MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Actinobacillus suis H91-0380 chromosome

Total Repeats: 1543

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_018690	ATAGC	2	10	1583476	1583485	40 %	20 %	20 %	20 %	407693009
1002	NC_018690	ACGTT	2	10	1583778	1583787	20 %	40 %	20 %	20 %	407693009
1003	NC_018690	CAAAC	2	10	1586224	1586233	60 %	0 %	0 %	40 %	407693011
1004	NC_018690	GTATT	2	10	1586484	1586493	20 %	60 %	20 %	0 %	407693011
1005	NC_018690	CATTC	2	10	1588607	1588616	20 %	40 %	0 %	40 %	407693013
1006	NC_018690	GCGGT	2	10	1588638	1588647	0 %	20 %	60 %	20 %	407693013
1007	NC_018690	GATTA	2	10	1589731	1589740	40 %	40 %	20 %	0 %	407693014
1008	NC_018690	TTTAA	2	10	1591718	1591727	40 %	60 %	0 %	0 %	407693014
1009	NC_018690	ATTAG	2	10	1593728	1593737	40 %	40 %	20 %	0 %	407693018
1010	NC_018690	ATTCC	2	10	1595787	1595796	20 %	40 %	0 %	40 %	407693019
1011	NC_018690	ACCCT	2	10	1596692	1596701	20 %	20 %	0 %	60 %	407693021
1012	NC_018690	CGCAA	2	10	1596753	1596762	40 %	0 %	20 %	40 %	407693021
1013	NC_018690	GAACA	2	10	1597005	1597014	60 %	0 %	20 %	20 %	407693022
1014	NC_018690	ACCCA	2	10	1597296	1597305	40 %	0 %	0 %	60 %	407693022
1015	NC_018690	AAATA	2	10	1602898	1602907	80 %	20 %	0 %	0 %	407693026
1016	NC_018690	GTGCG	2	10	1604819	1604828	0 %	20 %	60 %	20 %	407693028
1017	NC_018690	AAAGC	2	10	1605929	1605938	60 %	0 %	20 %	20 %	407693029
1018	NC_018690	GTGAA	2	10	1606817	1606826	40 %	20 %	40 %	0 %	407693030
1019	NC_018690	GCAAT	2	10	1607353	1607362	40 %	20 %	20 %	20 %	407693030
1020	NC_018690	TTCAG	2	10	1609078	1609087	20 %	40 %	20 %	20 %	407693032
1021	NC_018690	GTATT	2	10	1611705	1611714	20 %	60 %	20 %	0 %	407693034
1022	NC_018690	TTGGT	2	10	1612535	1612544	0 %	60 %	40 %	0 %	407693035
1023	NC_018690	TTCTT	2	10	1615933	1615942	0 %	80 %	0 %	20 %	407693037
1024	NC_018690	CTGCT	2	10	1618898	1618907	0 %	40 %	20 %	40 %	407693039
1025	NC_018690	ATCGA	2	10	1619205	1619214	40 %	20 %	20 %	20 %	407693039
1026	NC_018690	ACGGA	2	10	1619237	1619246	40 %	0 %	40 %	20 %	407693039
1027	NC_018690	TGCGG	2	10	1619624	1619633	0 %	20 %	60 %	20 %	407693039
1028	NC_018690	ATTAA	2	10	1619913	1619922	60 %	40 %	0 %	0 %	407693040
1029	NC_018690	AATTG	2	10	1620760	1620769	40 %	40 %	20 %	0 %	407693040
1030	NC_018690	AATAA	2	10	1621927	1621936	80 %	20 %	0 %	0 %	407693041
1031	NC_018690	TTTCC	2	10	1623099	1623108	0 %	60 %	0 %	40 %	407693042
1032	NC_018690	ACGTA	2	10	1624971	1624980	40 %	20 %	20 %	20 %	407693042
1033	NC_018690	AATTA	2	10	1625361	1625370	60 %	40 %	0 %	0 %	407693042
1034	NC_018690	AAGCA	2	10	1626914	1626923	60 %	0 %	20 %	20 %	407693045
1035	NC_018690	CCATA	2	10	1627045	1627054	40 %	20 %	0 %	40 %	407693045
1036	NC_018690	CTGTT	2	10	1634716	1634725	0 %	60 %	20 %	20 %	407693053
1037	NC_018690	ATATT	2	10	1634728	1634737	40 %	60 %	0 %	0 %	407693053
1038	NC_018690	TAAAT	2	10	1634941	1634950	60 %	40 %	0 %	0 %	407693053
1039	NC_018690	GTTTT	2	10	1635712	1635721	0 %	80 %	20 %	0 %	407693054
1040	NC_018690	TTGGC	2	10	1636450	1636459	0 %	40 %	40 %	20 %	407693055
1041	NC_018690	CTTCT	2	10	1640173	1640182	0 %	60 %	0 %	40 %	407693059
1042	NC_018690	GCATT	2	10	1640342	1640351	20 %	40 %	20 %	20 %	407693059
1043	NC_018690	CCGGT	2	10	1641730	1641739	0 %	20 %	40 %	40 %	407693060
1044	NC_018690	CGGTT	2	10	1643887	1643896	0 %	40 %	40 %	20 %	407693064
1045	NC_018690	GCTGC	2	10	1645554	1645563	0 %	20 %	40 %	40 %	407693066
1046	NC_018690	AAAGC	2	10	1646128	1646137	60 %	0 %	20 %	20 %	407693066
1047	NC_018690	TTTTC	2	10	1646484	1646493	0 %	80 %	0 %	20 %	407693067
1048	NC_018690	AAAAT	2	10	1649695	1649704	80 %	20 %	0 %	0 %	407693070
1049	NC_018690	ATTAA	2	10	1651402	1651411	60 %	40 %	0 %	0 %	407693071
1050	NC_018690	AATCA	2	10	1651469	1651478	60 %	20 %	0 %	20 %	407693071
1051	NC_018690	CCGTA	2	10	1653793	1653802	20 %	20 %	20 %	40 %	407693073
1052	NC_018690	TACGC	2	10	1654115	1654124	20 %	20 %	20 %	40 %	407693073
1053	NC_018690	TCGCT	2	10	1656260	1656269	0 %	40 %	20 %	40 %	407693074
1054	NC_018690	AACGC	2	10	1656612	1656621	40 %	0 %	20 %	40 %	407693074
1055	NC_018690	TAAAA	2	10	1660116	1660125	80 %	20 %	0 %	0 %	407693078
1056	NC_018690	TGAAG	2	10	1663741	1663750	40 %	20 %	40 %	0 %	407693083
1057	NC_018690	CCAAG	2	10	1667498	1667507	40 %	0 %	20 %	40 %	407693088
1058	NC_018690	ATCAC	2	10	1667655	1667664	40 %	20 %	0 %	40 %	407693088
1059	NC_018690	GAAGC	2	10	1667684	1667693	40 %	0 %	40 %	20 %	407693088
1060	NC_018690	ACCGG	2	10	1669352	1669361	20 %	0 %	40 %	40 %	407693091
1061	NC_018690	TAAAA	2	10	1671009	1671018	80 %	20 %	0 %	0 %	407693094
1062	NC_018690	ACATC	2	10	1671338	1671347	40 %	20 %	0 %	40 %	407693094
1063	NC_018690	TAATT	2	10	1673229	1673238	40 %	60 %	0 %	0 %	407693096
1064	NC_018690	CAACC	2	10	1675010	1675019	40 %	0 %	0 %	60 %	407693098
1065	NC_018690	CCACG	2	10	1676273	1676282	20 %	0 %	20 %	60 %	407693098
1066	NC_018690	TGTTT	2	10	1678989	1678998	0 %	80 %	20 %	0 %	407693099
1067	NC_018690	CGTCC	2	10	1681001	1681010	0 %	20 %	20 %	60 %	407693101
1068	NC_018690	TCACT	2	10	1683770	1683779	20 %	40 %	0 %	40 %	407693102
1069	NC_018690	TACAT	2	10	1684221	1684230	40 %	40 %	0 %	20 %	407693102
1070	NC_018690	AGTAA	2	10	1688374	1688383	60 %	20 %	20 %	0 %	407693104
1071	NC_018690	CACAA	2	10	1688699	1688708	60 %	0 %	0 %	40 %	407693105
1072	NC_018690	ACCGA	2	10	1689128	1689137	40 %	0 %	20 %	40 %	407693105
1073	NC_018690	CGAAG	2	10	1692058	1692067	40 %	0 %	40 %	20 %	407693109
1074	NC_018690	CGCTT	2	10	1692640	1692649	0 %	40 %	20 %	40 %	407693110
1075	NC_018690	AACCG	2	10	1692982	1692991	40 %	0 %	20 %	40 %	407693110
1076	NC_018690	GTGCG	2	10	1695039	1695048	0 %	20 %	60 %	20 %	407693112
1077	NC_018690	CTTGC	2	10	1697924	1697933	0 %	40 %	20 %	40 %	407693114
1078	NC_018690	CATTA	2	10	1698703	1698712	40 %	40 %	0 %	20 %	407693115
1079	NC_018690	TGCCG	2	10	1699324	1699333	0 %	20 %	40 %	40 %	407693116
1080	NC_018690	AACAA	2	10	1701229	1701238	80 %	0 %	0 %	20 %	407693118
1081	NC_018690	TTTTA	2	10	1701372	1701381	20 %	80 %	0 %	0 %	407693118
1082	NC_018690	CAATT	2	10	1701677	1701686	40 %	40 %	0 %	20 %	407693118
1083	NC_018690	AGTTT	2	10	1705926	1705935	20 %	60 %	20 %	0 %	407693119
1084	NC_018690	TATGA	2	10	1706740	1706749	40 %	40 %	20 %	0 %	407693119
1085	NC_018690	CTAAA	2	10	1707406	1707415	60 %	20 %	0 %	20 %	407693119
1086	NC_018690	TAATG	2	10	1708127	1708136	40 %	40 %	20 %	0 %	407693119
1087	NC_018690	ATTAC	2	10	1708704	1708713	40 %	40 %	0 %	20 %	407693119
1088	NC_018690	TTACC	2	10	1712477	1712486	20 %	40 %	0 %	40 %	407693121
1089	NC_018690	GTTGT	2	10	1712779	1712788	0 %	60 %	40 %	0 %	407693121
1090	NC_018690	AAATG	2	10	1713042	1713051	60 %	20 %	20 %	0 %	407693121
1091	NC_018690	CGGTT	2	10	1716278	1716287	0 %	40 %	40 %	20 %	407693123
1092	NC_018690	GCTGA	2	10	1717354	1717363	20 %	20 %	40 %	20 %	407693124
1093	NC_018690	TGCCG	2	10	1717636	1717645	0 %	20 %	40 %	40 %	407693124
1094	NC_018690	CTGCC	2	10	1719762	1719771	0 %	20 %	20 %	60 %	407693127
1095	NC_018690	GCTAA	2	10	1723709	1723718	40 %	20 %	20 %	20 %	407693129
1096	NC_018690	TACCG	2	10	1725220	1725229	20 %	20 %	20 %	40 %	407693129
1097	NC_018690	CATTC	2	10	1726269	1726278	20 %	40 %	0 %	40 %	407693129
1098	NC_018690	TGCTT	2	10	1727027	1727036	0 %	60 %	20 %	20 %	407693129
1099	NC_018690	TAACT	2	10	1730800	1730809	40 %	40 %	0 %	20 %	407693132
1100	NC_018690	ATACT	2	10	1730868	1730877	40 %	40 %	0 %	20 %	407693132
1101	NC_018690	AAAGT	2	10	1731747	1731756	60 %	20 %	20 %	0 %	407693132
1102	NC_018690	CCCTT	2	10	1732315	1732324	0 %	40 %	0 %	60 %	407693133
1103	NC_018690	TGCCG	2	10	1733977	1733986	0 %	20 %	40 %	40 %	407693135
1104	NC_018690	ATAAA	2	10	1735142	1735151	80 %	20 %	0 %	0 %	407693136
1105	NC_018690	ATACG	2	10	1738118	1738127	40 %	20 %	20 %	20 %	407693137
1106	NC_018690	AATAA	2	10	1739561	1739570	80 %	20 %	0 %	0 %	407693139
1107	NC_018690	TTGAT	2	10	1739712	1739721	20 %	60 %	20 %	0 %	407693139
1108	NC_018690	GTGCG	2	10	1740236	1740245	0 %	20 %	60 %	20 %	407693140
1109	NC_018690	AAAAT	2	10	1740384	1740393	80 %	20 %	0 %	0 %	407693140
1110	NC_018690	GAGTT	2	10	1742422	1742431	20 %	40 %	40 %	0 %	407693143
1111	NC_018690	ACGCC	2	10	1745356	1745365	20 %	0 %	20 %	60 %	407693146
1112	NC_018690	ATGTT	2	10	1745388	1745397	20 %	60 %	20 %	0 %	407693146
1113	NC_018690	ATCGC	2	10	1746722	1746731	20 %	20 %	20 %	40 %	407693148
1114	NC_018690	AAGCA	2	10	1746762	1746771	60 %	0 %	20 %	20 %	407693148
1115	NC_018690	GAAAT	2	10	1747589	1747598	60 %	20 %	20 %	0 %	407693149
1116	NC_018690	GTTAC	2	10	1749800	1749809	20 %	40 %	20 %	20 %	407693152
1117	NC_018690	ATCGT	2	10	1750022	1750031	20 %	40 %	20 %	20 %	407693153
1118	NC_018690	GCAAT	2	10	1751161	1751170	40 %	20 %	20 %	20 %	407693154
1119	NC_018690	CGCTA	2	10	1758868	1758877	20 %	20 %	20 %	40 %	407693163
1120	NC_018690	TGCTG	2	10	1760154	1760163	0 %	40 %	40 %	20 %	407693164
1121	NC_018690	GCAAT	2	10	1762191	1762200	40 %	20 %	20 %	20 %	407693166
1122	NC_018690	TTATC	2	10	1763440	1763449	20 %	60 %	0 %	20 %	407693168
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1124	NC_018690	ATTTT	2	10	1764921	1764930	20 %	80 %	0 %	0 %	407693170
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1495	NC_018690	GTATT	2	10	2411340	2411349	20 %	60 %	20 %	0 %	407693778
1496	NC_018690	AATGC	2	10	2412811	2412820	40 %	20 %	20 %	20 %	407693779
1497	NC_018690	GCTAA	2	10	2413186	2413195	40 %	20 %	20 %	20 %	407693779
1498	NC_018690	ATTCC	2	10	2415280	2415289	20 %	40 %	0 %	40 %	407693783
1499	NC_018690	TGCAA	2	10	2415626	2415635	40 %	20 %	20 %	20 %	407693783
1500	NC_018690	CAAGC	2	10	2415951	2415960	40 %	0 %	20 %	40 %	407693784

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