	1404898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329421
18018	NC_019942	CCT	2	6	1405213	1405218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329421
18019	NC_019942	ATC	2	6	1405248	1405253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329421
18020	NC_019942	CTG	2	6	1405436	1405441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329421
18021	NC_019942	GAA	2	6	1405471	1405476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329421
18022	NC_019942	TTC	2	6	1405579	1405584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329421
18023	NC_019942	CCT	2	6	1405663	1405668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329421
18024	NC_019942	TTC	2	6	1405689	1405694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329421
18025	NC_019942	ATC	2	6	1405709	1405714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329421
18026	NC_019942	CTT	2	6	1405892	1405897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329421
18027	NC_019942	CTG	2	6	1405922	1405927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329421
18028	NC_019942	GAG	2	6	1406014	1406019	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329421
18029	NC_019942	ACC	2	6	1406030	1406035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329421
18030	NC_019942	AAG	2	6	1406066	1406071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329421
18031	NC_019942	TCC	2	6	1406160	1406165	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329421
18032	NC_019942	AAT	2	6	1406233	1406238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329421
18033	NC_019942	ACC	2	6	1406261	1406266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329421
18034	NC_019942	GAA	2	6	1406275	1406280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329421
18035	NC_019942	CAT	2	6	1406294	1406299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329421
18036	NC_019942	TTC	3	9	1406304	1406312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329421
18037	NC_019942	CCT	2	6	1406332	1406337	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329421
18038	NC_019942	TAT	2	6	1406387	1406392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329421
18039	NC_019942	GAA	2	6	1406452	1406457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329421
18040	NC_019942	GGA	2	6	1406595	1406600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329421
18041	NC_019942	TCA	2	6	1406646	1406651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329421
18042	NC_019942	CTT	2	6	1406713	1406718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18043	NC_019942	AGA	2	6	1406971	1406976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329422
18044	NC_019942	ACA	2	6	1407014	1407019	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329422
18045	NC_019942	TTC	2	6	1407125	1407130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329422
18046	NC_019942	GAA	2	6	1407137	1407142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329422
18047	NC_019942	GAA	2	6	1407178	1407183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329422
18048	NC_019942	CTG	2	6	1407579	1407584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18049	NC_019942	CCG	2	6	1407709	1407714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18050	NC_019942	GGT	2	6	1407778	1407783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18051	NC_019942	CAC	2	6	1407855	1407860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18052	NC_019942	TTA	2	6	1407865	1407870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18053	NC_019942	GAT	2	6	1407874	1407879	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18054	NC_019942	CAC	2	6	1408399	1408404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329423
18055	NC_019942	GAA	2	6	1408492	1408497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329424
18056	NC_019942	TGG	2	6	1408498	1408503	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329424
18057	NC_019942	CTG	2	6	1408527	1408532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329424
18058	NC_019942	TAC	2	6	1408551	1408556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329424
18059	NC_019942	GCA	2	6	1408599	1408604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329424
18060	NC_019942	CTG	2	6	1408681	1408686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329424
18061	NC_019942	AAG	2	6	1408704	1408709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329424
18062	NC_019942	CAG	2	6	1408847	1408852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329424
18063	NC_019942	ATA	2	6	1408863	1408868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329424
18064	NC_019942	TCA	2	6	1408923	1408928	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329424
18065	NC_019942	ACG	2	6	1408933	1408938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329424
18066	NC_019942	CAT	2	6	1409012	1409017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329424
18067	NC_019942	CAA	2	6	1409021	1409026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329424
18068	NC_019942	AAT	2	6	1409054	1409059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329424
18069	NC_019942	TTC	2	6	1409072	1409077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329424
18070	NC_019942	CAC	2	6	1409193	1409198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329424
18071	NC_019942	CTT	2	6	1409382	1409387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329424
18072	NC_019942	GAA	2	6	1409439	1409444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329424
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18074	NC_019942	ATT	2	6	1409501	1409506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329425
18075	NC_019942	CAT	2	6	1409602	1409607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329425
18076	NC_019942	TTG	2	6	1409832	1409837	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329425
18077	NC_019942	GTT	2	6	1409924	1409929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329425
18078	NC_019942	ATA	2	6	1409936	1409941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329425
18079	NC_019942	CTG	2	6	1409984	1409989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329425
18080	NC_019942	TAC	2	6	1410050	1410055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329425
18081	NC_019942	TGT	2	6	1410081	1410086	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329425
18082	NC_019942	AAG	2	6	1410120	1410125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329425
18083	NC_019942	ATG	2	6	1410287	1410292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329425
18084	NC_019942	TGG	2	6	1410309	1410314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329425
18085	NC_019942	CTG	2	6	1410383	1410388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329425
18086	NC_019942	TCA	2	6	1410529	1410534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329426
18087	NC_019942	TTG	2	6	1410535	1410540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329426
18088	NC_019942	CAC	2	6	1410643	1410648	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	432329426
18089	NC_019942	AGG	2	6	1410654	1410659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329426
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18093	NC_019942	TGA	2	6	1411073	1411078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329426
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18099	NC_019942	AGG	2	6	1411333	1411338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329426
18100	NC_019942	ATA	2	6	1411614	1411619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329427
18101	NC_019942	AGA	2	6	1411784	1411789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329427
18102	NC_019942	GTG	2	6	1411945	1411950	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329427
18103	NC_019942	ATG	2	6	1412017	1412022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329427
18104	NC_019942	AAT	2	6	1412051	1412056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329427
18105	NC_019942	GAA	2	6	1412076	1412081	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	432329427
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18107	NC_019942	GTG	2	6	1412138	1412143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329428
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18111	NC_019942	CTC	2	6	1412188	1412193	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329428
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18229	NC_019942	GTT	2	6	1420186	1420191	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329437
18230	NC_019942	TAC	2	6	1420288	1420293	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329437
18231	NC_019942	TAT	2	6	1420303	1420308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329437
18232	NC_019942	GGC	2	6	1420309	1420314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	432329437
18233	NC_019942	CAA	2	6	1420605	1420610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329437
18234	NC_019942	CAA	2	6	1420697	1420702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329437
18235	NC_019942	AAC	2	6	1420723	1420728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329437
18236	NC_019942	TAC	2	6	1420744	1420749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329437
18237	NC_019942	TAA	2	6	1420808	1420813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329437
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18239	NC_019942	ATC	2	6	1420864	1420869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	432329437
18240	NC_019942	CAA	2	6	1420905	1420910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329437
18241	NC_019942	CTT	2	6	1421013	1421018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329438
18242	NC_019942	CTG	2	6	1421097	1421102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329438
18243	NC_019942	TCT	2	6	1421222	1421227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329438
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18248	NC_019942	CAA	2	6	1421443	1421448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329439
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18250	NC_019942	GAG	2	6	1421621	1421626	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329439
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18258	NC_019942	CCA	2	6	1422175	1422180	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18259	NC_019942	GAT	2	6	1422205	1422210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329440
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18261	NC_019942	CTG	2	6	1422220	1422225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329440
18262	NC_019942	CAA	2	6	1422365	1422370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329440
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18265	NC_019942	GGA	2	6	1422438	1422443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329440
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18279	NC_019942	CCA	2	6	1423896	1423901	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18280	NC_019942	GAG	4	12	1424302	1424313	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329442
18281	NC_019942	TTC	2	6	1424329	1424334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329442
18282	NC_019942	GGA	2	6	1424361	1424366	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329442
18283	NC_019942	GGA	2	6	1424386	1424391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329442
18284	NC_019942	GGT	2	6	1424466	1424471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329442
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18287	NC_019942	TGA	2	6	1424694	1424699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329442
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18289	NC_019942	GTA	2	6	1424752	1424757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329442
18290	NC_019942	TTG	2	6	1424774	1424779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329442
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18292	NC_019942	TGG	2	6	1424904	1424909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	432329442
18293	NC_019942	GAG	2	6	1424911	1424916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329442
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18297	NC_019942	TCC	2	6	1425338	1425343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18298	NC_019942	TGC	2	6	1425351	1425356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329443
18299	NC_019942	CAA	2	6	1425358	1425363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	432329443
18300	NC_019942	TGA	2	6	1425408	1425413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329443
18301	NC_019942	TTC	3	9	1425434	1425442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329443
18302	NC_019942	CTT	3	9	1425488	1425496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329443
18303	NC_019942	TTC	2	6	1425527	1425532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329443
18304	NC_019942	GAT	2	6	1425607	1425612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329443
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18309	NC_019942	TGT	2	6	1425814	1425819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329443
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18322	NC_019942	CCT	2	6	1427234	1427239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329444
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18324	NC_019942	TTG	2	6	1427323	1427328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	432329444
18325	NC_019942	GCC	2	6	1427353	1427358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	432329444
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18327	NC_019942	TCC	2	6	1427416	1427421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	432329444
18328	NC_019942	GCA	2	6	1427456	1427461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329444
18329	NC_019942	ATT	2	6	1427710	1427715	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	432329445
18330	NC_019942	AGG	2	6	1427728	1427733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329445
18331	NC_019942	GAG	2	6	1427821	1427826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	432329445
18332	NC_019942	TGA	2	6	1427920	1427925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329446
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18337	NC_019942	ACG	2	6	1428429	1428434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	432329446
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18340	NC_019942	ATA	2	6	1428714	1428719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	432329447
18341	NC_019942	TCT	2	6	1428788	1428793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	432329447
18342	NC_019942	GAT	2	6	1428796	1428801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329447
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18345	NC_019942	CTG	2	6	1429092	1429097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329447
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18349	NC_019942	CTG	2	6	1429294	1429299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	432329447
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18386	NC_019942	TGA	3	9	1432322	1432330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329448
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18455	NC_019942	ATG	2	6	1436654	1436659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	432329451
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