MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 1543

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 34Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_018690	GCGGA	2	10	2416578	2416587	20 %	0 %	60 %	20 %	407693784
1502	NC_018690	TACGG	2	10	2418601	2418610	20 %	20 %	40 %	20 %	407693787
1503	NC_018690	GTAGA	2	10	2418689	2418698	40 %	20 %	40 %	0 %	407693787
1504	NC_018690	AGAAA	2	10	2421454	2421463	80 %	0 %	20 %	0 %	407693792
1505	NC_018690	AGTTG	2	10	2422495	2422504	20 %	40 %	40 %	0 %	407693792
1506	NC_018690	GATGC	2	10	2422778	2422787	20 %	20 %	40 %	20 %	407693792
1507	NC_018690	GGTTT	2	10	2425388	2425397	0 %	60 %	40 %	0 %	407693795
1508	NC_018690	AGGCG	2	10	2428225	2428234	20 %	0 %	60 %	20 %	407693798
1509	NC_018690	TTGGT	2	10	2430500	2430509	0 %	60 %	40 %	0 %	407693799
1510	NC_018690	ATCGT	2	10	2430823	2430832	20 %	40 %	20 %	20 %	407693800
1511	NC_018690	ATCAA	2	10	2432953	2432962	60 %	20 %	0 %	20 %	407693802
1512	NC_018690	TTAAT	2	10	2433077	2433086	40 %	60 %	0 %	0 %	407693802
1513	NC_018690	AAATC	2	10	2434382	2434391	60 %	20 %	0 %	20 %	407693804
1514	NC_018690	TACGT	2	10	2435515	2435524	20 %	40 %	20 %	20 %	407693805
1515	NC_018690	GGCAG	2	10	2436663	2436672	20 %	0 %	60 %	20 %	407693806
1516	NC_018690	TTGGA	2	10	2443222	2443231	20 %	40 %	40 %	0 %	407693812
1517	NC_018690	GGCTT	2	10	2444763	2444772	0 %	40 %	40 %	20 %	407693813
1518	NC_018690	ATTGC	2	10	2445138	2445147	20 %	40 %	20 %	20 %	407693813
1519	NC_018690	TGGTT	2	10	2447535	2447544	0 %	60 %	40 %	0 %	407693814
1520	NC_018690	CAAAA	2	10	2448296	2448305	80 %	0 %	0 %	20 %	407693815
1521	NC_018690	TCGAT	2	10	2449029	2449038	20 %	40 %	20 %	20 %	407693816
1522	NC_018690	ATTGG	2	10	2454371	2454380	20 %	40 %	40 %	0 %	407693821
1523	NC_018690	CGGCA	2	10	2454653	2454662	20 %	0 %	40 %	40 %	407693821
1524	NC_018690	AAATT	2	10	2455341	2455350	60 %	40 %	0 %	0 %	407693822
1525	NC_018690	AATAT	2	10	2455960	2455969	60 %	40 %	0 %	0 %	407693822
1526	NC_018690	AATTT	2	10	2456190	2456199	40 %	60 %	0 %	0 %	407693822
1527	NC_018690	AAATC	2	10	2456414	2456423	60 %	20 %	0 %	20 %	407693823
1528	NC_018690	TGGGG	2	10	2456445	2456454	0 %	20 %	80 %	0 %	407693823
1529	NC_018690	TGATT	2	10	2456490	2456499	20 %	60 %	20 %	0 %	407693823
1530	NC_018690	AGGTG	2	10	2456577	2456586	20 %	20 %	60 %	0 %	407693823
1531	NC_018690	TGAAA	2	10	2457283	2457292	60 %	20 %	20 %	0 %	407693824
1532	NC_018690	CAAAA	2	10	2459418	2459427	80 %	0 %	0 %	20 %	407693827
1533	NC_018690	AAGCG	2	10	2459921	2459930	40 %	0 %	40 %	20 %	407693827
1534	NC_018690	CCACG	2	10	2463578	2463587	20 %	0 %	20 %	60 %	407693830
1535	NC_018690	GCAAT	2	10	2468204	2468213	40 %	20 %	20 %	20 %	407693832
1536	NC_018690	GGTAA	2	10	2470249	2470258	40 %	20 %	40 %	0 %	407693832
1537	NC_018690	CAGTT	2	10	2470938	2470947	20 %	40 %	20 %	20 %	407693832
1538	NC_018690	GCGAA	2	10	2471192	2471201	40 %	0 %	40 %	20 %	407693832
1539	NC_018690	GGTAA	2	10	2471758	2471767	40 %	20 %	40 %	0 %	407693832
1540	NC_018690	TAACT	2	10	2472456	2472465	40 %	40 %	0 %	20 %	407693832
1541	NC_018690	ACGCC	2	10	2475671	2475680	20 %	0 %	20 %	60 %	407693833
1542	NC_018690	TAAGC	2	10	2478341	2478350	40 %	20 %	20 %	20 %	407693835
1543	NC_018690	ATTTA	2	10	2481110	2481119	40 %	60 %	0 %	0 %	407693838

< Previous 1 2 34Next >